MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_022535	CCG	2	6	1949708	1949713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43002	NC_022535	GTC	2	6	1949838	1949843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43003	NC_022535	GCCA	2	8	1949877	1949884	25 %	0 %	25 %	50 %	549706437
43004	NC_022535	CGT	2	6	1949885	1949890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43005	NC_022535	CCG	2	6	1949977	1949982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43006	NC_022535	GCC	2	6	1949994	1949999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43007	NC_022535	GCT	2	6	1950005	1950010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43008	NC_022535	CGAG	2	8	1950017	1950024	25 %	0 %	50 %	25 %	549706437
43009	NC_022535	GTC	2	6	1950054	1950059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43010	NC_022535	GGT	2	6	1950065	1950070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706437
43011	NC_022535	CATGTA	2	12	1950081	1950092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549706437
43012	NC_022535	CGT	2	6	1950134	1950139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43013	NC_022535	CTT	2	6	1950174	1950179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43014	NC_022535	CTT	2	6	1950251	1950256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43015	NC_022535	CGAG	2	8	1950269	1950276	25 %	0 %	50 %	25 %	549706437
43016	NC_022535	TCA	2	6	1950280	1950285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706437
43017	NC_022535	TCT	2	6	1950392	1950397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43018	NC_022535	GAC	2	6	1950546	1950551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43019	NC_022535	CGGC	2	8	1950568	1950575	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43020	NC_022535	CGC	2	6	1950656	1950661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43021	NC_022535	GCT	2	6	1950692	1950697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43022	NC_022535	TCG	2	6	1950715	1950720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43023	NC_022535	CCA	2	6	1950780	1950785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706437
43024	NC_022535	GAC	2	6	1950807	1950812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43025	NC_022535	CTT	2	6	1950834	1950839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43026	NC_022535	GCA	2	6	1950875	1950880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43027	NC_022535	TCG	2	6	1950925	1950930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43028	NC_022535	CG	3	6	1950978	1950983	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43029	NC_022535	GC	3	6	1951102	1951107	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43030	NC_022535	TTC	2	6	1951116	1951121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43031	NC_022535	CGA	2	6	1951160	1951165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43032	NC_022535	TCG	2	6	1951213	1951218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43033	NC_022535	TTC	2	6	1951222	1951227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43034	NC_022535	CTT	2	6	1951232	1951237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43035	NC_022535	CG	3	6	1951256	1951261	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43036	NC_022535	TTC	2	6	1951266	1951271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43037	NC_022535	TTC	2	6	1951308	1951313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43038	NC_022535	TGGA	2	8	1951318	1951325	25 %	25 %	50 %	0 %	549706437
43039	NC_022535	CGT	2	6	1951334	1951339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43040	NC_022535	CGA	2	6	1951406	1951411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43041	NC_022535	GGTC	2	8	1951442	1951449	0 %	25 %	50 %	25 %	549706437
43042	NC_022535	GAT	2	6	1951464	1951469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706437
43043	NC_022535	GAT	2	6	1951482	1951487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706437
43044	NC_022535	CGCGT	2	10	1951618	1951627	0 %	20 %	40 %	40 %	549706437
43045	NC_022535	CGA	2	6	1951637	1951642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43046	NC_022535	CCG	2	6	1951645	1951650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43047	NC_022535	GC	3	6	1951726	1951731	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43048	NC_022535	CGT	3	9	1951784	1951792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43049	NC_022535	GCT	2	6	1951832	1951837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43050	NC_022535	TGT	2	6	1951862	1951867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706437
43051	NC_022535	GAC	2	6	1951905	1951910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43052	NC_022535	GCG	2	6	1951943	1951948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706437
43053	NC_022535	CGT	2	6	1952003	1952008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43054	NC_022535	TTG	2	6	1952062	1952067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706437
43055	NC_022535	GC	3	6	1952182	1952187	0 %	0 %	50 %	50 %	549706437
43056	NC_022535	ACC	2	6	1952199	1952204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706437
43057	NC_022535	GAC	2	6	1952222	1952227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43058	NC_022535	GAA	2	6	1952292	1952297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706437
43059	NC_022535	GCA	2	6	1952308	1952313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43060	NC_022535	TCGA	2	8	1952362	1952369	25 %	25 %	25 %	25 %	549706437
43061	NC_022535	CGG	2	6	1952455	1952460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706437
43062	NC_022535	GTC	2	6	1952478	1952483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43063	NC_022535	GAC	2	6	1952523	1952528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43064	NC_022535	GTCGAG	2	12	1952574	1952585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549706437
43065	NC_022535	GAA	2	6	1952640	1952645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706437
43066	NC_022535	CCG	2	6	1952666	1952671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706437
43067	NC_022535	CGG	2	6	1952682	1952687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706437
43068	NC_022535	TCT	2	6	1952849	1952854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43069	NC_022535	TCG	2	6	1952863	1952868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43070	NC_022535	GCG	2	6	1952996	1953001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706437
43071	NC_022535	CTT	2	6	1953006	1953011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43072	NC_022535	CGA	2	6	1953020	1953025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43073	NC_022535	GAC	2	6	1953060	1953065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43074	NC_022535	TTC	2	6	1953073	1953078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706437
43075	NC_022535	GCCGTC	2	12	1953108	1953119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549706437
43076	NC_022535	CAG	2	6	1953186	1953191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
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43078	NC_022535	GCA	2	6	1953295	1953300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706437
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43080	NC_022535	GAA	2	6	1953345	1953350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706437
43081	NC_022535	GCG	2	6	1953536	1953541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706437
43082	NC_022535	TCG	2	6	1953682	1953687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43083	NC_022535	TCG	2	6	1953839	1953844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706437
43084	NC_022535	ACGG	2	8	1953874	1953881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43085	NC_022535	TCAA	2	8	1953905	1953912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43086	NC_022535	GATC	2	8	1953943	1953950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43087	NC_022535	TGA	2	6	1953965	1953970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43088	NC_022535	GAA	2	6	1953993	1953998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_022535	GAC	2	6	1954056	1954061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43090	NC_022535	CTT	3	9	1954139	1954147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706438
43091	NC_022535	CAG	2	6	1954153	1954158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706438
43092	NC_022535	GAGGCC	2	12	1954226	1954237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549706438
43093	NC_022535	TGA	2	6	1954258	1954263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706438
43094	NC_022535	TTG	2	6	1954272	1954277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706438
43095	NC_022535	TCT	2	6	1954317	1954322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706438
43096	NC_022535	AGC	6	18	1954328	1954345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706438
43097	NC_022535	GCC	2	6	1954346	1954351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706438
43098	NC_022535	AGC	3	9	1954352	1954360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706438
43099	NC_022535	AGC	3	9	1954373	1954381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706438
43100	NC_022535	TTC	2	6	1954397	1954402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706438
43101	NC_022535	GAG	2	6	1954443	1954448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706438
43102	NC_022535	TCT	2	6	1954452	1954457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706438
43103	NC_022535	CTT	2	6	1954555	1954560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706439
43104	NC_022535	GCG	2	6	1954601	1954606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706439
43105	NC_022535	CAG	2	6	1954648	1954653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706439
43106	NC_022535	GC	3	6	1954658	1954663	0 %	0 %	50 %	50 %	549706439
43107	NC_022535	AAC	2	6	1954744	1954749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706439
43108	NC_022535	GAC	2	6	1954780	1954785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706439
43109	NC_022535	ATC	2	6	1954796	1954801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706439
43110	NC_022535	TTC	2	6	1954895	1954900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706439
43111	NC_022535	GC	3	6	1954925	1954930	0 %	0 %	50 %	50 %	549706439
43112	NC_022535	AACCG	2	10	1954990	1954999	40 %	0 %	20 %	40 %	549706439
43113	NC_022535	CTGT	2	8	1955058	1955065	0 %	50 %	25 %	25 %	549706439
43114	NC_022535	TTTGCC	2	12	1955105	1955116	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43115	NC_022535	CGC	2	6	1955177	1955182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43116	NC_022535	CAGGCA	2	12	1955192	1955203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43117	NC_022535	CGA	2	6	1955426	1955431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706440
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43233	NC_022535	TCA	2	6	1960991	1960996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706446
43234	NC_022535	AC	3	6	1961084	1961089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43235	NC_022535	ACC	2	6	1961151	1961156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43236	NC_022535	TGG	2	6	1961169	1961174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43237	NC_022535	ATA	3	9	1961304	1961312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43238	NC_022535	AAAG	2	8	1961314	1961321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43239	NC_022535	GCG	2	6	1961350	1961355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43240	NC_022535	CGT	2	6	1961364	1961369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43241	NC_022535	CGT	2	6	1961390	1961395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43242	NC_022535	TC	3	6	1961403	1961408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43243	NC_022535	CTG	2	6	1961412	1961417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43244	NC_022535	CGG	2	6	1961468	1961473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43245	NC_022535	GCC	2	6	1961500	1961505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43246	NC_022535	T	7	7	1961532	1961538	0 %	100 %	0 %	0 %	549706447
43247	NC_022535	CA	3	6	1961545	1961550	50 %	0 %	0 %	50 %	549706447
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43249	NC_022535	GCC	2	6	1961632	1961637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706447
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43254	NC_022535	CGT	2	6	1961791	1961796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706447
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43260	NC_022535	GGCT	2	8	1962031	1962038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43261	NC_022535	CCCG	2	8	1962256	1962263	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43262	NC_022535	GCG	2	6	1962363	1962368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43263	NC_022535	ACCG	2	8	1962372	1962379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43264	NC_022535	GCC	3	9	1962431	1962439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706448
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43266	NC_022535	TCG	2	6	1962592	1962597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706448
43267	NC_022535	GTC	2	6	1962638	1962643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706448
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43269	NC_022535	CGC	2	6	1962791	1962796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706448
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43272	NC_022535	GAGC	2	8	1962937	1962944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43273	NC_022535	ATCC	2	8	1962949	1962956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43274	NC_022535	CGAA	2	8	1963085	1963092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43275	NC_022535	CGCT	2	8	1963137	1963144	0 %	25 %	25 %	50 %	549706449
43276	NC_022535	CAGC	2	8	1963202	1963209	25 %	0 %	25 %	50 %	549706449
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43287	NC_022535	GCG	2	6	1963796	1963801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43289	NC_022535	TCGT	2	8	1963841	1963848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43290	NC_022535	A	6	6	1963882	1963887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43293	NC_022535	CGT	2	6	1964018	1964023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706450
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43314	NC_022535	TGC	2	6	1964887	1964892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43336	NC_022535	GCCT	2	8	1965959	1965966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43337	NC_022535	TCG	2	6	1965974	1965979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43338	NC_022535	TTG	2	6	1965995	1966000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706453
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43340	NC_022535	CGA	2	6	1966077	1966082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706453
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43342	NC_022535	TGC	2	6	1966250	1966255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706453
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43345	NC_022535	AGAGCG	2	12	1966415	1966426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549706453
43346	NC_022535	GAC	2	6	1966437	1966442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706453
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43349	NC_022535	CGG	2	6	1966635	1966640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706454
43350	NC_022535	GAAA	2	8	1966646	1966653	75 %	0 %	25 %	0 %	549706454
43351	NC_022535	TGG	2	6	1966707	1966712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706454
43352	NC_022535	CGA	2	6	1966749	1966754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706454
43353	NC_022535	CCA	2	6	1966790	1966795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706454
43354	NC_022535	GCAC	2	8	1966823	1966830	25 %	0 %	25 %	50 %	549706454
43355	NC_022535	TCGC	2	8	1966853	1966860	0 %	25 %	25 %	50 %	549706454
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43360	NC_022535	TTG	2	6	1967095	1967100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43363	NC_022535	AAG	2	6	1967164	1967169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43384	NC_022535	GGCA	2	8	1968148	1968155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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43431	NC_022535	CGG	2	6	1970333	1970338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706458
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43455	NC_022535	TC	3	6	1971450	1971455	0 %	50 %	0 %	50 %	549706458
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43462	NC_022535	CCA	3	9	1972196	1972204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706459
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43466	NC_022535	CGA	2	6	1972397	1972402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706459
43467	NC_022535	ACAG	2	8	1972414	1972421	50 %	0 %	25 %	25 %	549706459
43468	NC_022535	A	6	6	1972466	1972471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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