MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022535	CGC	2	6	818403	818408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705223
18002	NC_022535	TCGGCC	2	12	818451	818462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549705223
18003	NC_022535	ATC	2	6	818474	818479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705223
18004	NC_022535	AGCGG	2	10	818522	818531	20 %	0 %	60 %	20 %	549705223
18005	NC_022535	GTG	2	6	818550	818555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705223
18006	NC_022535	GCCATC	2	12	818558	818569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549705223
18007	NC_022535	GCC	2	6	818690	818695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705223
18008	NC_022535	CGC	2	6	818724	818729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705223
18009	NC_022535	TTC	2	6	818732	818737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705223
18010	NC_022535	GCC	2	6	818741	818746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705223
18011	NC_022535	GCG	3	9	818768	818776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705223
18012	NC_022535	CGG	2	6	818823	818828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705223
18013	NC_022535	CAAA	2	8	818980	818987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18014	NC_022535	GCA	2	6	819031	819036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_022535	CG	3	6	819046	819051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18016	NC_022535	GGC	2	6	819052	819057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_022535	GGTG	2	8	819123	819130	0 %	25 %	75 %	0 %	549705224
18018	NC_022535	TCA	2	6	819170	819175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705224
18019	NC_022535	CGG	2	6	819344	819349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705224
18020	NC_022535	TCA	2	6	819476	819481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705224
18021	NC_022535	TCG	2	6	819584	819589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705224
18022	NC_022535	GCCGA	2	10	819649	819658	20 %	0 %	40 %	40 %	549705224
18023	NC_022535	GC	3	6	819671	819676	0 %	0 %	50 %	50 %	549705224
18024	NC_022535	TG	3	6	819686	819691	0 %	50 %	50 %	0 %	549705224
18025	NC_022535	A	6	6	819746	819751	100 %	0 %	0 %	0 %	549705224
18026	NC_022535	GTC	2	6	819781	819786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705224
18027	NC_022535	GC	3	6	819817	819822	0 %	0 %	50 %	50 %	549705224
18028	NC_022535	GAT	2	6	819861	819866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705224
18029	NC_022535	CTG	2	6	819940	819945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705224
18030	NC_022535	GAG	2	6	819997	820002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705224
18031	NC_022535	CGC	2	6	820035	820040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705224
18032	NC_022535	ACGAGG	2	12	820064	820075	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549705224
18033	NC_022535	CTT	2	6	820103	820108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705225
18034	NC_022535	AAGCTG	2	12	820142	820153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549705225
18035	NC_022535	ATT	2	6	820161	820166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705225
18036	NC_022535	GGC	2	6	820204	820209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705225
18037	NC_022535	CTG	2	6	820250	820255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18038	NC_022535	GGAT	2	8	820275	820282	25 %	25 %	50 %	0 %	549705225
18039	NC_022535	CGG	2	6	820357	820362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705225
18040	NC_022535	GTG	2	6	820403	820408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705225
18041	NC_022535	TGA	2	6	820413	820418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705225
18042	NC_022535	GCGGT	2	10	820443	820452	0 %	20 %	60 %	20 %	549705225
18043	NC_022535	TCT	2	6	820481	820486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705225
18044	NC_022535	CAT	2	6	820582	820587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705225
18045	NC_022535	GCC	2	6	820618	820623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705225
18046	NC_022535	CGC	2	6	820629	820634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705225
18047	NC_022535	CGCC	2	8	820680	820687	0 %	0 %	25 %	75 %	549705225
18048	NC_022535	CCG	2	6	820749	820754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705225
18049	NC_022535	CGC	2	6	820759	820764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705225
18050	NC_022535	CGA	2	6	820840	820845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18051	NC_022535	CGAT	2	8	820878	820885	25 %	25 %	25 %	25 %	549705225
18052	NC_022535	GATG	2	8	820897	820904	25 %	25 %	50 %	0 %	549705225
18053	NC_022535	GCT	2	6	820909	820914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18054	NC_022535	GGC	2	6	820919	820924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705225
18055	NC_022535	CAA	2	6	820936	820941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549705225
18056	NC_022535	GCA	2	6	820966	820971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18057	NC_022535	GAC	2	6	821009	821014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18058	NC_022535	CTG	2	6	821042	821047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705225
18059	NC_022535	CG	3	6	821069	821074	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18060	NC_022535	CGGC	2	8	821095	821102	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18061	NC_022535	CAC	2	6	821124	821129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705225
18062	NC_022535	TACGC	2	10	821185	821194	20 %	20 %	20 %	40 %	549705225
18063	NC_022535	GC	3	6	821263	821268	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18064	NC_022535	ATG	2	6	821321	821326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705225
18065	NC_022535	GGA	2	6	821398	821403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705225
18066	NC_022535	GCGG	2	8	821515	821522	0 %	0 %	75 %	25 %	549705225
18067	NC_022535	GC	3	6	821524	821529	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18068	NC_022535	GC	3	6	821635	821640	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18069	NC_022535	GCCG	2	8	821650	821657	0 %	0 %	50 %	50 %	549705225
18070	NC_022535	TGG	2	6	821679	821684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705225
18071	NC_022535	GAT	2	6	821686	821691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705225
18072	NC_022535	GGC	2	6	821711	821716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_022535	TTA	2	6	821729	821734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_022535	ATG	2	6	821779	821784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_022535	TTG	2	6	821797	821802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_022535	CGC	2	6	821834	821839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18077	NC_022535	CTTT	2	8	821896	821903	0 %	75 %	0 %	25 %	549705226
18078	NC_022535	AG	3	6	821923	821928	50 %	0 %	50 %	0 %	549705226
18079	NC_022535	CGCGG	2	10	821952	821961	0 %	0 %	60 %	40 %	549705226
18080	NC_022535	CAG	2	6	821988	821993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18081	NC_022535	GCC	2	6	822004	822009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705226
18082	NC_022535	CACC	2	8	822091	822098	25 %	0 %	0 %	75 %	549705226
18083	NC_022535	TGC	2	6	822099	822104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18084	NC_022535	GGC	2	6	822112	822117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705226
18085	NC_022535	TCGA	2	8	822191	822198	25 %	25 %	25 %	25 %	549705226
18086	NC_022535	GGC	2	6	822266	822271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705226
18087	NC_022535	TGA	2	6	822300	822305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705226
18088	NC_022535	TGC	2	6	822333	822338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18089	NC_022535	ATT	2	6	822375	822380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705226
18090	NC_022535	ACG	2	6	822390	822395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18091	NC_022535	GGC	3	9	822412	822420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705226
18092	NC_022535	CTT	2	6	822460	822465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705226
18093	NC_022535	GGC	2	6	822485	822490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705226
18094	NC_022535	TGC	2	6	822529	822534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18095	NC_022535	GAG	2	6	822587	822592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705226
18096	NC_022535	CGA	2	6	822601	822606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18097	NC_022535	CGA	2	6	822610	822615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18098	NC_022535	TCA	2	6	822624	822629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705226
18099	NC_022535	CTC	2	6	822634	822639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549705226
18100	NC_022535	CTG	2	6	822674	822679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705226
18101	NC_022535	GGA	2	6	822691	822696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705226
18102	NC_022535	AAG	2	6	822764	822769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549705226
18103	NC_022535	GTG	2	6	822794	822799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705226
18104	NC_022535	GGA	2	6	822811	822816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705226
18105	NC_022535	GAG	2	6	822886	822891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_022535	CCA	2	6	822969	822974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705227
18107	NC_022535	T	6	6	822984	822989	0 %	100 %	0 %	0 %	549705227
18108	NC_022535	GC	3	6	823003	823008	0 %	0 %	50 %	50 %	549705227
18109	NC_022535	TTG	2	6	823009	823014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549705227
18110	NC_022535	GAC	2	6	823074	823079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705227
18111	NC_022535	GTCAT	2	10	823102	823111	20 %	40 %	20 %	20 %	549705227
18112	NC_022535	CGC	2	6	823217	823222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705227
18113	NC_022535	GGGC	2	8	823273	823280	0 %	0 %	75 %	25 %	549705227
18114	NC_022535	GCC	2	6	823311	823316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705227
18115	NC_022535	GCA	3	9	823322	823330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705227
18116	NC_022535	GGC	2	6	823356	823361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705227
18117	NC_022535	TCA	2	6	823438	823443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705227
18118	NC_022535	CAGC	2	8	823470	823477	25 %	0 %	25 %	50 %	549705227
18119	NC_022535	CGT	2	6	823506	823511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705227
18120	NC_022535	GCCGG	2	10	823614	823623	0 %	0 %	60 %	40 %	549705227
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18364	NC_022535	CGG	2	6	833669	833674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705238
18365	NC_022535	CAGCCG	2	12	833700	833711	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549705238
18366	NC_022535	GCC	2	6	833779	833784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705238
18367	NC_022535	AGA	2	6	833809	833814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549705238
18368	NC_022535	CGG	2	6	833832	833837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705238
18369	NC_022535	CAG	2	6	833862	833867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705238
18370	NC_022535	TTG	2	6	833881	833886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549705238
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18372	NC_022535	CAGG	2	8	833958	833965	25 %	0 %	50 %	25 %	549705238
18373	NC_022535	CACG	2	8	833969	833976	25 %	0 %	25 %	50 %	549705238
18374	NC_022535	TGTT	2	8	834076	834083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18375	NC_022535	GCCG	2	8	834109	834116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18376	NC_022535	GCG	2	6	834127	834132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18377	NC_022535	AGG	2	6	834154	834159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18378	NC_022535	CGT	2	6	834178	834183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705239
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18385	NC_022535	GCT	2	6	834423	834428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705239
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18394	NC_022535	GAG	3	9	834910	834918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18395	NC_022535	AATGGA	2	12	834924	834935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549705240
18396	NC_022535	TCG	2	6	834977	834982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705240
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18400	NC_022535	GAT	2	6	835188	835193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705240
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18404	NC_022535	ATG	2	6	835319	835324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705240
18405	NC_022535	GAAC	2	8	835434	835441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18406	NC_022535	GCC	2	6	835444	835449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18407	NC_022535	GCG	2	6	835457	835462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18408	NC_022535	GAC	2	6	835500	835505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18409	NC_022535	TGA	2	6	835544	835549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705241
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18412	NC_022535	GCG	2	6	835667	835672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705241
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18463	NC_022535	CGG	2	6	837789	837794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705243
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18467	NC_022535	CG	3	6	837989	837994	0 %	0 %	50 %	50 %	549705243
18468	NC_022535	TCG	2	6	838041	838046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705243
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18474	NC_022535	CAA	2	6	838199	838204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549705244
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18477	NC_022535	TGA	2	6	838372	838377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705244
18478	NC_022535	CGA	2	6	838415	838420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705244
18479	NC_022535	GAT	2	6	838433	838438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705244
18480	NC_022535	CCG	2	6	838456	838461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705244
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18482	NC_022535	CACG	2	8	838486	838493	25 %	0 %	25 %	50 %	549705244
18483	NC_022535	GAG	2	6	838509	838514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705244
18484	NC_022535	CGC	2	6	838515	838520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705244
18485	NC_022535	GA	3	6	838542	838547	50 %	0 %	50 %	0 %	549705244
18486	NC_022535	GCG	2	6	838586	838591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705245
18487	NC_022535	CCG	2	6	838596	838601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705245
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18491	NC_022535	CGG	2	6	838870	838875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705245
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18495	NC_022535	TTG	2	6	838951	838956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_022535	GCA	2	6	839024	839029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705246
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