MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022535	GAC	2	6	730824	730829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705126
16002	NC_022535	CGG	2	6	730893	730898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705126
16003	NC_022535	GAT	3	9	730914	730922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705126
16004	NC_022535	GTC	2	6	730957	730962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705126
16005	NC_022535	CG	4	8	731016	731023	0 %	0 %	50 %	50 %	549705127
16006	NC_022535	GGCATC	2	12	731041	731052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549705127
16007	NC_022535	GAT	2	6	731080	731085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705127
16008	NC_022535	CAC	2	6	731170	731175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705127
16009	NC_022535	CGG	2	6	731199	731204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705127
16010	NC_022535	AGC	2	6	731210	731215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705127
16011	NC_022535	GCA	2	6	731237	731242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705127
16012	NC_022535	CGA	2	6	731376	731381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705127
16013	NC_022535	GCCGCA	2	12	731403	731414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549705127
16014	NC_022535	CAATG	2	10	731509	731518	40 %	20 %	20 %	20 %	549705127
16015	NC_022535	GCG	2	6	731550	731555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705127
16016	NC_022535	AGCC	2	8	731567	731574	25 %	0 %	25 %	50 %	549705127
16017	NC_022535	GC	3	6	731622	731627	0 %	0 %	50 %	50 %	549705128
16018	NC_022535	GCA	2	6	731644	731649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705128
16019	NC_022535	GCC	2	6	731746	731751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705128
16020	NC_022535	TGGT	2	8	731791	731798	0 %	50 %	50 %	0 %	549705128
16021	NC_022535	GGC	2	6	731841	731846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705128
16022	NC_022535	CCG	2	6	731869	731874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705128
16023	NC_022535	GC	4	8	731885	731892	0 %	0 %	50 %	50 %	549705128
16024	NC_022535	GCCGAG	2	12	731961	731972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549705128
16025	NC_022535	TCG	2	6	731995	732000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705128
16026	NC_022535	GAT	2	6	732015	732020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705128
16027	NC_022535	GCTTG	2	10	732117	732126	0 %	40 %	40 %	20 %	549705128
16028	NC_022535	GGT	2	6	732153	732158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705128
16029	NC_022535	CGTCAA	2	12	732201	732212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549705128
16030	NC_022535	CGG	2	6	732254	732259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705128
16031	NC_022535	TCA	2	6	732317	732322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_022535	A	7	7	732343	732349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_022535	CGAA	2	8	732407	732414	50 %	0 %	25 %	25 %	549705129
16034	NC_022535	GCA	2	6	732415	732420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16035	NC_022535	TCC	2	6	732451	732456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549705129
16036	NC_022535	GCT	2	6	732486	732491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16037	NC_022535	TCA	2	6	732497	732502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705129
16038	NC_022535	GC	3	6	732546	732551	0 %	0 %	50 %	50 %	549705129
16039	NC_022535	ATT	2	6	732562	732567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705129
16040	NC_022535	GCT	2	6	732609	732614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16041	NC_022535	CG	3	6	732625	732630	0 %	0 %	50 %	50 %	549705129
16042	NC_022535	ATG	2	6	732650	732655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705129
16043	NC_022535	CCG	3	9	732702	732710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705129
16044	NC_022535	CGC	2	6	732792	732797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705129
16045	NC_022535	AGG	2	6	732830	732835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705129
16046	NC_022535	TGG	2	6	732853	732858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705129
16047	NC_022535	GCCG	2	8	732919	732926	0 %	0 %	50 %	50 %	549705129
16048	NC_022535	TCG	2	6	733010	733015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16049	NC_022535	CCAC	2	8	733055	733062	25 %	0 %	0 %	75 %	549705129
16050	NC_022535	CGC	2	6	733071	733076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705129
16051	NC_022535	CGC	2	6	733094	733099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705129
16052	NC_022535	AGG	2	6	733100	733105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705129
16053	NC_022535	GA	3	6	733107	733112	50 %	0 %	50 %	0 %	549705129
16054	NC_022535	TCC	2	6	733237	733242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549705129
16055	NC_022535	TGC	2	6	733274	733279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16056	NC_022535	TAT	2	6	733315	733320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705129
16057	NC_022535	TAT	2	6	733363	733368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705129
16058	NC_022535	GCA	2	6	733433	733438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705129
16059	NC_022535	CGC	2	6	733450	733455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705129
16060	NC_022535	GC	3	6	733476	733481	0 %	0 %	50 %	50 %	549705129
16061	NC_022535	GGC	2	6	733490	733495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705129
16062	NC_022535	GGA	2	6	733575	733580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705129
16063	NC_022535	GAT	2	6	733600	733605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_022535	GA	3	6	733609	733614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_022535	TCT	2	6	733681	733686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_022535	CCG	2	6	733689	733694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_022535	GAGG	2	8	733722	733729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_022535	GAA	2	6	733799	733804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_022535	GCG	2	6	733835	733840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_022535	CG	3	6	733923	733928	0 %	0 %	50 %	50 %	549705130
16071	NC_022535	TCA	2	6	733932	733937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705130
16072	NC_022535	GC	3	6	733974	733979	0 %	0 %	50 %	50 %	549705130
16073	NC_022535	CG	3	6	734043	734048	0 %	0 %	50 %	50 %	549705130
16074	NC_022535	GCC	2	6	734055	734060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705130
16075	NC_022535	CGC	2	6	734109	734114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705130
16076	NC_022535	TCT	2	6	734130	734135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705130
16077	NC_022535	CGT	2	6	734172	734177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705130
16078	NC_022535	TGC	2	6	734252	734257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705130
16079	NC_022535	AGGGA	2	10	734268	734277	40 %	0 %	60 %	0 %	549705130
16080	NC_022535	GGCCG	2	10	734293	734302	0 %	0 %	60 %	40 %	549705130
16081	NC_022535	AGG	2	6	734322	734327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549705130
16082	NC_022535	CCA	2	6	734337	734342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705130
16083	NC_022535	TCA	2	6	734450	734455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705130
16084	NC_022535	CGG	2	6	734482	734487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705130
16085	NC_022535	CGC	2	6	734547	734552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705130
16086	NC_022535	CCGGG	2	10	734582	734591	0 %	0 %	60 %	40 %	549705130
16087	NC_022535	CGG	2	6	734598	734603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705130
16088	NC_022535	CGG	2	6	734652	734657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705130
16089	NC_022535	CCA	2	6	734733	734738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705130
16090	NC_022535	CTT	2	6	734763	734768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705130
16091	NC_022535	CG	3	6	734769	734774	0 %	0 %	50 %	50 %	549705130
16092	NC_022535	CTG	2	6	734844	734849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705130
16093	NC_022535	TCA	3	9	734879	734887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705130
16094	NC_022535	CCGG	2	8	734983	734990	0 %	0 %	50 %	50 %	549705131
16095	NC_022535	CCA	2	6	735033	735038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705131
16096	NC_022535	CGGCA	2	10	735052	735061	20 %	0 %	40 %	40 %	549705131
16097	NC_022535	TTG	2	6	735110	735115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549705131
16098	NC_022535	ATCG	2	8	735124	735131	25 %	25 %	25 %	25 %	549705131
16099	NC_022535	GC	3	6	735175	735180	0 %	0 %	50 %	50 %	549705131
16100	NC_022535	GCC	2	6	735217	735222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16101	NC_022535	CGG	2	6	735300	735305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705131
16102	NC_022535	CCG	2	6	735408	735413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16103	NC_022535	TTC	2	6	735484	735489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705131
16104	NC_022535	GGC	2	6	735505	735510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705131
16105	NC_022535	AGA	2	6	735519	735524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549705131
16106	NC_022535	ATCCCA	2	12	735544	735555	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549705131
16107	NC_022535	GC	3	6	735594	735599	0 %	0 %	50 %	50 %	549705131
16108	NC_022535	ACC	2	6	735620	735625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705131
16109	NC_022535	CG	3	6	735629	735634	0 %	0 %	50 %	50 %	549705131
16110	NC_022535	CGC	2	6	735655	735660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16111	NC_022535	CG	4	8	735666	735673	0 %	0 %	50 %	50 %	549705131
16112	NC_022535	CCG	3	9	735683	735691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16113	NC_022535	CGC	2	6	735752	735757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16114	NC_022535	TGT	2	6	735823	735828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549705131
16115	NC_022535	CGC	2	6	735893	735898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705131
16116	NC_022535	TCCA	2	8	735935	735942	25 %	25 %	0 %	50 %	549705131
16117	NC_022535	TGC	2	6	735944	735949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705131
16118	NC_022535	CGGG	2	8	735975	735982	0 %	0 %	75 %	25 %	549705131
16119	NC_022535	CCA	2	6	735990	735995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705131
16120	NC_022535	GGT	2	6	736030	736035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705131
16121	NC_022535	CTTT	2	8	736163	736170	0 %	75 %	0 %	25 %	549705132
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16235	NC_022535	CGCTG	2	10	741774	741783	0 %	20 %	40 %	40 %	549705140
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16237	NC_022535	GGC	2	6	741833	741838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705140
16238	NC_022535	AGCG	2	8	741855	741862	25 %	0 %	50 %	25 %	549705140
16239	NC_022535	CAG	2	6	741885	741890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705140
16240	NC_022535	GCG	2	6	741972	741977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16241	NC_022535	TCA	2	6	741997	742002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16242	NC_022535	CCA	2	6	742095	742100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705141
16243	NC_022535	TCGG	2	8	742145	742152	0 %	25 %	50 %	25 %	549705141
16244	NC_022535	TCA	2	6	742179	742184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705141
16245	NC_022535	CCG	2	6	742188	742193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705141
16246	NC_022535	TCC	2	6	742223	742228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549705141
16247	NC_022535	GTC	2	6	742260	742265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705141
16248	NC_022535	CGC	2	6	742314	742319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705141
16249	NC_022535	GC	3	6	742318	742323	0 %	0 %	50 %	50 %	549705141
16250	NC_022535	CGA	2	6	742390	742395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705141
16251	NC_022535	GCG	2	6	742408	742413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705141
16252	NC_022535	GCCAT	2	10	742466	742475	20 %	20 %	20 %	40 %	549705141
16253	NC_022535	CAT	2	6	742480	742485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705141
16254	NC_022535	TGA	2	6	742566	742571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705141
16255	NC_022535	GCC	2	6	742624	742629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705141
16256	NC_022535	TTC	2	6	742630	742635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705141
16257	NC_022535	GCC	2	6	742640	742645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705141
16258	NC_022535	CGCT	2	8	742667	742674	0 %	25 %	25 %	50 %	549705141
16259	NC_022535	GCA	2	6	742725	742730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705141
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16261	NC_022535	ACGG	2	8	742773	742780	25 %	0 %	50 %	25 %	549705142
16262	NC_022535	CGA	2	6	742803	742808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705142
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16270	NC_022535	TG	4	8	743277	743284	0 %	50 %	50 %	0 %	549705142
16271	NC_022535	TTC	2	6	743332	743337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705142
16272	NC_022535	CCAG	2	8	743363	743370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16273	NC_022535	CGC	2	6	743401	743406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16274	NC_022535	GTC	2	6	743506	743511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16275	NC_022535	CAGG	2	8	743513	743520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16276	NC_022535	GCC	2	6	743543	743548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705143
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16291	NC_022535	TCT	2	6	744318	744323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705143
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16324	NC_022535	A	8	8	745603	745610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16325	NC_022535	GTC	2	6	745694	745699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16326	NC_022535	TCG	2	6	745745	745750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16327	NC_022535	CG	4	8	745798	745805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16328	NC_022535	TTA	2	6	745882	745887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549705146
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16330	NC_022535	GCA	2	6	745968	745973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705146
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16332	NC_022535	GCT	2	6	746141	746146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705146
16333	NC_022535	TCG	3	9	746149	746157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705146
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16335	NC_022535	CA	3	6	746300	746305	50 %	0 %	0 %	50 %	549705146
16336	NC_022535	AGGATC	2	12	746419	746430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549705146
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16341	NC_022535	GCC	2	6	746605	746610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705146
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16344	NC_022535	GGT	2	6	746711	746716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705146
16345	NC_022535	CAG	2	6	746724	746729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705146
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16347	NC_022535	CGC	3	9	746744	746752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705146
16348	NC_022535	TCTGA	2	10	746757	746766	20 %	40 %	20 %	20 %	549705146
16349	NC_022535	GCC	2	6	746826	746831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705146
16350	NC_022535	ACG	2	6	746882	746887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705147
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16353	NC_022535	GAC	2	6	746932	746937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705147
16354	NC_022535	ATG	2	6	746945	746950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705147
16355	NC_022535	CAT	2	6	746953	746958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705147
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16357	NC_022535	CCA	2	6	746996	747001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705147
16358	NC_022535	TCG	2	6	747053	747058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705147
16359	NC_022535	GCG	2	6	747059	747064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705147
16360	NC_022535	CGT	2	6	747072	747077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705147
16361	NC_022535	CGG	2	6	747168	747173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705147
16362	NC_022535	CAC	2	6	747195	747200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705147
16363	NC_022535	TCT	2	6	747221	747226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705147
16364	NC_022535	CGG	2	6	747249	747254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705147
16365	NC_022535	GAT	2	6	747267	747272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549705147
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16375	NC_022535	CTG	3	9	747616	747624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705147
16376	NC_022535	GGCG	2	8	747642	747649	0 %	0 %	75 %	25 %	549705147
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16398	NC_022535	CG	3	6	748593	748598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16399	NC_022535	GGC	2	6	748633	748638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16400	NC_022535	GGC	2	6	748789	748794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16401	NC_022535	GGC	2	6	748938	748943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16402	NC_022535	GAAG	2	8	748948	748955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16403	NC_022535	CAGGA	2	10	748956	748965	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16404	NC_022535	GC	4	8	749028	749035	0 %	0 %	50 %	50 %	549705148
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16410	NC_022535	TCT	2	6	749353	749358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705148
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16426	NC_022535	AGG	3	9	750070	750078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16427	NC_022535	TGCCG	2	10	750194	750203	0 %	20 %	40 %	40 %	549705150
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16434	NC_022535	TTC	2	6	750552	750557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705150
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16436	NC_022535	GAG	2	6	750699	750704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16437	NC_022535	AGA	2	6	750774	750779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549705151
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16456	NC_022535	GAGC	2	8	751659	751666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16461	NC_022535	GACGC	2	10	751799	751808	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16462	NC_022535	GGC	2	6	751919	751924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705152
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16469	NC_022535	CAA	2	6	752254	752259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549705152
16470	NC_022535	AGGC	2	8	752269	752276	25 %	0 %	50 %	25 %	549705152
16471	NC_022535	TGAA	2	8	752284	752291	50 %	25 %	25 %	0 %	549705152
16472	NC_022535	GGC	2	6	752306	752311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705153
16473	NC_022535	CTG	2	6	752346	752351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705153
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16476	NC_022535	CCAC	2	8	752563	752570	25 %	0 %	0 %	75 %	549705153
16477	NC_022535	CGC	2	6	752599	752604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705153
16478	NC_022535	GCT	2	6	752756	752761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705153
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16481	NC_022535	GATGCC	2	12	752865	752876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549705153
16482	NC_022535	CGG	2	6	752888	752893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705153
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