MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022535	TCG	2	6	249712	249717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704655
5502	NC_022535	AAGGTG	2	12	249810	249821	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549704655
5503	NC_022535	CTT	3	9	249873	249881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704655
5504	NC_022535	GAAG	2	8	249887	249894	50 %	0 %	50 %	0 %	549704655
5505	NC_022535	GCCGA	2	10	249921	249930	20 %	0 %	40 %	40 %	549704655
5506	NC_022535	GAT	3	9	249947	249955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704655
5507	NC_022535	GC	3	6	250059	250064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_022535	AAG	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704656
5509	NC_022535	GTT	2	6	250222	250227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704656
5510	NC_022535	GCC	3	9	250231	250239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704656
5511	NC_022535	CAA	2	6	250269	250274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704656
5512	NC_022535	CG	3	6	250287	250292	0 %	0 %	50 %	50 %	549704656
5513	NC_022535	AAG	2	6	250324	250329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704656
5514	NC_022535	GTC	2	6	250330	250335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704656
5515	NC_022535	GCC	2	6	250479	250484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704657
5516	NC_022535	GCA	2	6	250502	250507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704657
5517	NC_022535	CAA	2	6	250558	250563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704657
5518	NC_022535	GCT	2	6	250601	250606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704657
5519	NC_022535	GCA	2	6	250712	250717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704657
5520	NC_022535	GC	3	6	250722	250727	0 %	0 %	50 %	50 %	549704657
5521	NC_022535	TCG	2	6	250728	250733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704657
5522	NC_022535	AGC	2	6	250735	250740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704657
5523	NC_022535	GAA	2	6	250741	250746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704657
5524	NC_022535	TGT	2	6	250825	250830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_022535	T	7	7	250864	250870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_022535	T	6	6	250901	250906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_022535	AGA	2	6	250920	250925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_022535	TGG	2	6	250960	250965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_022535	CGA	3	9	251024	251032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704658
5530	NC_022535	TCC	2	6	251056	251061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704658
5531	NC_022535	GTG	2	6	251144	251149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704658
5532	NC_022535	CTG	2	6	251178	251183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704658
5533	NC_022535	TTC	2	6	251194	251199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704658
5534	NC_022535	GCA	2	6	251255	251260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704658
5535	NC_022535	CAG	2	6	251265	251270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704658
5536	NC_022535	CCG	2	6	251286	251291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704658
5537	NC_022535	GTG	2	6	251316	251321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704658
5538	NC_022535	TCCGA	2	10	251373	251382	20 %	20 %	20 %	40 %	549704658
5539	NC_022535	GCC	2	6	251455	251460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704658
5540	NC_022535	CTT	3	9	251474	251482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704658
5541	NC_022535	GAG	2	6	251514	251519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704658
5542	NC_022535	GCT	2	6	251570	251575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704658
5543	NC_022535	CG	3	6	251593	251598	0 %	0 %	50 %	50 %	549704658
5544	NC_022535	ATG	2	6	251602	251607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704658
5545	NC_022535	CGC	2	6	251624	251629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704658
5546	NC_022535	GAA	2	6	251670	251675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704658
5547	NC_022535	T	6	6	251705	251710	0 %	100 %	0 %	0 %	549704658
5548	NC_022535	CGAC	2	8	251773	251780	25 %	0 %	25 %	50 %	549704658
5549	NC_022535	TGA	2	6	251785	251790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704658
5550	NC_022535	CGC	2	6	251807	251812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704658
5551	NC_022535	A	6	6	251817	251822	100 %	0 %	0 %	0 %	549704658
5552	NC_022535	CGC	3	9	251886	251894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704659
5553	NC_022535	AAG	2	6	251941	251946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704659
5554	NC_022535	GCA	2	6	251978	251983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704659
5555	NC_022535	GGA	2	6	251991	251996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704659
5556	NC_022535	GCC	2	6	252013	252018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704659
5557	NC_022535	CGC	2	6	252081	252086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704659
5558	NC_022535	CGC	2	6	252090	252095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704659
5559	NC_022535	TCAG	2	8	252173	252180	25 %	25 %	25 %	25 %	549704659
5560	NC_022535	TCG	2	6	252182	252187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704659
5561	NC_022535	GACT	2	8	252249	252256	25 %	25 %	25 %	25 %	549704659
5562	NC_022535	CTT	3	9	252318	252326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704659
5563	NC_022535	TGC	2	6	252356	252361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704659
5564	NC_022535	GCC	2	6	252408	252413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704659
5565	NC_022535	AAG	2	6	252508	252513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704659
5566	NC_022535	GAG	2	6	252544	252549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704659
5567	NC_022535	CTT	2	6	252561	252566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704659
5568	NC_022535	CGT	2	6	252579	252584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704659
5569	NC_022535	CTT	2	6	252603	252608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704659
5570	NC_022535	TGGA	2	8	252691	252698	25 %	25 %	50 %	0 %	549704659
5571	NC_022535	TGC	2	6	252731	252736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704659
5572	NC_022535	GC	3	6	252735	252740	0 %	0 %	50 %	50 %	549704659
5573	NC_022535	CGG	2	6	252741	252746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704659
5574	NC_022535	TTC	2	6	252838	252843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704659
5575	NC_022535	TCCG	2	8	252878	252885	0 %	25 %	25 %	50 %	549704659
5576	NC_022535	CGG	2	6	252906	252911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704659
5577	NC_022535	GAC	2	6	253054	253059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5578	NC_022535	GGC	2	6	253062	253067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5579	NC_022535	GGT	2	6	253092	253097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704660
5580	NC_022535	GC	4	8	253195	253202	0 %	0 %	50 %	50 %	549704660
5581	NC_022535	TCG	2	6	253208	253213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5582	NC_022535	ATG	2	6	253300	253305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704660
5583	NC_022535	CGA	2	6	253332	253337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5584	NC_022535	ACG	2	6	253340	253345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5585	NC_022535	CAT	2	6	253347	253352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704660
5586	NC_022535	CGG	2	6	253361	253366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5587	NC_022535	CTTC	2	8	253382	253389	0 %	50 %	0 %	50 %	549704660
5588	NC_022535	CAT	2	6	253391	253396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704660
5589	NC_022535	GAT	2	6	253408	253413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704660
5590	NC_022535	CCT	2	6	253526	253531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704660
5591	NC_022535	GAA	2	6	253626	253631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704660
5592	NC_022535	GCA	2	6	253653	253658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5593	NC_022535	TCT	2	6	253662	253667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704660
5594	NC_022535	TTG	2	6	253697	253702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704660
5595	NC_022535	GCCG	2	8	253733	253740	0 %	0 %	50 %	50 %	549704660
5596	NC_022535	CGC	2	6	253755	253760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704660
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5599	NC_022535	GTC	2	6	253855	253860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5600	NC_022535	CGG	2	6	253890	253895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5601	NC_022535	CGA	2	6	253923	253928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5602	NC_022535	CAT	2	6	254004	254009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704660
5603	NC_022535	GC	3	6	254017	254022	0 %	0 %	50 %	50 %	549704660
5604	NC_022535	ACC	2	6	254077	254082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704660
5605	NC_022535	GCG	3	9	254102	254110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5606	NC_022535	AG	3	6	254217	254222	50 %	0 %	50 %	0 %	549704660
5607	NC_022535	CG	3	6	254442	254447	0 %	0 %	50 %	50 %	549704660
5608	NC_022535	CGG	3	9	254523	254531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
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5610	NC_022535	CTG	2	6	254605	254610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5611	NC_022535	CCG	2	6	254612	254617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704660
5612	NC_022535	CTCG	2	8	254739	254746	0 %	25 %	25 %	50 %	549704660
5613	NC_022535	ACG	2	6	254807	254812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5614	NC_022535	CGG	2	6	254880	254885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5615	NC_022535	GCCT	2	8	254886	254893	0 %	25 %	25 %	50 %	549704660
5616	NC_022535	ATC	2	6	254897	254902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704660
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5619	NC_022535	GGC	2	6	255159	255164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
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5621	NC_022535	TCG	2	6	255326	255331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704660
5622	NC_022535	GGC	2	6	255352	255357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704660
5623	NC_022535	GC	3	6	255363	255368	0 %	0 %	50 %	50 %	549704660
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5753	NC_022535	G	6	6	262015	262020	0 %	0 %	100 %	0 %	549704668
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5866	NC_022535	CGG	2	6	266976	266981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704674
5867	NC_022535	GGC	2	6	266985	266990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704674
5868	NC_022535	CGGC	2	8	267074	267081	0 %	0 %	50 %	50 %	549704674
5869	NC_022535	TTCTGG	2	12	267107	267118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549704674
5870	NC_022535	GATG	2	8	267132	267139	25 %	25 %	50 %	0 %	549704674
5871	NC_022535	GGC	2	6	267150	267155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704674
5872	NC_022535	CCG	2	6	267214	267219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704674
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5874	NC_022535	CTG	3	9	267268	267276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704674
5875	NC_022535	T	7	7	267288	267294	0 %	100 %	0 %	0 %	549704674
5876	NC_022535	GCCGAC	2	12	267306	267317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549704674
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5879	NC_022535	GGCT	2	8	267463	267470	0 %	25 %	50 %	25 %	549704674
5880	NC_022535	TCAG	2	8	267539	267546	25 %	25 %	25 %	25 %	549704674
5881	NC_022535	GTC	2	6	267570	267575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704675
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5883	NC_022535	GCC	2	6	267688	267693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704675
5884	NC_022535	TGATC	2	10	267702	267711	20 %	40 %	20 %	20 %	549704675
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5887	NC_022535	TCG	2	6	267968	267973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704675
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5890	NC_022535	GCCAT	2	10	268111	268120	20 %	20 %	20 %	40 %	549704675
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5897	NC_022535	TGCCA	2	10	268537	268546	20 %	20 %	20 %	40 %	549704675
5898	NC_022535	AGCC	2	8	268553	268560	25 %	0 %	25 %	50 %	549704675
5899	NC_022535	TCGC	2	8	268583	268590	0 %	25 %	25 %	50 %	549704675
5900	NC_022535	TCG	2	6	268619	268624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704675
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5904	NC_022535	GATCCT	2	12	268722	268733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549704675
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5906	NC_022535	TCC	2	6	268859	268864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5907	NC_022535	GC	3	6	268885	268890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5933	NC_022535	CGG	2	6	270206	270211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5972	NC_022535	GACC	2	8	272060	272067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5973	NC_022535	GCT	2	6	272082	272087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5977	NC_022535	CGT	2	6	272347	272352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704682
5978	NC_022535	AT	3	6	272428	272433	50 %	50 %	0 %	0 %	549704682
5979	NC_022535	GTGA	2	8	272483	272490	25 %	25 %	50 %	0 %	549704682
5980	NC_022535	CGC	2	6	272541	272546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704682
5981	NC_022535	CAGG	2	8	272561	272568	25 %	0 %	50 %	25 %	549704682
5982	NC_022535	GAT	2	6	272605	272610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704682
5983	NC_022535	ACAAA	2	10	272623	272632	80 %	0 %	0 %	20 %	549704682
5984	NC_022535	CGC	2	6	272635	272640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704682
5985	NC_022535	CGT	2	6	272654	272659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5986	NC_022535	TTC	2	6	272662	272667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5987	NC_022535	GCA	2	6	272689	272694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5988	NC_022535	GGC	2	6	272740	272745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704683
5989	NC_022535	GAC	2	6	272763	272768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704683
5990	NC_022535	TGA	2	6	272792	272797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704683
5991	NC_022535	CG	3	6	272874	272879	0 %	0 %	50 %	50 %	549704683
5992	NC_022535	GCA	3	9	272939	272947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704683
5993	NC_022535	TCG	2	6	272995	273000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704683
5994	NC_022535	AGAT	2	8	273001	273008	50 %	25 %	25 %	0 %	549704683
5995	NC_022535	GGC	2	6	273095	273100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704683
5996	NC_022535	GC	3	6	273139	273144	0 %	0 %	50 %	50 %	549704683
5997	NC_022535	CGA	2	6	273176	273181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704683
5998	NC_022535	CCG	2	6	273208	273213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704683
5999	NC_022535	TGG	2	6	273220	273225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704683
6000	NC_022535	CGG	2	6	273326	273331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704683

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