MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_022535	CCG	2	6	2680658	2680663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59002	NC_022535	GAC	2	6	2680720	2680725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707148
59003	NC_022535	GCTG	2	8	2680751	2680758	0 %	25 %	50 %	25 %	549707148
59004	NC_022535	CGC	2	6	2680802	2680807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59005	NC_022535	T	6	6	2680840	2680845	0 %	100 %	0 %	0 %	549707148
59006	NC_022535	CGC	2	6	2680884	2680889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59007	NC_022535	CAT	2	6	2680901	2680906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549707148
59008	NC_022535	CGG	2	6	2680996	2681001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707148
59009	NC_022535	CGTC	2	8	2681009	2681016	0 %	25 %	25 %	50 %	549707148
59010	NC_022535	CCG	2	6	2681030	2681035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59011	NC_022535	GCA	2	6	2681113	2681118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707148
59012	NC_022535	GAA	2	6	2681148	2681153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707148
59013	NC_022535	ATC	2	6	2681167	2681172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549707148
59014	NC_022535	TCA	2	6	2681186	2681191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549707148
59015	NC_022535	CAG	2	6	2681193	2681198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707148
59016	NC_022535	CCA	3	9	2681222	2681230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707148
59017	NC_022535	CCA	2	6	2681246	2681251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707148
59018	NC_022535	TGA	2	6	2681363	2681368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707148
59019	NC_022535	GAAA	2	8	2681376	2681383	75 %	0 %	25 %	0 %	549707148
59020	NC_022535	ACG	2	6	2681401	2681406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707148
59021	NC_022535	GCC	2	6	2681435	2681440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59022	NC_022535	GAA	2	6	2681472	2681477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707148
59023	NC_022535	AAC	2	6	2681488	2681493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549707148
59024	NC_022535	GCC	2	6	2681563	2681568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707148
59025	NC_022535	GCGG	2	8	2681592	2681599	0 %	0 %	75 %	25 %	549707148
59026	NC_022535	GAA	2	6	2681660	2681665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707148
59027	NC_022535	GGAG	2	8	2681699	2681706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59028	NC_022535	AT	3	6	2681758	2681763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59029	NC_022535	CG	3	6	2681764	2681769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59030	NC_022535	GAC	2	6	2681870	2681875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707149
59031	NC_022535	CAGC	2	8	2681900	2681907	25 %	0 %	25 %	50 %	549707149
59032	NC_022535	GAA	2	6	2681921	2681926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707149
59033	NC_022535	ACC	3	9	2681934	2681942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707149
59034	NC_022535	GCG	2	6	2681964	2681969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707149
59035	NC_022535	AAG	2	6	2681970	2681975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707149
59036	NC_022535	TCG	2	6	2682046	2682051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707149
59037	NC_022535	CGAT	2	8	2682063	2682070	25 %	25 %	25 %	25 %	549707149
59038	NC_022535	GAT	3	9	2682068	2682076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707149
59039	NC_022535	TTG	2	6	2682147	2682152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549707149
59040	NC_022535	CAG	2	6	2682158	2682163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707149
59041	NC_022535	GAT	2	6	2682194	2682199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707149
59042	NC_022535	ATG	2	6	2682318	2682323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707149
59043	NC_022535	AGC	2	6	2682336	2682341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707149
59044	NC_022535	CGG	2	6	2682343	2682348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707149
59045	NC_022535	GCGAAC	2	12	2682367	2682378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707149
59046	NC_022535	GAT	2	6	2682472	2682477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707150
59047	NC_022535	CAGCG	2	10	2682584	2682593	20 %	0 %	40 %	40 %	549707150
59048	NC_022535	AGC	2	6	2682650	2682655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707150
59049	NC_022535	GAA	2	6	2682664	2682669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707150
59050	NC_022535	GCC	2	6	2682673	2682678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707150
59051	NC_022535	CAG	2	6	2682679	2682684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707150
59052	NC_022535	TGA	2	6	2682726	2682731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707150
59053	NC_022535	GTG	2	6	2682917	2682922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549707150
59054	NC_022535	CGC	2	6	2682933	2682938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707150
59055	NC_022535	ACG	2	6	2682959	2682964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707150
59056	NC_022535	CCA	2	6	2683011	2683016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707150
59057	NC_022535	CGA	2	6	2683169	2683174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59058	NC_022535	GCG	2	6	2683307	2683312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707151
59059	NC_022535	GAT	2	6	2683401	2683406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707151
59060	NC_022535	CG	3	6	2683542	2683547	0 %	0 %	50 %	50 %	549707151
59061	NC_022535	GCCG	2	8	2683557	2683564	0 %	0 %	50 %	50 %	549707151
59062	NC_022535	GGC	2	6	2683599	2683604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707151
59063	NC_022535	GTC	3	9	2683618	2683626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59064	NC_022535	ACG	2	6	2683648	2683653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59065	NC_022535	GA	3	6	2683675	2683680	50 %	0 %	50 %	0 %	549707151
59066	NC_022535	CGCC	2	8	2683727	2683734	0 %	0 %	25 %	75 %	549707151
59067	NC_022535	ATG	2	6	2683735	2683740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707151
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59069	NC_022535	TG	3	6	2683906	2683911	0 %	50 %	50 %	0 %	549707151
59070	NC_022535	TGG	2	6	2684037	2684042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549707151
59071	NC_022535	TCG	2	6	2684080	2684085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59072	NC_022535	AGC	2	6	2684086	2684091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707151
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59074	NC_022535	ACG	2	6	2684116	2684121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707151
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59077	NC_022535	GGA	2	6	2684259	2684264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549707151
59078	NC_022535	TCG	2	6	2684281	2684286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707151
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59081	NC_022535	CGT	2	6	2684360	2684365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59082	NC_022535	GCA	2	6	2684410	2684415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707151
59083	NC_022535	CGAA	2	8	2684456	2684463	50 %	0 %	25 %	25 %	549707151
59084	NC_022535	T	6	6	2684469	2684474	0 %	100 %	0 %	0 %	549707151
59085	NC_022535	GTT	2	6	2684494	2684499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59087	NC_022535	GTT	2	6	2684660	2684665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549707152
59088	NC_022535	CAA	2	6	2684668	2684673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549707152
59089	NC_022535	AACC	2	8	2684689	2684696	50 %	0 %	0 %	50 %	549707152
59090	NC_022535	C	6	6	2684728	2684733	0 %	0 %	0 %	100 %	549707152
59091	NC_022535	CGC	2	6	2684747	2684752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707152
59092	NC_022535	GC	3	6	2684767	2684772	0 %	0 %	50 %	50 %	549707152
59093	NC_022535	TGCG	2	8	2684788	2684795	0 %	25 %	50 %	25 %	549707152
59094	NC_022535	TTC	2	6	2684852	2684857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549707152
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59096	NC_022535	TCGG	2	8	2684895	2684902	0 %	25 %	50 %	25 %	549707152
59097	NC_022535	GTC	2	6	2685020	2685025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707152
59098	NC_022535	TGG	2	6	2685093	2685098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549707152
59099	NC_022535	GAA	2	6	2685120	2685125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707152
59100	NC_022535	AGGCGC	2	12	2685126	2685137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549707152
59101	NC_022535	CCA	2	6	2685283	2685288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707152
59102	NC_022535	ATG	2	6	2685333	2685338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707152
59103	NC_022535	TGAA	2	8	2685375	2685382	50 %	25 %	25 %	0 %	549707152
59104	NC_022535	TGCGG	2	10	2685417	2685426	0 %	20 %	60 %	20 %	549707152
59105	NC_022535	CCG	2	6	2685469	2685474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707152
59106	NC_022535	GCG	2	6	2685585	2685590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707152
59107	NC_022535	GAT	2	6	2685602	2685607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707152
59108	NC_022535	GC	3	6	2685608	2685613	0 %	0 %	50 %	50 %	549707152
59109	NC_022535	GCG	2	6	2685635	2685640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707152
59110	NC_022535	CCGC	2	8	2685730	2685737	0 %	0 %	25 %	75 %	549707152
59111	NC_022535	GAC	2	6	2685763	2685768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707152
59112	NC_022535	C	6	6	2685804	2685809	0 %	0 %	0 %	100 %	549707153
59113	NC_022535	CCATTC	2	12	2685862	2685873	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549707153
59114	NC_022535	GGCCG	2	10	2685874	2685883	0 %	0 %	60 %	40 %	549707153
59115	NC_022535	ATG	2	6	2685887	2685892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549707153
59116	NC_022535	ATC	2	6	2685901	2685906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549707153
59117	NC_022535	GGC	2	6	2686012	2686017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707153
59118	NC_022535	GGTGCG	2	12	2686057	2686068	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549707153
59119	NC_022535	GC	3	6	2686071	2686076	0 %	0 %	50 %	50 %	549707153
59120	NC_022535	GAC	2	6	2686430	2686435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707153
59121	NC_022535	CAC	2	6	2686444	2686449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549707153
59122	NC_022535	TGC	2	6	2686594	2686599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707153
59123	NC_022535	TTG	2	6	2686649	2686654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549707153
59124	NC_022535	GGC	2	6	2686798	2686803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59125	NC_022535	CTC	2	6	2686860	2686865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549707154
59126	NC_022535	GCG	2	6	2686904	2686909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707154
59127	NC_022535	GTACC	2	10	2686934	2686943	20 %	20 %	20 %	40 %	549707154
59128	NC_022535	TGG	2	6	2686948	2686953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549707154
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59131	NC_022535	CTT	2	6	2687085	2687090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549707154
59132	NC_022535	GC	3	6	2687091	2687096	0 %	0 %	50 %	50 %	549707154
59133	NC_022535	CGC	2	6	2687175	2687180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707154
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59137	NC_022535	GC	3	6	2687295	2687300	0 %	0 %	50 %	50 %	549707154
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59143	NC_022535	GGC	2	6	2687440	2687445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707154
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59145	NC_022535	CGA	2	6	2687531	2687536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707154
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59156	NC_022535	GAA	2	6	2688193	2688198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59157	NC_022535	GC	3	6	2688260	2688265	0 %	0 %	50 %	50 %	549707155
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59177	NC_022535	CGA	2	6	2688792	2688797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707155
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59219	NC_022535	GC	3	6	2690429	2690434	0 %	0 %	50 %	50 %	549707157
59220	NC_022535	AAG	2	6	2690454	2690459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549707157
59221	NC_022535	GCTGCG	2	12	2690481	2690492	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549707157
59222	NC_022535	CTG	2	6	2690500	2690505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707157
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59224	NC_022535	CGC	2	6	2690556	2690561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59225	NC_022535	T	6	6	2690565	2690570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59226	NC_022535	AGA	2	6	2690617	2690622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59227	NC_022535	GC	3	6	2690677	2690682	0 %	0 %	50 %	50 %	549707158
59228	NC_022535	CGA	3	9	2690903	2690911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707158
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59230	NC_022535	CGA	2	6	2690921	2690926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707158
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59232	NC_022535	CTG	2	6	2691024	2691029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549707158
59233	NC_022535	GGC	2	6	2691077	2691082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707158
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59339	NC_022535	GGC	2	6	2695411	2695416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549707165
59340	NC_022535	GCA	2	6	2695424	2695429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707165
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59343	NC_022535	GCC	2	6	2695622	2695627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549707165
59344	NC_022535	ACG	2	6	2695634	2695639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707165
59345	NC_022535	GGCAAC	2	12	2695645	2695656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549707165
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