MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_022535	ATC	2	6	2466066	2466071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706956
54502	NC_022535	GCG	2	6	2466148	2466153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706956
54503	NC_022535	AAG	2	6	2466164	2466169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706956
54504	NC_022535	T	6	6	2466224	2466229	0 %	100 %	0 %	0 %	549706957
54505	NC_022535	AAT	2	6	2466288	2466293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706957
54506	NC_022535	CTC	2	6	2466462	2466467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54507	NC_022535	CGG	2	6	2466579	2466584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54508	NC_022535	TCAA	2	8	2466599	2466606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54509	NC_022535	CG	3	6	2466614	2466619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54510	NC_022535	ACA	2	6	2466643	2466648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54511	NC_022535	GCT	2	6	2466682	2466687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706958
54512	NC_022535	CAA	2	6	2466730	2466735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706958
54513	NC_022535	CTT	3	9	2466742	2466750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706958
54514	NC_022535	GC	4	8	2466833	2466840	0 %	0 %	50 %	50 %	549706958
54515	NC_022535	TTC	2	6	2466845	2466850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706958
54516	NC_022535	CAG	2	6	2466878	2466883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706958
54517	NC_022535	AGCC	2	8	2466921	2466928	25 %	0 %	25 %	50 %	549706958
54518	NC_022535	CGG	2	6	2466958	2466963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706958
54519	NC_022535	GAC	3	9	2467033	2467041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706958
54520	NC_022535	A	7	7	2467084	2467090	100 %	0 %	0 %	0 %	549706958
54521	NC_022535	CGC	2	6	2467166	2467171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706958
54522	NC_022535	ATG	2	6	2467173	2467178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706958
54523	NC_022535	CG	3	6	2467204	2467209	0 %	0 %	50 %	50 %	549706958
54524	NC_022535	ATG	3	9	2467281	2467289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706958
54525	NC_022535	ATTT	2	8	2467346	2467353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54526	NC_022535	GCC	2	6	2467388	2467393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54527	NC_022535	GGA	2	6	2467562	2467567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54528	NC_022535	ACGG	2	8	2467625	2467632	25 %	0 %	50 %	25 %	549706959
54529	NC_022535	CGC	2	6	2467667	2467672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706959
54530	NC_022535	ACG	2	6	2467712	2467717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706959
54531	NC_022535	TCGG	2	8	2467730	2467737	0 %	25 %	50 %	25 %	549706959
54532	NC_022535	TC	3	6	2467759	2467764	0 %	50 %	0 %	50 %	549706959
54533	NC_022535	TGG	2	6	2467815	2467820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706959
54534	NC_022535	CGG	2	6	2467848	2467853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706959
54535	NC_022535	C	6	6	2467892	2467897	0 %	0 %	0 %	100 %	549706959
54536	NC_022535	CGG	2	6	2467944	2467949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706959
54537	NC_022535	A	6	6	2467956	2467961	100 %	0 %	0 %	0 %	549706959
54538	NC_022535	TTCC	2	8	2467998	2468005	0 %	50 %	0 %	50 %	549706959
54539	NC_022535	CGT	2	6	2468065	2468070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706959
54540	NC_022535	CTG	2	6	2468117	2468122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706959
54541	NC_022535	CGG	2	6	2468188	2468193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706959
54542	NC_022535	GC	3	6	2468239	2468244	0 %	0 %	50 %	50 %	549706959
54543	NC_022535	TTG	2	6	2468286	2468291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706959
54544	NC_022535	CA	3	6	2468340	2468345	50 %	0 %	0 %	50 %	549706959
54545	NC_022535	TGG	2	6	2468385	2468390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706959
54546	NC_022535	CGG	2	6	2468408	2468413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706959
54547	NC_022535	GCC	2	6	2468453	2468458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706959
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54549	NC_022535	GCC	2	6	2468585	2468590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706960
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54552	NC_022535	GCA	2	6	2468880	2468885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706960
54553	NC_022535	ATC	2	6	2468935	2468940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706960
54554	NC_022535	TCA	2	6	2468978	2468983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706960
54555	NC_022535	CGCAA	2	10	2469106	2469115	40 %	0 %	20 %	40 %	549706960
54556	NC_022535	CGG	2	6	2469147	2469152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54557	NC_022535	CAA	2	6	2469190	2469195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54558	NC_022535	GAG	2	6	2469204	2469209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54559	NC_022535	GGA	2	6	2469225	2469230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54560	NC_022535	CATT	2	8	2469245	2469252	25 %	50 %	0 %	25 %	549706961
54561	NC_022535	CGCGC	2	10	2469264	2469273	0 %	0 %	40 %	60 %	549706961
54562	NC_022535	GGCA	2	8	2469280	2469287	25 %	0 %	50 %	25 %	549706961
54563	NC_022535	CGG	2	6	2469288	2469293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706961
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54567	NC_022535	CAG	3	9	2469479	2469487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706961
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54571	NC_022535	TGGC	2	8	2469587	2469594	0 %	25 %	50 %	25 %	549706961
54572	NC_022535	TCAC	2	8	2469623	2469630	25 %	25 %	0 %	50 %	549706961
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54583	NC_022535	GTC	2	6	2470133	2470138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706961
54584	NC_022535	GGTT	2	8	2470144	2470151	0 %	50 %	50 %	0 %	549706961
54585	NC_022535	GTC	2	6	2470214	2470219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706961
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54589	NC_022535	GCCG	2	8	2470369	2470376	0 %	0 %	50 %	50 %	549706961
54590	NC_022535	CTGG	2	8	2470378	2470385	0 %	25 %	50 %	25 %	549706961
54591	NC_022535	CGG	2	6	2470489	2470494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706961
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54598	NC_022535	CGCTC	2	10	2470857	2470866	0 %	20 %	20 %	60 %	549706962
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54600	NC_022535	GCG	2	6	2470928	2470933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706962
54601	NC_022535	GAT	2	6	2470947	2470952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706962
54602	NC_022535	GAT	2	6	2470986	2470991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706962
54603	NC_022535	GCTGGT	2	12	2471088	2471099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549706962
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54606	NC_022535	CG	3	6	2471162	2471167	0 %	0 %	50 %	50 %	549706962
54607	NC_022535	GAT	2	6	2471235	2471240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706962
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54612	NC_022535	TTA	2	6	2471382	2471387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549706962
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54615	NC_022535	CAT	3	9	2471427	2471435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706962
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54617	NC_022535	TTC	2	6	2471553	2471558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706963
54618	NC_022535	TGA	2	6	2471569	2471574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706963
54619	NC_022535	TTC	2	6	2471592	2471597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706963
54620	NC_022535	GAT	2	6	2471603	2471608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706963
54621	NC_022535	TCGCTG	2	12	2471610	2471621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706963
54622	NC_022535	CCG	2	6	2471649	2471654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706963
54623	NC_022535	TTC	2	6	2471715	2471720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706963
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54627	NC_022535	CGG	2	6	2471827	2471832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706963
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54629	NC_022535	CTTT	2	8	2471865	2471872	0 %	75 %	0 %	25 %	549706963
54630	NC_022535	CTG	2	6	2471889	2471894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706963
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54636	NC_022535	TCT	2	6	2472121	2472126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706963
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54640	NC_022535	TGC	3	9	2472268	2472276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706963
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54642	NC_022535	GGC	2	6	2472333	2472338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706963
54643	NC_022535	CAAA	2	8	2472347	2472354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54644	NC_022535	CGTCAT	2	12	2472418	2472429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549706964
54645	NC_022535	TCG	2	6	2472465	2472470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706964
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54647	NC_022535	CTG	2	6	2472506	2472511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706964
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54649	NC_022535	GCCC	2	8	2472583	2472590	0 %	0 %	25 %	75 %	549706964
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54652	NC_022535	CCAAGG	2	12	2472702	2472713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706964
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54690	NC_022535	GC	3	6	2474400	2474405	0 %	0 %	50 %	50 %	549706965
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54712	NC_022535	CTT	2	6	2475600	2475605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706966
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54720	NC_022535	CTGC	2	8	2476093	2476100	0 %	25 %	25 %	50 %	549706967
54721	NC_022535	GAT	2	6	2476156	2476161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706967
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54723	NC_022535	CCG	2	6	2476212	2476217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706967
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54727	NC_022535	CGC	2	6	2476276	2476281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706967
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54730	NC_022535	GCC	2	6	2476452	2476457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706967
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54849	NC_022535	GCG	2	6	2481810	2481815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706972
54850	NC_022535	CAT	2	6	2481850	2481855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706972
54851	NC_022535	CGA	2	6	2481941	2481946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706973
54852	NC_022535	CAC	2	6	2482023	2482028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706973
54853	NC_022535	GCGG	2	8	2482140	2482147	0 %	0 %	75 %	25 %	549706973
54854	NC_022535	TGA	2	6	2482148	2482153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706973
54855	NC_022535	GC	3	6	2482186	2482191	0 %	0 %	50 %	50 %	549706973
54856	NC_022535	CGT	2	6	2482262	2482267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706973
54857	NC_022535	AGC	2	6	2482291	2482296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706973
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54859	NC_022535	GAT	2	6	2482344	2482349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706973
54860	NC_022535	GCCCCG	2	12	2482358	2482369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706973
54861	NC_022535	AGC	2	6	2482399	2482404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706973
54862	NC_022535	GAC	2	6	2482452	2482457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706973
54863	NC_022535	CGG	2	6	2482493	2482498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706973
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54865	NC_022535	TGA	2	6	2482790	2482795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706973
54866	NC_022535	TCA	2	6	2482796	2482801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706973
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54871	NC_022535	TGG	2	6	2482957	2482962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706974
54872	NC_022535	CG	3	6	2483055	2483060	0 %	0 %	50 %	50 %	549706974
54873	NC_022535	GGC	2	6	2483072	2483077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706974
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54875	NC_022535	CGT	2	6	2483128	2483133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706974
54876	NC_022535	TTG	2	6	2483145	2483150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706974
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54878	NC_022535	GC	3	6	2483229	2483234	0 %	0 %	50 %	50 %	549706974
54879	NC_022535	AAT	2	6	2483344	2483349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706974
54880	NC_022535	TGG	2	6	2483475	2483480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706974
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54884	NC_022535	AGGTC	2	10	2483671	2483680	20 %	20 %	40 %	20 %	549706974
54885	NC_022535	GCA	2	6	2483707	2483712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706974
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54887	NC_022535	GAT	2	6	2483750	2483755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706974
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54893	NC_022535	CGT	2	6	2483987	2483992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706974
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54911	NC_022535	GGAAC	2	10	2484415	2484424	40 %	0 %	40 %	20 %	549706974
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54944	NC_022535	GACGG	2	10	2486339	2486348	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54945	NC_022535	T	6	6	2486421	2486426	0 %	100 %	0 %	0 %	549706977
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54950	NC_022535	ATG	2	6	2486617	2486622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706977
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54953	NC_022535	GC	3	6	2486842	2486847	0 %	0 %	50 %	50 %	549706977
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54957	NC_022535	GCG	2	6	2486916	2486921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706977
54958	NC_022535	TA	3	6	2486955	2486960	50 %	50 %	0 %	0 %	549706977
54959	NC_022535	GGC	2	6	2486995	2487000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706977
54960	NC_022535	CGC	2	6	2487059	2487064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706977
54961	NC_022535	CTT	2	6	2487119	2487124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706977
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54966	NC_022535	TGA	2	6	2487307	2487312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706977
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