MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_022535	CTC	2	6	2400973	2400978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706892
53002	NC_022535	CTG	2	6	2400985	2400990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706892
53003	NC_022535	TTC	2	6	2401066	2401071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706892
53004	NC_022535	ACC	2	6	2401078	2401083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706892
53005	NC_022535	GGC	2	6	2401084	2401089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706892
53006	NC_022535	GGT	2	6	2401098	2401103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706892
53007	NC_022535	GC	3	6	2401107	2401112	0 %	0 %	50 %	50 %	549706892
53008	NC_022535	AGG	2	6	2401154	2401159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706892
53009	NC_022535	TCT	2	6	2401235	2401240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706892
53010	NC_022535	CGG	2	6	2401269	2401274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706892
53011	NC_022535	ATG	2	6	2401291	2401296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706892
53012	NC_022535	CGG	2	6	2401341	2401346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706892
53013	NC_022535	TCG	2	6	2401367	2401372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706892
53014	NC_022535	AGC	2	6	2401399	2401404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706892
53015	NC_022535	CAG	2	6	2401480	2401485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706892
53016	NC_022535	GCG	2	6	2401533	2401538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53017	NC_022535	TCT	2	6	2401543	2401548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53018	NC_022535	CCG	2	6	2401551	2401556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53019	NC_022535	GAA	2	6	2401658	2401663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53020	NC_022535	AAT	2	6	2401721	2401726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53021	NC_022535	GC	3	6	2401761	2401766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53022	NC_022535	CTG	2	6	2401842	2401847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706893
53023	NC_022535	CCG	2	6	2401874	2401879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706893
53024	NC_022535	TCG	2	6	2401882	2401887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706893
53025	NC_022535	CG	3	6	2401908	2401913	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53026	NC_022535	CGC	2	6	2401973	2401978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706893
53027	NC_022535	GC	3	6	2402141	2402146	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53028	NC_022535	GC	3	6	2402168	2402173	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53029	NC_022535	CAT	2	6	2402177	2402182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706893
53030	NC_022535	CCT	2	6	2402192	2402197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706893
53031	NC_022535	GCA	2	6	2402198	2402203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706893
53032	NC_022535	GC	3	6	2402222	2402227	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53033	NC_022535	CCGC	2	8	2402248	2402255	0 %	0 %	25 %	75 %	549706893
53034	NC_022535	CG	3	6	2402269	2402274	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53035	NC_022535	GAT	2	6	2402280	2402285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706893
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53037	NC_022535	CAAA	2	8	2402330	2402337	75 %	0 %	0 %	25 %	549706893
53038	NC_022535	AAGG	2	8	2402355	2402362	50 %	0 %	50 %	0 %	549706893
53039	NC_022535	GC	3	6	2402427	2402432	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53040	NC_022535	GAG	2	6	2402457	2402462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706893
53041	NC_022535	AGG	2	6	2402524	2402529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706893
53042	NC_022535	CG	3	6	2402531	2402536	0 %	0 %	50 %	50 %	549706893
53043	NC_022535	CGG	2	6	2402561	2402566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706893
53044	NC_022535	GCA	2	6	2402569	2402574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706893
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53047	NC_022535	GCA	2	6	2402633	2402638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706893
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53053	NC_022535	CGC	2	6	2402900	2402905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706893
53054	NC_022535	GAT	2	6	2402909	2402914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706893
53055	NC_022535	AGG	2	6	2402932	2402937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706893
53056	NC_022535	GCT	2	6	2402960	2402965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706893
53057	NC_022535	GGT	2	6	2403017	2403022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706893
53058	NC_022535	GAAGCG	2	12	2403029	2403040	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549706893
53059	NC_022535	TGTGG	2	10	2403051	2403060	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53060	NC_022535	C	6	6	2403088	2403093	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53061	NC_022535	CTGCC	2	10	2403095	2403104	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53062	NC_022535	G	6	6	2403122	2403127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53063	NC_022535	AGG	2	6	2403136	2403141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53064	NC_022535	C	6	6	2403202	2403207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53065	NC_022535	G	6	6	2403236	2403241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53066	NC_022535	CCCG	2	8	2403284	2403291	0 %	0 %	25 %	75 %	549706894
53067	NC_022535	GCG	2	6	2403356	2403361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706894
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53069	NC_022535	GAT	2	6	2403557	2403562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706894
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53079	NC_022535	GCCG	2	8	2404016	2404023	0 %	0 %	50 %	50 %	549706894
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53081	NC_022535	GTC	2	6	2404077	2404082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706894
53082	NC_022535	CAG	2	6	2404107	2404112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706894
53083	NC_022535	GCCG	2	8	2404206	2404213	0 %	0 %	50 %	50 %	549706895
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53101	NC_022535	CACC	2	8	2405324	2405331	25 %	0 %	0 %	75 %	549706896
53102	NC_022535	GAA	2	6	2405421	2405426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706896
53103	NC_022535	TCG	2	6	2405440	2405445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706896
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53106	NC_022535	A	6	6	2405596	2405601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53107	NC_022535	A	7	7	2405637	2405643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_022535	CCT	2	6	2405715	2405720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53109	NC_022535	CCG	2	6	2405741	2405746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53110	NC_022535	CCG	2	6	2405813	2405818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706897
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53117	NC_022535	GAC	2	6	2406147	2406152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706897
53118	NC_022535	TGG	2	6	2406194	2406199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706897
53119	NC_022535	CGC	2	6	2406253	2406258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706897
53120	NC_022535	CAT	2	6	2406263	2406268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706897
53121	NC_022535	GGTG	2	8	2406311	2406318	0 %	25 %	75 %	0 %	549706897
53122	NC_022535	TG	3	6	2406386	2406391	0 %	50 %	50 %	0 %	549706897
53123	NC_022535	GGT	2	6	2406488	2406493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706897
53124	NC_022535	AAG	2	6	2406601	2406606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706897
53125	NC_022535	TG	3	6	2406628	2406633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53126	NC_022535	GC	3	6	2406720	2406725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53127	NC_022535	CGG	2	6	2406729	2406734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53128	NC_022535	CGA	2	6	2406849	2406854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706898
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53131	NC_022535	TGG	2	6	2407108	2407113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706898
53132	NC_022535	AT	3	6	2407134	2407139	50 %	50 %	0 %	0 %	549706898
53133	NC_022535	TTC	2	6	2407195	2407200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706898
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53139	NC_022535	CGC	3	9	2407459	2407467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706898
53140	NC_022535	CGC	2	6	2407507	2407512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706898
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53143	NC_022535	GAAG	2	8	2407644	2407651	50 %	0 %	50 %	0 %	549706898
53144	NC_022535	CG	4	8	2407662	2407669	0 %	0 %	50 %	50 %	549706898
53145	NC_022535	GTG	2	6	2407678	2407683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706898
53146	NC_022535	ATC	2	6	2407729	2407734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53147	NC_022535	T	6	6	2407754	2407759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53148	NC_022535	GGCG	2	8	2407770	2407777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53149	NC_022535	GGA	2	6	2407815	2407820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53150	NC_022535	CCG	2	6	2407922	2407927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53151	NC_022535	CCT	2	6	2407978	2407983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53152	NC_022535	GGCAG	2	10	2408000	2408009	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53153	NC_022535	G	6	6	2408011	2408016	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53154	NC_022535	CACC	2	8	2408024	2408031	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53155	NC_022535	CCG	2	6	2408070	2408075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53156	NC_022535	GGC	2	6	2408094	2408099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53157	NC_022535	GCC	2	6	2408104	2408109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53158	NC_022535	GCC	2	6	2408148	2408153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706899
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53178	NC_022535	ACC	2	6	2409047	2409052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706899
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53180	NC_022535	ACC	2	6	2409122	2409127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706899
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53189	NC_022535	ATC	2	6	2409302	2409307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706899
53190	NC_022535	TGT	2	6	2409325	2409330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706899
53191	NC_022535	CGCCTG	2	12	2409335	2409346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549706899
53192	NC_022535	ACG	2	6	2409444	2409449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706899
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53194	NC_022535	GCT	2	6	2409481	2409486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706899
53195	NC_022535	ATG	2	6	2409587	2409592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706899
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53199	NC_022535	GCGGT	2	10	2409757	2409766	0 %	20 %	60 %	20 %	549706899
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53210	NC_022535	CG	3	6	2410112	2410117	0 %	0 %	50 %	50 %	549706899
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53212	NC_022535	TTC	2	6	2410124	2410129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706899
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53214	NC_022535	TCC	3	9	2410188	2410196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706899
53215	NC_022535	GGC	2	6	2410241	2410246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706899
53216	NC_022535	CAA	2	6	2410271	2410276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706899
53217	NC_022535	TTC	2	6	2410277	2410282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706899
53218	NC_022535	CGG	2	6	2410283	2410288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706899
53219	NC_022535	GC	3	6	2410328	2410333	0 %	0 %	50 %	50 %	549706899
53220	NC_022535	TCG	2	6	2410431	2410436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53221	NC_022535	GTC	2	6	2410524	2410529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706900
53222	NC_022535	TCC	2	6	2410576	2410581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706900
53223	NC_022535	GC	3	6	2410694	2410699	0 %	0 %	50 %	50 %	549706900
53224	NC_022535	CTGG	2	8	2410701	2410708	0 %	25 %	50 %	25 %	549706900
53225	NC_022535	GAT	2	6	2410715	2410720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706900
53226	NC_022535	TGG	2	6	2410820	2410825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706900
53227	NC_022535	CGAC	2	8	2410826	2410833	25 %	0 %	25 %	50 %	549706900
53228	NC_022535	TCGG	2	8	2410942	2410949	0 %	25 %	50 %	25 %	549706900
53229	NC_022535	CG	3	6	2410967	2410972	0 %	0 %	50 %	50 %	549706900
53230	NC_022535	AGC	2	6	2411101	2411106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706900
53231	NC_022535	GC	3	6	2411114	2411119	0 %	0 %	50 %	50 %	549706900
53232	NC_022535	CGGCG	2	10	2411141	2411150	0 %	0 %	60 %	40 %	549706900
53233	NC_022535	CTT	2	6	2411151	2411156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706900
53234	NC_022535	AGC	3	9	2411161	2411169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706900
53235	NC_022535	CGA	2	6	2411263	2411268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706900
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53237	NC_022535	GTG	2	6	2411395	2411400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706900
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53240	NC_022535	ACG	2	6	2411611	2411616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706900
53241	NC_022535	ACG	2	6	2411698	2411703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706900
53242	NC_022535	CAA	2	6	2411729	2411734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706900
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53247	NC_022535	AAACCC	2	12	2411838	2411849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53248	NC_022535	TGT	2	6	2411864	2411869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53341	NC_022535	AT	3	6	2416182	2416187	50 %	50 %	0 %	0 %	549706905
53342	NC_022535	TCGATG	2	12	2416199	2416210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549706905
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53348	NC_022535	A	6	6	2416730	2416735	100 %	0 %	0 %	0 %	549706905
53349	NC_022535	TGT	2	6	2416737	2416742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706905
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53351	NC_022535	CGC	2	6	2416756	2416761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706905
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53353	NC_022535	CTT	2	6	2416813	2416818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53354	NC_022535	ACCG	2	8	2416997	2417004	25 %	0 %	25 %	50 %	549706906
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53362	NC_022535	CGA	2	6	2417175	2417180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706906
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53384	NC_022535	CGA	2	6	2417977	2417982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706906
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53386	NC_022535	CTTCA	2	10	2418045	2418054	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53387	NC_022535	CG	3	6	2418085	2418090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53388	NC_022535	CCAG	2	8	2418140	2418147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53389	NC_022535	CGC	2	6	2418178	2418183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53390	NC_022535	AGGG	2	8	2418239	2418246	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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53420	NC_022535	GGA	2	6	2419962	2419967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53469	NC_022535	CAC	2	6	2421847	2421852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706912
53470	NC_022535	GATAA	2	10	2421913	2421922	60 %	20 %	20 %	0 %	549706912
53471	NC_022535	TGA	2	6	2421936	2421941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706912
53472	NC_022535	GGC	3	9	2421952	2421960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53473	NC_022535	GGC	2	6	2422006	2422011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53474	NC_022535	CGC	2	6	2422017	2422022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706912
53475	NC_022535	GC	3	6	2422021	2422026	0 %	0 %	50 %	50 %	549706912
53476	NC_022535	CAC	2	6	2422036	2422041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706912
53477	NC_022535	CGTC	2	8	2422068	2422075	0 %	25 %	25 %	50 %	549706912
53478	NC_022535	TCC	2	6	2422097	2422102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706912
53479	NC_022535	GAT	2	6	2422129	2422134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706912
53480	NC_022535	CGC	3	9	2422135	2422143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706912
53481	NC_022535	CGC	2	6	2422159	2422164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706912
53482	NC_022535	CGG	2	6	2422227	2422232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53483	NC_022535	CAGC	2	8	2422275	2422282	25 %	0 %	25 %	50 %	549706912
53484	NC_022535	AG	3	6	2422297	2422302	50 %	0 %	50 %	0 %	549706912
53485	NC_022535	CGC	2	6	2422347	2422352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706912
53486	NC_022535	CGG	2	6	2422354	2422359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53487	NC_022535	GA	3	6	2422436	2422441	50 %	0 %	50 %	0 %	549706912
53488	NC_022535	GCT	2	6	2422531	2422536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706912
53489	NC_022535	CG	3	6	2422545	2422550	0 %	0 %	50 %	50 %	549706912
53490	NC_022535	GGC	2	6	2422654	2422659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53491	NC_022535	GCG	2	6	2422679	2422684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53492	NC_022535	GCG	2	6	2422694	2422699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706912
53493	NC_022535	CGC	2	6	2422771	2422776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53494	NC_022535	CGC	2	6	2422806	2422811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53495	NC_022535	CTGA	2	8	2422884	2422891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53496	NC_022535	CGT	2	6	2422944	2422949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706913
53497	NC_022535	CCA	2	6	2423093	2423098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706913
53498	NC_022535	CGC	2	6	2423139	2423144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706913
53499	NC_022535	TC	3	6	2423184	2423189	0 %	50 %	0 %	50 %	549706913
53500	NC_022535	TCA	2	6	2423216	2423221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706913

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