MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_022535	GAA	2	6	2315907	2315912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706802
51002	NC_022535	GCG	2	6	2315990	2315995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706802
51003	NC_022535	TGC	2	6	2316011	2316016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706802
51004	NC_022535	GC	3	6	2316076	2316081	0 %	0 %	50 %	50 %	549706802
51005	NC_022535	CTG	2	6	2316106	2316111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706802
51006	NC_022535	ATG	2	6	2316206	2316211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706802
51007	NC_022535	AGCG	2	8	2316331	2316338	25 %	0 %	50 %	25 %	549706802
51008	NC_022535	CGG	2	6	2316356	2316361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706802
51009	NC_022535	GC	3	6	2316381	2316386	0 %	0 %	50 %	50 %	549706802
51010	NC_022535	ACC	2	6	2316388	2316393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706802
51011	NC_022535	ACG	2	6	2316544	2316549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706803
51012	NC_022535	GGA	2	6	2316630	2316635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706803
51013	NC_022535	GAC	2	6	2316679	2316684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706803
51014	NC_022535	TCGCG	2	10	2316696	2316705	0 %	20 %	40 %	40 %	549706803
51015	NC_022535	TGG	2	6	2316707	2316712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706803
51016	NC_022535	CAG	2	6	2316727	2316732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706803
51017	NC_022535	GTG	2	6	2316742	2316747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706803
51018	NC_022535	CAC	2	6	2316793	2316798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706803
51019	NC_022535	GAGC	2	8	2316894	2316901	25 %	0 %	50 %	25 %	549706803
51020	NC_022535	GCCT	2	8	2317061	2317068	0 %	25 %	25 %	50 %	549706803
51021	NC_022535	TGA	2	6	2317091	2317096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706803
51022	NC_022535	GGA	2	6	2317107	2317112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706803
51023	NC_022535	CGC	2	6	2317176	2317181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706803
51024	NC_022535	CAA	2	6	2317182	2317187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706803
51025	NC_022535	CGCAT	2	10	2317213	2317222	20 %	20 %	20 %	40 %	549706803
51026	NC_022535	GC	3	6	2317244	2317249	0 %	0 %	50 %	50 %	549706803
51027	NC_022535	CGGCC	2	10	2317269	2317278	0 %	0 %	40 %	60 %	549706803
51028	NC_022535	GCA	2	6	2317308	2317313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706803
51029	NC_022535	CAGAGC	2	12	2317318	2317329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706803
51030	NC_022535	GCC	2	6	2317352	2317357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706804
51031	NC_022535	GAC	2	6	2317361	2317366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706804
51032	NC_022535	ACC	2	6	2317406	2317411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706804
51033	NC_022535	GCAG	2	8	2317417	2317424	25 %	0 %	50 %	25 %	549706804
51034	NC_022535	CCGC	2	8	2317429	2317436	0 %	0 %	25 %	75 %	549706804
51035	NC_022535	GCG	3	9	2317494	2317502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706804
51036	NC_022535	AT	3	6	2317516	2317521	50 %	50 %	0 %	0 %	549706804
51037	NC_022535	TGCC	2	8	2317666	2317673	0 %	25 %	25 %	50 %	549706804
51038	NC_022535	TGC	2	6	2317674	2317679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706804
51039	NC_022535	GCCCT	2	10	2317689	2317698	0 %	20 %	20 %	60 %	549706804
51040	NC_022535	CAT	2	6	2317705	2317710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706804
51041	NC_022535	GGC	2	6	2317739	2317744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706804
51042	NC_022535	GGA	2	6	2317831	2317836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706804
51043	NC_022535	GCA	2	6	2317979	2317984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51044	NC_022535	CCGG	2	8	2318045	2318052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51045	NC_022535	CAT	2	6	2318106	2318111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706805
51046	NC_022535	GTG	2	6	2318133	2318138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706805
51047	NC_022535	TCG	2	6	2318219	2318224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706805
51048	NC_022535	ATG	2	6	2318228	2318233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706805
51049	NC_022535	TCAT	2	8	2318261	2318268	25 %	50 %	0 %	25 %	549706805
51050	NC_022535	GAG	2	6	2318278	2318283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706805
51051	NC_022535	GAA	2	6	2318323	2318328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706805
51052	NC_022535	CCG	2	6	2318331	2318336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706805
51053	NC_022535	TGGCG	2	10	2318343	2318352	0 %	20 %	60 %	20 %	549706805
51054	NC_022535	CG	4	8	2318351	2318358	0 %	0 %	50 %	50 %	549706805
51055	NC_022535	CAA	2	6	2318372	2318377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706805
51056	NC_022535	GCC	2	6	2318383	2318388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706805
51057	NC_022535	CTG	2	6	2318415	2318420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706805
51058	NC_022535	CGC	2	6	2318521	2318526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51059	NC_022535	CCG	2	6	2318527	2318532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51060	NC_022535	CAT	2	6	2318539	2318544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51061	NC_022535	CAC	2	6	2318549	2318554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51062	NC_022535	AGG	2	6	2318566	2318571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51063	NC_022535	CAT	2	6	2318593	2318598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706806
51064	NC_022535	GCC	2	6	2318630	2318635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706806
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51066	NC_022535	GCA	2	6	2318713	2318718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706806
51067	NC_022535	CTG	2	6	2318723	2318728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706806
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51072	NC_022535	CGC	2	6	2319101	2319106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706807
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51077	NC_022535	CAC	2	6	2319332	2319337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706807
51078	NC_022535	CGAGA	2	10	2319378	2319387	40 %	0 %	40 %	20 %	549706807
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51082	NC_022535	GCA	2	6	2319554	2319559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706807
51083	NC_022535	GAAG	2	8	2319570	2319577	50 %	0 %	50 %	0 %	549706807
51084	NC_022535	CGT	2	6	2319600	2319605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706807
51085	NC_022535	AAG	2	6	2319650	2319655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51089	NC_022535	CGG	2	6	2319918	2319923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706808
51090	NC_022535	TGCCG	2	10	2319982	2319991	0 %	20 %	40 %	40 %	549706808
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51101	NC_022535	CGG	2	6	2320621	2320626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706808
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51105	NC_022535	TCT	2	6	2320878	2320883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51106	NC_022535	CTTGTT	2	12	2320968	2320979	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549706809
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51116	NC_022535	GAT	2	6	2321223	2321228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706809
51117	NC_022535	CCAG	2	8	2321242	2321249	25 %	0 %	25 %	50 %	549706809
51118	NC_022535	GCC	2	6	2321325	2321330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706809
51119	NC_022535	AGCA	2	8	2321394	2321401	50 %	0 %	25 %	25 %	549706809
51120	NC_022535	CAG	2	6	2321475	2321480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706809
51121	NC_022535	GAA	2	6	2321493	2321498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706809
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51123	NC_022535	ATC	2	6	2321593	2321598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706809
51124	NC_022535	GGT	2	6	2321601	2321606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706809
51125	NC_022535	GCC	2	6	2321622	2321627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706809
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51128	NC_022535	GCC	2	6	2321691	2321696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706809
51129	NC_022535	GAT	2	6	2321799	2321804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706809
51130	NC_022535	GCC	2	6	2321805	2321810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706809
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51139	NC_022535	ATG	2	6	2322049	2322054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706809
51140	NC_022535	CGA	2	6	2322056	2322061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706809
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51143	NC_022535	TGT	2	6	2322138	2322143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706809
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51147	NC_022535	CGA	2	6	2322232	2322237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706810
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51155	NC_022535	GAT	2	6	2322557	2322562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706810
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51178	NC_022535	CGA	2	6	2323582	2323587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706810
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51180	NC_022535	TTTTTA	2	12	2323725	2323736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51199	NC_022535	GTA	2	6	2324468	2324473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706811
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51203	NC_022535	TCG	3	9	2324646	2324654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706811
51204	NC_022535	GGTC	2	8	2324665	2324672	0 %	25 %	50 %	25 %	549706811
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51209	NC_022535	AAT	2	6	2324834	2324839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706811
51210	NC_022535	CT	3	6	2324852	2324857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51211	NC_022535	GAA	2	6	2324919	2324924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51212	NC_022535	GCTC	2	8	2324935	2324942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51213	NC_022535	CTC	2	6	2324976	2324981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51214	NC_022535	AT	3	6	2325043	2325048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51215	NC_022535	AT	3	6	2325057	2325062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51216	NC_022535	AAC	2	6	2325135	2325140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706812
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51218	NC_022535	GAG	2	6	2325223	2325228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706812
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51220	NC_022535	CGG	2	6	2325275	2325280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706812
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51222	NC_022535	AG	3	6	2325332	2325337	50 %	0 %	50 %	0 %	549706812
51223	NC_022535	CG	3	6	2325341	2325346	0 %	0 %	50 %	50 %	549706812
51224	NC_022535	GC	3	6	2325388	2325393	0 %	0 %	50 %	50 %	549706812
51225	NC_022535	GCG	2	6	2325452	2325457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706812
51226	NC_022535	CGCC	2	8	2325485	2325492	0 %	0 %	25 %	75 %	549706812
51227	NC_022535	AGC	2	6	2325568	2325573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706812
51228	NC_022535	GCTG	2	8	2325594	2325601	0 %	25 %	50 %	25 %	549706812
51229	NC_022535	TCA	2	6	2325614	2325619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706812
51230	NC_022535	TCCA	2	8	2325658	2325665	25 %	25 %	0 %	50 %	549706812
51231	NC_022535	GC	3	6	2325681	2325686	0 %	0 %	50 %	50 %	549706812
51232	NC_022535	TGG	2	6	2325692	2325697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706812
51233	NC_022535	GCG	2	6	2325722	2325727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706812
51234	NC_022535	GC	3	6	2325782	2325787	0 %	0 %	50 %	50 %	549706812
51235	NC_022535	GCG	2	6	2325792	2325797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706812
51236	NC_022535	GGA	2	6	2325804	2325809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706812
51237	NC_022535	TCA	2	6	2325848	2325853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706812
51238	NC_022535	CGCTTG	2	12	2325875	2325886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706812
51239	NC_022535	GGCC	2	8	2325939	2325946	0 %	0 %	50 %	50 %	549706812
51240	NC_022535	GTC	2	6	2325997	2326002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706812
51241	NC_022535	CAT	2	6	2326014	2326019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706812
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51244	NC_022535	CGG	2	6	2326108	2326113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51245	NC_022535	GTC	2	6	2326209	2326214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706813
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51252	NC_022535	CGG	2	6	2326468	2326473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706813
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51254	NC_022535	CGCC	2	8	2326532	2326539	0 %	0 %	25 %	75 %	549706813
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51261	NC_022535	CGA	2	6	2326908	2326913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706814
51262	NC_022535	TCGC	2	8	2327002	2327009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51263	NC_022535	CG	3	6	2327013	2327018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51264	NC_022535	GTGCC	2	10	2327133	2327142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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51286	NC_022535	CG	3	6	2328078	2328083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51287	NC_022535	GAAA	2	8	2328189	2328196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51288	NC_022535	AACC	2	8	2328208	2328215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51289	NC_022535	GATTCC	2	12	2328273	2328284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51290	NC_022535	T	6	6	2328359	2328364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51291	NC_022535	CGC	2	6	2328456	2328461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51292	NC_022535	CGAT	2	8	2328474	2328481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51293	NC_022535	GGC	3	9	2328516	2328524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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51295	NC_022535	TTC	2	6	2328556	2328561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51333	NC_022535	CTTC	2	8	2329712	2329719	0 %	50 %	0 %	50 %	549706817
51334	NC_022535	CTG	2	6	2329725	2329730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706817
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51338	NC_022535	CG	3	6	2329949	2329954	0 %	0 %	50 %	50 %	549706817
51339	NC_022535	AAT	2	6	2329974	2329979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706817
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51344	NC_022535	CAT	2	6	2330276	2330281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706817
51345	NC_022535	ACC	2	6	2330293	2330298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706817
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51347	NC_022535	GCG	2	6	2330431	2330436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706817
51348	NC_022535	CGA	2	6	2330516	2330521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706817
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51350	NC_022535	A	6	6	2330604	2330609	100 %	0 %	0 %	0 %	549706818
51351	NC_022535	AGG	2	6	2330630	2330635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706818
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51354	NC_022535	CAT	2	6	2330695	2330700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706818
51355	NC_022535	CAT	2	6	2330719	2330724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706818
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51366	NC_022535	GGC	2	6	2331037	2331042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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51467	NC_022535	GC	3	6	2335736	2335741	0 %	0 %	50 %	50 %	549706822
51468	NC_022535	GTTC	2	8	2335767	2335774	0 %	50 %	25 %	25 %	549706822
51469	NC_022535	CATG	2	8	2335917	2335924	25 %	25 %	25 %	25 %	549706822
51470	NC_022535	GC	3	6	2335939	2335944	0 %	0 %	50 %	50 %	549706822
51471	NC_022535	CGG	2	6	2335962	2335967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706822
51472	NC_022535	CATTT	2	10	2336009	2336018	20 %	60 %	0 %	20 %	549706822
51473	NC_022535	TCGCC	2	10	2336055	2336064	0 %	20 %	20 %	60 %	549706822
51474	NC_022535	GCG	2	6	2336068	2336073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706822
51475	NC_022535	CGG	2	6	2336076	2336081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706822
51476	NC_022535	T	7	7	2336133	2336139	0 %	100 %	0 %	0 %	549706822
51477	NC_022535	CCG	2	6	2336209	2336214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706822
51478	NC_022535	AACAT	2	10	2336356	2336365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51479	NC_022535	CCG	2	6	2336407	2336412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51480	NC_022535	GTA	2	6	2336451	2336456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51481	NC_022535	TGG	2	6	2336606	2336611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706823
51482	NC_022535	TGA	2	6	2336613	2336618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706823
51483	NC_022535	CG	3	6	2336666	2336671	0 %	0 %	50 %	50 %	549706823
51484	NC_022535	CGC	2	6	2336908	2336913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51485	NC_022535	GCT	2	6	2336943	2336948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706823
51486	NC_022535	CGG	2	6	2336949	2336954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706823
51487	NC_022535	GGC	2	6	2336971	2336976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706823
51488	NC_022535	CGG	2	6	2337012	2337017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706823
51489	NC_022535	CGA	2	6	2337021	2337026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706823
51490	NC_022535	GCC	2	6	2337070	2337075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51491	NC_022535	GCC	2	6	2337101	2337106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51492	NC_022535	ATG	2	6	2337142	2337147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706823
51493	NC_022535	TCG	2	6	2337212	2337217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706823
51494	NC_022535	CGC	2	6	2337250	2337255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51495	NC_022535	CCG	2	6	2337306	2337311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51496	NC_022535	TCAT	2	8	2337347	2337354	25 %	50 %	0 %	25 %	549706823
51497	NC_022535	CGT	2	6	2337378	2337383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706823
51498	NC_022535	T	6	6	2337383	2337388	0 %	100 %	0 %	0 %	549706823
51499	NC_022535	CCG	2	6	2337389	2337394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706823
51500	NC_022535	GGT	2	6	2337446	2337451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706824

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