MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_022535	GCGGAC	2	12	2271380	2271391	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549706757
50003	NC_022535	ATG	2	6	2271468	2271473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706757
50004	NC_022535	GCGCC	2	10	2271496	2271505	0 %	0 %	40 %	60 %	549706757
50005	NC_022535	CCGC	2	8	2271544	2271551	0 %	0 %	25 %	75 %	549706757
50006	NC_022535	CAT	2	6	2271571	2271576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706757
50007	NC_022535	CGC	2	6	2271604	2271609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706757
50008	NC_022535	CGG	2	6	2271751	2271756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706757
50009	NC_022535	GGT	2	6	2271793	2271798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706757
50010	NC_022535	ACG	2	6	2271803	2271808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706757
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50015	NC_022535	TCG	2	6	2271954	2271959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706757
50016	NC_022535	GCC	2	6	2271964	2271969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706757
50017	NC_022535	CG	3	6	2272030	2272035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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50117	NC_022535	CG	3	6	2276379	2276384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50118	NC_022535	ATCC	2	8	2276399	2276406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50119	NC_022535	C	6	6	2276575	2276580	0 %	0 %	0 %	100 %	549706762
50120	NC_022535	CGA	3	9	2276593	2276601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706762
50121	NC_022535	CCA	2	6	2276605	2276610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706762
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50123	NC_022535	ATC	2	6	2276847	2276852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706762
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50127	NC_022535	TCG	2	6	2277010	2277015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706762
50128	NC_022535	GC	4	8	2277023	2277030	0 %	0 %	50 %	50 %	549706762
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50151	NC_022535	GAT	2	6	2278197	2278202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706763
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50153	NC_022535	AAG	2	6	2278213	2278218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706763
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50155	NC_022535	GGC	2	6	2278255	2278260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50157	NC_022535	TTTG	2	8	2278275	2278282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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50166	NC_022535	CGC	2	6	2278712	2278717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706764
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50183	NC_022535	ATT	2	6	2279589	2279594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50187	NC_022535	GAC	2	6	2279791	2279796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706765
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50218	NC_022535	AGG	2	6	2281205	2281210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50219	NC_022535	CGT	2	6	2281211	2281216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706766
50220	NC_022535	GC	3	6	2281287	2281292	0 %	0 %	50 %	50 %	549706766
50221	NC_022535	ATC	3	9	2281318	2281326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706766
50222	NC_022535	GAAA	2	8	2281355	2281362	75 %	0 %	25 %	0 %	549706766
50223	NC_022535	ATG	2	6	2281394	2281399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706766
50224	NC_022535	CGC	2	6	2281400	2281405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706766
50225	NC_022535	CTC	2	6	2281441	2281446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706766
50226	NC_022535	CTG	2	6	2281564	2281569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706766
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50229	NC_022535	A	6	6	2281664	2281669	100 %	0 %	0 %	0 %	549706766
50230	NC_022535	TTC	2	6	2281673	2281678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706766
50231	NC_022535	CGCC	2	8	2281707	2281714	0 %	0 %	25 %	75 %	549706766
50232	NC_022535	GC	3	6	2281723	2281728	0 %	0 %	50 %	50 %	549706766
50233	NC_022535	GTG	2	6	2281862	2281867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706766
50234	NC_022535	TTC	2	6	2281945	2281950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706766
50235	NC_022535	TGATC	2	10	2282115	2282124	20 %	40 %	20 %	20 %	549706767
50236	NC_022535	GCA	2	6	2282151	2282156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706767
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50246	NC_022535	GCG	2	6	2282535	2282540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50247	NC_022535	GCC	2	6	2282542	2282547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50248	NC_022535	CGG	2	6	2282561	2282566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50250	NC_022535	ATA	2	6	2282669	2282674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50253	NC_022535	GCCT	2	8	2282754	2282761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50254	NC_022535	GCAT	2	8	2282813	2282820	25 %	25 %	25 %	25 %	549706768
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50279	NC_022535	TGCC	2	8	2283648	2283655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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50350	NC_022535	CCG	2	6	2286771	2286776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50351	NC_022535	GCC	2	6	2286806	2286811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50352	NC_022535	CGC	2	6	2286817	2286822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50353	NC_022535	CGC	2	6	2286853	2286858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50354	NC_022535	GTC	2	6	2286887	2286892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706770
50355	NC_022535	TCA	2	6	2286945	2286950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706770
50356	NC_022535	CCG	3	9	2286981	2286989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50357	NC_022535	CGC	2	6	2287024	2287029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706770
50358	NC_022535	TAT	2	6	2287049	2287054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549706770
50359	NC_022535	GCG	2	6	2287067	2287072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706770
50360	NC_022535	ATCG	2	8	2287084	2287091	25 %	25 %	25 %	25 %	549706770
50361	NC_022535	TCC	2	6	2287131	2287136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706770
50362	NC_022535	GCTG	2	8	2287209	2287216	0 %	25 %	50 %	25 %	549706770
50363	NC_022535	GGA	2	6	2287222	2287227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706770
50364	NC_022535	TGG	2	6	2287232	2287237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706770
50365	NC_022535	GGC	2	6	2287248	2287253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706770
50366	NC_022535	CCA	2	6	2287353	2287358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706770
50367	NC_022535	ACC	2	6	2287384	2287389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706770
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50369	NC_022535	GAGG	2	8	2287530	2287537	25 %	0 %	75 %	0 %	549706770
50370	NC_022535	TCCG	2	8	2287565	2287572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50371	NC_022535	GAA	2	6	2287600	2287605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50372	NC_022535	TCT	2	6	2287670	2287675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50373	NC_022535	CCG	2	6	2287678	2287683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50374	NC_022535	GC	3	6	2287695	2287700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50375	NC_022535	CCTC	2	8	2287737	2287744	0 %	25 %	0 %	75 %	549706771
50376	NC_022535	CG	3	6	2287812	2287817	0 %	0 %	50 %	50 %	549706771
50377	NC_022535	CGG	3	9	2287867	2287875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
50378	NC_022535	AT	3	6	2287885	2287890	50 %	50 %	0 %	0 %	549706771
50379	NC_022535	TGC	2	6	2287914	2287919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
50380	NC_022535	TGC	2	6	2287976	2287981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
50381	NC_022535	GGCG	2	8	2287982	2287989	0 %	0 %	75 %	25 %	549706771
50382	NC_022535	CGG	2	6	2288016	2288021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
50383	NC_022535	GCC	2	6	2288027	2288032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
50384	NC_022535	AGGCA	2	10	2288040	2288049	40 %	0 %	40 %	20 %	549706771
50385	NC_022535	AGC	3	9	2288064	2288072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706771
50386	NC_022535	CCG	2	6	2288073	2288078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
50387	NC_022535	GCTG	2	8	2288113	2288120	0 %	25 %	50 %	25 %	549706771
50388	NC_022535	GCT	2	6	2288131	2288136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
50389	NC_022535	CTGACC	2	12	2288141	2288152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549706771
50390	NC_022535	GCG	2	6	2288198	2288203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
50391	NC_022535	TTCG	2	8	2288231	2288238	0 %	50 %	25 %	25 %	549706771
50392	NC_022535	AGG	2	6	2288307	2288312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706771
50393	NC_022535	GCC	2	6	2288404	2288409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
50394	NC_022535	CGG	2	6	2288440	2288445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
50395	NC_022535	GCG	2	6	2288448	2288453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
50396	NC_022535	CCG	2	6	2288469	2288474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
50397	NC_022535	CGC	2	6	2288531	2288536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
50398	NC_022535	CT	3	6	2288626	2288631	0 %	50 %	0 %	50 %	549706772
50399	NC_022535	CG	3	6	2288661	2288666	0 %	0 %	50 %	50 %	549706772
50400	NC_022535	CG	3	6	2288679	2288684	0 %	0 %	50 %	50 %	549706772
50401	NC_022535	TGA	2	6	2288737	2288742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50402	NC_022535	GCC	2	6	2288867	2288872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706773
50403	NC_022535	CTG	2	6	2288948	2288953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50404	NC_022535	GAG	2	6	2288954	2288959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706773
50405	NC_022535	AGG	2	6	2289063	2289068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706773
50406	NC_022535	CTG	2	6	2289296	2289301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50407	NC_022535	TGC	2	6	2289321	2289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50408	NC_022535	CGG	2	6	2289349	2289354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706773
50409	NC_022535	CTG	2	6	2289374	2289379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50410	NC_022535	TGG	2	6	2289410	2289415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706773
50411	NC_022535	GCC	2	6	2289474	2289479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706773
50412	NC_022535	GCG	2	6	2289506	2289511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706773
50413	NC_022535	GCCA	2	8	2289515	2289522	25 %	0 %	25 %	50 %	549706773
50414	NC_022535	GCC	2	6	2289573	2289578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706773
50415	NC_022535	AGC	2	6	2289602	2289607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50416	NC_022535	ACT	2	6	2289618	2289623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706773
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50418	NC_022535	GCCG	2	8	2289705	2289712	0 %	0 %	50 %	50 %	549706773
50419	NC_022535	CAG	3	9	2289713	2289721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706773
50420	NC_022535	ACAG	2	8	2289777	2289784	50 %	0 %	25 %	25 %	549706774
50421	NC_022535	GGT	2	6	2289786	2289791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706774
50422	NC_022535	GAT	2	6	2289861	2289866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706774
50423	NC_022535	ATC	2	6	2289926	2289931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706774
50424	NC_022535	GCA	2	6	2289961	2289966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706774
50425	NC_022535	CGG	2	6	2290087	2290092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706774
50426	NC_022535	TCAC	2	8	2290134	2290141	25 %	25 %	0 %	50 %	549706775
50427	NC_022535	CAG	2	6	2290296	2290301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50428	NC_022535	CA	3	6	2290306	2290311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50429	NC_022535	ATGG	2	8	2290560	2290567	25 %	25 %	50 %	0 %	549706776
50430	NC_022535	TCA	2	6	2290592	2290597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706776
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50432	NC_022535	GAG	2	6	2290690	2290695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706776
50433	NC_022535	GGC	3	9	2290708	2290716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706776
50434	NC_022535	TAT	2	6	2290834	2290839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549706776
50435	NC_022535	GGC	2	6	2290840	2290845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706776
50436	NC_022535	TCGC	2	8	2290918	2290925	0 %	25 %	25 %	50 %	549706776
50437	NC_022535	GGCT	2	8	2290930	2290937	0 %	25 %	50 %	25 %	549706776
50438	NC_022535	CGC	2	6	2290961	2290966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706776
50439	NC_022535	CAA	2	6	2290971	2290976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706776
50440	NC_022535	TGA	2	6	2290988	2290993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706776
50441	NC_022535	TGG	2	6	2291012	2291017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706776
50442	NC_022535	CGC	2	6	2291055	2291060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706776
50443	NC_022535	CCA	2	6	2291087	2291092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706776
50444	NC_022535	TCA	3	9	2291114	2291122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706776
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50446	NC_022535	TCG	3	9	2291138	2291146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706776
50447	NC_022535	CAA	2	6	2291214	2291219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706776
50448	NC_022535	TCT	2	6	2291240	2291245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706776
50449	NC_022535	ATC	2	6	2291296	2291301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706776
50450	NC_022535	ACC	2	6	2291350	2291355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706776
50451	NC_022535	TCA	2	6	2291414	2291419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706776
50452	NC_022535	GCC	2	6	2291470	2291475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706776
50453	NC_022535	CGT	2	6	2291535	2291540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706776
50454	NC_022535	GCC	2	6	2291566	2291571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706776
50455	NC_022535	CGA	2	6	2291625	2291630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706776
50456	NC_022535	CGC	2	6	2291637	2291642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706776
50457	NC_022535	GCCAT	2	10	2291678	2291687	20 %	20 %	20 %	40 %	549706776
50458	NC_022535	CTG	2	6	2291805	2291810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50459	NC_022535	GCC	2	6	2291815	2291820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706777
50460	NC_022535	CCG	2	6	2291831	2291836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706777
50461	NC_022535	CG	3	6	2291835	2291840	0 %	0 %	50 %	50 %	549706777
50462	NC_022535	CGA	2	6	2291852	2291857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50463	NC_022535	GGC	2	6	2291886	2291891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706777
50464	NC_022535	ACC	2	6	2291977	2291982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706777
50465	NC_022535	GTC	2	6	2292042	2292047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50466	NC_022535	GCC	2	6	2292057	2292062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706777
50467	NC_022535	CTG	2	6	2292066	2292071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50468	NC_022535	GGA	2	6	2292098	2292103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706777
50469	NC_022535	GC	3	6	2292121	2292126	0 %	0 %	50 %	50 %	549706777
50470	NC_022535	GCC	3	9	2292186	2292194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706777
50471	NC_022535	CCG	2	6	2292217	2292222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706777
50472	NC_022535	CTT	2	6	2292227	2292232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706777
50473	NC_022535	CGG	2	6	2292266	2292271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706777
50474	NC_022535	TGA	2	6	2292277	2292282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706777
50475	NC_022535	CTG	2	6	2292306	2292311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50476	NC_022535	AC	3	6	2292313	2292318	50 %	0 %	0 %	50 %	549706777
50477	NC_022535	CCT	2	6	2292325	2292330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706777
50478	NC_022535	AGC	2	6	2292434	2292439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50479	NC_022535	TCTG	2	8	2292485	2292492	0 %	50 %	25 %	25 %	549706777
50480	NC_022535	CGAC	2	8	2292538	2292545	25 %	0 %	25 %	50 %	549706777
50481	NC_022535	GCCAT	2	10	2292598	2292607	20 %	20 %	20 %	40 %	549706777
50482	NC_022535	CGG	3	9	2292764	2292772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706777
50483	NC_022535	TGC	2	6	2292787	2292792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50484	NC_022535	TGA	2	6	2292865	2292870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706777
50485	NC_022535	CCT	2	6	2292958	2292963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706777
50486	NC_022535	GGT	2	6	2292992	2292997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706777
50487	NC_022535	GAA	2	6	2293011	2293016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706777
50488	NC_022535	CGA	2	6	2293040	2293045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706777
50489	NC_022535	GGCC	2	8	2293070	2293077	0 %	0 %	50 %	50 %	549706777
50490	NC_022535	GCT	2	6	2293127	2293132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50491	NC_022535	GCC	2	6	2293171	2293176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50492	NC_022535	TCTT	2	8	2293177	2293184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50493	NC_022535	CGG	2	6	2293190	2293195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50494	NC_022535	GAA	2	6	2293199	2293204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50495	NC_022535	CTCG	2	8	2293215	2293222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50496	NC_022535	CGAATG	2	12	2293253	2293264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50497	NC_022535	ACC	2	6	2293299	2293304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706778
50498	NC_022535	CTG	2	6	2293305	2293310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706778
50499	NC_022535	CGC	2	6	2293418	2293423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706778
50500	NC_022535	TCA	2	6	2293447	2293452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706778

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