MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021911	CTT	2	6	864459	864464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838322
19502	NC_021911	TGA	2	6	864505	864510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838322
19503	NC_021911	TTA	2	6	864547	864552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838322
19504	NC_021911	GAT	3	9	864563	864571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838322
19505	NC_021911	ATG	3	9	864641	864649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838323
19506	NC_021911	AAG	2	6	864782	864787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838323
19507	NC_021911	ACA	2	6	864834	864839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838323
19508	NC_021911	CGC	2	6	864976	864981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838323
19509	NC_021911	TTGC	2	8	864986	864993	0 %	50 %	25 %	25 %	528838323
19510	NC_021911	CGG	2	6	865024	865029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838323
19511	NC_021911	ACG	2	6	865095	865100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838323
19512	NC_021911	ATG	2	6	865109	865114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838323
19513	NC_021911	CTC	2	6	865130	865135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838323
19514	NC_021911	GGA	2	6	865141	865146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838323
19515	NC_021911	CTG	2	6	865202	865207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838323
19516	NC_021911	CGG	2	6	865249	865254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838323
19517	NC_021911	CGG	2	6	865398	865403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838323
19518	NC_021911	CCG	2	6	865431	865436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838323
19519	NC_021911	CGT	3	9	865485	865493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838324
19520	NC_021911	CAT	2	6	865515	865520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838324
19521	NC_021911	GA	3	6	865550	865555	50 %	0 %	50 %	0 %	528838324
19522	NC_021911	CGG	2	6	865616	865621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838324
19523	NC_021911	GAC	2	6	865666	865671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838324
19524	NC_021911	CTGA	2	8	865684	865691	25 %	25 %	25 %	25 %	528838324
19525	NC_021911	CAA	2	6	865704	865709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838324
19526	NC_021911	TGT	2	6	865880	865885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838324
19527	NC_021911	GCG	2	6	865921	865926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838324
19528	NC_021911	GTCG	2	8	865938	865945	0 %	25 %	50 %	25 %	528838324
19529	NC_021911	GTC	2	6	866020	866025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838324
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19532	NC_021911	GCC	2	6	866107	866112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838324
19533	NC_021911	GTC	2	6	866125	866130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838324
19534	NC_021911	CGA	2	6	866232	866237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838324
19535	NC_021911	TCCGC	2	10	866282	866291	0 %	20 %	20 %	60 %	528838324
19536	NC_021911	GCC	3	9	866311	866319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838324
19537	NC_021911	CG	3	6	866336	866341	0 %	0 %	50 %	50 %	528838324
19538	NC_021911	AGG	2	6	866381	866386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_021911	TTCA	2	8	866396	866403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19540	NC_021911	CTGATG	2	12	866423	866434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19541	NC_021911	CGA	2	6	866443	866448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_021911	ACC	2	6	866469	866474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19543	NC_021911	CAAA	2	8	866492	866499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19544	NC_021911	TCG	2	6	866515	866520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_021911	GCC	2	6	866547	866552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19546	NC_021911	TCG	2	6	866587	866592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_021911	CGA	2	6	866653	866658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19548	NC_021911	GGT	2	6	866666	866671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19549	NC_021911	CGC	2	6	866675	866680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19550	NC_021911	ATG	2	6	866728	866733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19551	NC_021911	AGCGA	2	10	866735	866744	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19552	NC_021911	CCG	2	6	866764	866769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19553	NC_021911	AAG	2	6	866799	866804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_021911	CGT	2	6	866807	866812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19555	NC_021911	TTC	2	6	866857	866862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19556	NC_021911	GAG	2	6	866878	866883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_021911	CCG	2	6	866892	866897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19558	NC_021911	TCG	2	6	866932	866937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19559	NC_021911	GGT	2	6	866945	866950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19560	NC_021911	CG	3	6	867039	867044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19561	NC_021911	CATCT	2	10	867054	867063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19562	NC_021911	CGG	2	6	867078	867083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19563	NC_021911	TCGG	2	8	867134	867141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19564	NC_021911	GC	3	6	867191	867196	0 %	0 %	50 %	50 %	528838325
19565	NC_021911	AGT	2	6	867224	867229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838325
19566	NC_021911	GGTTG	2	10	867274	867283	0 %	40 %	60 %	0 %	528838325
19567	NC_021911	GAC	2	6	867316	867321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838325
19568	NC_021911	CGCC	2	8	867357	867364	0 %	0 %	25 %	75 %	528838325
19569	NC_021911	CGC	2	6	867451	867456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838325
19570	NC_021911	CTT	2	6	867526	867531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838325
19571	NC_021911	AGC	2	6	867571	867576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838325
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19573	NC_021911	CGT	2	6	867618	867623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838325
19574	NC_021911	CTCG	2	8	867777	867784	0 %	25 %	25 %	50 %	528838325
19575	NC_021911	CCAT	2	8	867812	867819	25 %	25 %	0 %	50 %	528838325
19576	NC_021911	GCG	2	6	867918	867923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19577	NC_021911	AGGCT	2	10	867925	867934	20 %	20 %	40 %	20 %	528838326
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19579	NC_021911	CGACC	2	10	867976	867985	20 %	0 %	20 %	60 %	528838326
19580	NC_021911	GTC	2	6	867997	868002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
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19582	NC_021911	CGT	2	6	868092	868097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
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19584	NC_021911	GTC	2	6	868241	868246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
19585	NC_021911	ATG	2	6	868249	868254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838326
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19587	NC_021911	CGA	2	6	868320	868325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
19588	NC_021911	GCGG	2	8	868354	868361	0 %	0 %	75 %	25 %	528838326
19589	NC_021911	AGA	2	6	868385	868390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838326
19590	NC_021911	GGTGAT	2	12	868573	868584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	528838326
19591	NC_021911	TCGA	2	8	868610	868617	25 %	25 %	25 %	25 %	528838326
19592	NC_021911	GCCT	2	8	868618	868625	0 %	25 %	25 %	50 %	528838326
19593	NC_021911	GAG	2	6	868666	868671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838326
19594	NC_021911	CCGC	2	8	868835	868842	0 %	0 %	25 %	75 %	528838326
19595	NC_021911	TTC	2	6	868933	868938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838326
19596	NC_021911	GC	3	6	868942	868947	0 %	0 %	50 %	50 %	528838326
19597	NC_021911	TCT	2	6	868959	868964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838326
19598	NC_021911	ATCG	2	8	869035	869042	25 %	25 %	25 %	25 %	528838326
19599	NC_021911	CCG	2	6	869057	869062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838326
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19602	NC_021911	CTC	2	6	869287	869292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838326
19603	NC_021911	TCCAG	2	10	869312	869321	20 %	20 %	20 %	40 %	528838326
19604	NC_021911	CGGT	2	8	869469	869476	0 %	25 %	50 %	25 %	528838326
19605	NC_021911	C	6	6	869687	869692	0 %	0 %	0 %	100 %	528838326
19606	NC_021911	TG	3	6	869799	869804	0 %	50 %	50 %	0 %	528838326
19607	NC_021911	ATG	2	6	869817	869822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838326
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19613	NC_021911	CAG	3	9	870138	870146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
19614	NC_021911	TGC	2	6	870196	870201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
19615	NC_021911	GCTT	2	8	870215	870222	0 %	50 %	25 %	25 %	528838326
19616	NC_021911	CAT	2	6	870231	870236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838326
19617	NC_021911	CGT	2	6	870253	870258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
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19621	NC_021911	GCT	2	6	870470	870475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19622	NC_021911	GAT	2	6	870535	870540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19623	NC_021911	GCC	2	6	870734	870739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838327
19624	NC_021911	TTCG	2	8	870821	870828	0 %	50 %	25 %	25 %	528838327
19625	NC_021911	CGG	2	6	870846	870851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838327
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19644	NC_021911	TCC	2	6	871722	871727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19645	NC_021911	CTTC	2	8	871829	871836	0 %	50 %	0 %	50 %	528838328
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19860	NC_021911	ATG	2	6	882513	882518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838336
19861	NC_021911	TCT	2	6	882544	882549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838336
19862	NC_021911	TGCC	2	8	882741	882748	0 %	25 %	25 %	50 %	528838336
19863	NC_021911	ATC	2	6	882753	882758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838336
19864	NC_021911	CGG	2	6	882763	882768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838336
19865	NC_021911	AGC	2	6	882773	882778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838336
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19870	NC_021911	T	6	6	883054	883059	0 %	100 %	0 %	0 %	528838337
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19873	NC_021911	CGG	2	6	883194	883199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838337
19874	NC_021911	GC	3	6	883403	883408	0 %	0 %	50 %	50 %	528838337
19875	NC_021911	GC	3	6	883428	883433	0 %	0 %	50 %	50 %	528838337
19876	NC_021911	GC	4	8	883441	883448	0 %	0 %	50 %	50 %	528838337
19877	NC_021911	ACC	2	6	883564	883569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838337
19878	NC_021911	CGGAT	2	10	883610	883619	20 %	20 %	40 %	20 %	528838337
19879	NC_021911	TCA	2	6	883622	883627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838337
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19882	NC_021911	CGC	2	6	883715	883720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838337
19883	NC_021911	CTG	2	6	883782	883787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838337
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19885	NC_021911	CGG	2	6	883845	883850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838337
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19888	NC_021911	GTCC	2	8	883908	883915	0 %	25 %	25 %	50 %	528838337
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19890	NC_021911	T	6	6	884013	884018	0 %	100 %	0 %	0 %	528838337
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19892	NC_021911	GCCG	2	8	884107	884114	0 %	0 %	50 %	50 %	528838338
19893	NC_021911	G	6	6	884132	884137	0 %	0 %	100 %	0 %	528838338
19894	NC_021911	TCG	2	6	884149	884154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838338
19895	NC_021911	CGG	2	6	884237	884242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838338
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19897	NC_021911	GAT	2	6	884309	884314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838338
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19910	NC_021911	CGG	2	6	884840	884845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838338
19911	NC_021911	TCC	2	6	884907	884912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838338
19912	NC_021911	ATG	2	6	884959	884964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838338
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19917	NC_021911	TTA	2	6	885353	885358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838339
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19923	NC_021911	TAT	2	6	885632	885637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838339
19924	NC_021911	CCG	2	6	885640	885645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838339
19925	NC_021911	CGA	2	6	885673	885678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838339
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19928	NC_021911	GGA	2	6	885862	885867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838340
19929	NC_021911	TGA	2	6	885891	885896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838340
19930	NC_021911	ACG	2	6	885969	885974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838340
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19944	NC_021911	TAG	2	6	886724	886729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838341
19945	NC_021911	CGGCTG	2	12	886746	886757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528838341
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19952	NC_021911	ATGG	2	8	887098	887105	25 %	25 %	50 %	0 %	528838341
19953	NC_021911	AAG	2	6	887107	887112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838341
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19959	NC_021911	TTC	2	6	887628	887633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19960	NC_021911	GTC	2	6	887634	887639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19961	NC_021911	GACG	2	8	887686	887693	25 %	0 %	50 %	25 %	528838342
19962	NC_021911	TTC	2	6	887711	887716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838342
19963	NC_021911	ATCA	2	8	887733	887740	50 %	25 %	0 %	25 %	528838342
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19966	NC_021911	TCCG	2	8	887922	887929	0 %	25 %	25 %	50 %	528838342
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19971	NC_021911	CGA	2	6	888155	888160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838342
19972	NC_021911	GA	3	6	888169	888174	50 %	0 %	50 %	0 %	528838342
19973	NC_021911	CAG	2	6	888177	888182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838342
19974	NC_021911	GC	3	6	888307	888312	0 %	0 %	50 %	50 %	528838342
19975	NC_021911	GCA	2	6	888331	888336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838342
19976	NC_021911	TGA	2	6	888359	888364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838342
19977	NC_021911	AGCC	2	8	888414	888421	25 %	0 %	25 %	50 %	528838342
19978	NC_021911	AACTCG	2	12	888433	888444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528838342
19979	NC_021911	CCA	2	6	888455	888460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838342
19980	NC_021911	CAA	2	6	888533	888538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838342
19981	NC_021911	CGG	2	6	888548	888553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838342
19982	NC_021911	TTC	2	6	888558	888563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838342
19983	NC_021911	CCG	2	6	888642	888647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838342
19984	NC_021911	AGC	2	6	888663	888668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838342
19985	NC_021911	TTCG	2	8	888704	888711	0 %	50 %	25 %	25 %	528838343
19986	NC_021911	TGCG	2	8	888735	888742	0 %	25 %	50 %	25 %	528838343
19987	NC_021911	GCGA	2	8	888797	888804	25 %	0 %	50 %	25 %	528838343
19988	NC_021911	TGA	2	6	888892	888897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838343
19989	NC_021911	GTC	2	6	888899	888904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838343
19990	NC_021911	GATC	2	8	888966	888973	25 %	25 %	25 %	25 %	528838343
19991	NC_021911	GTC	3	9	889067	889075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838343
19992	NC_021911	TGGC	2	8	889138	889145	0 %	25 %	50 %	25 %	528838343
19993	NC_021911	CGT	2	6	889165	889170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838343
19994	NC_021911	TCG	2	6	889199	889204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838343
19995	NC_021911	GCG	2	6	889218	889223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838343
19996	NC_021911	GTG	2	6	889235	889240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838343
19997	NC_021911	CGC	2	6	889266	889271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838343
19998	NC_021911	CCGGA	2	10	889323	889332	20 %	0 %	40 %	40 %	528838343
19999	NC_021911	GCA	2	6	889363	889368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838343
20000	NC_021911	GCGT	2	8	889369	889376	0 %	25 %	50 %	25 %	528838343

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