MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021911	AGATCG	2	12	538681	538692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528838017
12003	NC_021911	GGC	2	6	538728	538733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838017
12004	NC_021911	CGG	2	6	538759	538764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838017
12005	NC_021911	TCA	2	6	538765	538770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838017
12006	NC_021911	CAT	2	6	538817	538822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838017
12007	NC_021911	GAA	3	9	538829	538837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838017
12008	NC_021911	AAG	2	6	538848	538853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838017
12009	NC_021911	ACG	2	6	538878	538883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838017
12010	NC_021911	GAG	2	6	538908	538913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838017
12011	NC_021911	GTCAAG	2	12	538935	538946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528838017
12012	NC_021911	TCG	2	6	538960	538965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838017
12013	NC_021911	GAA	2	6	538973	538978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838017
12014	NC_021911	TTC	3	9	539030	539038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838018
12015	NC_021911	ATC	2	6	539057	539062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838018
12016	NC_021911	ATGTGC	2	12	539114	539125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528838018
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12021	NC_021911	GCC	2	6	539290	539295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838018
12022	NC_021911	TCGG	2	8	539299	539306	0 %	25 %	50 %	25 %	528838018
12023	NC_021911	TGC	2	6	539315	539320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838018
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12025	NC_021911	CGC	2	6	539328	539333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838018
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12042	NC_021911	GAG	2	6	539955	539960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_021911	GTGGG	2	10	539975	539984	0 %	20 %	80 %	0 %	528838019
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12052	NC_021911	GGA	2	6	540414	540419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838019
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12101	NC_021911	CCGA	2	8	542980	542987	25 %	0 %	25 %	50 %	528838022
12102	NC_021911	CGT	2	6	543024	543029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838022
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12109	NC_021911	CGG	2	6	543368	543373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_021911	GAT	2	6	543399	543404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12111	NC_021911	CCG	2	6	543425	543430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12112	NC_021911	CCG	2	6	543463	543468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12113	NC_021911	TCA	2	6	543576	543581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_021911	CGT	2	6	543589	543594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_021911	GA	3	6	543601	543606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_021911	TTG	2	6	543651	543656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021911	CGT	2	6	543686	543691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_021911	CCG	2	6	543861	543866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838023
12119	NC_021911	GC	3	6	543908	543913	0 %	0 %	50 %	50 %	528838023
12120	NC_021911	TTTC	2	8	543948	543955	0 %	75 %	0 %	25 %	528838023
12121	NC_021911	GAT	2	6	543966	543971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838023
12122	NC_021911	GCG	2	6	543976	543981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838023
12123	NC_021911	AAC	2	6	544099	544104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838023
12124	NC_021911	CG	3	6	544182	544187	0 %	0 %	50 %	50 %	528838023
12125	NC_021911	GGC	3	9	544229	544237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838023
12126	NC_021911	CAT	2	6	544255	544260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838023
12127	NC_021911	ACG	2	6	544289	544294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838023
12128	NC_021911	CGT	2	6	544302	544307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838023
12129	NC_021911	CGG	2	6	544456	544461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838024
12130	NC_021911	CGC	2	6	544465	544470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838024
12131	NC_021911	TCGA	2	8	544471	544478	25 %	25 %	25 %	25 %	528838024
12132	NC_021911	CAT	2	6	544547	544552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838024
12133	NC_021911	CGG	2	6	544556	544561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838024
12134	NC_021911	TAC	2	6	544575	544580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838024
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12137	NC_021911	TCG	2	6	544740	544745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838024
12138	NC_021911	CCGA	2	8	544761	544768	25 %	0 %	25 %	50 %	528838024
12139	NC_021911	CGC	2	6	544805	544810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838024
12140	NC_021911	GTG	2	6	544854	544859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838024
12141	NC_021911	GAG	2	6	544866	544871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838024
12142	NC_021911	GAA	2	6	544895	544900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838024
12143	NC_021911	CGT	2	6	544901	544906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838024
12144	NC_021911	ATCTGC	2	12	544939	544950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528838024
12145	NC_021911	GAC	2	6	544992	544997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838024
12146	NC_021911	TTC	2	6	545010	545015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838024
12147	NC_021911	CG	3	6	545062	545067	0 %	0 %	50 %	50 %	528838024
12148	NC_021911	GAA	2	6	545102	545107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838024
12149	NC_021911	TGC	2	6	545140	545145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838024
12150	NC_021911	ATC	2	6	545205	545210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838024
12151	NC_021911	GGCC	2	8	545219	545226	0 %	0 %	50 %	50 %	528838024
12152	NC_021911	CGT	2	6	545282	545287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838024
12153	NC_021911	CATG	2	8	545334	545341	25 %	25 %	25 %	25 %	528838024
12154	NC_021911	GCC	2	6	545374	545379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838025
12155	NC_021911	CGA	2	6	545393	545398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12156	NC_021911	TCCG	2	8	545420	545427	0 %	25 %	25 %	50 %	528838025
12157	NC_021911	AGGC	2	8	545536	545543	25 %	0 %	50 %	25 %	528838025
12158	NC_021911	GGC	2	6	545561	545566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
12159	NC_021911	TGC	2	6	545594	545599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12160	NC_021911	CGCTG	2	10	545717	545726	0 %	20 %	40 %	40 %	528838025
12161	NC_021911	ACA	2	6	545756	545761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838025
12162	NC_021911	ATC	2	6	545791	545796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838025
12163	NC_021911	GC	3	6	545797	545802	0 %	0 %	50 %	50 %	528838025
12164	NC_021911	CGT	2	6	545814	545819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12165	NC_021911	TGC	2	6	545828	545833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12166	NC_021911	GCT	2	6	545847	545852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12167	NC_021911	GCC	2	6	545884	545889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838025
12168	NC_021911	GCT	2	6	545891	545896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12169	NC_021911	CAC	2	6	545931	545936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838025
12170	NC_021911	AGGC	2	8	545963	545970	25 %	0 %	50 %	25 %	528838025
12171	NC_021911	CCGG	2	8	545974	545981	0 %	0 %	50 %	50 %	528838025
12172	NC_021911	CGT	2	6	545991	545996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12173	NC_021911	GCC	2	6	546083	546088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838025
12174	NC_021911	GCG	2	6	546103	546108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
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12176	NC_021911	GCG	2	6	546140	546145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
12177	NC_021911	CGT	2	6	546159	546164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12178	NC_021911	CGA	2	6	546168	546173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12179	NC_021911	TCG	2	6	546191	546196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12180	NC_021911	GTC	2	6	546205	546210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12181	NC_021911	TGA	2	6	546290	546295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838025
12182	NC_021911	TCCT	2	8	546400	546407	0 %	50 %	0 %	50 %	528838025
12183	NC_021911	CGA	2	6	546408	546413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12184	NC_021911	GCG	2	6	546446	546451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
12185	NC_021911	GCC	2	6	546509	546514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838025
12186	NC_021911	ACG	2	6	546553	546558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838025
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12188	NC_021911	CCA	2	6	546713	546718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838025
12189	NC_021911	CGG	2	6	546726	546731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
12190	NC_021911	CGG	2	6	546750	546755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838025
12191	NC_021911	CGGT	2	8	546826	546833	0 %	25 %	50 %	25 %	528838025
12192	NC_021911	CGA	2	6	546834	546839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838025
12193	NC_021911	GCC	2	6	546853	546858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838026
12194	NC_021911	CCGA	2	8	546876	546883	25 %	0 %	25 %	50 %	528838026
12195	NC_021911	ATC	2	6	546969	546974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838026
12196	NC_021911	GGC	2	6	546975	546980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12197	NC_021911	CGC	2	6	547005	547010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838026
12198	NC_021911	TCG	2	6	547039	547044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12199	NC_021911	GCCG	2	8	547073	547080	0 %	0 %	50 %	50 %	528838026
12200	NC_021911	CGA	2	6	547145	547150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12201	NC_021911	TGC	2	6	547208	547213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12202	NC_021911	CG	3	6	547231	547236	0 %	0 %	50 %	50 %	528838026
12203	NC_021911	CGG	2	6	547249	547254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12204	NC_021911	CTA	2	6	547385	547390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838026
12205	NC_021911	CGG	2	6	547394	547399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12206	NC_021911	TGA	2	6	547420	547425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838026
12207	NC_021911	GCCG	2	8	547430	547437	0 %	0 %	50 %	50 %	528838026
12208	NC_021911	GC	3	6	547455	547460	0 %	0 %	50 %	50 %	528838026
12209	NC_021911	TCC	2	6	547467	547472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838026
12210	NC_021911	ATC	2	6	547479	547484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838026
12211	NC_021911	CGG	2	6	547682	547687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12212	NC_021911	GCG	2	6	547696	547701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12213	NC_021911	GCT	2	6	547715	547720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12214	NC_021911	GCCG	2	8	547721	547728	0 %	0 %	50 %	50 %	528838026
12215	NC_021911	GTC	2	6	547782	547787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12216	NC_021911	GCG	2	6	547859	547864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12217	NC_021911	AGGA	2	8	547972	547979	50 %	0 %	50 %	0 %	528838026
12218	NC_021911	CTG	2	6	547991	547996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12219	NC_021911	GAT	2	6	548036	548041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838026
12220	NC_021911	GGC	2	6	548042	548047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838026
12221	NC_021911	CGA	2	6	548107	548112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838026
12222	NC_021911	TGCG	2	8	548173	548180	0 %	25 %	50 %	25 %	528838026
12223	NC_021911	GCC	2	6	548223	548228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12224	NC_021911	AAC	2	6	548267	548272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_021911	CT	3	6	548293	548298	0 %	50 %	0 %	50 %	528838027
12226	NC_021911	CCTG	2	8	548327	548334	0 %	25 %	25 %	50 %	528838027
12227	NC_021911	AAG	2	6	548409	548414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838027
12228	NC_021911	ACAAGA	2	12	548548	548559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	528838027
12229	NC_021911	CTCG	2	8	548636	548643	0 %	25 %	25 %	50 %	528838027
12230	NC_021911	CGG	2	6	548672	548677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838027
12231	NC_021911	ATC	2	6	548682	548687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838027
12232	NC_021911	TCG	2	6	548761	548766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838027
12233	NC_021911	GCA	2	6	548770	548775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838027
12234	NC_021911	CGG	2	6	548776	548781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838027
12235	NC_021911	CGG	2	6	548788	548793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838027
12236	NC_021911	CGT	2	6	548848	548853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838027
12237	NC_021911	CGC	3	9	548908	548916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838027
12238	NC_021911	CTA	2	6	548921	548926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838027
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12299	NC_021911	CCGTCG	2	12	551464	551475	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528838030
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12342	NC_021911	GCA	2	6	553076	553081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838032
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12344	NC_021911	CGC	2	6	553109	553114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838032
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12351	NC_021911	CAG	2	6	553380	553385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838032
12352	NC_021911	CCTT	2	8	553393	553400	0 %	50 %	0 %	50 %	528838032
12353	NC_021911	GCC	2	6	553461	553466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838032
12354	NC_021911	TGA	2	6	553474	553479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838032
12355	NC_021911	TG	3	6	553494	553499	0 %	50 %	50 %	0 %	528838032
12356	NC_021911	GCTG	2	8	553501	553508	0 %	25 %	50 %	25 %	528838032
12357	NC_021911	GGC	2	6	553599	553604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838032
12358	NC_021911	AGC	3	9	553605	553613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838032
12359	NC_021911	GGC	2	6	553622	553627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838032
12360	NC_021911	CTG	2	6	553629	553634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838032
12361	NC_021911	CGAA	2	8	553661	553668	50 %	0 %	25 %	25 %	528838032
12362	NC_021911	TGC	2	6	553681	553686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838032
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12374	NC_021911	TGAT	2	8	554176	554183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12375	NC_021911	AGC	2	6	554229	554234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838033
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12387	NC_021911	GCC	2	6	554573	554578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838033
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12436	NC_021911	A	6	6	556591	556596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12437	NC_021911	TGC	2	6	556695	556700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838035
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12456	NC_021911	GC	4	8	557330	557337	0 %	0 %	50 %	50 %	528838035
12457	NC_021911	GGA	2	6	557386	557391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838035
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12462	NC_021911	GCC	2	6	557610	557615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
12463	NC_021911	CGAC	2	8	557623	557630	25 %	0 %	25 %	50 %	528838036
12464	NC_021911	CGC	2	6	557662	557667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
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12466	NC_021911	CAG	3	9	557780	557788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12467	NC_021911	GGAT	2	8	557790	557797	25 %	25 %	50 %	0 %	528838036
12468	NC_021911	CGA	2	6	557833	557838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
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12470	NC_021911	CG	3	6	557926	557931	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
12471	NC_021911	CCG	2	6	557971	557976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
12472	NC_021911	GCCT	2	8	558036	558043	0 %	25 %	25 %	50 %	528838036
12473	NC_021911	CGA	2	6	558100	558105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12474	NC_021911	CCGA	2	8	558234	558241	25 %	0 %	25 %	50 %	528838036
12475	NC_021911	TCC	2	6	558267	558272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838036
12476	NC_021911	GGC	2	6	558378	558383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
12477	NC_021911	GCCG	2	8	558395	558402	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
12478	NC_021911	GCCG	2	8	558435	558442	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
12479	NC_021911	CGG	2	6	558565	558570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
12480	NC_021911	GC	3	6	558583	558588	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
12481	NC_021911	GCA	2	6	558598	558603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12482	NC_021911	ACC	2	6	558654	558659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838036
12483	NC_021911	CGG	2	6	558664	558669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
12484	NC_021911	TCG	2	6	558735	558740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12485	NC_021911	GAT	3	9	558743	558751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838036
12486	NC_021911	GAC	2	6	558761	558766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12487	NC_021911	GATG	2	8	558775	558782	25 %	25 %	50 %	0 %	528838036
12488	NC_021911	TCG	2	6	558795	558800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12489	NC_021911	CGA	2	6	558817	558822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12490	NC_021911	GCA	2	6	558990	558995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
12491	NC_021911	CCG	2	6	559040	559045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
12492	NC_021911	GAT	2	6	559075	559080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838036
12493	NC_021911	CCG	2	6	559087	559092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
12494	NC_021911	CGCA	2	8	559187	559194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12495	NC_021911	CGG	2	6	559230	559235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12496	NC_021911	CTTC	2	8	559240	559247	0 %	50 %	0 %	50 %	528838037
12497	NC_021911	CCTT	2	8	559277	559284	0 %	50 %	0 %	50 %	528838037
12498	NC_021911	TCG	2	6	559305	559310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838037
12499	NC_021911	CGG	2	6	559358	559363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838037
12500	NC_021911	CCGG	2	8	559408	559415	0 %	0 %	50 %	50 %	528838037

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