MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 24116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021911	ATC	2	6	515440	515445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837994
11502	NC_021911	GAG	2	6	515516	515521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837994
11503	NC_021911	CGT	2	6	515605	515610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837995
11504	NC_021911	CGTT	2	8	515625	515632	0 %	50 %	25 %	25 %	528837995
11505	NC_021911	CGC	2	6	515659	515664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837995
11506	NC_021911	GGA	2	6	515686	515691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837995
11507	NC_021911	GGC	2	6	515798	515803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837995
11508	NC_021911	AAG	2	6	515852	515857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837995
11509	NC_021911	GC	3	6	515871	515876	0 %	0 %	50 %	50 %	528837995
11510	NC_021911	GGGC	2	8	515907	515914	0 %	0 %	75 %	25 %	528837995
11511	NC_021911	AGCCG	2	10	515965	515974	20 %	0 %	40 %	40 %	528837995
11512	NC_021911	GGC	2	6	516011	516016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837995
11513	NC_021911	C	6	6	516053	516058	0 %	0 %	0 %	100 %	528837995
11514	NC_021911	GC	3	6	516068	516073	0 %	0 %	50 %	50 %	528837995
11515	NC_021911	ACC	2	6	516117	516122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837995
11516	NC_021911	CGC	2	6	516130	516135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837995
11517	NC_021911	G	8	8	516155	516162	0 %	0 %	100 %	0 %	528837995
11518	NC_021911	TGG	2	6	516215	516220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837995
11519	NC_021911	CAA	2	6	516230	516235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837995
11520	NC_021911	AC	3	6	516300	516305	50 %	0 %	0 %	50 %	528837995
11521	NC_021911	GC	4	8	516398	516405	0 %	0 %	50 %	50 %	528837995
11522	NC_021911	GGC	2	6	516411	516416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837995
11523	NC_021911	CGA	2	6	516460	516465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837995
11524	NC_021911	ATG	2	6	516510	516515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837995
11525	NC_021911	GGCG	2	8	516559	516566	0 %	0 %	75 %	25 %	528837995
11526	NC_021911	GAC	2	6	516690	516695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11527	NC_021911	GC	3	6	516733	516738	0 %	0 %	50 %	50 %	528837996
11528	NC_021911	ACG	2	6	516827	516832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11529	NC_021911	AAG	2	6	516865	516870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837996
11530	NC_021911	CAC	2	6	516891	516896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837996
11531	NC_021911	A	6	6	516924	516929	100 %	0 %	0 %	0 %	528837996
11532	NC_021911	AT	3	6	516956	516961	50 %	50 %	0 %	0 %	528837996
11533	NC_021911	GCGG	2	8	516990	516997	0 %	0 %	75 %	25 %	528837996
11534	NC_021911	TTCG	2	8	517069	517076	0 %	50 %	25 %	25 %	528837996
11535	NC_021911	CGA	2	6	517104	517109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11536	NC_021911	AGC	3	9	517138	517146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11537	NC_021911	GCG	2	6	517210	517215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837996
11538	NC_021911	CCG	2	6	517321	517326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837996
11539	NC_021911	TTG	2	6	517403	517408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837996
11540	NC_021911	GAC	2	6	517462	517467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11541	NC_021911	AG	3	6	517495	517500	50 %	0 %	50 %	0 %	528837996
11542	NC_021911	GAA	2	6	517504	517509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837996
11543	NC_021911	GAT	2	6	517525	517530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837996
11544	NC_021911	TCG	2	6	517569	517574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11545	NC_021911	CAG	2	6	517582	517587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11546	NC_021911	GA	3	6	517602	517607	50 %	0 %	50 %	0 %	528837996
11547	NC_021911	GAA	2	6	517648	517653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837996
11548	NC_021911	GA	3	6	517737	517742	50 %	0 %	50 %	0 %	528837996
11549	NC_021911	GCA	2	6	517743	517748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11550	NC_021911	GCG	2	6	517795	517800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837996
11551	NC_021911	GTT	2	6	517801	517806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837996
11552	NC_021911	GC	3	6	517846	517851	0 %	0 %	50 %	50 %	528837996
11553	NC_021911	GTTCC	2	10	517878	517887	0 %	40 %	20 %	40 %	528837996
11554	NC_021911	CAAT	2	8	517905	517912	50 %	25 %	0 %	25 %	528837996
11555	NC_021911	G	6	6	517947	517952	0 %	0 %	100 %	0 %	528837996
11556	NC_021911	GCG	2	6	518052	518057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837996
11557	NC_021911	CACG	2	8	518068	518075	25 %	0 %	25 %	50 %	528837996
11558	NC_021911	CTG	2	6	518077	518082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11559	NC_021911	GAAT	2	8	518102	518109	50 %	25 %	25 %	0 %	528837996
11560	NC_021911	GTA	2	6	518135	518140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837996
11561	NC_021911	TGG	2	6	518142	518147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837996
11562	NC_021911	TGC	2	6	518148	518153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837996
11563	NC_021911	GAG	2	6	518170	518175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_021911	ATG	2	6	518248	518253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837997
11565	NC_021911	GTG	2	6	518315	518320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837997
11566	NC_021911	ACG	2	6	518437	518442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837997
11567	NC_021911	TGGC	2	8	518459	518466	0 %	25 %	50 %	25 %	528837997
11568	NC_021911	ATC	2	6	518481	518486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837997
11569	NC_021911	CGC	2	6	518498	518503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837997
11570	NC_021911	GAA	2	6	518535	518540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837997
11571	NC_021911	GAT	2	6	518568	518573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837997
11572	NC_021911	CGG	2	6	518720	518725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837997
11573	NC_021911	ATC	2	6	518760	518765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837997
11574	NC_021911	TCAA	2	8	518782	518789	50 %	25 %	0 %	25 %	528837997
11575	NC_021911	AAT	2	6	518838	518843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837997
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11577	NC_021911	GATCG	2	10	518873	518882	20 %	20 %	40 %	20 %	528837997
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11579	NC_021911	AAG	2	6	518958	518963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_021911	GGA	2	6	519006	519011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_021911	CTT	2	6	519096	519101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837998
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11583	NC_021911	GAC	2	6	519200	519205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837998
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11587	NC_021911	GGA	2	6	519363	519368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837998
11588	NC_021911	GAC	2	6	519424	519429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837998
11589	NC_021911	CG	3	6	519566	519571	0 %	0 %	50 %	50 %	528837998
11590	NC_021911	ATTC	2	8	519590	519597	25 %	50 %	0 %	25 %	528837998
11591	NC_021911	GGA	2	6	519610	519615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837998
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11593	NC_021911	GTT	2	6	519680	519685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021911	GGC	2	6	519758	519763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837999
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11598	NC_021911	TCG	2	6	520124	520129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838000
11599	NC_021911	CGG	2	6	520195	520200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838000
11600	NC_021911	TG	3	6	520212	520217	0 %	50 %	50 %	0 %	528838000
11601	NC_021911	AAAGCT	2	12	520510	520521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528838000
11602	NC_021911	GGT	2	6	520574	520579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838000
11603	NC_021911	CTG	2	6	520587	520592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838000
11604	NC_021911	CCA	2	6	520679	520684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838000
11605	NC_021911	TCAG	2	8	520758	520765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11606	NC_021911	GCA	2	6	520770	520775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_021911	TGCC	2	8	520851	520858	0 %	25 %	25 %	50 %	528838001
11608	NC_021911	CAC	2	6	520913	520918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838001
11609	NC_021911	ATC	2	6	520955	520960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838001
11610	NC_021911	TCG	2	6	520986	520991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838001
11611	NC_021911	CGAA	2	8	521007	521014	50 %	0 %	25 %	25 %	528838001
11612	NC_021911	CGC	2	6	521025	521030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838001
11613	NC_021911	CGG	2	6	521073	521078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838001
11614	NC_021911	CTGA	2	8	521101	521108	25 %	25 %	25 %	25 %	528838001
11615	NC_021911	GCC	2	6	521154	521159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11616	NC_021911	CCGA	2	8	521191	521198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_021911	GCCG	2	8	521212	521219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11618	NC_021911	CGG	2	6	521226	521231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_021911	GGAC	2	8	521298	521305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_021911	TGC	2	6	521394	521399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_021911	TTC	2	6	521469	521474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838002
11622	NC_021911	CGG	2	6	521506	521511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838002
11623	NC_021911	GAAT	2	8	521525	521532	50 %	25 %	25 %	0 %	528838002
11624	NC_021911	GCCG	2	8	521535	521542	0 %	0 %	50 %	50 %	528838002
11625	NC_021911	CAT	2	6	521552	521557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838002
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11640	NC_021911	CGG	2	6	522318	522323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11641	NC_021911	GAT	2	6	522325	522330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838003
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11671	NC_021911	CG	4	8	523901	523908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11672	NC_021911	CGA	2	6	523910	523915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11860	NC_021911	ATCG	2	8	532623	532630	25 %	25 %	25 %	25 %	528838011
11861	NC_021911	TTC	2	6	532633	532638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838011
11862	NC_021911	CGT	3	9	532652	532660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838011
11863	NC_021911	AGC	2	6	532790	532795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838012
11864	NC_021911	TCT	2	6	532801	532806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838012
11865	NC_021911	TTC	2	6	532850	532855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838012
11866	NC_021911	TTG	2	6	532917	532922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838012
11867	NC_021911	CTT	2	6	532946	532951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838012
11868	NC_021911	ACG	2	6	533010	533015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838012
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11871	NC_021911	AGC	2	6	533136	533141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838012
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11873	NC_021911	CGG	2	6	533215	533220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838012
11874	NC_021911	CGA	2	6	533233	533238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838012
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11884	NC_021911	GATC	2	8	533524	533531	25 %	25 %	25 %	25 %	528838012
11885	NC_021911	TCG	2	6	533581	533586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838012
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11887	NC_021911	CGG	2	6	533713	533718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838012
11888	NC_021911	CGC	2	6	533734	533739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838012
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11892	NC_021911	TGC	2	6	533890	533895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838013
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11901	NC_021911	CGGCG	2	10	534057	534066	0 %	0 %	60 %	40 %	528838013
11902	NC_021911	CGGC	2	8	534075	534082	0 %	0 %	50 %	50 %	528838013
11903	NC_021911	CAT	2	6	534106	534111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838013
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11908	NC_021911	GAC	2	6	534229	534234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838013
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11924	NC_021911	TCC	2	6	535116	535121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838014
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11930	NC_021911	CAT	2	6	535290	535295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11968	NC_021911	GTC	3	9	537241	537249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838015
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11972	NC_021911	AG	3	6	537477	537482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11973	NC_021911	GCC	2	6	537483	537488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11974	NC_021911	GGGA	2	8	537501	537508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11975	NC_021911	CGC	2	6	537598	537603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838016
11976	NC_021911	TTC	2	6	537616	537621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838016
11977	NC_021911	GCG	2	6	537622	537627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838016
11978	NC_021911	GC	4	8	537646	537653	0 %	0 %	50 %	50 %	528838016
11979	NC_021911	GAGG	2	8	537658	537665	25 %	0 %	75 %	0 %	528838016
11980	NC_021911	CGC	2	6	537781	537786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838016
11981	NC_021911	ACCAC	2	10	537797	537806	40 %	0 %	0 %	60 %	528838016
11982	NC_021911	TCG	2	6	537848	537853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838016
11983	NC_021911	GGA	2	6	537867	537872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838016
11984	NC_021911	GGA	2	6	537945	537950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838016
11985	NC_021911	CAG	2	6	537982	537987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838016
11986	NC_021911	GGGGA	2	10	537988	537997	20 %	0 %	80 %	0 %	528838016
11987	NC_021911	CGG	2	6	538017	538022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838016
11988	NC_021911	CGC	2	6	538073	538078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838016
11989	NC_021911	TTGC	2	8	538096	538103	0 %	50 %	25 %	25 %	528838016
11990	NC_021911	CGGC	2	8	538120	538127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11991	NC_021911	GCG	2	6	538155	538160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11992	NC_021911	A	7	7	538180	538186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_021911	CGA	2	6	538361	538366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838017
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11996	NC_021911	GAG	2	6	538452	538457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838017
11997	NC_021911	CGA	2	6	538511	538516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838017
11998	NC_021911	AGC	2	6	538570	538575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838017
11999	NC_021911	CGA	3	9	538607	538615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838017
12000	NC_021911	GGC	2	6	538640	538645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838017

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