MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 5325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021910	CGC	2	6	129702	129707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835437
2502	NC_021910	CAA	2	6	129723	129728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835437
2503	NC_021910	CGG	2	6	129765	129770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835437
2504	NC_021910	CGG	3	9	129882	129890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835437
2505	NC_021910	CCG	2	6	129947	129952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835438
2506	NC_021910	CATT	2	8	130058	130065	25 %	50 %	0 %	25 %	528835438
2507	NC_021910	ACG	2	6	130076	130081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835438
2508	NC_021910	GAT	2	6	130141	130146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835438
2509	NC_021910	GTC	2	6	130159	130164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835438
2510	NC_021910	TCGC	2	8	130177	130184	0 %	25 %	25 %	50 %	528835438
2511	NC_021910	CCG	2	6	130191	130196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835438
2512	NC_021910	GCT	2	6	130197	130202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835438
2513	NC_021910	CTA	2	6	130230	130235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835438
2514	NC_021910	CGAT	2	8	130274	130281	25 %	25 %	25 %	25 %	528835438
2515	NC_021910	CGGCG	2	10	130288	130297	0 %	0 %	60 %	40 %	528835438
2516	NC_021910	GCC	2	6	130309	130314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835438
2517	NC_021910	CTG	2	6	130318	130323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835438
2518	NC_021910	CCG	2	6	130368	130373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835438
2519	NC_021910	CTG	2	6	130426	130431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835438
2520	NC_021910	AGG	2	6	130467	130472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021910	CAACG	2	10	130497	130506	40 %	0 %	20 %	40 %	528835439
2522	NC_021910	GGC	2	6	130725	130730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2523	NC_021910	GGC	2	6	130775	130780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2524	NC_021910	TGA	2	6	130783	130788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835439
2525	NC_021910	GCTC	2	8	130798	130805	0 %	25 %	25 %	50 %	528835439
2526	NC_021910	CGG	2	6	130820	130825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2527	NC_021910	GATC	2	8	130844	130851	25 %	25 %	25 %	25 %	528835439
2528	NC_021910	CG	3	6	130852	130857	0 %	0 %	50 %	50 %	528835439
2529	NC_021910	CGC	2	6	130864	130869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2530	NC_021910	CGC	2	6	130890	130895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2531	NC_021910	CAA	2	6	130910	130915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835439
2532	NC_021910	GAT	2	6	130988	130993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835439
2533	NC_021910	CCG	2	6	131003	131008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2534	NC_021910	CCGA	2	8	131016	131023	25 %	0 %	25 %	50 %	528835439
2535	NC_021910	TCA	2	6	131026	131031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835439
2536	NC_021910	GC	4	8	131034	131041	0 %	0 %	50 %	50 %	528835439
2537	NC_021910	GCCG	2	8	131079	131086	0 %	0 %	50 %	50 %	528835439
2538	NC_021910	TGC	2	6	131183	131188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2539	NC_021910	AGC	2	6	131329	131334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2540	NC_021910	GCA	2	6	131350	131355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2541	NC_021910	AGC	2	6	131407	131412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2542	NC_021910	CGG	2	6	131431	131436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2543	NC_021910	CCAT	2	8	131449	131456	25 %	25 %	0 %	50 %	528835439
2544	NC_021910	TTG	2	6	131488	131493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835439
2545	NC_021910	GCC	2	6	131499	131504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2546	NC_021910	TTC	2	6	131560	131565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835439
2547	NC_021910	CGG	2	6	131585	131590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2548	NC_021910	GTC	3	9	131592	131600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2549	NC_021910	GAA	2	6	131618	131623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835439
2550	NC_021910	CGGCGC	2	12	131655	131666	0 %	0 %	50 %	50 %	528835439
2551	NC_021910	GCG	2	6	131669	131674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2552	NC_021910	CCG	2	6	131725	131730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2553	NC_021910	GGC	2	6	131754	131759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835439
2554	NC_021910	GATC	2	8	131765	131772	25 %	25 %	25 %	25 %	528835439
2555	NC_021910	GTCCG	2	10	131775	131784	0 %	20 %	40 %	40 %	528835439
2556	NC_021910	GCA	2	6	131803	131808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2557	NC_021910	AGC	2	6	131836	131841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835439
2558	NC_021910	CCG	2	6	131866	131871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835439
2559	NC_021910	CTGC	2	8	131932	131939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2560	NC_021910	TTC	2	6	131953	131958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_021910	T	7	7	132033	132039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021910	CAT	2	6	132059	132064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_021910	GGC	2	6	132088	132093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_021910	GCC	2	6	132108	132113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_021910	GGC	2	6	132204	132209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_021910	GAT	2	6	132369	132374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_021910	TGA	2	6	132434	132439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_021910	CCGAC	2	10	132469	132478	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2569	NC_021910	CCG	2	6	132481	132486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_021910	T	6	6	132505	132510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_021910	TCG	2	6	132517	132522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_021910	GCC	2	6	132608	132613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_021910	GGT	2	6	132644	132649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_021910	GCC	2	6	132696	132701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_021910	CGT	2	6	132752	132757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_021910	GCC	2	6	132780	132785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2577	NC_021910	AGC	2	6	132832	132837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_021910	ACA	2	6	133024	133029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_021910	CAGC	2	8	133033	133040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_021910	GC	3	6	133062	133067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_021910	CGA	2	6	133106	133111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_021910	GCT	2	6	133121	133126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_021910	CAG	2	6	133134	133139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021910	GCG	2	6	133216	133221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_021910	GCG	2	6	133282	133287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_021910	TCG	2	6	133291	133296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_021910	CG	4	8	133346	133353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_021910	CT	3	6	133371	133376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_021910	GCT	2	6	133504	133509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021910	TCC	3	9	133576	133584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_021910	GCC	2	6	133596	133601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_021910	CCG	2	6	133612	133617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2593	NC_021910	ACG	2	6	133622	133627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_021910	GAA	2	6	133779	133784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835440
2595	NC_021910	CAG	2	6	133830	133835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835440
2596	NC_021910	GA	3	6	133858	133863	50 %	0 %	50 %	0 %	528835440
2597	NC_021910	GGC	2	6	133887	133892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835440
2598	NC_021910	TTC	2	6	133897	133902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835440
2599	NC_021910	CAG	2	6	133986	133991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835440
2600	NC_021910	CGG	2	6	134042	134047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835440
2601	NC_021910	TCG	2	6	134245	134250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835441
2602	NC_021910	TCCG	2	8	134267	134274	0 %	25 %	25 %	50 %	528835441
2603	NC_021910	CGC	2	6	134320	134325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835441
2604	NC_021910	GGC	3	9	134362	134370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835441
2605	NC_021910	GCC	2	6	134411	134416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835441
2606	NC_021910	GC	3	6	134487	134492	0 %	0 %	50 %	50 %	528835441
2607	NC_021910	CAGG	2	8	134542	134549	25 %	0 %	50 %	25 %	528835441
2608	NC_021910	AGC	2	6	134571	134576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835441
2609	NC_021910	GA	3	6	134578	134583	50 %	0 %	50 %	0 %	528835441
2610	NC_021910	CCA	2	6	134596	134601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835441
2611	NC_021910	GAC	2	6	134636	134641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835441
2612	NC_021910	GAT	2	6	134678	134683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835441
2613	NC_021910	ACGC	2	8	134699	134706	25 %	0 %	25 %	50 %	528835441
2614	NC_021910	TTC	2	6	134711	134716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835441
2615	NC_021910	CTT	2	6	134720	134725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835441
2616	NC_021910	CAG	2	6	134777	134782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835441
2617	NC_021910	GCC	2	6	134783	134788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835441
2618	NC_021910	CGG	2	6	134872	134877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835441
2619	NC_021910	TCG	2	6	134955	134960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835441
2620	NC_021910	TTG	2	6	135036	135041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835441
2621	NC_021910	ATC	2	6	135081	135086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835441
2622	NC_021910	GGC	2	6	135098	135103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835441
2623	NC_021910	GCG	2	6	135127	135132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835441
2624	NC_021910	GCCGG	2	10	135243	135252	0 %	0 %	60 %	40 %	528835441
2625	NC_021910	ATG	2	6	135348	135353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835441
2626	NC_021910	AAG	2	6	135369	135374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2752	NC_021910	TGG	2	6	141706	141711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835450
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2869	NC_021910	GCC	2	6	147863	147868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2870	NC_021910	GA	3	6	147896	147901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2871	NC_021910	CCG	2	6	147910	147915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2872	NC_021910	TCA	2	6	148012	148017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2873	NC_021910	TGC	2	6	148092	148097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835457
2874	NC_021910	AGG	2	6	148098	148103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835457
2875	NC_021910	ACG	2	6	148158	148163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835457
2876	NC_021910	ACC	2	6	148262	148267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835457
2877	NC_021910	CAT	2	6	148351	148356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835457
2878	NC_021910	ATG	2	6	148559	148564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835457
2879	NC_021910	GCT	2	6	148613	148618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835457
2880	NC_021910	GCC	2	6	148782	148787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835457
2881	NC_021910	CGT	2	6	148894	148899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835457
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2883	NC_021910	GGGC	2	8	149092	149099	0 %	0 %	75 %	25 %	528835457
2884	NC_021910	ATC	2	6	149192	149197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835457
2885	NC_021910	ACGTC	2	10	149212	149221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2886	NC_021910	GC	3	6	149245	149250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2887	NC_021910	GAA	2	6	149420	149425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835458
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2889	NC_021910	GAA	2	6	149494	149499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835458
2890	NC_021910	TTC	2	6	149534	149539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835458
2891	NC_021910	CGT	2	6	149547	149552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835458
2892	NC_021910	CGG	2	6	149568	149573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835458
2893	NC_021910	TGATCC	2	12	149577	149588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528835458
2894	NC_021910	TGC	2	6	149655	149660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835458
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2919	NC_021910	GC	3	6	150784	150789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2920	NC_021910	AAG	2	6	150831	150836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2921	NC_021910	GT	3	6	150861	150866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2922	NC_021910	CGT	2	6	150870	150875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2965	NC_021910	AGCT	2	8	153044	153051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2986	NC_021910	TGG	2	6	154310	154315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835461
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2988	NC_021910	ACG	2	6	154406	154411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835461
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2991	NC_021910	TTG	2	6	154613	154618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835461
2992	NC_021910	GAA	2	6	154629	154634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2993	NC_021910	TTA	2	6	154667	154672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835461
2994	NC_021910	TGGC	2	8	154749	154756	0 %	25 %	50 %	25 %	528835461
2995	NC_021910	GAA	2	6	154765	154770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835461
2996	NC_021910	TGA	2	6	154812	154817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835461
2997	NC_021910	GC	3	6	154831	154836	0 %	0 %	50 %	50 %	528835461
2998	NC_021910	TGG	2	6	154852	154857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835461
2999	NC_021910	TCG	2	6	154928	154933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835461
3000	NC_021910	ATCTTC	2	12	155039	155050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	528835462

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