MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021909	GAC	2	6	547664	547669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834616
11002	NC_021909	CGA	2	6	547696	547701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834616
11003	NC_021909	CGC	2	6	547708	547713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834616
11004	NC_021909	TCG	2	6	547818	547823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834616
11005	NC_021909	C	8	8	547837	547844	0 %	0 %	0 %	100 %	528834616
11006	NC_021909	GC	3	6	547888	547893	0 %	0 %	50 %	50 %	528834616
11007	NC_021909	GGC	2	6	547907	547912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834616
11008	NC_021909	GCC	2	6	547929	547934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834616
11009	NC_021909	CTGG	2	8	547949	547956	0 %	25 %	50 %	25 %	528834616
11010	NC_021909	CAC	2	6	548033	548038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834616
11011	NC_021909	AGC	2	6	548061	548066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834616
11012	NC_021909	CGC	2	6	548125	548130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11013	NC_021909	CGT	2	6	548230	548235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11014	NC_021909	CGC	2	6	548236	548241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11015	NC_021909	GCCG	2	8	548280	548287	0 %	0 %	50 %	50 %	528834617
11016	NC_021909	CCTC	2	8	548309	548316	0 %	25 %	0 %	75 %	528834617
11017	NC_021909	GAC	2	6	548437	548442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11018	NC_021909	GAC	2	6	548476	548481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11019	NC_021909	CGAT	2	8	548493	548500	25 %	25 %	25 %	25 %	528834617
11020	NC_021909	GAC	2	6	548506	548511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11021	NC_021909	AGA	2	6	548517	548522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834617
11022	NC_021909	CGGA	2	8	548530	548537	25 %	0 %	50 %	25 %	528834617
11023	NC_021909	GAT	2	6	548539	548544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834617
11024	NC_021909	CCG	2	6	548565	548570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11025	NC_021909	CGT	3	9	548583	548591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11026	NC_021909	TCCG	2	8	548626	548633	0 %	25 %	25 %	50 %	528834617
11027	NC_021909	CG	3	6	548688	548693	0 %	0 %	50 %	50 %	528834617
11028	NC_021909	GC	3	6	548739	548744	0 %	0 %	50 %	50 %	528834617
11029	NC_021909	CTG	2	6	548761	548766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11030	NC_021909	CTGGGC	2	12	548845	548856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528834617
11031	NC_021909	CTT	2	6	548857	548862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834617
11032	NC_021909	GCT	2	6	548877	548882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11033	NC_021909	GAC	2	6	548905	548910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11034	NC_021909	TCG	2	6	548921	548926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11035	NC_021909	GCC	2	6	548989	548994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11036	NC_021909	GGC	3	9	549037	549045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834617
11037	NC_021909	CGC	2	6	549070	549075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11038	NC_021909	AGA	2	6	549099	549104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834617
11039	NC_021909	CCG	2	6	549113	549118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11040	NC_021909	CAG	2	6	549133	549138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11041	NC_021909	CG	3	6	549209	549214	0 %	0 %	50 %	50 %	528834617
11042	NC_021909	CGA	3	9	549240	549248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11043	NC_021909	CGG	2	6	549309	549314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834617
11044	NC_021909	CAG	2	6	549346	549351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11045	NC_021909	GAA	2	6	549391	549396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834617
11046	NC_021909	AGA	2	6	549399	549404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834617
11047	NC_021909	CGC	2	6	549407	549412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834617
11048	NC_021909	GAG	2	6	549413	549418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834617
11049	NC_021909	CGA	2	6	549423	549428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834617
11050	NC_021909	GTA	2	6	549484	549489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834617
11051	NC_021909	CGG	2	6	549527	549532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834617
11052	NC_021909	GC	3	6	549545	549550	0 %	0 %	50 %	50 %	528834617
11053	NC_021909	TCT	2	6	549561	549566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834617
11054	NC_021909	GCG	2	6	549570	549575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834617
11055	NC_021909	AG	3	6	549579	549584	50 %	0 %	50 %	0 %	528834617
11056	NC_021909	GGA	2	6	549785	549790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021909	TCC	2	6	549907	549912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834618
11058	NC_021909	CGA	2	6	549918	549923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834618
11059	NC_021909	GC	4	8	549940	549947	0 %	0 %	50 %	50 %	528834618
11060	NC_021909	GCC	3	9	550039	550047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834619
11061	NC_021909	CGC	2	6	550161	550166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834619
11062	NC_021909	GC	3	6	550165	550170	0 %	0 %	50 %	50 %	528834619
11063	NC_021909	GC	3	6	550200	550205	0 %	0 %	50 %	50 %	528834619
11064	NC_021909	TGC	2	6	550243	550248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834619
11065	NC_021909	GGC	2	6	550327	550332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834619
11066	NC_021909	GCA	2	6	550356	550361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834619
11067	NC_021909	GGC	2	6	550373	550378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834619
11068	NC_021909	TCG	2	6	550475	550480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834619
11069	NC_021909	GCC	2	6	550501	550506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834619
11070	NC_021909	GC	3	6	550530	550535	0 %	0 %	50 %	50 %	528834619
11071	NC_021909	CGC	2	6	550557	550562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834619
11072	NC_021909	GATCA	2	10	550624	550633	40 %	20 %	20 %	20 %	528834619
11073	NC_021909	CTG	2	6	550672	550677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834619
11074	NC_021909	GC	3	6	550685	550690	0 %	0 %	50 %	50 %	528834619
11075	NC_021909	ATC	2	6	550727	550732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834619
11076	NC_021909	CCA	2	6	550798	550803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834619
11077	NC_021909	TTG	2	6	550817	550822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834619
11078	NC_021909	TCA	2	6	550874	550879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834619
11079	NC_021909	CGG	2	6	550921	550926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834620
11080	NC_021909	CTT	2	6	550927	550932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834620
11081	NC_021909	TGCT	2	8	550941	550948	0 %	50 %	25 %	25 %	528834620
11082	NC_021909	CGA	2	6	550978	550983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834620
11083	NC_021909	GCC	2	6	550989	550994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834620
11084	NC_021909	AGG	2	6	551001	551006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834620
11085	NC_021909	CGT	2	6	551076	551081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11086	NC_021909	AGC	2	6	551204	551209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11087	NC_021909	CGT	2	6	551212	551217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11088	NC_021909	GTC	2	6	551272	551277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11089	NC_021909	CCT	2	6	551340	551345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834621
11090	NC_021909	ATG	2	6	551372	551377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834621
11091	NC_021909	ACG	2	6	551387	551392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11092	NC_021909	GC	3	6	551393	551398	0 %	0 %	50 %	50 %	528834621
11093	NC_021909	TTCG	2	8	551425	551432	0 %	50 %	25 %	25 %	528834621
11094	NC_021909	CCG	2	6	551441	551446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834621
11095	NC_021909	ATC	2	6	551564	551569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834621
11096	NC_021909	AGC	2	6	551586	551591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11097	NC_021909	GCG	2	6	551628	551633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834621
11098	NC_021909	GCC	2	6	551704	551709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834621
11099	NC_021909	GAC	2	6	551716	551721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11100	NC_021909	AGC	2	6	551723	551728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834621
11101	NC_021909	AGA	2	6	551738	551743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834621
11102	NC_021909	TCG	2	6	551851	551856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834622
11103	NC_021909	GCC	2	6	551904	551909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834622
11104	NC_021909	CCG	2	6	551926	551931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834622
11105	NC_021909	CG	3	6	551934	551939	0 %	0 %	50 %	50 %	528834622
11106	NC_021909	ATC	2	6	551956	551961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11107	NC_021909	CTG	2	6	552030	552035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834622
11108	NC_021909	ATC	2	6	552178	552183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11109	NC_021909	CCCA	2	8	552184	552191	25 %	0 %	0 %	75 %	528834622
11110	NC_021909	GC	3	6	552197	552202	0 %	0 %	50 %	50 %	528834622
11111	NC_021909	CAT	2	6	552267	552272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11112	NC_021909	CGA	2	6	552311	552316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834622
11113	NC_021909	TCA	2	6	552317	552322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11114	NC_021909	GAT	2	6	552327	552332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834622
11115	NC_021909	TCA	2	6	552371	552376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11116	NC_021909	GCC	2	6	552390	552395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834622
11117	NC_021909	AGG	2	6	552398	552403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834622
11118	NC_021909	GGT	2	6	552473	552478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834622
11119	NC_021909	GAT	2	6	552522	552527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834622
11120	NC_021909	CAT	2	6	552582	552587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834622
11121	NC_021909	CGG	2	6	552599	552604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834622
11122	NC_021909	GAA	2	6	552609	552614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834622
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11132	NC_021909	CGA	2	6	553157	553162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834622
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11139	NC_021909	CGGC	2	8	553458	553465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11140	NC_021909	CAA	2	6	553524	553529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11141	NC_021909	AC	3	6	553564	553569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11142	NC_021909	CGG	2	6	553755	553760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834623
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11147	NC_021909	GCT	2	6	554044	554049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834623
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11162	NC_021909	GC	3	6	554803	554808	0 %	0 %	50 %	50 %	528834624
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11191	NC_021909	CG	3	6	555970	555975	0 %	0 %	50 %	50 %	528834624
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11199	NC_021909	AG	3	6	556299	556304	50 %	0 %	50 %	0 %	528834624
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11203	NC_021909	GCC	2	6	556728	556733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834625
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11210	NC_021909	AAT	2	6	557157	557162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11211	NC_021909	GCG	2	6	557206	557211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11212	NC_021909	GGCAA	2	10	557301	557310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11213	NC_021909	GAAG	2	8	557437	557444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11214	NC_021909	GCG	2	6	557484	557489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11215	NC_021909	CGG	2	6	557611	557616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11217	NC_021909	CGGC	2	8	557663	557670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11218	NC_021909	TCTT	2	8	557682	557689	0 %	75 %	0 %	25 %	528834626
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11232	NC_021909	CGC	2	6	558304	558309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834627
11233	NC_021909	TGCG	2	8	558346	558353	0 %	25 %	50 %	25 %	528834628
11234	NC_021909	GCC	2	6	558382	558387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834628
11235	NC_021909	CGC	2	6	558437	558442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834628
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11238	NC_021909	ACCCG	2	10	558516	558525	20 %	0 %	20 %	60 %	528834628
11239	NC_021909	GAT	2	6	558573	558578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834628
11240	NC_021909	GCC	2	6	558701	558706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834628
11241	NC_021909	ATC	2	6	558744	558749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834628
11242	NC_021909	TCT	2	6	558771	558776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834628
11243	NC_021909	GC	3	6	558789	558794	0 %	0 %	50 %	50 %	528834628
11244	NC_021909	CTC	2	6	558867	558872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834628
11245	NC_021909	TCG	2	6	558925	558930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834628
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11247	NC_021909	CGCAG	2	10	558997	559006	20 %	0 %	40 %	40 %	528834628
11248	NC_021909	TGC	2	6	559079	559084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834628
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11251	NC_021909	GATC	2	8	559253	559260	25 %	25 %	25 %	25 %	528834628
11252	NC_021909	ATG	2	6	559342	559347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834628
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11259	NC_021909	ATC	2	6	559774	559779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11260	NC_021909	GCC	2	6	559817	559822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834629
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11269	NC_021909	GTCG	2	8	560206	560213	0 %	25 %	50 %	25 %	528834630
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11279	NC_021909	CGG	2	6	560855	560860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11280	NC_021909	GA	3	6	560922	560927	50 %	0 %	50 %	0 %	528834631
11281	NC_021909	GC	3	6	560988	560993	0 %	0 %	50 %	50 %	528834631
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11310	NC_021909	GGTTC	2	10	562287	562296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11312	NC_021909	TGG	2	6	562337	562342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11317	NC_021909	TGG	2	6	562553	562558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11320	NC_021909	CTT	3	9	562688	562696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11323	NC_021909	CGA	2	6	562763	562768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11327	NC_021909	GATT	2	8	562957	562964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11329	NC_021909	TGT	2	6	563004	563009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11332	NC_021909	GTTTG	2	10	563128	563137	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11333	NC_021909	GAA	2	6	563184	563189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11352	NC_021909	GGCC	2	8	564204	564211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11353	NC_021909	CGA	2	6	564286	564291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11354	NC_021909	GAG	2	6	564332	564337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11355	NC_021909	TCG	2	6	564388	564393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11356	NC_021909	CGC	2	6	564424	564429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11357	NC_021909	CAG	2	6	564483	564488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11358	NC_021909	GAC	2	6	564498	564503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11359	NC_021909	CCA	2	6	564530	564535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11360	NC_021909	CAG	2	6	564557	564562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11361	NC_021909	GGT	2	6	564611	564616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11363	NC_021909	GCC	2	6	564674	564679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11364	NC_021909	GCC	2	6	564681	564686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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