MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021909	TCT	2	6	523925	523930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834589
10502	NC_021909	GCT	2	6	523947	523952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10503	NC_021909	CAG	2	6	524007	524012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10504	NC_021909	TCG	2	6	524072	524077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10505	NC_021909	GAGG	2	8	524104	524111	25 %	0 %	75 %	0 %	528834589
10506	NC_021909	GAT	2	6	524197	524202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834589
10507	NC_021909	CTTC	2	8	524295	524302	0 %	50 %	0 %	50 %	528834589
10508	NC_021909	CG	3	6	524355	524360	0 %	0 %	50 %	50 %	528834589
10509	NC_021909	CGA	2	6	524362	524367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10510	NC_021909	CCTG	2	8	524369	524376	0 %	25 %	25 %	50 %	528834589
10511	NC_021909	GCC	2	6	524439	524444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834589
10512	NC_021909	ACG	2	6	524486	524491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10513	NC_021909	GAC	2	6	524506	524511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10514	NC_021909	TCG	2	6	524564	524569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10515	NC_021909	GTC	2	6	524584	524589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10516	NC_021909	GCC	2	6	524668	524673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834589
10517	NC_021909	GCT	2	6	524718	524723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10518	NC_021909	TTC	2	6	524759	524764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834589
10519	NC_021909	TTG	2	6	524793	524798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834589
10520	NC_021909	GCC	2	6	524848	524853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834589
10521	NC_021909	AGA	2	6	524886	524891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834589
10522	NC_021909	CTG	2	6	524992	524997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834589
10523	NC_021909	TAA	2	6	525091	525096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_021909	TAT	2	6	525108	525113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_021909	AAG	2	6	525149	525154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_021909	GAC	2	6	525258	525263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834590
10527	NC_021909	CGT	2	6	525461	525466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834591
10528	NC_021909	CGG	2	6	525522	525527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834591
10529	NC_021909	AGCC	2	8	525537	525544	25 %	0 %	25 %	50 %	528834591
10530	NC_021909	TCA	2	6	525570	525575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834591
10531	NC_021909	GCA	2	6	525626	525631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834592
10532	NC_021909	TCG	2	6	525634	525639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834592
10533	NC_021909	GAG	2	6	525707	525712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834592
10534	NC_021909	CAC	2	6	525752	525757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834592
10535	NC_021909	GTG	2	6	525925	525930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834593
10536	NC_021909	GCAG	2	8	525953	525960	25 %	0 %	50 %	25 %	528834593
10537	NC_021909	GGC	2	6	525967	525972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834593
10538	NC_021909	ATC	2	6	526028	526033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834593
10539	NC_021909	CTT	2	6	526253	526258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834594
10540	NC_021909	CGG	2	6	526318	526323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834594
10541	NC_021909	GGC	2	6	526364	526369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834594
10542	NC_021909	CGC	2	6	526393	526398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834594
10543	NC_021909	GAC	2	6	526403	526408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10544	NC_021909	TTG	2	6	526470	526475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834594
10545	NC_021909	TCA	2	6	526519	526524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834594
10546	NC_021909	CGA	2	6	526567	526572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10547	NC_021909	TCA	2	6	526590	526595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834594
10548	NC_021909	TGA	2	6	526600	526605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834594
10549	NC_021909	GC	3	6	526631	526636	0 %	0 %	50 %	50 %	528834594
10550	NC_021909	ATG	2	6	526659	526664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834594
10551	NC_021909	CCTTGC	2	12	526672	526683	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528834594
10552	NC_021909	CGG	2	6	526822	526827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834594
10553	NC_021909	CGT	2	6	526844	526849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10554	NC_021909	GAT	2	6	526874	526879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834594
10555	NC_021909	CTG	2	6	526919	526924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10556	NC_021909	CGT	2	6	526933	526938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10557	NC_021909	GTC	2	6	527024	527029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834594
10558	NC_021909	GCC	2	6	527070	527075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834594
10559	NC_021909	TCC	2	6	527126	527131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_021909	CTC	2	6	527154	527159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10561	NC_021909	TC	3	6	527209	527214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10562	NC_021909	TAC	2	6	527364	527369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_021909	GC	3	6	527404	527409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10564	NC_021909	CAT	2	6	527452	527457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_021909	TGC	2	6	527589	527594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_021909	ATC	2	6	527637	527642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_021909	CCA	2	6	527648	527653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_021909	TTCC	2	8	527654	527661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10569	NC_021909	GCG	2	6	527706	527711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_021909	CCG	2	6	527745	527750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834595
10571	NC_021909	CGA	2	6	527755	527760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834595
10572	NC_021909	ATC	2	6	527768	527773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834595
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10574	NC_021909	GC	4	8	527856	527863	0 %	0 %	50 %	50 %	528834595
10575	NC_021909	CCA	2	6	527879	527884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834595
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10578	NC_021909	GCG	2	6	528162	528167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_021909	GC	3	6	528217	528222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10580	NC_021909	TCA	2	6	528262	528267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_021909	GGC	2	6	528353	528358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_021909	GGA	2	6	528362	528367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_021909	GA	3	6	528580	528585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_021909	GGC	2	6	528689	528694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834596
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10588	NC_021909	GC	3	6	529047	529052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10589	NC_021909	TCTG	2	8	529064	529071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10590	NC_021909	ACG	2	6	529083	529088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_021909	CGC	2	6	529159	529164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10592	NC_021909	CAT	2	6	529210	529215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_021909	GCTG	2	8	529234	529241	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_021909	TCG	2	6	529252	529257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_021909	CGT	2	6	529277	529282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_021909	CAT	2	6	529289	529294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_021909	GCC	2	6	529358	529363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_021909	GC	3	6	529364	529369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10599	NC_021909	ACG	2	6	529375	529380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_021909	CTG	2	6	529392	529397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_021909	AAG	2	6	529432	529437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_021909	GCC	2	6	529455	529460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_021909	TGC	2	6	529559	529564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834597
10604	NC_021909	GAC	2	6	529568	529573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834597
10605	NC_021909	CGAT	3	12	529596	529607	25 %	25 %	25 %	25 %	528834597
10606	NC_021909	TGA	2	6	529627	529632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834597
10607	NC_021909	CGA	2	6	529651	529656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834597
10608	NC_021909	GCG	2	6	529717	529722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834597
10609	NC_021909	ATC	2	6	529736	529741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834597
10610	NC_021909	GCG	2	6	529861	529866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834597
10611	NC_021909	CTT	2	6	529877	529882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_021909	CTG	2	6	529885	529890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_021909	CTT	2	6	529892	529897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_021909	CCA	2	6	529901	529906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10615	NC_021909	TTC	2	6	530024	530029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_021909	GCA	3	9	530106	530114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_021909	GCT	2	6	530171	530176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_021909	CACTAT	2	12	530178	530189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_021909	GGA	2	6	530281	530286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_021909	TTG	2	6	530310	530315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_021909	CGGT	2	8	530394	530401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10622	NC_021909	GGA	2	6	530403	530408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_021909	GAC	2	6	530417	530422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_021909	CG	4	8	530447	530454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_021909	GCA	2	6	530635	530640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834598
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10627	NC_021909	GCA	2	6	530686	530691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834598
10628	NC_021909	TCG	2	6	530805	530810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834598
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10630	NC_021909	CAG	2	6	530903	530908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834598
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10639	NC_021909	TC	3	6	531339	531344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10640	NC_021909	TGC	2	6	531357	531362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10642	NC_021909	GGA	2	6	531476	531481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10643	NC_021909	CA	3	6	531531	531536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10644	NC_021909	ATCG	2	8	531562	531569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10645	NC_021909	GCC	2	6	531631	531636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834599
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10989	NC_021909	GGC	2	6	547221	547226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834615
10990	NC_021909	CAG	3	9	547251	547259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834615
10991	NC_021909	CGGT	2	8	547273	547280	0 %	25 %	50 %	25 %	528834615
10992	NC_021909	CGC	2	6	547332	547337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834615
10993	NC_021909	CGGA	2	8	547346	547353	25 %	0 %	50 %	25 %	528834615
10994	NC_021909	CGCC	2	8	547359	547366	0 %	0 %	25 %	75 %	528834615
10995	NC_021909	TCC	2	6	547375	547380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834615
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10997	NC_021909	TGGC	2	8	547537	547544	0 %	25 %	50 %	25 %	528834615
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10999	NC_021909	GGA	2	6	547566	547571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834615
11000	NC_021909	AGC	2	6	547610	547615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834615

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