MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021909	TCGGC	2	10	446646	446655	0 %	20 %	40 %	40 %	528834518
9002	NC_021909	GATC	2	8	446715	446722	25 %	25 %	25 %	25 %	528834518
9003	NC_021909	GCG	2	6	446794	446799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_021909	TGA	2	6	446808	446813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_021909	GCC	2	6	446822	446827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_021909	TGC	2	6	446843	446848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834519
9007	NC_021909	CAC	2	6	446880	446885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834519
9008	NC_021909	CAG	2	6	446912	446917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834519
9009	NC_021909	CTG	2	6	446984	446989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834519
9010	NC_021909	CTT	2	6	447034	447039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834519
9011	NC_021909	ATCG	2	8	447043	447050	25 %	25 %	25 %	25 %	528834519
9012	NC_021909	AAG	2	6	447067	447072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834520
9013	NC_021909	GTT	2	6	447085	447090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834520
9014	NC_021909	TAA	2	6	447101	447106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834520
9015	NC_021909	CAA	2	6	447128	447133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834520
9016	NC_021909	CGC	2	6	447137	447142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834520
9017	NC_021909	CG	3	6	447173	447178	0 %	0 %	50 %	50 %	528834520
9018	NC_021909	CAA	2	6	447200	447205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834520
9019	NC_021909	TCG	2	6	447289	447294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834520
9020	NC_021909	CG	3	6	447328	447333	0 %	0 %	50 %	50 %	528834520
9021	NC_021909	CTT	2	6	447405	447410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834520
9022	NC_021909	TTG	2	6	447589	447594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834520
9023	NC_021909	CGA	2	6	447608	447613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834520
9024	NC_021909	GCC	2	6	447632	447637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834520
9025	NC_021909	GCC	2	6	447875	447880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834521
9026	NC_021909	GAG	2	6	447913	447918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834521
9027	NC_021909	CAG	2	6	447976	447981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834521
9028	NC_021909	TGG	2	6	447999	448004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834521
9029	NC_021909	CGT	2	6	448063	448068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834521
9030	NC_021909	CGG	2	6	448099	448104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834521
9031	NC_021909	AGA	2	6	448377	448382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834521
9032	NC_021909	CAG	2	6	448393	448398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834521
9033	NC_021909	CGC	2	6	448654	448659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834521
9034	NC_021909	ATTG	2	8	448732	448739	25 %	50 %	25 %	0 %	528834521
9035	NC_021909	ATG	2	6	448766	448771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_021909	A	6	6	448783	448788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_021909	CCGG	2	8	448791	448798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_021909	TG	3	6	448815	448820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_021909	TAG	2	6	448838	448843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834522
9040	NC_021909	GGA	2	6	448847	448852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834522
9041	NC_021909	CGT	2	6	448863	448868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834522
9042	NC_021909	CCA	2	6	449027	449032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834522
9043	NC_021909	CCT	2	6	449073	449078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834522
9044	NC_021909	CTT	2	6	449193	449198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834522
9045	NC_021909	GACT	2	8	449239	449246	25 %	25 %	25 %	25 %	528834522
9046	NC_021909	ACC	2	6	449339	449344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834522
9047	NC_021909	CGG	2	6	449418	449423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834522
9048	NC_021909	GCCGT	2	10	449507	449516	0 %	20 %	40 %	40 %	528834522
9049	NC_021909	GA	3	6	449586	449591	50 %	0 %	50 %	0 %	528834522
9050	NC_021909	TGC	2	6	449656	449661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834522
9051	NC_021909	GC	3	6	449722	449727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_021909	GGC	2	6	449729	449734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_021909	AGTG	2	8	449786	449793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_021909	TAA	2	6	449808	449813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_021909	CAAA	2	8	449853	449860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_021909	AGA	2	6	449877	449882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_021909	CCA	2	6	449959	449964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_021909	CCA	2	6	450024	450029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834523
9059	NC_021909	CCA	2	6	450138	450143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834523
9060	NC_021909	GCA	2	6	450146	450151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9061	NC_021909	TTG	2	6	450188	450193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834523
9062	NC_021909	CGT	2	6	450249	450254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9063	NC_021909	CGCA	2	8	450280	450287	25 %	0 %	25 %	50 %	528834523
9064	NC_021909	GCA	2	6	450374	450379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9065	NC_021909	CCT	2	6	450405	450410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834523
9066	NC_021909	CGA	2	6	450414	450419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9067	NC_021909	GCC	2	6	450452	450457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834523
9068	NC_021909	CAG	2	6	450478	450483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9069	NC_021909	TCA	2	6	450503	450508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834523
9070	NC_021909	CCT	2	6	450531	450536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834523
9071	NC_021909	GCT	2	6	450607	450612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9072	NC_021909	CTG	2	6	450630	450635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9073	NC_021909	TGC	2	6	450712	450717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9074	NC_021909	CTG	2	6	450718	450723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9075	NC_021909	TTGC	2	8	450743	450750	0 %	50 %	25 %	25 %	528834523
9076	NC_021909	GAC	2	6	450787	450792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
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9078	NC_021909	CG	3	6	450970	450975	0 %	0 %	50 %	50 %	528834523
9079	NC_021909	CTT	2	6	450998	451003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834523
9080	NC_021909	CG	4	8	451056	451063	0 %	0 %	50 %	50 %	528834523
9081	NC_021909	AGCC	2	8	451257	451264	25 %	0 %	25 %	50 %	528834523
9082	NC_021909	ATC	2	6	451268	451273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834523
9083	NC_021909	CG	3	6	451379	451384	0 %	0 %	50 %	50 %	528834523
9084	NC_021909	CTGC	2	8	451628	451635	0 %	25 %	25 %	50 %	528834523
9085	NC_021909	TC	3	6	451680	451685	0 %	50 %	0 %	50 %	528834523
9086	NC_021909	TCGGT	2	10	451847	451856	0 %	40 %	40 %	20 %	528834523
9087	NC_021909	TCG	2	6	451865	451870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9088	NC_021909	GGC	2	6	452005	452010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834523
9089	NC_021909	CTGA	2	8	452092	452099	25 %	25 %	25 %	25 %	528834523
9090	NC_021909	GAT	2	6	452128	452133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834523
9091	NC_021909	GAT	2	6	452167	452172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834523
9092	NC_021909	CAG	3	9	452185	452193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834523
9093	NC_021909	T	6	6	452213	452218	0 %	100 %	0 %	0 %	528834523
9094	NC_021909	TCA	2	6	452223	452228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834523
9095	NC_021909	GA	3	6	452287	452292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_021909	TACT	2	8	452343	452350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9097	NC_021909	TA	3	6	452406	452411	50 %	50 %	0 %	0 %	528834524
9098	NC_021909	CAG	2	6	452424	452429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834524
9099	NC_021909	TGA	2	6	452430	452435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834524
9100	NC_021909	GCC	2	6	452620	452625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834524
9101	NC_021909	AGTT	2	8	452692	452699	25 %	50 %	25 %	0 %	528834524
9102	NC_021909	CCT	2	6	452706	452711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834524
9103	NC_021909	CTCG	2	8	452764	452771	0 %	25 %	25 %	50 %	528834524
9104	NC_021909	ATC	2	6	452777	452782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834524
9105	NC_021909	CCCG	2	8	452916	452923	0 %	0 %	25 %	75 %	528834525
9106	NC_021909	TCGA	2	8	452947	452954	25 %	25 %	25 %	25 %	528834525
9107	NC_021909	ATG	2	6	453054	453059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834525
9108	NC_021909	CCG	2	6	453088	453093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834525
9109	NC_021909	GAC	2	6	453104	453109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834525
9110	NC_021909	ACCCG	2	10	453129	453138	20 %	0 %	20 %	60 %	528834525
9111	NC_021909	TTG	2	6	453261	453266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834525
9112	NC_021909	ATA	2	6	453306	453311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834525
9113	NC_021909	GAA	2	6	453375	453380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834525
9114	NC_021909	GAT	2	6	453416	453421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834525
9115	NC_021909	C	6	6	453427	453432	0 %	0 %	0 %	100 %	528834525
9116	NC_021909	CGA	2	6	453442	453447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834525
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9118	NC_021909	CGC	2	6	453514	453519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834525
9119	NC_021909	CGG	2	6	453542	453547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834525
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9121	NC_021909	TGG	2	6	453639	453644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834525
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9123	NC_021909	GCTC	2	8	453727	453734	0 %	25 %	25 %	50 %	528834525
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9236	NC_021909	GC	3	6	459551	459556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9237	NC_021909	TC	3	6	459568	459573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9238	NC_021909	GT	3	6	459598	459603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9239	NC_021909	CT	3	6	459620	459625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9240	NC_021909	GAA	2	6	459665	459670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834532
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9243	NC_021909	GC	3	6	459782	459787	0 %	0 %	50 %	50 %	528834532
9244	NC_021909	ATCA	2	8	459799	459806	50 %	25 %	0 %	25 %	528834532
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9490	NC_021909	TGTC	2	8	471757	471764	0 %	50 %	25 %	25 %	528834544
9491	NC_021909	GCTG	2	8	471765	471772	0 %	25 %	50 %	25 %	528834544
9492	NC_021909	GCC	2	6	471818	471823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834544
9493	NC_021909	ACG	2	6	471837	471842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834544
9494	NC_021909	GAA	2	6	471889	471894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834544
9495	NC_021909	GCCCG	2	10	471901	471910	0 %	0 %	40 %	60 %	528834544
9496	NC_021909	TCGC	2	8	471974	471981	0 %	25 %	25 %	50 %	528834544
9497	NC_021909	AGC	2	6	471984	471989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834544
9498	NC_021909	TCGGCA	2	12	472035	472046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528834544
9499	NC_021909	GCA	2	6	472096	472101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834544
9500	NC_021909	CGG	3	9	472132	472140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834544

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