MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021909	GC	3	6	421640	421645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8502	NC_021909	TTC	2	6	421719	421724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_021909	CGC	2	6	421823	421828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8504	NC_021909	CGG	2	6	421851	421856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_021909	CG	3	6	421959	421964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8506	NC_021909	CGGCT	2	10	422046	422055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8507	NC_021909	GGA	2	6	422105	422110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834491
8508	NC_021909	CGC	2	6	422284	422289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834491
8509	NC_021909	TGGC	2	8	422330	422337	0 %	25 %	50 %	25 %	528834491
8510	NC_021909	TCGA	2	8	422364	422371	25 %	25 %	25 %	25 %	528834491
8511	NC_021909	CAA	2	6	422427	422432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834491
8512	NC_021909	TAC	2	6	422494	422499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834491
8513	NC_021909	CGA	2	6	422501	422506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834491
8514	NC_021909	TGC	2	6	422527	422532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834491
8515	NC_021909	GAAA	2	8	422534	422541	75 %	0 %	25 %	0 %	528834491
8516	NC_021909	CAC	2	6	422574	422579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834491
8517	NC_021909	GA	3	6	422606	422611	50 %	0 %	50 %	0 %	528834491
8518	NC_021909	CCA	2	6	422788	422793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834491
8519	NC_021909	CGA	2	6	422911	422916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834492
8520	NC_021909	GAC	2	6	422951	422956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834492
8521	NC_021909	TGG	2	6	422988	422993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834492
8522	NC_021909	TGC	2	6	422997	423002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834492
8523	NC_021909	CGAA	2	8	423019	423026	50 %	0 %	25 %	25 %	528834492
8524	NC_021909	GTC	2	6	423043	423048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834492
8525	NC_021909	GAT	2	6	423079	423084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834492
8526	NC_021909	GTG	2	6	423251	423256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834492
8527	NC_021909	ATG	2	6	423267	423272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834492
8528	NC_021909	AAGG	2	8	423293	423300	50 %	0 %	50 %	0 %	528834492
8529	NC_021909	GGCG	2	8	423321	423328	0 %	0 %	75 %	25 %	528834492
8530	NC_021909	GCCG	2	8	423362	423369	0 %	0 %	50 %	50 %	528834492
8531	NC_021909	GGC	2	6	423415	423420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834492
8532	NC_021909	GGA	2	6	423427	423432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834492
8533	NC_021909	ACG	2	6	423447	423452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834492
8534	NC_021909	CGG	2	6	423473	423478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834492
8535	NC_021909	GC	3	6	423483	423488	0 %	0 %	50 %	50 %	528834492
8536	NC_021909	TGAA	2	8	423506	423513	50 %	25 %	25 %	0 %	528834492
8537	NC_021909	TCC	2	6	423519	423524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834493
8538	NC_021909	CG	4	8	423595	423602	0 %	0 %	50 %	50 %	528834493
8539	NC_021909	TGT	2	6	423612	423617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834493
8540	NC_021909	GGA	2	6	423652	423657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834493
8541	NC_021909	GGT	2	6	423670	423675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834493
8542	NC_021909	TTG	2	6	423723	423728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834493
8543	NC_021909	AAGCC	2	10	423747	423756	40 %	0 %	20 %	40 %	528834493
8544	NC_021909	ACG	2	6	423785	423790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834493
8545	NC_021909	CTG	2	6	423792	423797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834493
8546	NC_021909	GTT	2	6	423833	423838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834493
8547	NC_021909	CGT	2	6	423856	423861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834493
8548	NC_021909	AAG	2	6	423866	423871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834493
8549	NC_021909	GGCA	2	8	423877	423884	25 %	0 %	50 %	25 %	528834493
8550	NC_021909	ATTCTG	2	12	424038	424049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	528834493
8551	NC_021909	GAA	2	6	424145	424150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834493
8552	NC_021909	AAGA	2	8	424181	424188	75 %	0 %	25 %	0 %	528834493
8553	NC_021909	GAA	2	6	424229	424234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834493
8554	NC_021909	GC	3	6	424240	424245	0 %	0 %	50 %	50 %	528834493
8555	NC_021909	CCAG	2	8	424302	424309	25 %	0 %	25 %	50 %	528834493
8556	NC_021909	CT	3	6	424328	424333	0 %	50 %	0 %	50 %	528834493
8557	NC_021909	GCC	2	6	424512	424517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834494
8558	NC_021909	CGA	2	6	424522	424527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834494
8559	NC_021909	CGA	2	6	424557	424562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834494
8560	NC_021909	CAG	2	6	424563	424568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834494
8561	NC_021909	CGG	2	6	424589	424594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834494
8562	NC_021909	ATA	2	6	424597	424602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834494
8563	NC_021909	GTA	2	6	424664	424669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_021909	CGT	2	6	424745	424750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8565	NC_021909	GCG	2	6	424771	424776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8566	NC_021909	GCA	2	6	424817	424822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8567	NC_021909	GGC	2	6	424832	424837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8568	NC_021909	CGC	2	6	424883	424888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834495
8569	NC_021909	GC	3	6	424887	424892	0 %	0 %	50 %	50 %	528834495
8570	NC_021909	CGC	2	6	424899	424904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834495
8571	NC_021909	CGG	2	6	424916	424921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8572	NC_021909	GA	3	6	424973	424978	50 %	0 %	50 %	0 %	528834495
8573	NC_021909	ATG	2	6	424991	424996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834495
8574	NC_021909	CGC	2	6	425003	425008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834495
8575	NC_021909	GCG	2	6	425015	425020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8576	NC_021909	CGT	2	6	425024	425029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8577	NC_021909	CGG	2	6	425057	425062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8578	NC_021909	GCA	2	6	425081	425086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8579	NC_021909	TGT	2	6	425090	425095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834495
8580	NC_021909	GAT	2	6	425106	425111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834495
8581	NC_021909	CTC	2	6	425112	425117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834495
8582	NC_021909	GC	3	6	425268	425273	0 %	0 %	50 %	50 %	528834495
8583	NC_021909	CAG	2	6	425274	425279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8584	NC_021909	ACG	3	9	425314	425322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8585	NC_021909	TCC	2	6	425389	425394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834495
8586	NC_021909	TCG	2	6	425410	425415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834495
8587	NC_021909	CCCA	2	8	425467	425474	25 %	0 %	0 %	75 %	528834495
8588	NC_021909	TCC	2	6	425476	425481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834495
8589	NC_021909	CGG	2	6	425504	425509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8590	NC_021909	GCG	2	6	425510	425515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834495
8591	NC_021909	TTTC	2	8	425628	425635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8592	NC_021909	ATG	2	6	425705	425710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834496
8593	NC_021909	CGG	2	6	425737	425742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834496
8594	NC_021909	GCC	2	6	425762	425767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834496
8595	NC_021909	GGC	2	6	425852	425857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834496
8596	NC_021909	AAG	2	6	425911	425916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834496
8597	NC_021909	ACGTGA	2	12	426027	426038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528834496
8598	NC_021909	TCT	2	6	426045	426050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834496
8599	NC_021909	GC	3	6	426079	426084	0 %	0 %	50 %	50 %	528834496
8600	NC_021909	CGG	2	6	426085	426090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834496
8601	NC_021909	CCT	2	6	426108	426113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834496
8602	NC_021909	CCGG	2	8	426135	426142	0 %	0 %	50 %	50 %	528834496
8603	NC_021909	GGC	2	6	426163	426168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834496
8604	NC_021909	CCG	2	6	426195	426200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834496
8605	NC_021909	TCGA	2	8	426245	426252	25 %	25 %	25 %	25 %	528834496
8606	NC_021909	GC	3	6	426318	426323	0 %	0 %	50 %	50 %	528834496
8607	NC_021909	GGA	2	6	426352	426357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834496
8608	NC_021909	GCC	2	6	426365	426370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834496
8609	NC_021909	TCG	3	9	426420	426428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834496
8610	NC_021909	CGG	2	6	426430	426435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834496
8611	NC_021909	TGC	2	6	426454	426459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_021909	AGA	2	6	426464	426469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_021909	ACGC	2	8	426479	426486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8614	NC_021909	ACTCG	2	10	426503	426512	20 %	20 %	20 %	40 %	528834497
8615	NC_021909	GGC	2	6	426603	426608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834497
8616	NC_021909	GAA	2	6	426642	426647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834497
8617	NC_021909	CCGG	2	8	426694	426701	0 %	0 %	50 %	50 %	528834497
8618	NC_021909	GGCGAA	2	12	426823	426834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8619	NC_021909	GCT	2	6	426954	426959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_021909	GGCG	2	8	426984	426991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8621	NC_021909	GCTG	2	8	427010	427017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_021909	GC	3	6	427064	427069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_021909	TCC	2	6	427143	427148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8989	NC_021909	AAC	2	6	445987	445992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834518
8990	NC_021909	TCG	2	6	446000	446005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834518
8991	NC_021909	GCAA	2	8	446017	446024	50 %	0 %	25 %	25 %	528834518
8992	NC_021909	AAC	2	6	446041	446046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834518
8993	NC_021909	GC	3	6	446081	446086	0 %	0 %	50 %	50 %	528834518
8994	NC_021909	C	6	6	446114	446119	0 %	0 %	0 %	100 %	528834518
8995	NC_021909	CGGCT	2	10	446140	446149	0 %	20 %	40 %	40 %	528834518
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8997	NC_021909	ACG	2	6	446293	446298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834518
8998	NC_021909	GCC	2	6	446326	446331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834518
8999	NC_021909	CG	3	6	446470	446475	0 %	0 %	50 %	50 %	528834518
9000	NC_021909	TCGC	2	8	446576	446583	0 %	25 %	25 %	50 %	528834518

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