MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021909	TCC	2	6	395431	395436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834463
8002	NC_021909	CCG	2	6	395542	395547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834463
8003	NC_021909	ATA	2	6	395635	395640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834463
8004	NC_021909	TCC	2	6	395653	395658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834463
8005	NC_021909	ATC	2	6	395710	395715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834463
8006	NC_021909	ACAG	2	8	395755	395762	50 %	0 %	25 %	25 %	528834463
8007	NC_021909	CT	3	6	395775	395780	0 %	50 %	0 %	50 %	528834463
8008	NC_021909	ATG	2	6	395827	395832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834463
8009	NC_021909	TGC	2	6	395841	395846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834463
8010	NC_021909	CGG	2	6	395925	395930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834463
8011	NC_021909	TCT	2	6	395944	395949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834463
8012	NC_021909	GAAG	2	8	395995	396002	50 %	0 %	50 %	0 %	528834463
8013	NC_021909	CCT	2	6	396139	396144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_021909	AG	3	6	396190	396195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021909	AGG	2	6	396265	396270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_021909	ACG	2	6	396278	396283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_021909	GACGGC	2	12	396346	396357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_021909	CAA	2	6	396426	396431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_021909	CTG	2	6	396465	396470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_021909	CTG	2	6	396472	396477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_021909	CAA	2	6	396478	396483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_021909	GCC	2	6	396497	396502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_021909	GCG	2	6	396553	396558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_021909	CCG	3	9	396559	396567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_021909	TGTC	2	8	396641	396648	0 %	50 %	25 %	25 %	528834464
8026	NC_021909	CGA	2	6	396660	396665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834464
8027	NC_021909	GC	4	8	396678	396685	0 %	0 %	50 %	50 %	528834464
8028	NC_021909	CT	3	6	396687	396692	0 %	50 %	0 %	50 %	528834464
8029	NC_021909	A	6	6	396693	396698	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
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8031	NC_021909	ATGA	2	8	396775	396782	50 %	25 %	25 %	0 %	528834464
8032	NC_021909	TAC	2	6	396810	396815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834464
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8035	NC_021909	A	6	6	396911	396916	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
8036	NC_021909	TCCT	2	8	396964	396971	0 %	50 %	0 %	50 %	528834464
8037	NC_021909	TTC	2	6	397027	397032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834464
8038	NC_021909	GAC	2	6	397041	397046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834464
8039	NC_021909	GAT	2	6	397061	397066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834464
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8042	NC_021909	CGC	2	6	397119	397124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834464
8043	NC_021909	A	6	6	397135	397140	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
8044	NC_021909	AT	3	6	397157	397162	50 %	50 %	0 %	0 %	528834464
8045	NC_021909	AATTC	2	10	397174	397183	40 %	40 %	0 %	20 %	528834464
8046	NC_021909	CTCG	2	8	397227	397234	0 %	25 %	25 %	50 %	528834464
8047	NC_021909	C	6	6	397265	397270	0 %	0 %	0 %	100 %	528834464
8048	NC_021909	TCT	2	6	397295	397300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834464
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8051	NC_021909	CT	3	6	397397	397402	0 %	50 %	0 %	50 %	528834464
8052	NC_021909	GC	3	6	397413	397418	0 %	0 %	50 %	50 %	528834464
8053	NC_021909	CCA	2	6	397436	397441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834464
8054	NC_021909	ATT	2	6	397467	397472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834464
8055	NC_021909	CAA	2	6	397500	397505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834464
8056	NC_021909	GTCCA	2	10	397533	397542	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8057	NC_021909	GTG	2	6	397545	397550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021909	TGA	2	6	397644	397649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_021909	A	6	6	397668	397673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021909	TC	3	6	397719	397724	0 %	50 %	0 %	50 %	528834465
8061	NC_021909	GTT	2	6	397749	397754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834465
8062	NC_021909	GAT	2	6	397829	397834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834465
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8064	NC_021909	GGC	2	6	397947	397952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_021909	CTT	2	6	398065	398070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8067	NC_021909	GAG	2	6	398178	398183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021909	TTGA	2	8	398199	398206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_021909	CTC	3	9	398214	398222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_021909	CGG	2	6	398333	398338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8072	NC_021909	T	6	6	398430	398435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021909	GAC	2	6	398482	398487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_021909	GAT	2	6	398568	398573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834466
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8084	NC_021909	CAT	2	6	399144	399149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834466
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8089	NC_021909	GTT	2	6	399534	399539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_021909	GGC	3	9	399682	399690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834467
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8101	NC_021909	TCAA	2	8	400232	400239	50 %	25 %	0 %	25 %	528834467
8102	NC_021909	T	6	6	400247	400252	0 %	100 %	0 %	0 %	528834467
8103	NC_021909	CGT	2	6	400540	400545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834467
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8105	NC_021909	CGG	2	6	400639	400644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834467
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8107	NC_021909	TGCT	2	8	400702	400709	0 %	50 %	25 %	25 %	528834467
8108	NC_021909	CGA	2	6	400713	400718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834467
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8111	NC_021909	CTC	2	6	400912	400917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834467
8112	NC_021909	TTC	2	6	401037	401042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_021909	CCT	2	6	401178	401183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_021909	GCG	2	6	401346	401351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_021909	GGTTC	2	10	401426	401435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8116	NC_021909	TC	3	6	401438	401443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_021909	TGG	2	6	401476	401481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_021909	CTT	2	6	401557	401562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_021909	CG	3	6	401677	401682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_021909	CGG	2	6	401686	401691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_021909	TGG	2	6	401692	401697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021909	CGA	2	6	401713	401718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_021909	CGAT	2	8	401736	401743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_021909	CTT	3	9	401827	401835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_021909	GGC	2	6	401865	401870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_021909	GCAG	2	8	401886	401893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_021909	CGA	2	6	401902	401907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_021909	TCT	2	6	402090	402095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_021909	CT	3	6	402131	402136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8243	NC_021909	GC	3	6	407205	407210	0 %	0 %	50 %	50 %	528834472
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8246	NC_021909	GAAA	2	8	407440	407447	75 %	0 %	25 %	0 %	528834472
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8249	NC_021909	CAAC	2	8	407561	407568	50 %	0 %	0 %	50 %	528834472
8250	NC_021909	GCG	2	6	407681	407686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834473
8251	NC_021909	TGGCA	2	10	407762	407771	20 %	20 %	40 %	20 %	528834473
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