MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 12362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021909	GGC	2	6	319231	319236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834387
6502	NC_021909	TGAT	2	8	319245	319252	25 %	50 %	25 %	0 %	528834387
6503	NC_021909	CGGTG	2	10	319279	319288	0 %	20 %	60 %	20 %	528834387
6504	NC_021909	TTGTC	2	10	319356	319365	0 %	60 %	20 %	20 %	528834387
6505	NC_021909	ACA	2	6	319379	319384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834387
6506	NC_021909	CTC	2	6	319475	319480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834387
6507	NC_021909	ATG	2	6	319553	319558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834387
6508	NC_021909	CGA	2	6	319605	319610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834387
6509	NC_021909	ATC	2	6	319631	319636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834387
6510	NC_021909	TCG	2	6	319659	319664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834387
6511	NC_021909	CGG	2	6	319696	319701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834387
6512	NC_021909	GAAGA	2	10	319744	319753	60 %	0 %	40 %	0 %	528834388
6513	NC_021909	TTCG	2	8	319822	319829	0 %	50 %	25 %	25 %	528834388
6514	NC_021909	AGCG	2	8	319872	319879	25 %	0 %	50 %	25 %	528834388
6515	NC_021909	CTA	2	6	319906	319911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834388
6516	NC_021909	CAA	2	6	319917	319922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834388
6517	NC_021909	GCC	2	6	320020	320025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834388
6518	NC_021909	TCT	2	6	320066	320071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834388
6519	NC_021909	CAAT	2	8	320102	320109	50 %	25 %	0 %	25 %	528834388
6520	NC_021909	CGT	2	6	320130	320135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834388
6521	NC_021909	CGG	2	6	320190	320195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834388
6522	NC_021909	TCT	2	6	320202	320207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834388
6523	NC_021909	GGC	2	6	320329	320334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834388
6524	NC_021909	CTG	3	9	320344	320352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834388
6525	NC_021909	TGAC	2	8	320384	320391	25 %	25 %	25 %	25 %	528834388
6526	NC_021909	ACG	2	6	320448	320453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834388
6527	NC_021909	GGGC	2	8	320521	320528	0 %	0 %	75 %	25 %	528834388
6528	NC_021909	CA	3	6	320609	320614	50 %	0 %	0 %	50 %	528834388
6529	NC_021909	AGGCGC	2	12	320624	320635	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528834388
6530	NC_021909	GTC	2	6	320647	320652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834388
6531	NC_021909	CGC	2	6	320748	320753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834388
6532	NC_021909	CGA	2	6	320775	320780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_021909	CTTTT	2	10	320790	320799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6534	NC_021909	CGC	2	6	320854	320859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_021909	TGA	2	6	320913	320918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_021909	GCC	2	6	320987	320992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_021909	GGC	2	6	321013	321018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_021909	GCT	2	6	321132	321137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_021909	GAC	2	6	321185	321190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_021909	GGT	2	6	321201	321206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021909	ACC	2	6	321230	321235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_021909	CGAG	2	8	321240	321247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_021909	AGA	2	6	321259	321264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021909	CGT	2	6	321278	321283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_021909	GTGCG	2	10	321367	321376	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6546	NC_021909	CG	3	6	321375	321380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_021909	ATG	2	6	321411	321416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_021909	CGA	2	6	321427	321432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_021909	T	6	6	321541	321546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021909	GTCA	2	8	321578	321585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_021909	CGGC	2	8	321609	321616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_021909	CTT	3	9	321671	321679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_021909	GGC	2	6	321772	321777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_021909	TG	3	6	321812	321817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_021909	CGA	2	6	321841	321846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_021909	GTGC	2	8	321863	321870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_021909	GCC	2	6	322086	322091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_021909	TGG	2	6	322158	322163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_021909	GCG	2	6	322229	322234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_021909	GCA	2	6	322261	322266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_021909	CAT	2	6	322288	322293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_021909	A	7	7	322357	322363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021909	CGC	2	6	322370	322375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_021909	GCC	2	6	322415	322420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_021909	CGT	2	6	322437	322442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_021909	AGC	2	6	322453	322458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_021909	TGCT	2	8	322503	322510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_021909	GTC	2	6	322517	322522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_021909	CTG	2	6	322531	322536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_021909	GGC	2	6	322571	322576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_021909	GAC	2	6	322666	322671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_021909	CTG	2	6	322690	322695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_021909	GAAGCA	2	12	322726	322737	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6574	NC_021909	GCC	2	6	322756	322761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_021909	CG	3	6	322800	322805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_021909	GAG	2	6	322900	322905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_021909	GGC	2	6	322935	322940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_021909	CGTC	2	8	322987	322994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6579	NC_021909	CGT	2	6	323027	323032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_021909	CGC	2	6	323036	323041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_021909	TGT	2	6	323058	323063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_021909	CTG	2	6	323241	323246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_021909	GAT	2	6	323249	323254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_021909	AGCG	2	8	323298	323305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6585	NC_021909	TGC	2	6	323414	323419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_021909	CGA	2	6	323435	323440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_021909	CT	3	6	323526	323531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6588	NC_021909	CCG	2	6	323532	323537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_021909	GGC	2	6	323631	323636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_021909	AGGC	2	8	323679	323686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6591	NC_021909	GCCCC	2	10	323717	323726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6592	NC_021909	GCG	2	6	323882	323887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834389
6593	NC_021909	AG	3	6	323888	323893	50 %	0 %	50 %	0 %	528834389
6594	NC_021909	TGG	2	6	323922	323927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834389
6595	NC_021909	ACC	2	6	323929	323934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834389
6596	NC_021909	CCGT	2	8	323942	323949	0 %	25 %	25 %	50 %	528834389
6597	NC_021909	CAT	2	6	323984	323989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834389
6598	NC_021909	CAGGTG	2	12	324023	324034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528834389
6599	NC_021909	CAC	2	6	324101	324106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834389
6600	NC_021909	TGG	2	6	324163	324168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834389
6601	NC_021909	GCC	2	6	324184	324189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834389
6602	NC_021909	GGAGCC	2	12	324238	324249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528834389
6603	NC_021909	GCCG	2	8	324289	324296	0 %	0 %	50 %	50 %	528834389
6604	NC_021909	GTC	2	6	324326	324331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834389
6605	NC_021909	CAC	2	6	324374	324379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834389
6606	NC_021909	ACC	2	6	324388	324393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834389
6607	NC_021909	AGG	2	6	324411	324416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834390
6608	NC_021909	CGC	2	6	324474	324479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834390
6609	NC_021909	CTT	2	6	324494	324499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834390
6610	NC_021909	GAC	2	6	324601	324606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834390
6611	NC_021909	GACA	2	8	324651	324658	50 %	0 %	25 %	25 %	528834390
6612	NC_021909	GGC	2	6	324687	324692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_021909	GGC	2	6	324746	324751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_021909	ACG	2	6	324864	324869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_021909	CG	3	6	324873	324878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_021909	GGC	2	6	324886	324891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834391
6617	NC_021909	GAC	2	6	324936	324941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834391
6618	NC_021909	GAT	2	6	324966	324971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834391
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6620	NC_021909	GC	3	6	325358	325363	0 %	0 %	50 %	50 %	528834392
6621	NC_021909	GAGAT	2	10	325431	325440	40 %	20 %	40 %	0 %	528834392
6622	NC_021909	TCAA	2	8	325458	325465	50 %	25 %	0 %	25 %	528834392
6623	NC_021909	GC	3	6	325477	325482	0 %	0 %	50 %	50 %	528834392
6624	NC_021909	GCCAAG	2	12	325559	325570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834392
6625	NC_021909	GCA	2	6	325599	325604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834392
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6627	NC_021909	G	6	6	325668	325673	0 %	0 %	100 %	0 %	528834392
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6864	NC_021909	CTT	2	6	337087	337092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6994	NC_021909	CGTT	2	8	343050	343057	0 %	50 %	25 %	25 %	528834412
6995	NC_021909	TCA	2	6	343114	343119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834412
6996	NC_021909	GAAG	2	8	343136	343143	50 %	0 %	50 %	0 %	528834412
6997	NC_021909	AAAGG	2	10	343156	343165	60 %	0 %	40 %	0 %	528834412
6998	NC_021909	AGC	2	6	343276	343281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834412
6999	NC_021909	CGG	2	6	343314	343319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834412
7000	NC_021909	GCA	2	6	343406	343411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834412

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