MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_021908	CAT	2	6	81244	81249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832555
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2013	NC_021908	GC	3	6	81909	81914	0 %	0 %	50 %	50 %	528832556
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2127	NC_021908	GA	4	8	87075	87082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2250	NC_021908	GCAC	2	8	92664	92671	25 %	0 %	25 %	50 %	528832566
2251	NC_021908	TGC	2	6	92676	92681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2252	NC_021908	GCT	2	6	92722	92727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2253	NC_021908	CTCCGG	2	12	92734	92745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832566
2254	NC_021908	CTG	2	6	92774	92779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2255	NC_021908	GGCC	2	8	92853	92860	0 %	0 %	50 %	50 %	528832566
2256	NC_021908	CG	3	6	92985	92990	0 %	0 %	50 %	50 %	528832566
2257	NC_021908	GCT	2	6	93016	93021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2258	NC_021908	TC	3	6	93067	93072	0 %	50 %	0 %	50 %	528832566
2259	NC_021908	CGG	2	6	93073	93078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832566
2260	NC_021908	CAG	3	9	93080	93088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2261	NC_021908	CGC	2	6	93091	93096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832566
2262	NC_021908	CGA	2	6	93139	93144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2263	NC_021908	GC	4	8	93196	93203	0 %	0 %	50 %	50 %	528832566
2264	NC_021908	ATGAG	2	10	93240	93249	40 %	20 %	40 %	0 %	528832566
2265	NC_021908	CGT	2	6	93274	93279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832566
2266	NC_021908	AGC	2	6	93305	93310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832566
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2268	NC_021908	TCA	2	6	93395	93400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832567
2269	NC_021908	CG	4	8	93429	93436	0 %	0 %	50 %	50 %	528832567
2270	NC_021908	GGGC	2	8	93440	93447	0 %	0 %	75 %	25 %	528832567
2271	NC_021908	GCCG	2	8	93465	93472	0 %	0 %	50 %	50 %	528832567
2272	NC_021908	TCG	2	6	93503	93508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2273	NC_021908	TCG	2	6	93515	93520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2274	NC_021908	GC	3	6	93531	93536	0 %	0 %	50 %	50 %	528832567
2275	NC_021908	GC	3	6	93560	93565	0 %	0 %	50 %	50 %	528832567
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2280	NC_021908	GCT	2	6	93655	93660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2281	NC_021908	GC	3	6	93669	93674	0 %	0 %	50 %	50 %	528832567
2282	NC_021908	CGC	2	6	93681	93686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832567
2283	NC_021908	TCG	2	6	93734	93739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2284	NC_021908	CGC	2	6	93747	93752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832567
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2286	NC_021908	AAGG	2	8	93934	93941	50 %	0 %	50 %	0 %	528832567
2287	NC_021908	ACGGC	2	10	93956	93965	20 %	0 %	40 %	40 %	528832567
2288	NC_021908	GCT	2	6	94011	94016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2289	NC_021908	GGC	2	6	94053	94058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832567
2290	NC_021908	CGA	2	6	94080	94085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2291	NC_021908	TCG	2	6	94166	94171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
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2295	NC_021908	GTC	2	6	94336	94341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
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2300	NC_021908	CCG	2	6	94557	94562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832567
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2303	NC_021908	CGG	2	6	94587	94592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832567
2304	NC_021908	AGG	2	6	94610	94615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832567
2305	NC_021908	GCC	3	9	94636	94644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832567
2306	NC_021908	GCT	2	6	94650	94655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2307	NC_021908	AT	3	6	94677	94682	50 %	50 %	0 %	0 %	528832567
2308	NC_021908	GGCGCA	2	12	94707	94718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832567
2309	NC_021908	CGG	2	6	94736	94741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832567
2310	NC_021908	CGTG	2	8	94776	94783	0 %	25 %	50 %	25 %	528832567
2311	NC_021908	CGA	2	6	94803	94808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832567
2312	NC_021908	GGT	2	6	94833	94838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832567
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2314	NC_021908	ACAGG	2	10	94882	94891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2315	NC_021908	TCG	2	6	95019	95024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832568
2316	NC_021908	TGA	2	6	95071	95076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832568
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2319	NC_021908	GAA	2	6	95138	95143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832568
2320	NC_021908	CGG	2	6	95146	95151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832568
2321	NC_021908	ACC	2	6	95154	95159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832568
2322	NC_021908	GTG	2	6	95196	95201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832568
2323	NC_021908	TTC	2	6	95223	95228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832568
2324	NC_021908	CCAG	2	8	95233	95240	25 %	0 %	25 %	50 %	528832568
2325	NC_021908	CCGA	2	8	95334	95341	25 %	0 %	25 %	50 %	528832568
2326	NC_021908	CGC	2	6	95353	95358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832568
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2328	NC_021908	CGG	2	6	95390	95395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832568
2329	NC_021908	AAG	2	6	95478	95483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2331	NC_021908	AAG	2	6	95605	95610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2332	NC_021908	ACG	2	6	95642	95647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832569
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2334	NC_021908	CGG	2	6	95711	95716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832569
2335	NC_021908	TGC	2	6	95725	95730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832569
2336	NC_021908	CGAG	2	8	95740	95747	25 %	0 %	50 %	25 %	528832569
2337	NC_021908	TTTCG	2	10	95766	95775	0 %	60 %	20 %	20 %	528832569
2338	NC_021908	CTG	2	6	95787	95792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832569
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2340	NC_021908	CGA	2	6	95855	95860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832569
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2342	NC_021908	GCT	2	6	95894	95899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832569
2343	NC_021908	TCA	2	6	95908	95913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832569
2344	NC_021908	ATCT	2	8	95916	95923	25 %	50 %	0 %	25 %	528832569
2345	NC_021908	GCT	2	6	95924	95929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832569
2346	NC_021908	GGCT	2	8	95979	95986	0 %	25 %	50 %	25 %	528832569
2347	NC_021908	CGG	2	6	96094	96099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832569
2348	NC_021908	TGG	2	6	96124	96129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832569
2349	NC_021908	CA	3	6	96134	96139	50 %	0 %	0 %	50 %	528832569
2350	NC_021908	TCA	2	6	96193	96198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832569
2351	NC_021908	ATCT	2	8	96213	96220	25 %	50 %	0 %	25 %	528832569
2352	NC_021908	GTG	2	6	96254	96259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832569
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2356	NC_021908	GCG	2	6	96614	96619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832570
2357	NC_021908	TCG	2	6	96627	96632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832570
2358	NC_021908	CGA	2	6	96658	96663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832570
2359	NC_021908	TCA	2	6	96718	96723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832570
2360	NC_021908	CG	3	6	96754	96759	0 %	0 %	50 %	50 %	528832570
2361	NC_021908	AGG	2	6	96852	96857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832570
2362	NC_021908	GCAGGC	2	12	96868	96879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832570
2363	NC_021908	GCG	2	6	96890	96895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832570
2364	NC_021908	AGCGC	2	10	96940	96949	20 %	0 %	40 %	40 %	528832570
2365	NC_021908	CGC	2	6	97064	97069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832570
2366	NC_021908	CTT	2	6	97115	97120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832570
2367	NC_021908	GC	3	6	97305	97310	0 %	0 %	50 %	50 %	528832570
2368	NC_021908	TCG	3	9	97320	97328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832570
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2371	NC_021908	GGC	2	6	97580	97585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832570
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2373	NC_021908	GCC	2	6	97628	97633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832570
2374	NC_021908	GCGG	2	8	97676	97683	0 %	0 %	75 %	25 %	528832570
2375	NC_021908	GGC	2	6	97730	97735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832570
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2497	NC_021908	GC	3	6	102742	102747	0 %	0 %	50 %	50 %	528832575
2498	NC_021908	GGC	2	6	102754	102759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832575
2499	NC_021908	GTC	2	6	102795	102800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_021908	GGGA	2	8	102811	102818	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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