MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021908	ATG	2	6	461452	461457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832911
11002	NC_021908	TCA	2	6	461478	461483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832911
11003	NC_021908	ATG	2	6	461513	461518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832911
11004	NC_021908	GAAG	2	8	461575	461582	50 %	0 %	50 %	0 %	528832911
11005	NC_021908	ATC	2	6	461633	461638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832911
11006	NC_021908	GC	3	6	461669	461674	0 %	0 %	50 %	50 %	528832911
11007	NC_021908	CGG	2	6	461707	461712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832911
11008	NC_021908	CAT	2	6	461728	461733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832911
11009	NC_021908	CG	3	6	461739	461744	0 %	0 %	50 %	50 %	528832911
11010	NC_021908	CCA	2	6	461746	461751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832911
11011	NC_021908	AGA	2	6	461805	461810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832911
11012	NC_021908	TCG	2	6	461888	461893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11013	NC_021908	TCG	2	6	461960	461965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11014	NC_021908	GCGGT	2	10	461975	461984	0 %	20 %	60 %	20 %	528832911
11015	NC_021908	CAG	2	6	461998	462003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11016	NC_021908	TTC	2	6	462010	462015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832911
11017	NC_021908	TCG	2	6	462060	462065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11018	NC_021908	CGA	2	6	462129	462134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11019	NC_021908	ACG	2	6	462260	462265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11020	NC_021908	TTC	2	6	462329	462334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832911
11021	NC_021908	GC	3	6	462437	462442	0 %	0 %	50 %	50 %	528832911
11022	NC_021908	AGG	2	6	462450	462455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832911
11023	NC_021908	CTC	2	6	462475	462480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832911
11024	NC_021908	AAT	2	6	462486	462491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832911
11025	NC_021908	TCG	2	6	462569	462574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832911
11026	NC_021908	GCCC	2	8	462603	462610	0 %	0 %	25 %	75 %	528832911
11027	NC_021908	GC	3	6	462680	462685	0 %	0 %	50 %	50 %	528832911
11028	NC_021908	TG	3	6	462765	462770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_021908	CTC	2	6	462779	462784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_021908	GAA	2	6	462796	462801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_021908	TC	3	6	462840	462845	0 %	50 %	0 %	50 %	528832912
11032	NC_021908	CGT	2	6	462879	462884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11033	NC_021908	GTC	2	6	462908	462913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11034	NC_021908	CGG	2	6	462952	462957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832912
11035	NC_021908	CG	3	6	462972	462977	0 %	0 %	50 %	50 %	528832912
11036	NC_021908	GCGCC	2	10	462982	462991	0 %	0 %	40 %	60 %	528832912
11037	NC_021908	TCA	2	6	463023	463028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832912
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11039	NC_021908	CGT	2	6	463135	463140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11040	NC_021908	ATCGTC	2	12	463196	463207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528832912
11041	NC_021908	CTG	2	6	463234	463239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11042	NC_021908	CGT	2	6	463360	463365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11043	NC_021908	CATC	2	8	463377	463384	25 %	25 %	0 %	50 %	528832912
11044	NC_021908	CGA	2	6	463407	463412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11045	NC_021908	AT	3	6	463442	463447	50 %	50 %	0 %	0 %	528832912
11046	NC_021908	GTC	2	6	463495	463500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11047	NC_021908	CGC	2	6	463573	463578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832912
11048	NC_021908	CAG	2	6	463591	463596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11049	NC_021908	TCA	2	6	463620	463625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832912
11050	NC_021908	CTTC	2	8	463656	463663	0 %	50 %	0 %	50 %	528832912
11051	NC_021908	TCG	2	6	463703	463708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11052	NC_021908	CCCG	2	8	463736	463743	0 %	0 %	25 %	75 %	528832912
11053	NC_021908	TCG	2	6	463784	463789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11054	NC_021908	ACG	2	6	463810	463815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832912
11055	NC_021908	CTTG	2	8	463863	463870	0 %	50 %	25 %	25 %	528832912
11056	NC_021908	T	6	6	463896	463901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021908	ATC	2	6	463955	463960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832913
11058	NC_021908	TGC	2	6	463965	463970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832913
11059	NC_021908	TTC	2	6	463981	463986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832913
11060	NC_021908	CGT	2	6	464001	464006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832913
11061	NC_021908	GCA	2	6	464010	464015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832913
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11064	NC_021908	GCCG	2	8	464092	464099	0 %	0 %	50 %	50 %	528832913
11065	NC_021908	GAAA	2	8	464195	464202	75 %	0 %	25 %	0 %	528832913
11066	NC_021908	TCA	2	6	464253	464258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832913
11067	NC_021908	GATGC	2	10	464371	464380	20 %	20 %	40 %	20 %	528832913
11068	NC_021908	CG	3	6	464424	464429	0 %	0 %	50 %	50 %	528832913
11069	NC_021908	GGC	2	6	464455	464460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832913
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11072	NC_021908	CATG	2	8	464610	464617	25 %	25 %	25 %	25 %	528832913
11073	NC_021908	GCC	2	6	464626	464631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832913
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11079	NC_021908	CCG	2	6	464864	464869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_021908	AAC	2	6	464878	464883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832914
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11087	NC_021908	TCG	2	6	465230	465235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832914
11088	NC_021908	GAA	2	6	465243	465248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832914
11089	NC_021908	GAGCC	2	10	465256	465265	20 %	0 %	40 %	40 %	528832914
11090	NC_021908	GCT	2	6	465356	465361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832914
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11092	NC_021908	GC	3	6	465415	465420	0 %	0 %	50 %	50 %	528832914
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11101	NC_021908	AGC	2	6	465952	465957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
11102	NC_021908	GAT	2	6	465962	465967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832915
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11106	NC_021908	CGT	2	6	466097	466102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832915
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11109	NC_021908	GAC	2	6	466244	466249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
11110	NC_021908	GCCGGA	2	12	466259	466270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832915
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11116	NC_021908	TA	3	6	466666	466671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_021908	CGG	2	6	466723	466728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
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11119	NC_021908	GCG	2	6	466751	466756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
11120	NC_021908	CCG	2	6	466802	466807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832916
11121	NC_021908	CCGG	2	8	466968	466975	0 %	0 %	50 %	50 %	528832916
11122	NC_021908	CGG	2	6	466980	466985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
11123	NC_021908	GAC	2	6	467116	467121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832916
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11125	NC_021908	GCG	2	6	467155	467160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
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11165	NC_021908	CTTC	2	8	468509	468516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11358	NC_021908	CGC	2	6	476034	476039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832924
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11480	NC_021908	GGC	2	6	480993	480998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11481	NC_021908	ACA	2	6	481007	481012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11482	NC_021908	CAA	2	6	481016	481021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11483	NC_021908	ACA	2	6	481024	481029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11484	NC_021908	GCG	2	6	481159	481164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_021908	GGC	2	6	481342	481347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832929
11486	NC_021908	CAT	2	6	481357	481362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_021908	GCC	2	6	481363	481368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11488	NC_021908	GTGC	2	8	481378	481385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11489	NC_021908	CCGG	2	8	481504	481511	0 %	0 %	50 %	50 %	528832930
11490	NC_021908	GGC	2	6	481515	481520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832930
11491	NC_021908	GGC	2	6	481526	481531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832930
11492	NC_021908	CCTT	2	8	481596	481603	0 %	50 %	0 %	50 %	528832930
11493	NC_021908	ATC	2	6	481629	481634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832930
11494	NC_021908	TGC	2	6	481641	481646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832930
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11497	NC_021908	GCCC	2	8	481738	481745	0 %	0 %	25 %	75 %	528832930
11498	NC_021908	ATG	2	6	481806	481811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832930
11499	NC_021908	GTC	2	6	481886	481891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832930
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