MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021908	AC	3	6	441098	441103	50 %	0 %	0 %	50 %	528832893
10502	NC_021908	GGC	2	6	441159	441164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832893
10503	NC_021908	GC	3	6	441176	441181	0 %	0 %	50 %	50 %	528832893
10504	NC_021908	CCG	2	6	441182	441187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832893
10505	NC_021908	GTC	2	6	441295	441300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832893
10506	NC_021908	GC	3	6	441317	441322	0 %	0 %	50 %	50 %	528832893
10507	NC_021908	GGC	2	6	441344	441349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832893
10508	NC_021908	GCA	2	6	441386	441391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_021908	GGC	2	6	441538	441543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832894
10510	NC_021908	CGTTC	2	10	441556	441565	0 %	40 %	20 %	40 %	528832894
10511	NC_021908	TGAT	2	8	441619	441626	25 %	50 %	25 %	0 %	528832894
10512	NC_021908	GAT	2	6	441676	441681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832894
10513	NC_021908	ATA	2	6	441840	441845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832894
10514	NC_021908	CTC	2	6	442008	442013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10515	NC_021908	GGC	2	6	442052	442057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_021908	CAT	2	6	442082	442087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_021908	AAC	2	6	442154	442159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832895
10518	NC_021908	CTG	2	6	442337	442342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832895
10519	NC_021908	CGG	2	6	442354	442359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832895
10520	NC_021908	CGG	2	6	442434	442439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832895
10521	NC_021908	GCA	2	6	442471	442476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832895
10522	NC_021908	GCT	2	6	442496	442501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832895
10523	NC_021908	GCC	2	6	442678	442683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_021908	GCG	2	6	442727	442732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_021908	TTG	2	6	442759	442764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_021908	TC	3	6	442788	442793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_021908	CGA	2	6	442835	442840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_021908	ACG	2	6	442883	442888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10529	NC_021908	GAG	2	6	442890	442895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832896
10530	NC_021908	CGA	2	6	442979	442984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10531	NC_021908	GTG	2	6	442992	442997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832896
10532	NC_021908	ATCA	2	8	443001	443008	50 %	25 %	0 %	25 %	528832896
10533	NC_021908	CGC	2	6	443020	443025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10534	NC_021908	CGG	2	6	443030	443035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10535	NC_021908	GCC	2	6	443041	443046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10536	NC_021908	GGC	2	6	443064	443069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10537	NC_021908	TCG	2	6	443089	443094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10538	NC_021908	ACG	2	6	443122	443127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10539	NC_021908	CGA	2	6	443128	443133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10540	NC_021908	GAA	2	6	443237	443242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832896
10541	NC_021908	TGA	2	6	443305	443310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832896
10542	NC_021908	CGT	2	6	443375	443380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10543	NC_021908	GAC	2	6	443505	443510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10544	NC_021908	GGTC	2	8	443516	443523	0 %	25 %	50 %	25 %	528832896
10545	NC_021908	CGG	2	6	443550	443555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10546	NC_021908	CAG	2	6	443556	443561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10547	NC_021908	CGC	2	6	443642	443647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10548	NC_021908	ATC	2	6	443650	443655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832896
10549	NC_021908	GCC	2	6	443718	443723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10550	NC_021908	GCGGCC	2	12	443733	443744	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10551	NC_021908	CTG	2	6	443772	443777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10552	NC_021908	CGGAG	2	10	443821	443830	20 %	0 %	60 %	20 %	528832896
10553	NC_021908	GC	4	8	443840	443847	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10554	NC_021908	CTT	2	6	443856	443861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832896
10555	NC_021908	T	6	6	443864	443869	0 %	100 %	0 %	0 %	528832896
10556	NC_021908	CGT	2	6	443897	443902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10557	NC_021908	TCG	2	6	443923	443928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10558	NC_021908	CG	3	6	443927	443932	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10559	NC_021908	TGC	2	6	443968	443973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10560	NC_021908	CGA	2	6	443975	443980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10561	NC_021908	TGC	2	6	443990	443995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10562	NC_021908	GCT	2	6	443998	444003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10563	NC_021908	CGC	2	6	444020	444025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10564	NC_021908	CG	3	6	444094	444099	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10565	NC_021908	CAT	2	6	444113	444118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832896
10566	NC_021908	ATC	2	6	444219	444224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832896
10567	NC_021908	CGG	2	6	444229	444234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10568	NC_021908	GCG	2	6	444252	444257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10569	NC_021908	CGG	2	6	444344	444349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10570	NC_021908	CCGG	2	8	444389	444396	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10571	NC_021908	CTGG	2	8	444440	444447	0 %	25 %	50 %	25 %	528832896
10572	NC_021908	CGA	2	6	444470	444475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10573	NC_021908	CGG	2	6	444479	444484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10574	NC_021908	CGA	2	6	444485	444490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10575	NC_021908	GCT	2	6	444491	444496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10576	NC_021908	GC	3	6	444513	444518	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10577	NC_021908	CGT	2	6	444572	444577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10578	NC_021908	GAA	2	6	444597	444602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832896
10579	NC_021908	GC	3	6	444615	444620	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10580	NC_021908	CGGCAT	2	12	444661	444672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10581	NC_021908	CGT	2	6	444683	444688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10582	NC_021908	TGC	2	6	444725	444730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
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10584	NC_021908	CG	3	6	444826	444831	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10585	NC_021908	TGCC	2	8	444833	444840	0 %	25 %	25 %	50 %	528832896
10586	NC_021908	GTG	2	6	444894	444899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832896
10587	NC_021908	AGG	2	6	444929	444934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832896
10588	NC_021908	CG	3	6	444978	444983	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10589	NC_021908	CAT	2	6	445001	445006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832896
10590	NC_021908	CGA	2	6	445067	445072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10591	NC_021908	GCT	2	6	445148	445153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10592	NC_021908	CA	3	6	445166	445171	50 %	0 %	0 %	50 %	528832896
10593	NC_021908	GCCG	2	8	445232	445239	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10594	NC_021908	AGC	2	6	445266	445271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
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10597	NC_021908	CGT	2	6	445415	445420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10598	NC_021908	GGC	2	6	445452	445457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10599	NC_021908	TGC	3	9	445465	445473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10600	NC_021908	GGC	2	6	445561	445566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10601	NC_021908	CGG	2	6	445643	445648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10602	NC_021908	CGC	2	6	445665	445670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
10603	NC_021908	CTT	2	6	445685	445690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832896
10604	NC_021908	ATGT	2	8	445710	445717	25 %	50 %	25 %	0 %	528832896
10605	NC_021908	CGCTCG	2	12	445744	445755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832896
10606	NC_021908	GCG	2	6	445761	445766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10607	NC_021908	GAG	2	6	445767	445772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832896
10608	NC_021908	CGT	2	6	445790	445795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10609	NC_021908	ACG	2	6	445812	445817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10610	NC_021908	CAG	3	9	445859	445867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10611	NC_021908	GGC	3	9	445895	445903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
10612	NC_021908	GC	4	8	445911	445918	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10613	NC_021908	GGC	2	6	445944	445949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832896
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10615	NC_021908	ACG	2	6	446018	446023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10616	NC_021908	CGGC	2	8	446027	446034	0 %	0 %	50 %	50 %	528832896
10617	NC_021908	CCTG	2	8	446051	446058	0 %	25 %	25 %	50 %	528832896
10618	NC_021908	TGC	2	6	446066	446071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832896
10619	NC_021908	CGC	2	6	446093	446098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832896
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10621	NC_021908	TGA	2	6	446110	446115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832896
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10982	NC_021908	TGA	2	6	460870	460875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832910
10983	NC_021908	TGC	2	6	460876	460881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832910
10984	NC_021908	AGATG	2	10	460942	460951	40 %	20 %	40 %	0 %	528832910
10985	NC_021908	TGGCG	2	10	460957	460966	0 %	20 %	60 %	20 %	528832910
10986	NC_021908	GTCC	2	8	460988	460995	0 %	25 %	25 %	50 %	528832910
10987	NC_021908	GCT	2	6	460996	461001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832910
10988	NC_021908	GCCC	2	8	461007	461014	0 %	0 %	25 %	75 %	528832910
10989	NC_021908	ACC	2	6	461016	461021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832910
10990	NC_021908	GAT	2	6	461084	461089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832910
10991	NC_021908	TCG	2	6	461091	461096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832910
10992	NC_021908	TCG	2	6	461154	461159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832910
10993	NC_021908	CTCG	2	8	461225	461232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10994	NC_021908	AGG	2	6	461235	461240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10995	NC_021908	TCACT	2	10	461259	461268	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10996	NC_021908	CT	3	6	461299	461304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10997	NC_021908	GCA	2	6	461322	461327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10999	NC_021908	TCC	2	6	461414	461419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832911
11000	NC_021908	TCG	2	6	461426	461431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832911

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