MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 12246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021908	CGC	2	6	276314	276319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832731
6502	NC_021908	GCA	2	6	276344	276349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832731
6503	NC_021908	GCCGG	2	10	276384	276393	0 %	0 %	60 %	40 %	528832731
6504	NC_021908	CCGG	2	8	276404	276411	0 %	0 %	50 %	50 %	528832731
6505	NC_021908	GGAC	2	8	276421	276428	25 %	0 %	50 %	25 %	528832731
6506	NC_021908	TGC	2	6	276479	276484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_021908	GGC	2	6	276502	276507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_021908	CCTT	2	8	276581	276588	0 %	50 %	0 %	50 %	528832732
6509	NC_021908	AGC	2	6	276599	276604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832732
6510	NC_021908	TTC	2	6	276653	276658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832732
6511	NC_021908	CTT	2	6	276682	276687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832732
6512	NC_021908	TTG	2	6	276704	276709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832732
6513	NC_021908	ACG	2	6	276710	276715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832732
6514	NC_021908	GCT	2	6	276749	276754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832732
6515	NC_021908	GCG	2	6	276770	276775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832732
6516	NC_021908	AAC	2	6	276843	276848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832733
6517	NC_021908	GCG	2	6	276860	276865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6518	NC_021908	TCC	2	6	276928	276933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832733
6519	NC_021908	GCCGC	2	10	276941	276950	0 %	0 %	40 %	60 %	528832733
6520	NC_021908	CGA	2	6	276986	276991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832733
6521	NC_021908	GCG	2	6	277063	277068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6522	NC_021908	CCG	2	6	277070	277075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832733
6523	NC_021908	GC	3	6	277084	277089	0 %	0 %	50 %	50 %	528832733
6524	NC_021908	GCC	2	6	277114	277119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832733
6525	NC_021908	CGG	2	6	277148	277153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6526	NC_021908	TCG	2	6	277253	277258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832733
6527	NC_021908	ATC	2	6	277261	277266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832733
6528	NC_021908	TGA	2	6	277337	277342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832733
6529	NC_021908	GGC	2	6	277392	277397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6530	NC_021908	TTG	3	9	277408	277416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832733
6531	NC_021908	GCG	2	6	277537	277542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6532	NC_021908	CGG	2	6	277544	277549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832733
6533	NC_021908	GAT	2	6	277641	277646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832733
6534	NC_021908	ATG	2	6	277670	277675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832733
6535	NC_021908	TGC	2	6	277687	277692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832733
6536	NC_021908	GAA	2	6	277714	277719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832733
6537	NC_021908	TCA	2	6	277771	277776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832733
6538	NC_021908	TCG	2	6	277822	277827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_021908	TCG	2	6	277845	277850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_021908	GGTC	2	8	277881	277888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_021908	CGG	2	6	277913	277918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_021908	CGG	2	6	278038	278043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_021908	TCG	2	6	278085	278090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_021908	GCC	3	9	278103	278111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_021908	GAAGC	2	10	278185	278194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6546	NC_021908	GAG	2	6	278206	278211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_021908	CGG	2	6	278270	278275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_021908	ATGCGG	2	12	278308	278319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6549	NC_021908	CGG	3	9	278334	278342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_021908	GTC	2	6	278379	278384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_021908	CCG	2	6	278390	278395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_021908	TGC	2	6	278414	278419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_021908	GAG	2	6	278467	278472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021908	GGC	2	6	278483	278488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_021908	AAAC	2	8	278508	278515	75 %	0 %	0 %	25 %	528832734
6556	NC_021908	ACC	2	6	278531	278536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832734
6557	NC_021908	ATC	2	6	278545	278550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832734
6558	NC_021908	GAT	2	6	278556	278561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832734
6559	NC_021908	AGA	2	6	278602	278607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832734
6560	NC_021908	GTC	2	6	278619	278624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832734
6561	NC_021908	CCG	2	6	278725	278730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832734
6562	NC_021908	CGA	2	6	278738	278743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832734
6563	NC_021908	CCGG	2	8	278765	278772	0 %	0 %	50 %	50 %	528832734
6564	NC_021908	GGCG	2	8	278777	278784	0 %	0 %	75 %	25 %	528832734
6565	NC_021908	GCG	2	6	278860	278865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832734
6566	NC_021908	GCC	2	6	278898	278903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832734
6567	NC_021908	GCC	2	6	278977	278982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832734
6568	NC_021908	CAG	2	6	279018	279023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832734
6569	NC_021908	CGC	2	6	279128	279133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_021908	GCC	2	6	279246	279251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_021908	AGC	2	6	279284	279289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832735
6572	NC_021908	CG	4	8	279326	279333	0 %	0 %	50 %	50 %	528832735
6573	NC_021908	CG	3	6	279370	279375	0 %	0 %	50 %	50 %	528832735
6574	NC_021908	GCCG	2	8	279397	279404	0 %	0 %	50 %	50 %	528832735
6575	NC_021908	GGC	2	6	279418	279423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832735
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6577	NC_021908	GCG	2	6	279566	279571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832735
6578	NC_021908	GCT	2	6	279586	279591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832735
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6580	NC_021908	TCG	2	6	279669	279674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832735
6581	NC_021908	GAG	2	6	279680	279685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832735
6582	NC_021908	GGA	2	6	279736	279741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832735
6583	NC_021908	ACG	2	6	279765	279770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832735
6584	NC_021908	CCTTTC	2	12	279873	279884	0 %	50 %	0 %	50 %	528832735
6585	NC_021908	CGC	2	6	279907	279912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832735
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6587	NC_021908	GC	4	8	279929	279936	0 %	0 %	50 %	50 %	528832735
6588	NC_021908	TCG	2	6	279960	279965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832735
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6598	NC_021908	GACG	2	8	280390	280397	25 %	0 %	50 %	25 %	528832736
6599	NC_021908	CGA	2	6	280398	280403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832736
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6602	NC_021908	GAT	2	6	280530	280535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832736
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6607	NC_021908	GAT	2	6	280668	280673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832736
6608	NC_021908	CCTATC	2	12	280694	280705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	528832736
6609	NC_021908	CGG	2	6	280707	280712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832736
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6614	NC_021908	GA	3	6	281121	281126	50 %	0 %	50 %	0 %	528832736
6615	NC_021908	GAG	2	6	281131	281136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832736
6616	NC_021908	CGC	3	9	281142	281150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832736
6617	NC_021908	GA	3	6	281168	281173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021908	A	6	6	281199	281204	100 %	0 %	0 %	0 %	528832737
6619	NC_021908	TAA	2	6	281206	281211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832737
6620	NC_021908	GAT	2	6	281231	281236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832737
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6622	NC_021908	TCA	2	6	281281	281286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832737
6623	NC_021908	ATCG	2	8	281315	281322	25 %	25 %	25 %	25 %	528832737
6624	NC_021908	GCC	2	6	281337	281342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832737
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6627	NC_021908	CGC	2	6	281539	281544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832737
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6650	NC_021908	GCA	2	6	282356	282361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832737
6651	NC_021908	CTTG	2	8	282365	282372	0 %	50 %	25 %	25 %	528832737
6652	NC_021908	GCA	2	6	282428	282433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832737
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6654	NC_021908	GGC	2	6	282535	282540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6655	NC_021908	CA	3	6	282618	282623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6656	NC_021908	CCG	2	6	282652	282657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832738
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6721	NC_021908	GCCGCT	2	12	285206	285217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832740
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6727	NC_021908	GTTC	2	8	285520	285527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6728	NC_021908	ATCA	2	8	285558	285565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6729	NC_021908	GAT	2	6	285576	285581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6732	NC_021908	GAC	2	6	286020	286025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832741
6733	NC_021908	TTA	2	6	286043	286048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832741
6734	NC_021908	CTC	2	6	286226	286231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832741
6735	NC_021908	GAG	2	6	286245	286250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832741
6736	NC_021908	CAT	2	6	286298	286303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832741
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6742	NC_021908	GGC	2	6	286475	286480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832741
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6867	NC_021908	CGAC	2	8	292376	292383	25 %	0 %	25 %	50 %	528832746
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