MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021907	GCC	2	6	231967	231972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831313
5502	NC_021907	CGAGAT	2	12	232059	232070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528831313
5503	NC_021907	GCCG	2	8	232071	232078	0 %	0 %	50 %	50 %	528831313
5504	NC_021907	GCG	2	6	232082	232087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831313
5505	NC_021907	GGC	2	6	232093	232098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831313
5506	NC_021907	GAC	2	6	232168	232173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5507	NC_021907	GCCGC	2	10	232174	232183	0 %	0 %	40 %	60 %	528831313
5508	NC_021907	GCCG	2	8	232185	232192	0 %	0 %	50 %	50 %	528831313
5509	NC_021907	ATCG	2	8	232200	232207	25 %	25 %	25 %	25 %	528831313
5510	NC_021907	GAG	2	6	232234	232239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831313
5511	NC_021907	CTG	2	6	232240	232245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5512	NC_021907	GCT	2	6	232251	232256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5513	NC_021907	CTCG	2	8	232266	232273	0 %	25 %	25 %	50 %	528831313
5514	NC_021907	TGG	2	6	232295	232300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831313
5515	NC_021907	TCG	2	6	232304	232309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5516	NC_021907	GGT	2	6	232335	232340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831313
5517	NC_021907	GCCG	2	8	232402	232409	0 %	0 %	50 %	50 %	528831313
5518	NC_021907	CGA	2	6	232461	232466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5519	NC_021907	CCG	3	9	232478	232486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831313
5520	NC_021907	TAT	2	6	232531	232536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831313
5521	NC_021907	TTC	2	6	232669	232674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831313
5522	NC_021907	TCG	2	6	232679	232684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831313
5523	NC_021907	GCG	2	6	232686	232691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831313
5524	NC_021907	CCG	2	6	232759	232764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831313
5525	NC_021907	GCA	2	6	232806	232811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5526	NC_021907	GAA	2	6	232827	232832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831314
5527	NC_021907	GCC	2	6	232838	232843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831314
5528	NC_021907	GC	3	6	232845	232850	0 %	0 %	50 %	50 %	528831314
5529	NC_021907	CCCTCG	2	12	232859	232870	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	528831314
5530	NC_021907	AGC	2	6	232883	232888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5531	NC_021907	GCCG	2	8	232902	232909	0 %	0 %	50 %	50 %	528831314
5532	NC_021907	CGT	2	6	232933	232938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5533	NC_021907	G	6	6	232943	232948	0 %	0 %	100 %	0 %	528831314
5534	NC_021907	GCG	2	6	233042	233047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831314
5535	NC_021907	CGAAGC	2	12	233136	233147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5536	NC_021907	CTGT	2	8	233168	233175	0 %	50 %	25 %	25 %	528831314
5537	NC_021907	GGC	2	6	233282	233287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831314
5538	NC_021907	GTT	2	6	233335	233340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831314
5539	NC_021907	CGA	2	6	233346	233351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5540	NC_021907	AGG	2	6	233352	233357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831314
5541	NC_021907	TCG	2	6	233363	233368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5542	NC_021907	GCG	2	6	233370	233375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831314
5543	NC_021907	TCG	2	6	233411	233416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5544	NC_021907	GCGTG	2	10	233418	233427	0 %	20 %	60 %	20 %	528831314
5545	NC_021907	GCG	2	6	233445	233450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831314
5546	NC_021907	GAT	2	6	233452	233457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831314
5547	NC_021907	TCC	2	6	233501	233506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831314
5548	NC_021907	CGA	2	6	233524	233529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5549	NC_021907	ATC	2	6	233564	233569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831314
5550	NC_021907	CGG	2	6	233576	233581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831314
5551	NC_021907	GAT	2	6	233617	233622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831314
5552	NC_021907	TGC	2	6	233637	233642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5553	NC_021907	GCC	2	6	233643	233648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831314
5554	NC_021907	GGTTGA	2	12	233649	233660	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	528831314
5555	NC_021907	TTC	2	6	233690	233695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831314
5556	NC_021907	TCT	2	6	233721	233726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831314
5557	NC_021907	CGA	2	6	233781	233786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831314
5558	NC_021907	TCC	2	6	233798	233803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831314
5559	NC_021907	CCA	2	6	233823	233828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831314
5560	NC_021907	GAC	2	6	233950	233955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021907	CGG	2	6	234053	234058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831315
5562	NC_021907	TGA	2	6	234068	234073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831315
5563	NC_021907	CCT	2	6	234135	234140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831315
5564	NC_021907	GGC	2	6	234203	234208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831315
5565	NC_021907	GCC	2	6	234276	234281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831315
5566	NC_021907	CGG	2	6	234284	234289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831315
5567	NC_021907	CGA	2	6	234308	234313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831315
5568	NC_021907	GGC	2	6	234359	234364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831315
5569	NC_021907	CGA	2	6	234456	234461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831315
5570	NC_021907	AGC	2	6	234490	234495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831315
5571	NC_021907	CCG	2	6	234539	234544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831315
5572	NC_021907	GGT	2	6	234644	234649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831315
5573	NC_021907	CCG	2	6	234679	234684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831315
5574	NC_021907	TCC	2	6	234685	234690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831315
5575	NC_021907	CGA	3	9	234776	234784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831315
5576	NC_021907	CGG	2	6	234923	234928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831315
5577	NC_021907	CGCGCA	2	12	234929	234940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528831315
5578	NC_021907	GGCCG	2	10	234950	234959	0 %	0 %	60 %	40 %	528831315
5579	NC_021907	CGGCAG	2	12	234966	234977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528831315
5580	NC_021907	CTT	2	6	235039	235044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_021907	GCC	2	6	235072	235077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5582	NC_021907	GTC	2	6	235150	235155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831316
5583	NC_021907	CGG	2	6	235194	235199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831316
5584	NC_021907	CTT	2	6	235201	235206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831316
5585	NC_021907	CGA	2	6	235248	235253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831316
5586	NC_021907	CGA	2	6	235272	235277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831316
5587	NC_021907	CATTGA	2	12	235293	235304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528831316
5588	NC_021907	TGC	2	6	235327	235332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831316
5589	NC_021907	GAT	2	6	235348	235353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831316
5590	NC_021907	CGC	2	6	235392	235397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5591	NC_021907	GCC	2	6	235398	235403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5592	NC_021907	CTGG	2	8	235408	235415	0 %	25 %	50 %	25 %	528831316
5593	NC_021907	TGA	2	6	235422	235427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831316
5594	NC_021907	GCC	2	6	235432	235437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5595	NC_021907	TCA	2	6	235473	235478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831316
5596	NC_021907	GGC	2	6	235564	235569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831316
5597	NC_021907	TTG	2	6	235571	235576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831316
5598	NC_021907	CCG	2	6	235592	235597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5599	NC_021907	CGG	3	9	235686	235694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831316
5600	NC_021907	TCG	2	6	235698	235703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831316
5601	NC_021907	TCGATA	2	12	235709	235720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528831316
5602	NC_021907	CCTT	2	8	235742	235749	0 %	50 %	0 %	50 %	528831316
5603	NC_021907	CG	4	8	235782	235789	0 %	0 %	50 %	50 %	528831316
5604	NC_021907	CCG	2	6	235790	235795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
5605	NC_021907	GGA	2	6	235896	235901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021907	TTC	2	6	235950	235955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831317
5607	NC_021907	GCG	3	9	236022	236030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831317
5608	NC_021907	CTG	2	6	236033	236038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831317
5609	NC_021907	CGA	2	6	236041	236046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831317
5610	NC_021907	CGA	2	6	236077	236082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831317
5611	NC_021907	GA	3	6	236136	236141	50 %	0 %	50 %	0 %	528831317
5612	NC_021907	GCC	2	6	236172	236177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831317
5613	NC_021907	GGC	2	6	236220	236225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831317
5614	NC_021907	CTT	2	6	236255	236260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831317
5615	NC_021907	AGGA	2	8	236289	236296	50 %	0 %	50 %	0 %	528831317
5616	NC_021907	CGGC	2	8	236442	236449	0 %	0 %	50 %	50 %	528831317
5617	NC_021907	GGA	2	6	236535	236540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831317
5618	NC_021907	TCA	2	6	236551	236556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831317
5619	NC_021907	CTT	2	6	236579	236584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831317
5620	NC_021907	GCC	2	6	236633	236638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831317
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5742	NC_021907	GAG	2	6	241551	241556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831322
5743	NC_021907	GAT	2	6	241587	241592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831322
5744	NC_021907	CGCC	2	8	241621	241628	0 %	0 %	25 %	75 %	528831322
5745	NC_021907	GCC	2	6	241641	241646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
5746	NC_021907	CCG	2	6	241652	241657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
5747	NC_021907	CTG	2	6	241695	241700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831322
5748	NC_021907	GCCGC	2	10	241715	241724	0 %	0 %	40 %	60 %	528831322
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5755	NC_021907	GC	3	6	241984	241989	0 %	0 %	50 %	50 %	528831322
5756	NC_021907	CCG	2	6	241999	242004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
5757	NC_021907	GAC	2	6	242014	242019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
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5761	NC_021907	AATGC	2	10	242068	242077	40 %	20 %	20 %	20 %	528831322
5762	NC_021907	AAGG	2	8	242265	242272	50 %	0 %	50 %	0 %	528831322
5763	NC_021907	GGC	2	6	242307	242312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831322
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5766	NC_021907	GAT	2	6	242535	242540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831322
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5773	NC_021907	TTG	2	6	242766	242771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831323
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5782	NC_021907	CTC	2	6	243581	243586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5783	NC_021907	CTT	2	6	243616	243621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831324
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5814	NC_021907	TCC	3	9	244842	244850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5987	NC_021907	GAA	2	6	251946	251951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831331
5988	NC_021907	TGG	2	6	251998	252003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831331
5989	NC_021907	CGA	2	6	252022	252027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831331
5990	NC_021907	GCT	2	6	252044	252049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831331
5991	NC_021907	TAT	2	6	252132	252137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831331
5992	NC_021907	TGA	2	6	252326	252331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831331
5993	NC_021907	CGG	2	6	252335	252340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831331
5994	NC_021907	TGA	2	6	252433	252438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831331
5995	NC_021907	TCGA	2	8	252455	252462	25 %	25 %	25 %	25 %	528831331
5996	NC_021907	GAG	2	6	252489	252494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831331
5997	NC_021907	CCG	2	6	252571	252576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831331
5998	NC_021907	GCGAA	2	10	252602	252611	40 %	0 %	40 %	20 %	528831331
5999	NC_021907	GCCG	3	12	252665	252676	0 %	0 %	50 %	50 %	528831331

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