MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021907	TCC	2	6	190945	190950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831275
4502	NC_021907	TCG	2	6	190972	190977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4503	NC_021907	GCC	2	6	191079	191084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4504	NC_021907	CGCT	2	8	191091	191098	0 %	25 %	25 %	50 %	528831275
4505	NC_021907	GGT	2	6	191102	191107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831275
4506	NC_021907	GCC	2	6	191114	191119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4507	NC_021907	CGG	2	6	191123	191128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4508	NC_021907	A	6	6	191164	191169	100 %	0 %	0 %	0 %	528831275
4509	NC_021907	CGG	2	6	191213	191218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4510	NC_021907	CGG	2	6	191282	191287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4511	NC_021907	ATC	2	6	191310	191315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831275
4512	NC_021907	CGG	2	6	191321	191326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4513	NC_021907	GCT	2	6	191384	191389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4514	NC_021907	CGC	2	6	191438	191443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4515	NC_021907	CTG	2	6	191463	191468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4516	NC_021907	CGC	2	6	191510	191515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4517	NC_021907	CTG	2	6	191528	191533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4518	NC_021907	GCT	2	6	191540	191545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4519	NC_021907	CCCTG	2	10	191587	191596	0 %	20 %	20 %	60 %	528831275
4520	NC_021907	GCG	2	6	191616	191621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4521	NC_021907	CAT	2	6	191627	191632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831275
4522	NC_021907	GAC	2	6	191657	191662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4523	NC_021907	GCT	2	6	191663	191668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4524	NC_021907	TGG	2	6	191715	191720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831275
4525	NC_021907	CGG	2	6	191729	191734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4526	NC_021907	CGG	2	6	191750	191755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4527	NC_021907	ATC	2	6	191793	191798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831275
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4529	NC_021907	CTG	2	6	191847	191852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4530	NC_021907	CAT	2	6	191861	191866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831275
4531	NC_021907	TCG	2	6	191883	191888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4532	NC_021907	GCTC	2	8	191906	191913	0 %	25 %	25 %	50 %	528831275
4533	NC_021907	CGG	2	6	191927	191932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4534	NC_021907	GCT	2	6	191990	191995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4535	NC_021907	GGC	2	6	192002	192007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831275
4536	NC_021907	GAT	2	6	192008	192013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831275
4537	NC_021907	GC	4	8	192026	192033	0 %	0 %	50 %	50 %	528831275
4538	NC_021907	CTT	2	6	192047	192052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831275
4539	NC_021907	CGC	2	6	192098	192103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4540	NC_021907	GGT	2	6	192107	192112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831275
4541	NC_021907	TTC	2	6	192130	192135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831275
4542	NC_021907	CG	3	6	192167	192172	0 %	0 %	50 %	50 %	528831275
4543	NC_021907	AC	3	6	192256	192261	50 %	0 %	0 %	50 %	528831275
4544	NC_021907	TTC	2	6	192297	192302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831275
4545	NC_021907	CCG	2	6	192320	192325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4546	NC_021907	GTC	2	6	192336	192341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4547	NC_021907	GGCA	2	8	192347	192354	25 %	0 %	50 %	25 %	528831275
4548	NC_021907	GAT	2	6	192444	192449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831275
4549	NC_021907	CG	3	6	192569	192574	0 %	0 %	50 %	50 %	528831275
4550	NC_021907	CTG	2	6	192582	192587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831275
4551	NC_021907	CGC	2	6	192638	192643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831275
4552	NC_021907	CG	3	6	192700	192705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_021907	GCG	2	6	192725	192730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_021907	CG	3	6	192729	192734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_021907	CAG	2	6	192772	192777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831276
4556	NC_021907	CG	3	6	192816	192821	0 %	0 %	50 %	50 %	528831276
4557	NC_021907	CG	3	6	192867	192872	0 %	0 %	50 %	50 %	528831276
4558	NC_021907	CCT	2	6	192906	192911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831276
4559	NC_021907	GTC	2	6	192935	192940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831276
4560	NC_021907	TCG	2	6	192947	192952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831276
4561	NC_021907	CTG	2	6	192973	192978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831276
4562	NC_021907	CATCG	2	10	192994	193003	20 %	20 %	20 %	40 %	528831276
4563	NC_021907	GC	3	6	193005	193010	0 %	0 %	50 %	50 %	528831276
4564	NC_021907	TCG	2	6	193019	193024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831276
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4568	NC_021907	CTG	2	6	193120	193125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831276
4569	NC_021907	CGA	2	6	193131	193136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831276
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4573	NC_021907	TTGCC	2	10	193287	193296	0 %	40 %	20 %	40 %	528831276
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4582	NC_021907	CGC	2	6	193710	193715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831277
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4586	NC_021907	TGAA	2	8	193829	193836	50 %	25 %	25 %	0 %	528831277
4587	NC_021907	GCC	2	6	193858	193863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831277
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4589	NC_021907	CG	3	6	193900	193905	0 %	0 %	50 %	50 %	528831277
4590	NC_021907	GTC	2	6	193940	193945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831277
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4594	NC_021907	CCGA	2	8	194048	194055	25 %	0 %	25 %	50 %	528831277
4595	NC_021907	GGC	2	6	194209	194214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831277
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4599	NC_021907	GA	3	6	194302	194307	50 %	0 %	50 %	0 %	528831277
4600	NC_021907	GGC	2	6	194392	194397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831277
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4604	NC_021907	GGC	2	6	194613	194618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831278
4605	NC_021907	AGC	2	6	194635	194640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831278
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4609	NC_021907	ATC	2	6	194722	194727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831278
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4619	NC_021907	CCGAGC	2	12	194959	194970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528831278
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4743	NC_021907	TCGTG	2	10	200580	200589	0 %	40 %	40 %	20 %	528831282
4744	NC_021907	CGG	2	6	200612	200617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831282
4745	NC_021907	TCG	2	6	200651	200656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831282
4746	NC_021907	CCG	2	6	200675	200680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831282
4747	NC_021907	GGC	2	6	200694	200699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831282
4748	NC_021907	GTC	2	6	200778	200783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4749	NC_021907	CGG	2	6	200834	200839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4750	NC_021907	GCT	2	6	200897	200902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4751	NC_021907	GGC	2	6	200913	200918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4752	NC_021907	CGC	2	6	200963	200968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831283
4753	NC_021907	GAC	2	6	200969	200974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4754	NC_021907	GGC	2	6	201000	201005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4755	NC_021907	CGC	3	9	201017	201025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831283
4756	NC_021907	CTTC	2	8	201075	201082	0 %	50 %	0 %	50 %	528831283
4757	NC_021907	ATC	2	6	201084	201089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831283
4758	NC_021907	TCA	3	9	201109	201117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831283
4759	NC_021907	GCG	2	6	201118	201123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4760	NC_021907	CTG	2	6	201135	201140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4761	NC_021907	GGCC	2	8	201185	201192	0 %	0 %	50 %	50 %	528831283
4762	NC_021907	GTG	2	6	201219	201224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831283
4763	NC_021907	CGC	2	6	201256	201261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831283
4764	NC_021907	CGGC	2	8	201280	201287	0 %	0 %	50 %	50 %	528831283
4765	NC_021907	CGTTC	2	10	201304	201313	0 %	40 %	20 %	40 %	528831283
4766	NC_021907	CTG	2	6	201363	201368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4767	NC_021907	TCG	2	6	201388	201393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4768	NC_021907	GCC	2	6	201456	201461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831283
4769	NC_021907	CGG	2	6	201467	201472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4770	NC_021907	CGG	2	6	201485	201490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831283
4771	NC_021907	CTG	2	6	201525	201530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831283
4772	NC_021907	TTC	2	6	201555	201560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831283
4773	NC_021907	CCG	2	6	201570	201575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831283
4774	NC_021907	ATC	2	6	201603	201608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831283
4775	NC_021907	CGC	2	6	201690	201695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831284
4776	NC_021907	TCT	2	6	201706	201711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831284
4777	NC_021907	TCG	2	6	201729	201734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4778	NC_021907	CCT	2	6	201781	201786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831284
4779	NC_021907	CGC	2	6	201793	201798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831284
4780	NC_021907	TCG	2	6	201810	201815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4781	NC_021907	CCG	2	6	201816	201821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831284
4782	NC_021907	GGC	2	6	201845	201850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831284
4783	NC_021907	TCA	2	6	201873	201878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831284
4784	NC_021907	GGC	2	6	201946	201951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831284
4785	NC_021907	TCGCCA	2	12	201954	201965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528831284
4786	NC_021907	TGA	2	6	201978	201983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831284
4787	NC_021907	ATC	2	6	202019	202024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831284
4788	NC_021907	TCG	2	6	202068	202073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4789	NC_021907	CGG	2	6	202075	202080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831284
4790	NC_021907	CCGTCA	2	12	202086	202097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528831284
4791	NC_021907	TCA	2	6	202110	202115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831284
4792	NC_021907	CAT	2	6	202153	202158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831284
4793	NC_021907	GTC	3	9	202178	202186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4794	NC_021907	TGC	2	6	202188	202193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4795	NC_021907	GC	3	6	202215	202220	0 %	0 %	50 %	50 %	528831284
4796	NC_021907	GCC	2	6	202250	202255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831284
4797	NC_021907	GCGTCA	2	12	202266	202277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4798	NC_021907	CTG	2	6	202388	202393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4799	NC_021907	CGC	2	6	202402	202407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831284
4800	NC_021907	CGT	2	6	202408	202413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4801	NC_021907	CGG	2	6	202417	202422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831284
4802	NC_021907	CGG	2	6	202435	202440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831284
4803	NC_021907	GACGGC	2	12	202486	202497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528831284
4804	NC_021907	CGT	2	6	202507	202512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831284
4805	NC_021907	GC	3	6	202589	202594	0 %	0 %	50 %	50 %	528831284
4806	NC_021907	CAC	2	6	202633	202638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831285
4807	NC_021907	CGA	2	6	202749	202754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831285
4808	NC_021907	CGC	2	6	202767	202772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831285
4809	NC_021907	GC	3	6	202771	202776	0 %	0 %	50 %	50 %	528831285
4810	NC_021907	GGA	2	6	202833	202838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831285
4811	NC_021907	CCGG	2	8	202911	202918	0 %	0 %	50 %	50 %	528831285
4812	NC_021907	GCGGAA	2	12	202939	202950	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528831285
4813	NC_021907	CGT	2	6	202959	202964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831285
4814	NC_021907	GCGTC	2	10	203014	203023	0 %	20 %	40 %	40 %	528831285
4815	NC_021907	CTGG	2	8	203042	203049	0 %	25 %	50 %	25 %	528831285
4816	NC_021907	CGG	2	6	203175	203180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831285
4817	NC_021907	AGG	2	6	203201	203206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831285
4818	NC_021907	AG	3	6	203245	203250	50 %	0 %	50 %	0 %	528831285
4819	NC_021907	TCG	2	6	203279	203284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831285
4820	NC_021907	GCGA	2	8	203371	203378	25 %	0 %	50 %	25 %	528831285
4821	NC_021907	CGA	2	6	203409	203414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831285
4822	NC_021907	CGC	2	6	203439	203444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831285
4823	NC_021907	AGC	2	6	203462	203467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831285
4824	NC_021907	GC	3	6	203466	203471	0 %	0 %	50 %	50 %	528831285
4825	NC_021907	CGAA	2	8	203565	203572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4826	NC_021907	CGA	2	6	203584	203589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4827	NC_021907	CCG	2	6	203618	203623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4828	NC_021907	CTG	2	6	203631	203636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4829	NC_021907	CAG	2	6	203645	203650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4830	NC_021907	CACTGC	2	12	203679	203690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528831286
4831	NC_021907	TGA	2	6	203730	203735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831286
4832	NC_021907	TTCG	2	8	203814	203821	0 %	50 %	25 %	25 %	528831286
4833	NC_021907	GCC	2	6	203861	203866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4834	NC_021907	TGC	2	6	203868	203873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4835	NC_021907	GCC	2	6	203889	203894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4836	NC_021907	GGCGG	2	10	203915	203924	0 %	0 %	80 %	20 %	528831286
4837	NC_021907	CCG	2	6	203925	203930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4838	NC_021907	GCT	2	6	203947	203952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4839	NC_021907	CTGG	2	8	204025	204032	0 %	25 %	50 %	25 %	528831286
4840	NC_021907	TGG	2	6	204063	204068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831286
4841	NC_021907	GCCG	2	8	204077	204084	0 %	0 %	50 %	50 %	528831286
4842	NC_021907	GCG	2	6	204113	204118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4843	NC_021907	GCC	2	6	204173	204178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4844	NC_021907	GCG	3	9	204188	204196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4845	NC_021907	CCG	2	6	204198	204203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4846	NC_021907	GGA	2	6	204208	204213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831286
4847	NC_021907	GC	3	6	204271	204276	0 %	0 %	50 %	50 %	528831286
4848	NC_021907	AG	3	6	204287	204292	50 %	0 %	50 %	0 %	528831286
4849	NC_021907	CAG	2	6	204309	204314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4850	NC_021907	GCC	2	6	204365	204370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831286
4851	NC_021907	TGC	2	6	204390	204395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831286
4852	NC_021907	GCG	2	6	204399	204404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4853	NC_021907	TCT	2	6	204408	204413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831286
4854	NC_021907	GC	3	6	204458	204463	0 %	0 %	50 %	50 %	528831286
4855	NC_021907	GGC	2	6	204464	204469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4856	NC_021907	CGG	2	6	204478	204483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4857	NC_021907	CGG	2	6	204498	204503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
4858	NC_021907	CCGG	2	8	204511	204518	0 %	0 %	50 %	50 %	528831286
4859	NC_021907	GGCATG	2	12	204575	204586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528831286
4860	NC_021907	GC	4	8	204642	204649	0 %	0 %	50 %	50 %	528831286
4861	NC_021907	GAT	2	6	204716	204721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831286
4862	NC_021907	GAT	2	6	204815	204820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831286
4863	NC_021907	CGG	2	6	204828	204833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831286
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4991	NC_021907	GAT	2	6	210400	210405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831290
4992	NC_021907	TCA	2	6	210444	210449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831290
4993	NC_021907	G	6	6	210450	210455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_021907	TGC	2	6	210513	210518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831291
4995	NC_021907	CCG	2	6	210582	210587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831291
4996	NC_021907	CG	3	6	210586	210591	0 %	0 %	50 %	50 %	528831291
4997	NC_021907	GCT	2	6	210609	210614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831291
4998	NC_021907	TCG	2	6	210618	210623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831291
4999	NC_021907	GGC	2	6	210629	210634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831291
5000	NC_021907	ATC	2	6	210682	210687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831291

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