MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 4321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021906	ATGT	2	8	106581	106588	25 %	50 %	25 %	0 %	528831029
2502	NC_021906	GAAG	2	8	106607	106614	50 %	0 %	50 %	0 %	528831029
2503	NC_021906	CCA	2	6	106682	106687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831029
2504	NC_021906	GGA	2	6	106712	106717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831029
2505	NC_021906	CCG	3	9	106756	106764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_021906	GGC	2	6	106769	106774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_021906	TGC	2	6	106788	106793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_021906	GCTT	2	8	106811	106818	0 %	50 %	25 %	25 %	528831030
2509	NC_021906	GCC	2	6	106827	106832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831030
2510	NC_021906	CGT	2	6	106867	106872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831030
2511	NC_021906	CGGC	2	8	106936	106943	0 %	0 %	50 %	50 %	528831030
2512	NC_021906	CTG	2	6	106944	106949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831030
2513	NC_021906	GCA	2	6	106969	106974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831030
2514	NC_021906	GCC	2	6	107007	107012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831030
2515	NC_021906	CCA	2	6	107037	107042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831030
2516	NC_021906	CTGC	2	8	107082	107089	0 %	25 %	25 %	50 %	528831030
2517	NC_021906	GCC	3	9	107210	107218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831030
2518	NC_021906	GC	3	6	107227	107232	0 %	0 %	50 %	50 %	528831030
2519	NC_021906	GC	3	6	107268	107273	0 %	0 %	50 %	50 %	528831030
2520	NC_021906	CTCGG	2	10	107277	107286	0 %	20 %	40 %	40 %	528831030
2521	NC_021906	CGT	2	6	107461	107466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831030
2522	NC_021906	CAG	2	6	107492	107497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831030
2523	NC_021906	GGC	2	6	107563	107568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831030
2524	NC_021906	CCA	2	6	107631	107636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831030
2525	NC_021906	G	6	6	107664	107669	0 %	0 %	100 %	0 %	528831030
2526	NC_021906	CAGA	2	8	107715	107722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_021906	CGC	2	6	107741	107746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_021906	TGT	2	6	107937	107942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_021906	CCG	2	6	107964	107969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_021906	GGCG	2	8	108017	108024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_021906	CGG	2	6	108040	108045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_021906	ATC	2	6	108142	108147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831031
2533	NC_021906	TGC	2	6	108148	108153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831031
2534	NC_021906	CTG	2	6	108187	108192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831031
2535	NC_021906	GCG	2	6	108202	108207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831031
2536	NC_021906	TGG	2	6	108209	108214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831031
2537	NC_021906	CCA	2	6	108264	108269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831031
2538	NC_021906	GACA	2	8	108273	108280	50 %	0 %	25 %	25 %	528831031
2539	NC_021906	GAT	2	6	108363	108368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831031
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2541	NC_021906	GCT	2	6	108396	108401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831031
2542	NC_021906	GA	3	6	108418	108423	50 %	0 %	50 %	0 %	528831031
2543	NC_021906	CTG	2	6	108439	108444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831031
2544	NC_021906	TCT	2	6	108476	108481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831031
2545	NC_021906	TCG	2	6	108488	108493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831031
2546	NC_021906	CG	3	6	108501	108506	0 %	0 %	50 %	50 %	528831031
2547	NC_021906	AGA	2	6	108576	108581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831031
2548	NC_021906	CGC	2	6	108582	108587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831031
2549	NC_021906	GCC	3	9	108607	108615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_021906	ACG	2	6	108625	108630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_021906	ACC	2	6	108646	108651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_021906	GCG	2	6	108661	108666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_021906	CCCAA	2	10	108687	108696	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2554	NC_021906	CAG	2	6	108698	108703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_021906	GA	3	6	108721	108726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_021906	GACA	2	8	108844	108851	50 %	0 %	25 %	25 %	528831032
2557	NC_021906	TGA	2	6	108900	108905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831032
2558	NC_021906	TAT	2	6	108973	108978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831032
2559	NC_021906	GAT	2	6	109054	109059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831032
2560	NC_021906	CTT	2	6	109071	109076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831032
2561	NC_021906	CGG	2	6	109089	109094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831032
2562	NC_021906	GC	3	6	109102	109107	0 %	0 %	50 %	50 %	528831032
2563	NC_021906	CCG	2	6	109219	109224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831032
2564	NC_021906	CGG	2	6	109289	109294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831032
2565	NC_021906	CTT	2	6	109332	109337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831032
2566	NC_021906	CGA	2	6	109350	109355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831032
2567	NC_021906	GCC	2	6	109449	109454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831032
2568	NC_021906	CAAGGG	2	12	109485	109496	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528831032
2569	NC_021906	CGG	3	9	109509	109517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831032
2570	NC_021906	ACGTCT	2	12	109526	109537	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528831032
2571	NC_021906	GGC	2	6	109599	109604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831032
2572	NC_021906	GAA	2	6	109626	109631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831032
2573	NC_021906	GAT	2	6	109650	109655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831033
2574	NC_021906	GTC	2	6	109686	109691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831033
2575	NC_021906	GCTG	2	8	109717	109724	0 %	25 %	50 %	25 %	528831033
2576	NC_021906	CG	3	6	109776	109781	0 %	0 %	50 %	50 %	528831033
2577	NC_021906	TGG	2	6	109849	109854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831033
2578	NC_021906	CGT	2	6	109985	109990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831034
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2581	NC_021906	CGC	2	6	110059	110064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
2582	NC_021906	GCC	2	6	110132	110137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
2583	NC_021906	GAA	2	6	110138	110143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831034
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2585	NC_021906	GCC	3	9	110172	110180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
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2587	NC_021906	GCC	3	9	110240	110248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
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2591	NC_021906	GCA	2	6	110398	110403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831034
2592	NC_021906	GC	3	6	110471	110476	0 %	0 %	50 %	50 %	528831034
2593	NC_021906	CCG	2	6	110512	110517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
2594	NC_021906	CGC	2	6	110638	110643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
2595	NC_021906	ATGA	2	8	110682	110689	50 %	25 %	25 %	0 %	528831034
2596	NC_021906	CGC	2	6	110737	110742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831034
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2598	NC_021906	CG	3	6	110822	110827	0 %	0 %	50 %	50 %	528831034
2599	NC_021906	CAG	2	6	110864	110869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831034
2600	NC_021906	CGCGG	2	10	110944	110953	0 %	0 %	60 %	40 %	528831035
2601	NC_021906	GCAA	2	8	111115	111122	50 %	0 %	25 %	25 %	528831035
2602	NC_021906	TCG	2	6	111155	111160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831035
2603	NC_021906	TTCC	2	8	111174	111181	0 %	50 %	0 %	50 %	528831035
2604	NC_021906	CTC	2	6	111205	111210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831035
2605	NC_021906	AAT	2	6	111324	111329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528831035
2606	NC_021906	CG	3	6	111330	111335	0 %	0 %	50 %	50 %	528831035
2607	NC_021906	GGC	2	6	111376	111381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831035
2608	NC_021906	TGT	2	6	111408	111413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831035
2609	NC_021906	AAAT	2	8	111422	111429	75 %	25 %	0 %	0 %	528831035
2610	NC_021906	GCG	2	6	111430	111435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831035
2611	NC_021906	GAC	2	6	111507	111512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831035
2612	NC_021906	TC	3	6	111531	111536	0 %	50 %	0 %	50 %	528831036
2613	NC_021906	AGCG	2	8	111538	111545	25 %	0 %	50 %	25 %	528831036
2614	NC_021906	TCG	2	6	111554	111559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831036
2615	NC_021906	GCCG	2	8	111585	111592	0 %	0 %	50 %	50 %	528831036
2616	NC_021906	GAG	2	6	111609	111614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831036
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2621	NC_021906	ATG	2	6	111703	111708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831036
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2623	NC_021906	CTC	2	6	111737	111742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831036
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2626	NC_021906	CGG	2	6	111821	111826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831036
2627	NC_021906	AGC	2	6	111832	111837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831036
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2744	NC_021906	GAC	2	6	117071	117076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831040
2745	NC_021906	TCG	3	9	117109	117117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831040
2746	NC_021906	CGT	2	6	117146	117151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831040
2747	NC_021906	CGC	2	6	117155	117160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831040
2748	NC_021906	TCG	2	6	117181	117186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831040
2749	NC_021906	GCT	2	6	117254	117259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831040
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2755	NC_021906	CAT	2	6	117442	117447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831041
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2777	NC_021906	CTT	2	6	118078	118083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831041
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2817	NC_021906	TGA	2	6	119907	119912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2850	NC_021906	CTTG	2	8	121590	121597	0 %	50 %	25 %	25 %	528831045
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2867	NC_021906	CGCC	2	8	122316	122323	0 %	0 %	25 %	75 %	528831045
2868	NC_021906	AGCA	2	8	122338	122345	50 %	0 %	25 %	25 %	528831045
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2872	NC_021906	GAT	2	6	122469	122474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2874	NC_021906	GTT	2	6	122510	122515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831046
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2971	NC_021906	AGTC	2	8	126824	126831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2972	NC_021906	GCCCC	2	10	126837	126846	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2973	NC_021906	CGG	2	6	126859	126864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2990	NC_021906	CGA	2	6	128081	128086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831051
2991	NC_021906	GCC	2	6	128087	128092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831051
2992	NC_021906	TCG	2	6	128158	128163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831051
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