MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 100380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021905	GC	3	6	547001	547006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_021905	CG	3	6	547007	547012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13003	NC_021905	GCT	2	6	547045	547050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_021905	GCAT	2	8	547081	547088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_021905	TGG	2	6	547101	547106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021905	TCG	2	6	547115	547120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_021905	AGG	2	6	547196	547201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021905	GGA	2	6	547271	547276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021905	TGC	2	6	547306	547311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_021905	CCG	2	6	547344	547349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_021905	TCG	2	6	547369	547374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_021905	CAG	2	6	547411	547416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13013	NC_021905	TC	3	6	547557	547562	0 %	50 %	0 %	50 %	528827371
13014	NC_021905	GTCG	2	8	547590	547597	0 %	25 %	50 %	25 %	528827371
13015	NC_021905	GCG	2	6	547673	547678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827371
13016	NC_021905	CGC	2	6	547743	547748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827371
13017	NC_021905	GCC	2	6	547799	547804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827371
13018	NC_021905	TGC	2	6	547832	547837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13019	NC_021905	GC	3	6	547840	547845	0 %	0 %	50 %	50 %	528827371
13020	NC_021905	CGC	2	6	547860	547865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827371
13021	NC_021905	GCT	2	6	547885	547890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13022	NC_021905	CGT	2	6	547914	547919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13023	NC_021905	GCC	2	6	547948	547953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827371
13024	NC_021905	GCC	2	6	548032	548037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827371
13025	NC_021905	TCGC	2	8	548074	548081	0 %	25 %	25 %	50 %	528827371
13026	NC_021905	TGC	2	6	548092	548097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13027	NC_021905	GC	3	6	548096	548101	0 %	0 %	50 %	50 %	528827371
13028	NC_021905	TGC	2	6	548156	548161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827371
13029	NC_021905	ATCT	2	8	548239	548246	25 %	50 %	0 %	25 %	528827371
13030	NC_021905	CGC	2	6	548323	548328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827372
13031	NC_021905	CGAGGC	2	12	548343	548354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528827372
13032	NC_021905	GCA	2	6	548361	548366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827372
13033	NC_021905	AGC	2	6	548372	548377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827372
13034	NC_021905	TCC	2	6	548384	548389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827372
13035	NC_021905	GA	3	6	548399	548404	50 %	0 %	50 %	0 %	528827372
13036	NC_021905	CGG	2	6	548406	548411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827372
13037	NC_021905	ACG	2	6	548486	548491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827372
13038	NC_021905	CAG	2	6	548512	548517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827372
13039	NC_021905	CGC	2	6	548518	548523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827372
13040	NC_021905	CG	4	8	548529	548536	0 %	0 %	50 %	50 %	528827372
13041	NC_021905	TCA	2	6	548555	548560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827372
13042	NC_021905	CGG	2	6	548637	548642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827372
13043	NC_021905	CCATCA	2	12	548646	548657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	528827372
13044	NC_021905	CAT	2	6	548670	548675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827372
13045	NC_021905	TTG	2	6	548708	548713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021905	GGC	3	9	548734	548742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_021905	GCA	2	6	548758	548763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827373
13048	NC_021905	CGG	2	6	548772	548777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827373
13049	NC_021905	GCG	2	6	548786	548791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827373
13050	NC_021905	CGC	2	6	548797	548802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827373
13051	NC_021905	GCG	2	6	548926	548931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827373
13052	NC_021905	AGC	2	6	548998	549003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827373
13053	NC_021905	CGG	2	6	549077	549082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827373
13054	NC_021905	CTGG	2	8	549107	549114	0 %	25 %	50 %	25 %	528827374
13055	NC_021905	GAT	2	6	549119	549124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827374
13056	NC_021905	TCGA	2	8	549195	549202	25 %	25 %	25 %	25 %	528827374
13057	NC_021905	ACG	3	9	549258	549266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827374
13058	NC_021905	GCG	2	6	549275	549280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827374
13059	NC_021905	CAT	2	6	549332	549337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827374
13060	NC_021905	CCA	2	6	549400	549405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827374
13061	NC_021905	CCGG	2	8	549420	549427	0 %	0 %	50 %	50 %	528827374
13062	NC_021905	GCC	2	6	549431	549436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827374
13063	NC_021905	TCG	2	6	549438	549443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827374
13064	NC_021905	AAG	2	6	549444	549449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827374
13065	NC_021905	CCG	2	6	549450	549455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827374
13066	NC_021905	GCC	2	6	549491	549496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827374
13067	NC_021905	GC	3	6	549510	549515	0 %	0 %	50 %	50 %	528827374
13068	NC_021905	GGA	2	6	549533	549538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827374
13069	NC_021905	CGAT	2	8	549607	549614	25 %	25 %	25 %	25 %	528827374
13070	NC_021905	CGG	2	6	549643	549648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827374
13071	NC_021905	TTG	2	6	549663	549668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827374
13072	NC_021905	CGGCG	2	10	549688	549697	0 %	0 %	60 %	40 %	528827374
13073	NC_021905	TG	3	6	549763	549768	0 %	50 %	50 %	0 %	528827374
13074	NC_021905	GCCG	2	8	549817	549824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_021905	ACCG	2	8	549832	549839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_021905	CGCGG	2	10	549840	549849	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13077	NC_021905	GTAAAG	2	12	549850	549861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021905	TGCG	2	8	549945	549952	0 %	25 %	50 %	25 %	528827375
13079	NC_021905	TCG	2	6	550000	550005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13080	NC_021905	CTG	2	6	550079	550084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13081	NC_021905	TGC	2	6	550195	550200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13082	NC_021905	GGA	2	6	550220	550225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827375
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13084	NC_021905	TCG	2	6	550270	550275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13085	NC_021905	CGT	2	6	550279	550284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
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13087	NC_021905	GC	3	6	550326	550331	0 %	0 %	50 %	50 %	528827375
13088	NC_021905	AGC	2	6	550380	550385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13089	NC_021905	CG	3	6	550422	550427	0 %	0 %	50 %	50 %	528827375
13090	NC_021905	CGA	2	6	550447	550452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13091	NC_021905	GTC	2	6	550514	550519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827375
13092	NC_021905	ATG	3	9	550524	550532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827375
13093	NC_021905	CTCC	2	8	550553	550560	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13094	NC_021905	TGC	2	6	550575	550580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_021905	CTG	2	6	550615	550620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_021905	ATCAG	2	10	550630	550639	40 %	20 %	20 %	20 %	528827376
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13099	NC_021905	TCT	2	6	550713	550718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827376
13100	NC_021905	ATG	2	6	550721	550726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827376
13101	NC_021905	GCTC	2	8	550763	550770	0 %	25 %	25 %	50 %	528827376
13102	NC_021905	TCG	2	6	550823	550828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827376
13103	NC_021905	GCC	2	6	550835	550840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827376
13104	NC_021905	TCG	2	6	550844	550849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827376
13105	NC_021905	CGC	2	6	550935	550940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827376
13106	NC_021905	TCGGCC	2	12	550967	550978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827376
13107	NC_021905	TCA	2	6	551031	551036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827376
13108	NC_021905	TCC	2	6	551042	551047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_021905	GCC	2	6	551097	551102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_021905	ATG	2	6	551150	551155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827377
13111	NC_021905	GCA	2	6	551200	551205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827377
13112	NC_021905	CCG	2	6	551295	551300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827377
13113	NC_021905	CGG	2	6	551389	551394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827377
13114	NC_021905	CGA	2	6	551464	551469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827377
13115	NC_021905	GATC	2	8	551505	551512	25 %	25 %	25 %	25 %	528827377
13116	NC_021905	GGC	2	6	551682	551687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827378
13117	NC_021905	TCGGCT	2	12	551732	551743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827378
13118	NC_021905	CCGCGC	2	12	551788	551799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827378
13119	NC_021905	TCA	2	6	551828	551833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827378
13120	NC_021905	CAA	2	6	551847	551852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528827378
13121	NC_021905	GCC	2	6	551866	551871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827378
13122	NC_021905	GGC	2	6	551876	551881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827378
13123	NC_021905	CAA	2	6	551928	551933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528827378
13124	NC_021905	CCG	2	6	551973	551978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827378
13125	NC_021905	GC	3	6	552052	552057	0 %	0 %	50 %	50 %	528827378
13126	NC_021905	GCG	2	6	552067	552072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827378
13127	NC_021905	CTG	2	6	552073	552078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827378
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13129	NC_021905	CCGG	2	8	552119	552126	0 %	0 %	50 %	50 %	528827378
13130	NC_021905	CTGAC	2	10	552155	552164	20 %	20 %	20 %	40 %	528827378
13131	NC_021905	CGC	2	6	552186	552191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827378
13132	NC_021905	CG	3	6	552245	552250	0 %	0 %	50 %	50 %	528827378
13133	NC_021905	AGG	2	6	552278	552283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827378
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13135	NC_021905	CGG	2	6	552323	552328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827378
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13139	NC_021905	CAG	2	6	552555	552560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827378
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13151	NC_021905	CGGCC	2	10	552998	553007	0 %	0 %	40 %	60 %	528827379
13152	NC_021905	CGG	2	6	553019	553024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827379
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13195	NC_021905	T	7	7	554801	554807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13196	NC_021905	GCC	3	9	554811	554819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13203	NC_021905	TTCGG	2	10	555142	555151	0 %	40 %	40 %	20 %	528827382
13204	NC_021905	GCC	2	6	555195	555200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827382
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13207	NC_021905	GTCG	2	8	555388	555395	0 %	25 %	50 %	25 %	528827382
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13214	NC_021905	TTAC	2	8	555867	555874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13215	NC_021905	GA	3	6	555924	555929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13216	NC_021905	TCA	2	6	556050	556055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827383
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13220	NC_021905	CCTT	2	8	556203	556210	0 %	50 %	0 %	50 %	528827383
13221	NC_021905	CTT	2	6	556246	556251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827383
13222	NC_021905	TTC	2	6	556268	556273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827383
13223	NC_021905	TC	3	6	556276	556281	0 %	50 %	0 %	50 %	528827383
13224	NC_021905	CATC	2	8	556384	556391	25 %	25 %	0 %	50 %	528827383
13225	NC_021905	GGC	2	6	556399	556404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827383
13226	NC_021905	CGG	2	6	556411	556416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827383
13227	NC_021905	CTG	2	6	556418	556423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827383
13228	NC_021905	GC	3	6	556434	556439	0 %	0 %	50 %	50 %	528827383
13229	NC_021905	CGG	2	6	556468	556473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827383
13230	NC_021905	GCC	3	9	556559	556567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827383
13231	NC_021905	GTC	2	6	556571	556576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827383
13232	NC_021905	CGC	2	6	556581	556586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827383
13233	NC_021905	CGT	2	6	556588	556593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827383
13234	NC_021905	ACC	2	6	556644	556649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827383
13235	NC_021905	TGA	2	6	556760	556765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_021905	CGC	2	6	556801	556806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827384
13237	NC_021905	GAA	2	6	556813	556818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827384
13238	NC_021905	GTC	2	6	556855	556860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827384
13239	NC_021905	AAC	2	6	556948	556953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13240	NC_021905	CAT	2	6	556987	556992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13241	NC_021905	GAT	2	6	557010	557015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_021905	CGC	2	6	557125	557130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13243	NC_021905	CCA	2	6	557132	557137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13244	NC_021905	TG	3	6	557254	557259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_021905	GCC	2	6	557317	557322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827385
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13247	NC_021905	ATCG	2	8	557334	557341	25 %	25 %	25 %	25 %	528827385
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13253	NC_021905	CATG	2	8	557609	557616	25 %	25 %	25 %	25 %	528827385
13254	NC_021905	GC	3	6	557650	557655	0 %	0 %	50 %	50 %	528827385
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13259	NC_021905	CGAT	2	8	557848	557855	25 %	25 %	25 %	25 %	528827386
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13271	NC_021905	A	6	6	558405	558410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13272	NC_021905	CAT	2	6	558423	558428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827387
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13361	NC_021905	CG	3	6	561966	561971	0 %	0 %	50 %	50 %	528827389
13362	NC_021905	TCG	2	6	561976	561981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827389
13363	NC_021905	GC	3	6	561987	561992	0 %	0 %	50 %	50 %	528827389
13364	NC_021905	CGT	2	6	562037	562042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827389
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13379	NC_021905	GGCAG	2	10	562561	562570	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13380	NC_021905	G	6	6	562572	562577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13381	NC_021905	ATT	2	6	562597	562602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13385	NC_021905	CTG	2	6	562667	562672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827390
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13399	NC_021905	GCC	3	9	563393	563401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827391
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13466	NC_021905	ATG	2	6	565771	565776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13467	NC_021905	T	6	6	565931	565936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13468	NC_021905	C	6	6	566012	566017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13469	NC_021905	AGGGG	2	10	566020	566029	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13470	NC_021905	GCA	2	6	566048	566053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13471	NC_021905	CT	3	6	566063	566068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13472	NC_021905	GGC	2	6	566168	566173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13473	NC_021905	AGC	2	6	566185	566190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13474	NC_021905	AGC	2	6	566258	566263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827394
13475	NC_021905	CGTC	2	8	566277	566284	0 %	25 %	25 %	50 %	528827394
13476	NC_021905	TTG	2	6	566390	566395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827394
13477	NC_021905	CTT	2	6	566422	566427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827394
13478	NC_021905	TGCCCG	2	12	566451	566462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827394
13479	NC_021905	TCG	2	6	566468	566473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827394
13480	NC_021905	GC	4	8	566534	566541	0 %	0 %	50 %	50 %	528827394
13481	NC_021905	TCG	2	6	566579	566584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827394
13482	NC_021905	GGC	2	6	566617	566622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827394
13483	NC_021905	TTC	2	6	566644	566649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827394
13484	NC_021905	CCG	2	6	566655	566660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827394
13485	NC_021905	AGG	2	6	566742	566747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827394
13486	NC_021905	CCG	2	6	566748	566753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827394
13487	NC_021905	CTG	2	6	566764	566769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827394
13488	NC_021905	GCC	2	6	566834	566839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827394
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13491	NC_021905	GC	3	6	567010	567015	0 %	0 %	50 %	50 %	528827394
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13499	NC_021905	GC	3	6	567288	567293	0 %	0 %	50 %	50 %	528827394
13500	NC_021905	CGG	2	6	567318	567323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827394

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