MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_021040	AAGAC	2	10	2150882	2150891	60 %	0 %	20 %	20 %	479203608
45002	NC_021040	TGG	2	6	2150910	2150915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203608
45003	NC_021040	TTA	2	6	2150931	2150936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203608
45004	NC_021040	G	6	6	2150941	2150946	0 %	0 %	100 %	0 %	479203608
45005	NC_021040	TA	3	6	2150981	2150986	50 %	50 %	0 %	0 %	479203608
45006	NC_021040	GCG	2	6	2151053	2151058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203608
45007	NC_021040	TGTT	2	8	2151138	2151145	0 %	75 %	25 %	0 %	479203608
45008	NC_021040	GT	3	6	2151201	2151206	0 %	50 %	50 %	0 %	479203608
45009	NC_021040	A	6	6	2151371	2151376	100 %	0 %	0 %	0 %	479203608
45010	NC_021040	TGC	2	6	2151409	2151414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203608
45011	NC_021040	CA	3	6	2151466	2151471	50 %	0 %	0 %	50 %	479203608
45012	NC_021040	GGC	2	6	2151487	2151492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203608
45013	NC_021040	CGG	2	6	2151598	2151603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203608
45014	NC_021040	GAT	2	6	2151643	2151648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203608
45015	NC_021040	GCA	2	6	2151659	2151664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203608
45016	NC_021040	TATTG	2	10	2151670	2151679	20 %	60 %	20 %	0 %	479203608
45017	NC_021040	A	6	6	2151778	2151783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45018	NC_021040	TCG	2	6	2151808	2151813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45019	NC_021040	CAA	2	6	2151822	2151827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45020	NC_021040	A	7	7	2151854	2151860	100 %	0 %	0 %	0 %	479203609
45021	NC_021040	ATT	2	6	2151967	2151972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203609
45022	NC_021040	AGC	2	6	2151975	2151980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203609
45023	NC_021040	ATG	2	6	2152151	2152156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203609
45024	NC_021040	TCCG	2	8	2152161	2152168	0 %	25 %	25 %	50 %	479203609
45025	NC_021040	GCA	2	6	2152175	2152180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203609
45026	NC_021040	A	7	7	2152193	2152199	100 %	0 %	0 %	0 %	479203609
45027	NC_021040	CAT	3	9	2152240	2152248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203609
45028	NC_021040	AGC	2	6	2152334	2152339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203609
45029	NC_021040	A	6	6	2152347	2152352	100 %	0 %	0 %	0 %	479203609
45030	NC_021040	CGG	2	6	2152369	2152374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203609
45031	NC_021040	A	6	6	2152387	2152392	100 %	0 %	0 %	0 %	479203609
45032	NC_021040	GGA	2	6	2152396	2152401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203609
45033	NC_021040	GGA	2	6	2152420	2152425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203609
45034	NC_021040	GAA	2	6	2152455	2152460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203609
45035	NC_021040	CAA	2	6	2152489	2152494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203609
45036	NC_021040	AGATC	2	10	2152540	2152549	40 %	20 %	20 %	20 %	479203609
45037	NC_021040	TAT	2	6	2152664	2152669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203609
45038	NC_021040	GCG	2	6	2152820	2152825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203609
45039	NC_021040	AT	3	6	2152915	2152920	50 %	50 %	0 %	0 %	479203609
45040	NC_021040	GCAG	2	8	2152957	2152964	25 %	0 %	50 %	25 %	479203609
45041	NC_021040	AT	3	6	2152972	2152977	50 %	50 %	0 %	0 %	479203609
45042	NC_021040	ATT	2	6	2153031	2153036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203610
45043	NC_021040	ATT	2	6	2153042	2153047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203610
45044	NC_021040	ATT	2	6	2153061	2153066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203610
45045	NC_021040	GGCAAA	2	12	2153096	2153107	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479203610
45046	NC_021040	CGA	2	6	2153146	2153151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203610
45047	NC_021040	ATG	2	6	2153217	2153222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203610
45048	NC_021040	GTCT	2	8	2153270	2153277	0 %	50 %	25 %	25 %	479203610
45049	NC_021040	GCC	2	6	2153298	2153303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203610
45050	NC_021040	TCTTT	2	10	2153335	2153344	0 %	80 %	0 %	20 %	479203610
45051	NC_021040	CTT	2	6	2153349	2153354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203610
45052	NC_021040	ATG	2	6	2153368	2153373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203610
45053	NC_021040	CAGG	2	8	2153415	2153422	25 %	0 %	50 %	25 %	479203610
45054	NC_021040	ATG	2	6	2153578	2153583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203610
45055	NC_021040	CGG	2	6	2153615	2153620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203610
45056	NC_021040	TCT	2	6	2153651	2153656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203610
45057	NC_021040	ACG	2	6	2153691	2153696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203610
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45059	NC_021040	TTA	2	6	2153810	2153815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203610
45060	NC_021040	CTG	2	6	2153880	2153885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203610
45061	NC_021040	GAC	2	6	2153908	2153913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203610
45062	NC_021040	TGG	2	6	2154013	2154018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203610
45063	NC_021040	AAAACA	2	12	2154073	2154084	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45064	NC_021040	GCA	2	6	2154199	2154204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45066	NC_021040	GCA	2	6	2154328	2154333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45067	NC_021040	AG	3	6	2154385	2154390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45068	NC_021040	ATG	2	6	2154598	2154603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45069	NC_021040	TG	4	8	2154602	2154609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45070	NC_021040	A	6	6	2154632	2154637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45071	NC_021040	ATC	2	6	2154679	2154684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45072	NC_021040	AAATC	2	10	2154782	2154791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45073	NC_021040	GAA	2	6	2154863	2154868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45074	NC_021040	GATC	2	8	2154873	2154880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45075	NC_021040	TG	3	6	2154955	2154960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45076	NC_021040	ATC	2	6	2155027	2155032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45077	NC_021040	AG	3	6	2155077	2155082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45078	NC_021040	CTG	2	6	2155096	2155101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45079	NC_021040	TG	3	6	2155140	2155145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45080	NC_021040	CAA	2	6	2155152	2155157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45083	NC_021040	A	6	6	2155238	2155243	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45084	NC_021040	GAAT	2	8	2155275	2155282	50 %	25 %	25 %	0 %	479203611
45085	NC_021040	A	7	7	2155356	2155362	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45086	NC_021040	A	6	6	2155489	2155494	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45087	NC_021040	CTG	2	6	2155517	2155522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
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45089	NC_021040	TG	3	6	2155635	2155640	0 %	50 %	50 %	0 %	479203611
45090	NC_021040	AG	3	6	2155690	2155695	50 %	0 %	50 %	0 %	479203611
45091	NC_021040	GAG	2	6	2155769	2155774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203611
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45093	NC_021040	CTG	2	6	2155878	2155883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
45094	NC_021040	AAT	2	6	2155889	2155894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203611
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45096	NC_021040	A	6	6	2155949	2155954	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
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45099	NC_021040	GA	4	8	2156107	2156114	50 %	0 %	50 %	0 %	479203611
45100	NC_021040	A	6	6	2156124	2156129	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45101	NC_021040	GTCA	2	8	2156143	2156150	25 %	25 %	25 %	25 %	479203611
45102	NC_021040	A	6	6	2156225	2156230	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45103	NC_021040	TCG	2	6	2156301	2156306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
45104	NC_021040	A	7	7	2156312	2156318	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45105	NC_021040	ATGG	2	8	2156399	2156406	25 %	25 %	50 %	0 %	479203611
45106	NC_021040	GAT	2	6	2156525	2156530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203611
45107	NC_021040	TGG	2	6	2156565	2156570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203611
45108	NC_021040	ATC	2	6	2156585	2156590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203611
45109	NC_021040	A	6	6	2156599	2156604	100 %	0 %	0 %	0 %	479203611
45110	NC_021040	GAT	2	6	2156615	2156620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203611
45111	NC_021040	GAC	2	6	2156644	2156649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203611
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45113	NC_021040	CA	3	6	2156874	2156879	50 %	0 %	0 %	50 %	479203611
45114	NC_021040	ATC	2	6	2156903	2156908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203611
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45116	NC_021040	TGC	2	6	2156979	2156984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
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45118	NC_021040	GAT	2	6	2157062	2157067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203611
45119	NC_021040	CGG	2	6	2157078	2157083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203611
45120	NC_021040	CAT	2	6	2157175	2157180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203611
45121	NC_021040	CTA	2	6	2157271	2157276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203611
45122	NC_021040	TGC	2	6	2157330	2157335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
45123	NC_021040	GTGG	2	8	2157377	2157384	0 %	25 %	75 %	0 %	479203611
45124	NC_021040	GGA	3	9	2157391	2157399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203611
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45129	NC_021040	GGA	2	6	2157595	2157600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203611
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45131	NC_021040	ATC	2	6	2157617	2157622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203611
45132	NC_021040	GAC	2	6	2157676	2157681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203611
45133	NC_021040	GGA	2	6	2157727	2157732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203611
45134	NC_021040	GTC	2	6	2157734	2157739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203611
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45142	NC_021040	CAT	2	6	2157959	2157964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203612
45143	NC_021040	GGAT	2	8	2157995	2158002	25 %	25 %	50 %	0 %	479203612
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45147	NC_021040	GAG	2	6	2158416	2158421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203612
45148	NC_021040	GAG	2	6	2158533	2158538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203612
45149	NC_021040	GAC	2	6	2158580	2158585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203612
45150	NC_021040	CAC	2	6	2158595	2158600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203612
45151	NC_021040	TCGA	2	8	2158617	2158624	25 %	25 %	25 %	25 %	479203612
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45155	NC_021040	CGG	2	6	2158790	2158795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203612
45156	NC_021040	GAT	2	6	2158995	2159000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203612
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45163	NC_021040	TAT	2	6	2159244	2159249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203612
45164	NC_021040	AG	3	6	2159307	2159312	50 %	0 %	50 %	0 %	479203612
45165	NC_021040	CTTA	2	8	2159316	2159323	25 %	50 %	0 %	25 %	479203612
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45168	NC_021040	CGAT	2	8	2159437	2159444	25 %	25 %	25 %	25 %	479203612
45169	NC_021040	TGC	2	6	2159531	2159536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203612
45170	NC_021040	CAGA	2	8	2159591	2159598	50 %	0 %	25 %	25 %	479203612
45171	NC_021040	A	6	6	2159700	2159705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45172	NC_021040	T	7	7	2159733	2159739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45173	NC_021040	AGA	2	6	2159783	2159788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203613
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45178	NC_021040	AAAT	2	8	2160228	2160235	75 %	25 %	0 %	0 %	479203613
45179	NC_021040	CGA	2	6	2160244	2160249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203613
45180	NC_021040	ACGGT	2	10	2160260	2160269	20 %	20 %	40 %	20 %	479203613
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45195	NC_021040	TAT	2	6	2160874	2160879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45196	NC_021040	TAG	2	6	2160962	2160967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45197	NC_021040	GACA	2	8	2161039	2161046	50 %	0 %	25 %	25 %	479203614
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45199	NC_021040	TGC	2	6	2161080	2161085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203614
45200	NC_021040	A	6	6	2161117	2161122	100 %	0 %	0 %	0 %	479203614
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45202	NC_021040	CAGC	2	8	2161359	2161366	25 %	0 %	25 %	50 %	479203614
45203	NC_021040	GA	3	6	2161374	2161379	50 %	0 %	50 %	0 %	479203614
45204	NC_021040	TTC	2	6	2161485	2161490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203614
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45206	NC_021040	ATCA	2	8	2161567	2161574	50 %	25 %	0 %	25 %	479203614
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45208	NC_021040	A	7	7	2161719	2161725	100 %	0 %	0 %	0 %	479203614
45209	NC_021040	A	6	6	2161741	2161746	100 %	0 %	0 %	0 %	479203614
45210	NC_021040	GGC	2	6	2161752	2161757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203614
45211	NC_021040	AGC	2	6	2161765	2161770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203614
45212	NC_021040	CTG	2	6	2161775	2161780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203614
45213	NC_021040	ATA	2	6	2161820	2161825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203614
45214	NC_021040	TAT	2	6	2161845	2161850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203614
45215	NC_021040	TTTA	2	8	2161951	2161958	25 %	75 %	0 %	0 %	479203614
45216	NC_021040	ATG	2	6	2162051	2162056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203614
45217	NC_021040	CAG	2	6	2162057	2162062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203614
45218	NC_021040	ATT	2	6	2162120	2162125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203614
45219	NC_021040	GAAA	2	8	2162131	2162138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45220	NC_021040	TG	3	6	2162139	2162144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45221	NC_021040	GAA	2	6	2162163	2162168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45222	NC_021040	A	6	6	2162192	2162197	100 %	0 %	0 %	0 %	479203615
45223	NC_021040	TA	3	6	2162206	2162211	50 %	50 %	0 %	0 %	479203615
45224	NC_021040	ATT	2	6	2162231	2162236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203615
45225	NC_021040	CATGG	2	10	2162243	2162252	20 %	20 %	40 %	20 %	479203615
45226	NC_021040	GAAT	2	8	2162270	2162277	50 %	25 %	25 %	0 %	479203615
45227	NC_021040	AG	3	6	2162286	2162291	50 %	0 %	50 %	0 %	479203615
45228	NC_021040	GGT	2	6	2162439	2162444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203615
45229	NC_021040	ATTT	2	8	2162497	2162504	25 %	75 %	0 %	0 %	479203615
45230	NC_021040	GATTTT	2	12	2162505	2162516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479203615
45231	NC_021040	TAA	2	6	2162600	2162605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203615
45232	NC_021040	GGC	2	6	2162651	2162656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203615
45233	NC_021040	TGC	2	6	2162743	2162748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203615
45234	NC_021040	GAT	2	6	2162805	2162810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203615
45235	NC_021040	AG	3	6	2162855	2162860	50 %	0 %	50 %	0 %	479203615
45236	NC_021040	AGG	2	6	2162875	2162880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203615
45237	NC_021040	CTGC	2	8	2162888	2162895	0 %	25 %	25 %	50 %	479203615
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45347	NC_021040	T	6	6	2168043	2168048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45348	NC_021040	GC	4	8	2168077	2168084	0 %	0 %	50 %	50 %	479203619
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45352	NC_021040	GTTT	2	8	2168195	2168202	0 %	75 %	25 %	0 %	479203619
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