MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_021040	CAA	2	6	2081939	2081944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43502	NC_021040	GAA	2	6	2082058	2082063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43503	NC_021040	TGG	2	6	2082155	2082160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_021040	GTAT	2	8	2082168	2082175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_021040	AGGA	2	8	2082200	2082207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43506	NC_021040	GCT	2	6	2082237	2082242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43507	NC_021040	TTG	2	6	2082301	2082306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43508	NC_021040	GCT	2	6	2082329	2082334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43509	NC_021040	A	6	6	2082425	2082430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_021040	TGGA	2	8	2082449	2082456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43511	NC_021040	ATG	2	6	2082491	2082496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43512	NC_021040	T	6	6	2082523	2082528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_021040	TAT	2	6	2082544	2082549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43514	NC_021040	GGA	2	6	2082570	2082575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_021040	GAA	2	6	2082622	2082627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43516	NC_021040	AG	3	6	2082698	2082703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43517	NC_021040	TAAG	2	8	2082760	2082767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43518	NC_021040	A	6	6	2082782	2082787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43519	NC_021040	CGT	2	6	2082788	2082793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43520	NC_021040	GGCA	2	8	2082882	2082889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43521	NC_021040	A	6	6	2082922	2082927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43522	NC_021040	GAG	2	6	2082955	2082960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43523	NC_021040	CTG	2	6	2083006	2083011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43524	NC_021040	A	6	6	2083089	2083094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43525	NC_021040	TTC	2	6	2083190	2083195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43526	NC_021040	AGAA	2	8	2083203	2083210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43527	NC_021040	GA	4	8	2083248	2083255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43528	NC_021040	TAT	2	6	2083261	2083266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43529	NC_021040	CAGC	2	8	2083275	2083282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43530	NC_021040	ATG	2	6	2083301	2083306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43531	NC_021040	TG	3	6	2083305	2083310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43532	NC_021040	AGG	2	6	2083464	2083469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_021040	CTTT	2	8	2083534	2083541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43534	NC_021040	T	6	6	2083539	2083544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43535	NC_021040	GAA	2	6	2083627	2083632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43536	NC_021040	T	6	6	2083717	2083722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43537	NC_021040	TGGA	2	8	2083781	2083788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43538	NC_021040	AT	3	6	2083995	2084000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_021040	CAGC	2	8	2084070	2084077	25 %	0 %	25 %	50 %	479203544
43540	NC_021040	GCG	2	6	2084083	2084088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203544
43541	NC_021040	TAT	2	6	2084095	2084100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203544
43542	NC_021040	TAT	2	6	2084146	2084151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203544
43543	NC_021040	ATA	2	6	2084159	2084164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203544
43544	NC_021040	TG	3	6	2084201	2084206	0 %	50 %	50 %	0 %	479203544
43545	NC_021040	CAG	2	6	2084439	2084444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203544
43546	NC_021040	TTTG	2	8	2084547	2084554	0 %	75 %	25 %	0 %	479203544
43547	NC_021040	A	6	6	2084588	2084593	100 %	0 %	0 %	0 %	479203544
43548	NC_021040	ATG	2	6	2084645	2084650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203544
43549	NC_021040	GA	3	6	2084670	2084675	50 %	0 %	50 %	0 %	479203544
43550	NC_021040	GGA	2	6	2084694	2084699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203544
43551	NC_021040	A	6	6	2084703	2084708	100 %	0 %	0 %	0 %	479203544
43552	NC_021040	AGC	2	6	2084725	2084730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203544
43553	NC_021040	TGA	2	6	2084772	2084777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203544
43554	NC_021040	TG	3	6	2084799	2084804	0 %	50 %	50 %	0 %	479203544
43555	NC_021040	A	6	6	2084827	2084832	100 %	0 %	0 %	0 %	479203544
43556	NC_021040	AGGA	2	8	2084839	2084846	50 %	0 %	50 %	0 %	479203544
43557	NC_021040	T	6	6	2084866	2084871	0 %	100 %	0 %	0 %	479203545
43558	NC_021040	A	6	6	2084881	2084886	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43559	NC_021040	GAA	2	6	2084896	2084901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203545
43560	NC_021040	A	6	6	2084900	2084905	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43561	NC_021040	GAT	2	6	2084908	2084913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203545
43562	NC_021040	TGT	2	6	2084973	2084978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203545
43563	NC_021040	GAT	2	6	2084994	2084999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203545
43564	NC_021040	GAG	2	6	2085019	2085024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203545
43565	NC_021040	ATG	2	6	2085062	2085067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203545
43566	NC_021040	AGA	2	6	2085078	2085083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203545
43567	NC_021040	GAAAA	2	10	2085097	2085106	80 %	0 %	20 %	0 %	479203545
43568	NC_021040	A	7	7	2085103	2085109	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43569	NC_021040	A	8	8	2085173	2085180	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43570	NC_021040	CAG	2	6	2085208	2085213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203545
43571	NC_021040	GAA	2	6	2085214	2085219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203545
43572	NC_021040	A	6	6	2085218	2085223	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43573	NC_021040	A	6	6	2085279	2085284	100 %	0 %	0 %	0 %	479203545
43574	NC_021040	CAG	2	6	2085349	2085354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203545
43575	NC_021040	TAT	2	6	2085371	2085376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203545
43576	NC_021040	CAT	2	6	2085378	2085383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203545
43577	NC_021040	GCA	2	6	2085397	2085402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203545
43578	NC_021040	ATGG	2	8	2085459	2085466	25 %	25 %	50 %	0 %	479203545
43579	NC_021040	GT	3	6	2085493	2085498	0 %	50 %	50 %	0 %	479203545
43580	NC_021040	TGC	2	6	2085515	2085520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203545
43581	NC_021040	TAA	2	6	2085579	2085584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203545
43582	NC_021040	AAG	2	6	2085648	2085653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203545
43583	NC_021040	TAT	2	6	2085682	2085687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203545
43584	NC_021040	CGTGAA	2	12	2085700	2085711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479203545
43585	NC_021040	ATG	2	6	2085788	2085793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203545
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43587	NC_021040	TGAT	2	8	2085824	2085831	25 %	50 %	25 %	0 %	479203545
43588	NC_021040	CAGA	2	8	2085873	2085880	50 %	0 %	25 %	25 %	479203545
43589	NC_021040	GAA	2	6	2085910	2085915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203545
43590	NC_021040	GGA	2	6	2085930	2085935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203545
43591	NC_021040	TTC	2	6	2085948	2085953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203545
43592	NC_021040	ATC	2	6	2085988	2085993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203545
43593	NC_021040	TTTGA	2	10	2086063	2086072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43594	NC_021040	ATG	2	6	2086085	2086090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43595	NC_021040	AT	3	6	2086095	2086100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43596	NC_021040	TATTT	2	10	2086142	2086151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43597	NC_021040	TGT	2	6	2086172	2086177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43598	NC_021040	ACA	2	6	2086183	2086188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43599	NC_021040	TTC	2	6	2086272	2086277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203546
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43601	NC_021040	ATCGC	2	10	2086444	2086453	20 %	20 %	20 %	40 %	479203546
43602	NC_021040	CCG	2	6	2086489	2086494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203546
43603	NC_021040	CTGC	2	8	2086496	2086503	0 %	25 %	25 %	50 %	479203546
43604	NC_021040	CGG	2	6	2086547	2086552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203546
43605	NC_021040	TTC	2	6	2086560	2086565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203546
43606	NC_021040	GGC	2	6	2086599	2086604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203546
43607	NC_021040	TCC	2	6	2086627	2086632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203546
43608	NC_021040	TAT	2	6	2086664	2086669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203546
43609	NC_021040	GCC	2	6	2086711	2086716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203546
43610	NC_021040	TCC	2	6	2086728	2086733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203546
43611	NC_021040	ACTG	2	8	2086736	2086743	25 %	25 %	25 %	25 %	479203546
43612	NC_021040	ATG	2	6	2086744	2086749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203546
43613	NC_021040	CCT	2	6	2086830	2086835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203547
43614	NC_021040	CCATGG	2	12	2086838	2086849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479203547
43615	NC_021040	GCAGT	2	10	2086927	2086936	20 %	20 %	40 %	20 %	479203547
43616	NC_021040	CTT	2	6	2086975	2086980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203547
43617	NC_021040	GGA	2	6	2087050	2087055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203547
43618	NC_021040	CTGA	2	8	2087072	2087079	25 %	25 %	25 %	25 %	479203547
43619	NC_021040	TCA	2	6	2087080	2087085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203547
43620	NC_021040	TGC	2	6	2087186	2087191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203548
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43622	NC_021040	ATG	2	6	2087424	2087429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43983	NC_021040	ATTTTC	2	12	2105165	2105176	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43984	NC_021040	GAA	2	6	2105212	2105217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43985	NC_021040	GC	3	6	2105221	2105226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43986	NC_021040	AG	3	6	2105250	2105255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43987	NC_021040	GTA	2	6	2105280	2105285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43988	NC_021040	ATA	2	6	2105300	2105305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43989	NC_021040	A	6	6	2105317	2105322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43990	NC_021040	A	7	7	2105328	2105334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43991	NC_021040	A	6	6	2105336	2105341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43992	NC_021040	T	8	8	2105350	2105357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43993	NC_021040	TAA	2	6	2105369	2105374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43998	NC_021040	CAG	2	6	2105593	2105598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203561
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