MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_021040	CAG	2	6	2057943	2057948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43002	NC_021040	CAG	2	6	2057964	2057969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_021040	TGA	2	6	2057995	2058000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_021040	CTG	2	6	2058022	2058027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43005	NC_021040	GAG	2	6	2058032	2058037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_021040	GTC	2	6	2058045	2058050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43007	NC_021040	TGA	2	6	2058139	2058144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_021040	TTA	2	6	2058176	2058181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43009	NC_021040	GCA	3	9	2058194	2058202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43010	NC_021040	GAT	2	6	2058203	2058208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_021040	TGT	2	6	2058337	2058342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_021040	N	308	308	2058372	2058679	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_021040	GAT	2	6	2058699	2058704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203526
43014	NC_021040	ATATG	2	10	2058740	2058749	40 %	40 %	20 %	0 %	479203526
43015	NC_021040	TGA	2	6	2058755	2058760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203526
43016	NC_021040	GAA	2	6	2058764	2058769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203526
43017	NC_021040	GGAA	2	8	2058782	2058789	50 %	0 %	50 %	0 %	479203526
43018	NC_021040	GCA	2	6	2058837	2058842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203526
43019	NC_021040	CGG	2	6	2058869	2058874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203526
43020	NC_021040	GGT	2	6	2058912	2058917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203526
43021	NC_021040	GCA	2	6	2058930	2058935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203526
43022	NC_021040	ATG	3	9	2058991	2058999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203526
43023	NC_021040	GA	4	8	2059004	2059011	50 %	0 %	50 %	0 %	479203526
43024	NC_021040	GAT	2	6	2059023	2059028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203526
43025	NC_021040	AAC	2	6	2059038	2059043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203526
43026	NC_021040	TCTT	2	8	2059154	2059161	0 %	75 %	0 %	25 %	479203526
43027	NC_021040	GAA	2	6	2059182	2059187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203526
43028	NC_021040	GAA	2	6	2059202	2059207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203526
43029	NC_021040	GAAG	2	8	2059215	2059222	50 %	0 %	50 %	0 %	479203526
43030	NC_021040	AGA	2	6	2059232	2059237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203526
43031	NC_021040	AAG	2	6	2059294	2059299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203526
43032	NC_021040	ATGA	2	8	2059300	2059307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43033	NC_021040	TGT	2	6	2059347	2059352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43034	NC_021040	ATGA	2	8	2059354	2059361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43035	NC_021040	AAGG	2	8	2059387	2059394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43036	NC_021040	ATA	2	6	2059492	2059497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43037	NC_021040	AGG	2	6	2059509	2059514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43038	NC_021040	A	7	7	2059528	2059534	100 %	0 %	0 %	0 %	479203527
43039	NC_021040	GTA	2	6	2059546	2059551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203527
43040	NC_021040	AT	3	6	2059569	2059574	50 %	50 %	0 %	0 %	479203527
43041	NC_021040	GTA	2	6	2059594	2059599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203527
43042	NC_021040	ACA	2	6	2059640	2059645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203527
43043	NC_021040	A	6	6	2059752	2059757	100 %	0 %	0 %	0 %	479203527
43044	NC_021040	TAT	2	6	2059766	2059771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203527
43045	NC_021040	TTAAA	2	10	2059841	2059850	60 %	40 %	0 %	0 %	479203527
43046	NC_021040	TGT	2	6	2059916	2059921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203527
43047	NC_021040	GTT	2	6	2059929	2059934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203527
43048	NC_021040	GGA	2	6	2059942	2059947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203527
43049	NC_021040	GATTG	2	10	2059971	2059980	20 %	40 %	40 %	0 %	479203527
43050	NC_021040	TGA	2	6	2060039	2060044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203527
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43052	NC_021040	GGCA	2	8	2060085	2060092	25 %	0 %	50 %	25 %	479203527
43053	NC_021040	CT	3	6	2060109	2060114	0 %	50 %	0 %	50 %	479203527
43054	NC_021040	GCA	2	6	2060122	2060127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203527
43055	NC_021040	CTT	2	6	2060144	2060149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203527
43056	NC_021040	GGT	2	6	2060224	2060229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203527
43057	NC_021040	TAAA	2	8	2060312	2060319	75 %	25 %	0 %	0 %	479203527
43058	NC_021040	TATGG	2	10	2060338	2060347	20 %	40 %	40 %	0 %	479203527
43059	NC_021040	GTT	2	6	2060362	2060367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203527
43060	NC_021040	GTA	2	6	2060398	2060403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203527
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43063	NC_021040	AAG	2	6	2060489	2060494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203528
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43068	NC_021040	A	6	6	2060778	2060783	100 %	0 %	0 %	0 %	479203528
43069	NC_021040	TGA	2	6	2060803	2060808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203528
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43071	NC_021040	AGC	2	6	2060978	2060983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203528
43072	NC_021040	GC	3	6	2060982	2060987	0 %	0 %	50 %	50 %	479203528
43073	NC_021040	TGA	2	6	2061037	2061042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203528
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43078	NC_021040	TGA	2	6	2061208	2061213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203528
43079	NC_021040	TAT	2	6	2061349	2061354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43083	NC_021040	CCG	2	6	2061401	2061406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43084	NC_021040	A	6	6	2061435	2061440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43085	NC_021040	TTATAA	2	12	2061445	2061456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43086	NC_021040	AGGAA	2	10	2061487	2061496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43087	NC_021040	CAGA	2	8	2061558	2061565	50 %	0 %	25 %	25 %	479203529
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43089	NC_021040	GAAA	2	8	2061720	2061727	75 %	0 %	25 %	0 %	479203529
43090	NC_021040	GCG	2	6	2061754	2061759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203529
43091	NC_021040	GTGGAT	2	12	2061799	2061810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479203529
43092	NC_021040	AGC	2	6	2061834	2061839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203529
43093	NC_021040	CAG	2	6	2061975	2061980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203529
43094	NC_021040	TACGG	2	10	2062000	2062009	20 %	20 %	40 %	20 %	479203529
43095	NC_021040	CTGT	2	8	2062025	2062032	0 %	50 %	25 %	25 %	479203529
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43099	NC_021040	GCA	3	9	2062210	2062218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203529
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43101	NC_021040	TGA	2	6	2062238	2062243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203529
43102	NC_021040	CAGG	2	8	2062288	2062295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43103	NC_021040	CTGAA	2	10	2062302	2062311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43104	NC_021040	GTG	2	6	2062328	2062333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43105	NC_021040	AAGAT	2	10	2062586	2062595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43106	NC_021040	TG	3	6	2062715	2062720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43107	NC_021040	ATC	2	6	2062864	2062869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43109	NC_021040	GGA	2	6	2062931	2062936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43110	NC_021040	GCA	2	6	2062989	2062994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203530
43111	NC_021040	A	7	7	2063013	2063019	100 %	0 %	0 %	0 %	479203530
43112	NC_021040	ATG	2	6	2063064	2063069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203530
43113	NC_021040	CAT	2	6	2063099	2063104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203530
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43115	NC_021040	A	8	8	2063161	2063168	100 %	0 %	0 %	0 %	479203530
43116	NC_021040	AAAACA	2	12	2063175	2063186	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43117	NC_021040	CAGT	2	8	2063200	2063207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43118	NC_021040	TGC	2	6	2063242	2063247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43120	NC_021040	TGC	2	6	2063278	2063283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43121	NC_021040	A	6	6	2063287	2063292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43122	NC_021040	A	6	6	2063339	2063344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43123	NC_021040	AAAT	2	8	2063372	2063379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43124	NC_021040	GAA	2	6	2063380	2063385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43227	NC_021040	A	8	8	2069150	2069157	100 %	0 %	0 %	0 %	479203535
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43239	NC_021040	TGG	2	6	2069871	2069876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203536
43240	NC_021040	TGCG	2	8	2069978	2069985	0 %	25 %	50 %	25 %	479203536
43241	NC_021040	GCA	2	6	2069993	2069998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203536
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43243	NC_021040	AGA	2	6	2070099	2070104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203536
43244	NC_021040	GA	3	6	2070112	2070117	50 %	0 %	50 %	0 %	479203536
43245	NC_021040	CAT	2	6	2070126	2070131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203536
43246	NC_021040	AAG	2	6	2070291	2070296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203536
43247	NC_021040	A	6	6	2070369	2070374	100 %	0 %	0 %	0 %	479203536
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43250	NC_021040	AGCAT	2	10	2070493	2070502	40 %	20 %	20 %	20 %	479203536
43251	NC_021040	T	7	7	2070556	2070562	0 %	100 %	0 %	0 %	479203536
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43258	NC_021040	AG	3	6	2070794	2070799	50 %	0 %	50 %	0 %	479203537
43259	NC_021040	TGT	2	6	2070813	2070818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203537
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43265	NC_021040	AT	3	6	2071020	2071025	50 %	50 %	0 %	0 %	479203537
43266	NC_021040	GGAT	2	8	2071031	2071038	25 %	25 %	50 %	0 %	479203537
43267	NC_021040	AAT	2	6	2071039	2071044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203537
43268	NC_021040	TATT	2	8	2071062	2071069	25 %	75 %	0 %	0 %	479203537
43269	NC_021040	TTA	2	6	2071071	2071076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203537
43270	NC_021040	CAT	2	6	2071135	2071140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203537
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43273	NC_021040	CA	3	6	2071330	2071335	50 %	0 %	0 %	50 %	479203537
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43277	NC_021040	GA	3	6	2071545	2071550	50 %	0 %	50 %	0 %	479203537
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43285	NC_021040	AAGAT	2	10	2071985	2071994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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43348	NC_021040	A	7	7	2075668	2075674	100 %	0 %	0 %	0 %	479203540
43349	NC_021040	A	6	6	2075706	2075711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43350	NC_021040	AG	3	6	2075719	2075724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43351	NC_021040	AATA	2	8	2075744	2075751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43352	NC_021040	AT	3	6	2075765	2075770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43353	NC_021040	TAT	2	6	2075798	2075803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43354	NC_021040	GAAA	2	8	2075825	2075832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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43477	NC_021040	A	6	6	2081043	2081048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43478	NC_021040	GAT	2	6	2081128	2081133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43479	NC_021040	AT	3	6	2081146	2081151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43480	NC_021040	GAT	2	6	2081226	2081231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43481	NC_021040	GCA	2	6	2081248	2081253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43482	NC_021040	ATGC	2	8	2081273	2081280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43483	NC_021040	TA	3	6	2081348	2081353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43484	NC_021040	GGA	2	6	2081376	2081381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43485	NC_021040	GTT	2	6	2081414	2081419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43486	NC_021040	TG	3	6	2081449	2081454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43487	NC_021040	GCA	2	6	2081508	2081513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43488	NC_021040	GAT	2	6	2081533	2081538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43489	NC_021040	GT	3	6	2081552	2081557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43490	NC_021040	GTGA	2	8	2081581	2081588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43491	NC_021040	ATCAT	2	10	2081617	2081626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43492	NC_021040	AAAG	2	8	2081636	2081643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43493	NC_021040	GC	3	6	2081695	2081700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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43495	NC_021040	AGA	2	6	2081760	2081765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43496	NC_021040	CAG	2	6	2081828	2081833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43498	NC_021040	CTT	2	6	2081854	2081859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43499	NC_021040	ATG	2	6	2081897	2081902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43500	NC_021040	TATC	2	8	2081910	2081917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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