MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021040	ATC	2	6	163728	163733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201959
3502	NC_021040	A	6	6	163791	163796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021040	GAG	2	6	163994	163999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201960
3504	NC_021040	CCG	2	6	164094	164099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201960
3505	NC_021040	ATTG	2	8	164182	164189	25 %	50 %	25 %	0 %	479201960
3506	NC_021040	AGG	2	6	164253	164258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201960
3507	NC_021040	GCA	2	6	164282	164287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201960
3508	NC_021040	A	7	7	164327	164333	100 %	0 %	0 %	0 %	479201960
3509	NC_021040	ATCG	2	8	164347	164354	25 %	25 %	25 %	25 %	479201960
3510	NC_021040	GAA	2	6	164393	164398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201960
3511	NC_021040	AAG	2	6	164430	164435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201960
3512	NC_021040	GTT	2	6	164450	164455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201960
3513	NC_021040	CAG	2	6	164577	164582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201960
3514	NC_021040	AGA	2	6	164596	164601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201960
3515	NC_021040	GCA	2	6	164650	164655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201960
3516	NC_021040	TTG	2	6	164796	164801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201960
3517	NC_021040	ATAA	2	8	164814	164821	75 %	25 %	0 %	0 %	479201960
3518	NC_021040	A	6	6	164845	164850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021040	A	6	6	164867	164872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021040	TAA	2	6	164890	164895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201961
3521	NC_021040	AAG	2	6	164958	164963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201961
3522	NC_021040	TCA	3	9	164973	164981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201961
3523	NC_021040	GGC	2	6	165038	165043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201961
3524	NC_021040	A	6	6	165090	165095	100 %	0 %	0 %	0 %	479201961
3525	NC_021040	CAT	2	6	165106	165111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201961
3526	NC_021040	CAA	2	6	165142	165147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201961
3527	NC_021040	GAT	2	6	165164	165169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201961
3528	NC_021040	TGA	2	6	165174	165179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201961
3529	NC_021040	AGC	2	6	165270	165275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201961
3530	NC_021040	ATC	2	6	165287	165292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201961
3531	NC_021040	ATC	2	6	165298	165303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201961
3532	NC_021040	GGCG	2	8	165355	165362	0 %	0 %	75 %	25 %	479201961
3533	NC_021040	TTC	2	6	165397	165402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201961
3534	NC_021040	GACA	2	8	165466	165473	50 %	0 %	25 %	25 %	479201961
3535	NC_021040	GAT	2	6	165527	165532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201961
3536	NC_021040	CGG	2	6	165604	165609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201961
3537	NC_021040	GGAAA	2	10	165697	165706	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021040	AGT	2	6	165722	165727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021040	AAG	2	6	165793	165798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021040	ATT	2	6	165923	165928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021040	AGA	2	6	165992	165997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021040	AACA	2	8	166208	166215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_021040	GCA	2	6	166234	166239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021040	TTCAC	2	10	166314	166323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3545	NC_021040	TCC	2	6	166335	166340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_021040	TTCCA	2	10	166361	166370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3547	NC_021040	CTG	2	6	166522	166527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021040	TCCG	2	8	166582	166589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_021040	GAA	2	6	166590	166595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021040	ATATG	2	10	166685	166694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021040	GCC	2	6	166737	166742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_021040	GAA	2	6	166824	166829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021040	GATG	2	8	166862	166869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021040	N	466	466	166885	167350	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021040	CGG	2	6	167367	167372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_021040	CTG	2	6	167389	167394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021040	A	6	6	167395	167400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021040	AAT	2	6	167408	167413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021040	GGA	2	6	167416	167421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021040	ATTTT	2	10	167447	167456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021040	AAC	2	6	167487	167492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201962
3562	NC_021040	GAA	2	6	167551	167556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201962
3563	NC_021040	A	7	7	167583	167589	100 %	0 %	0 %	0 %	479201962
3564	NC_021040	TC	3	6	167697	167702	0 %	50 %	0 %	50 %	479201962
3565	NC_021040	GAA	2	6	167707	167712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201962
3566	NC_021040	AATT	2	8	167742	167749	50 %	50 %	0 %	0 %	479201962
3567	NC_021040	AGT	2	6	167769	167774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201962
3568	NC_021040	AG	3	6	167910	167915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021040	ATAA	2	8	167936	167943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021040	GCA	2	6	167973	167978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201963
3571	NC_021040	T	8	8	167979	167986	0 %	100 %	0 %	0 %	479201963
3572	NC_021040	GAA	3	9	167987	167995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201963
3573	NC_021040	A	6	6	167994	167999	100 %	0 %	0 %	0 %	479201963
3574	NC_021040	AGA	2	6	168017	168022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201963
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3576	NC_021040	A	7	7	168047	168053	100 %	0 %	0 %	0 %	479201963
3577	NC_021040	GCC	2	6	168077	168082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201963
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3579	NC_021040	A	7	7	168136	168142	100 %	0 %	0 %	0 %	479201963
3580	NC_021040	ATT	2	6	168169	168174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201963
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3582	NC_021040	GT	3	6	168378	168383	0 %	50 %	50 %	0 %	479201963
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3586	NC_021040	TTATT	2	10	168475	168484	20 %	80 %	0 %	0 %	479201963
3587	NC_021040	TGT	2	6	168486	168491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201963
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3593	NC_021040	GC	3	6	168917	168922	0 %	0 %	50 %	50 %	479201963
3594	NC_021040	GTGC	2	8	168957	168964	0 %	25 %	50 %	25 %	479201963
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3597	NC_021040	GAT	2	6	169056	169061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201963
3598	NC_021040	TGA	2	6	169204	169209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201963
3599	NC_021040	ATC	2	6	169236	169241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201963
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3601	NC_021040	TGA	2	6	169360	169365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201963
3602	NC_021040	GCG	2	6	169381	169386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201963
3603	NC_021040	GTCG	2	8	169400	169407	0 %	25 %	50 %	25 %	479201963
3604	NC_021040	AAG	2	6	169501	169506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201963
3605	NC_021040	AT	3	6	169619	169624	50 %	50 %	0 %	0 %	479201963
3606	NC_021040	AGC	2	6	169675	169680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201963
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3608	NC_021040	ATT	2	6	169734	169739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021040	AAATA	2	10	169757	169766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021040	AAAATC	2	12	169792	169803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3611	NC_021040	GAT	2	6	169846	169851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021040	GGA	2	6	169926	169931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021040	GAC	3	9	169932	169940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_021040	GCA	3	9	169954	169962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021040	GAA	2	6	169996	170001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021040	GCA	2	6	170017	170022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_021040	A	6	6	170085	170090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021040	CTGC	2	8	170114	170121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_021040	TTTG	2	8	170130	170137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021040	GCG	2	6	170272	170277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021040	N	501	501	170292	170792	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021040	AAAGC	2	10	170809	170818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3623	NC_021040	GCA	2	6	170827	170832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021040	GC	3	6	170873	170878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_021040	G	6	6	170879	170884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021040	TCC	2	6	170888	170893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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