MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_021040	GT	3	6	1814824	1814829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38002	NC_021040	GT	3	6	1814836	1814841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38003	NC_021040	ATG	2	6	1814890	1814895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_021040	AGA	2	6	1814954	1814959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38005	NC_021040	AGA	2	6	1814962	1814967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38006	NC_021040	GAT	2	6	1814991	1814996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38007	NC_021040	GAA	2	6	1815024	1815029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38008	NC_021040	GTG	2	6	1815123	1815128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38009	NC_021040	GAAAA	2	10	1815144	1815153	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38010	NC_021040	GCG	2	6	1815168	1815173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38011	NC_021040	AGA	2	6	1815181	1815186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38012	NC_021040	GAA	2	6	1815204	1815209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38013	NC_021040	GCT	2	6	1815287	1815292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38014	NC_021040	A	6	6	1815335	1815340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38015	NC_021040	AGA	2	6	1815368	1815373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_021040	CAG	2	6	1815387	1815392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38017	NC_021040	ACTG	2	8	1815434	1815441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38018	NC_021040	TTC	2	6	1815505	1815510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38019	NC_021040	A	8	8	1815515	1815522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38020	NC_021040	AGG	2	6	1815556	1815561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38021	NC_021040	A	7	7	1815611	1815617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38022	NC_021040	ATG	2	6	1815631	1815636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38023	NC_021040	GAT	2	6	1815680	1815685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38024	NC_021040	N	467	467	1815719	1816185	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38025	NC_021040	TAT	2	6	1816191	1816196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38026	NC_021040	CAT	2	6	1816199	1816204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38027	NC_021040	GA	3	6	1816205	1816210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38028	NC_021040	ACA	2	6	1816304	1816309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38029	NC_021040	TCGA	2	8	1816334	1816341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38030	NC_021040	AAG	2	6	1816422	1816427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38031	NC_021040	TTTG	2	8	1816467	1816474	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_021040	A	7	7	1816484	1816490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38033	NC_021040	AGG	2	6	1816532	1816537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38034	NC_021040	TGG	2	6	1816616	1816621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203347
38035	NC_021040	ATTT	2	8	1816635	1816642	25 %	75 %	0 %	0 %	479203347
38036	NC_021040	TCA	2	6	1816681	1816686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203347
38037	NC_021040	GGAT	2	8	1816689	1816696	25 %	25 %	50 %	0 %	479203347
38038	NC_021040	GCA	2	6	1816747	1816752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203347
38039	NC_021040	TTG	2	6	1816757	1816762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203347
38040	NC_021040	TTA	2	6	1816951	1816956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203347
38041	NC_021040	ATG	2	6	1816993	1816998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203347
38042	NC_021040	GAT	2	6	1817064	1817069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203347
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38045	NC_021040	AT	3	6	1817179	1817184	50 %	50 %	0 %	0 %	479203347
38046	NC_021040	A	6	6	1817214	1817219	100 %	0 %	0 %	0 %	479203347
38047	NC_021040	TAA	3	9	1817220	1817228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203347
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38049	NC_021040	TAA	2	6	1817288	1817293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38050	NC_021040	GAA	2	6	1817463	1817468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203348
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38052	NC_021040	GAAT	2	8	1817537	1817544	50 %	25 %	25 %	0 %	479203348
38053	NC_021040	TGG	2	6	1817581	1817586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203348
38054	NC_021040	T	6	6	1817631	1817636	0 %	100 %	0 %	0 %	479203348
38055	NC_021040	ATCA	2	8	1817667	1817674	50 %	25 %	0 %	25 %	479203348
38056	NC_021040	GTC	2	6	1817708	1817713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203348
38057	NC_021040	AC	3	6	1817775	1817780	50 %	0 %	0 %	50 %	479203348
38058	NC_021040	ACC	2	6	1817805	1817810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203348
38059	NC_021040	CAG	2	6	1817842	1817847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203348
38060	NC_021040	GA	4	8	1817973	1817980	50 %	0 %	50 %	0 %	479203348
38061	NC_021040	ACG	2	6	1818150	1818155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203348
38062	NC_021040	GCAG	2	8	1818164	1818171	25 %	0 %	50 %	25 %	479203348
38063	NC_021040	AG	3	6	1818272	1818277	50 %	0 %	50 %	0 %	479203348
38064	NC_021040	TGA	2	6	1818284	1818289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203348
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38092	NC_021040	CA	3	6	1819683	1819688	50 %	0 %	0 %	50 %	479203349
38093	NC_021040	AGC	2	6	1819717	1819722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203349
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38103	NC_021040	TAA	2	6	1820325	1820330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38104	NC_021040	AAATA	2	10	1820374	1820383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38105	NC_021040	A	6	6	1820383	1820388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38106	NC_021040	ATT	2	6	1820399	1820404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38107	NC_021040	AAAT	2	8	1820416	1820423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38108	NC_021040	AAAGA	2	10	1820451	1820460	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38109	NC_021040	GAAAT	2	10	1820491	1820500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38110	NC_021040	GAA	2	6	1820544	1820549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38118	NC_021040	TGA	2	6	1820880	1820885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203351
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38122	NC_021040	CTA	2	6	1821120	1821125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203351
38123	NC_021040	GGA	3	9	1821189	1821197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203351
38124	NC_021040	AGA	2	6	1821243	1821248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203351
38125	NC_021040	A	6	6	1821268	1821273	100 %	0 %	0 %	0 %	479203351
38126	NC_021040	TAAA	2	8	1821293	1821300	75 %	25 %	0 %	0 %	479203351
38127	NC_021040	TACAG	2	10	1821340	1821349	40 %	20 %	20 %	20 %	479203351
38128	NC_021040	TTC	2	6	1821357	1821362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203351
38129	NC_021040	A	6	6	1821370	1821375	100 %	0 %	0 %	0 %	479203351
38130	NC_021040	AGT	2	6	1821483	1821488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203351
38131	NC_021040	GATG	2	8	1821489	1821496	25 %	25 %	50 %	0 %	479203351
38132	NC_021040	ATTGA	2	10	1821553	1821562	40 %	40 %	20 %	0 %	479203351
38133	NC_021040	ATG	2	6	1821577	1821582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203352
38134	NC_021040	T	6	6	1821608	1821613	0 %	100 %	0 %	0 %	479203352
38135	NC_021040	AAAG	2	8	1821656	1821663	75 %	0 %	25 %	0 %	479203352
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38137	NC_021040	TGT	2	6	1821768	1821773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203352
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38139	NC_021040	TA	4	8	1821800	1821807	50 %	50 %	0 %	0 %	479203352
38140	NC_021040	TTA	2	6	1821879	1821884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203352
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38142	NC_021040	GGA	2	6	1822069	1822074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203352
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38146	NC_021040	TGAG	2	8	1822298	1822305	25 %	25 %	50 %	0 %	479203352
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38148	NC_021040	A	6	6	1822378	1822383	100 %	0 %	0 %	0 %	479203352
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38150	NC_021040	GCG	2	6	1822474	1822479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203352
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38152	NC_021040	GA	3	6	1822527	1822532	50 %	0 %	50 %	0 %	479203352
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38155	NC_021040	TTG	2	6	1822576	1822581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203352
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38162	NC_021040	ATA	2	6	1822768	1822773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203352
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38170	NC_021040	GA	3	6	1822907	1822912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38171	NC_021040	T	8	8	1822923	1822930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38195	NC_021040	GCAA	2	8	1823898	1823905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38196	NC_021040	GCAT	2	8	1823949	1823956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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38232	NC_021040	ACA	2	6	1826066	1826071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38233	NC_021040	TGC	2	6	1826084	1826089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38234	NC_021040	TGT	2	6	1826120	1826125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38236	NC_021040	A	6	6	1826143	1826148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38237	NC_021040	A	6	6	1826230	1826235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38238	NC_021040	GAC	2	6	1826251	1826256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38239	NC_021040	TATGT	2	10	1826326	1826335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38240	NC_021040	GTTG	2	8	1826337	1826344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38241	NC_021040	AAG	2	6	1826399	1826404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38242	NC_021040	GAT	2	6	1826449	1826454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38244	NC_021040	A	6	6	1826483	1826488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38372	NC_021040	ATG	2	6	1832374	1832379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38373	NC_021040	GAA	2	6	1832457	1832462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38491	NC_021040	TAT	2	6	1837591	1837596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203362
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