MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_021040	TCA	2	6	1238438	1238443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26002	NC_021040	CCAG	2	8	1238534	1238541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26003	NC_021040	CTG	2	6	1238658	1238663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26004	NC_021040	CCTGT	2	10	1238729	1238738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26005	NC_021040	GGC	2	6	1238742	1238747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26006	NC_021040	TGG	2	6	1238770	1238775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26007	NC_021040	GGC	2	6	1238780	1238785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26008	NC_021040	CAG	2	6	1238814	1238819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26009	NC_021040	GAT	2	6	1238880	1238885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26010	NC_021040	CCG	2	6	1238894	1238899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26011	NC_021040	AGCC	2	8	1238976	1238983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26012	NC_021040	T	6	6	1239039	1239044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26013	NC_021040	TCC	2	6	1239130	1239135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26014	NC_021040	CGG	2	6	1239188	1239193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26015	NC_021040	CCTT	2	8	1239265	1239272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26016	NC_021040	CCT	2	6	1239445	1239450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26017	NC_021040	AC	4	8	1239460	1239467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26018	NC_021040	GCC	2	6	1239477	1239482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26019	NC_021040	GCCGGA	2	12	1239537	1239548	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26020	NC_021040	CA	3	6	1239558	1239563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26021	NC_021040	ATG	2	6	1239637	1239642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26022	NC_021040	CTC	2	6	1239711	1239716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26023	NC_021040	CCG	2	6	1239720	1239725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26024	NC_021040	CAG	2	6	1239759	1239764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26025	NC_021040	GGCCG	2	10	1239837	1239846	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26026	NC_021040	GCCCA	2	10	1239855	1239864	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26027	NC_021040	CGC	2	6	1239891	1239896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26028	NC_021040	TTC	2	6	1239985	1239990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26029	NC_021040	ACC	2	6	1239995	1240000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26030	NC_021040	CCG	2	6	1240047	1240052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26031	NC_021040	CAG	2	6	1240168	1240173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26032	NC_021040	CGG	2	6	1240220	1240225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26033	NC_021040	CTGC	2	8	1240306	1240313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26034	NC_021040	GGC	2	6	1240353	1240358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26035	NC_021040	CCG	2	6	1240359	1240364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26036	NC_021040	TCA	2	6	1240445	1240450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26037	NC_021040	CCT	2	6	1240464	1240469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26038	NC_021040	CAGC	2	8	1240525	1240532	25 %	0 %	25 %	50 %	479202866
26039	NC_021040	CCT	2	6	1240543	1240548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202866
26040	NC_021040	AAT	2	6	1240562	1240567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202866
26041	NC_021040	GCC	2	6	1240694	1240699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202866
26042	NC_021040	CCCG	2	8	1240735	1240742	0 %	0 %	25 %	75 %	479202866
26043	NC_021040	TCAAAG	2	12	1240749	1240760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479202866
26044	NC_021040	TAT	2	6	1240771	1240776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202866
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26058	NC_021040	GGGC	2	8	1241434	1241441	0 %	0 %	75 %	25 %	479202867
26059	NC_021040	GCCT	2	8	1241455	1241462	0 %	25 %	25 %	50 %	479202867
26060	NC_021040	GCGG	2	8	1241482	1241489	0 %	0 %	75 %	25 %	479202867
26061	NC_021040	CGC	2	6	1241511	1241516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202867
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26063	NC_021040	TAA	2	6	1241577	1241582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26064	NC_021040	C	6	6	1241599	1241604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26065	NC_021040	GGC	2	6	1241630	1241635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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26082	NC_021040	T	7	7	1242195	1242201	0 %	100 %	0 %	0 %	479202868
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26095	NC_021040	TCCT	2	8	1242715	1242722	0 %	50 %	0 %	50 %	479202868
26096	NC_021040	GGCT	2	8	1242742	1242749	0 %	25 %	50 %	25 %	479202868
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26119	NC_021040	AT	3	6	1243965	1243970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26120	NC_021040	ACC	2	6	1244061	1244066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26121	NC_021040	TTCAG	2	10	1244085	1244094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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26123	NC_021040	A	6	6	1244128	1244133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26124	NC_021040	GAT	2	6	1244236	1244241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202869
26125	NC_021040	TCC	2	6	1244254	1244259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202869
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26130	NC_021040	TCAG	2	8	1244530	1244537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26131	NC_021040	ATT	2	6	1244608	1244613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26132	NC_021040	ATT	2	6	1244641	1244646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26133	NC_021040	A	8	8	1244706	1244713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26134	NC_021040	A	6	6	1244730	1244735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26135	NC_021040	TAGT	2	8	1244768	1244775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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26139	NC_021040	T	6	6	1244938	1244943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26140	NC_021040	T	6	6	1244975	1244980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26141	NC_021040	AG	3	6	1245044	1245049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26142	NC_021040	A	7	7	1245062	1245068	100 %	0 %	0 %	0 %	479202870
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26177	NC_021040	TC	3	6	1246691	1246696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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26230	NC_021040	GAT	2	6	1249410	1249415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202873
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26238	NC_021040	A	6	6	1249900	1249905	100 %	0 %	0 %	0 %	479202873
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26477	NC_021040	TGC	2	6	1262405	1262410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202882
26478	NC_021040	TCA	2	6	1262440	1262445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202882
26479	NC_021040	ATT	2	6	1262450	1262455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202882
26480	NC_021040	ATT	2	6	1262463	1262468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202882
26481	NC_021040	CTGGCA	2	12	1262472	1262483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479202882
26482	NC_021040	GAA	2	6	1262535	1262540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202882
26483	NC_021040	GAT	2	6	1262541	1262546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202882
26484	NC_021040	AATGA	2	10	1262689	1262698	60 %	20 %	20 %	0 %	479202883
26485	NC_021040	CAA	2	6	1262720	1262725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202883
26486	NC_021040	TGG	2	6	1262732	1262737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202883
26487	NC_021040	AG	3	6	1262745	1262750	50 %	0 %	50 %	0 %	479202883
26488	NC_021040	TCT	2	6	1262788	1262793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202883
26489	NC_021040	GCA	2	6	1262809	1262814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202883
26490	NC_021040	GAT	2	6	1262924	1262929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26491	NC_021040	AGA	2	6	1262979	1262984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202884
26492	NC_021040	GAA	2	6	1263081	1263086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202884
26493	NC_021040	TAA	2	6	1263132	1263137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202884
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26495	NC_021040	GCA	2	6	1263154	1263159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202884
26496	NC_021040	CAG	2	6	1263188	1263193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202884
26497	NC_021040	GAA	2	6	1263211	1263216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202884
26498	NC_021040	GCT	2	6	1263303	1263308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26499	NC_021040	CCGGA	2	10	1263354	1263363	20 %	0 %	40 %	40 %	479202885
26500	NC_021040	AATC	2	8	1263390	1263397	50 %	25 %	0 %	25 %	479202885

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