MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_021040	AG	3	6	1211668	1211673	50 %	0 %	50 %	0 %	479202840
25502	NC_021040	GTG	2	6	1211695	1211700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202840
25503	NC_021040	TAT	2	6	1211718	1211723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202840
25504	NC_021040	CGG	2	6	1211752	1211757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202840
25505	NC_021040	TTG	2	6	1211854	1211859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202840
25506	NC_021040	CAA	2	6	1211888	1211893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202840
25507	NC_021040	GAT	2	6	1211934	1211939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202840
25508	NC_021040	ACT	2	6	1211974	1211979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202840
25509	NC_021040	CGG	2	6	1211981	1211986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202840
25510	NC_021040	CAT	3	9	1212008	1212016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202840
25511	NC_021040	TA	3	6	1212043	1212048	50 %	50 %	0 %	0 %	479202840
25512	NC_021040	CAG	2	6	1212096	1212101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202840
25513	NC_021040	CTG	2	6	1212108	1212113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202840
25514	NC_021040	ACA	2	6	1212172	1212177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202840
25515	NC_021040	GGACC	2	10	1212184	1212193	20 %	0 %	40 %	40 %	479202840
25516	NC_021040	GAT	2	6	1212201	1212206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202840
25517	NC_021040	ATA	2	6	1212290	1212295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202840
25518	NC_021040	AGAT	2	8	1212315	1212322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_021040	TAT	2	6	1212396	1212401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202841
25520	NC_021040	CAG	2	6	1212441	1212446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202841
25521	NC_021040	GCA	2	6	1212514	1212519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202841
25522	NC_021040	CAG	2	6	1212566	1212571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202841
25523	NC_021040	CTTC	2	8	1212640	1212647	0 %	50 %	0 %	50 %	479202841
25524	NC_021040	TCTGC	2	10	1212687	1212696	0 %	40 %	20 %	40 %	479202841
25525	NC_021040	TGA	2	6	1212725	1212730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202841
25526	NC_021040	AT	3	6	1212774	1212779	50 %	50 %	0 %	0 %	479202841
25527	NC_021040	GCT	2	6	1212847	1212852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202841
25528	NC_021040	GGC	2	6	1212970	1212975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202841
25529	NC_021040	GTAT	2	8	1212980	1212987	25 %	50 %	25 %	0 %	479202841
25530	NC_021040	GAT	2	6	1213002	1213007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202841
25531	NC_021040	CAG	2	6	1213062	1213067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202841
25532	NC_021040	AGG	2	6	1213079	1213084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202841
25533	NC_021040	GTT	2	6	1213234	1213239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202841
25534	NC_021040	TCCA	2	8	1213240	1213247	25 %	25 %	0 %	50 %	479202841
25535	NC_021040	CAA	2	6	1213329	1213334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25536	NC_021040	ATATGA	2	12	1213460	1213471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_021040	TGA	2	6	1213476	1213481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_021040	AAG	2	6	1213482	1213487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25539	NC_021040	CTT	2	6	1213500	1213505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25540	NC_021040	N	344	344	1213512	1213855	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25541	NC_021040	AC	3	6	1213876	1213881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25542	NC_021040	CTG	2	6	1214215	1214220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202842
25543	NC_021040	T	7	7	1214331	1214337	0 %	100 %	0 %	0 %	479202842
25544	NC_021040	CAG	2	6	1214418	1214423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202842
25545	NC_021040	TTGA	2	8	1214441	1214448	25 %	50 %	25 %	0 %	479202842
25546	NC_021040	AAT	2	6	1214496	1214501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202842
25547	NC_021040	TTG	2	6	1214507	1214512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202842
25548	NC_021040	GCCC	2	8	1214537	1214544	0 %	0 %	25 %	75 %	479202842
25549	NC_021040	AG	3	6	1214622	1214627	50 %	0 %	50 %	0 %	479202842
25550	NC_021040	GTTC	2	8	1214892	1214899	0 %	50 %	25 %	25 %	479202842
25551	NC_021040	TGA	2	6	1214923	1214928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202842
25552	NC_021040	CAG	2	6	1214967	1214972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202842
25553	NC_021040	CAA	2	6	1214982	1214987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202842
25554	NC_021040	TCA	2	6	1215120	1215125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202842
25555	NC_021040	GAT	2	6	1215142	1215147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202842
25556	NC_021040	TAA	2	6	1215198	1215203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202842
25557	NC_021040	AACA	2	8	1215220	1215227	75 %	0 %	0 %	25 %	479202842
25558	NC_021040	CAT	2	6	1215372	1215377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202842
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25562	NC_021040	GA	3	6	1215546	1215551	50 %	0 %	50 %	0 %	479202842
25563	NC_021040	CTG	2	6	1215556	1215561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202842
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25572	NC_021040	ACC	2	6	1215797	1215802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25573	NC_021040	GA	3	6	1215844	1215849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25574	NC_021040	CAGG	2	8	1215898	1215905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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25583	NC_021040	CACC	2	8	1216319	1216326	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25584	NC_021040	TACT	2	8	1216340	1216347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25585	NC_021040	GAA	2	6	1216376	1216381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25588	NC_021040	AAG	2	6	1216431	1216436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25589	NC_021040	A	6	6	1216437	1216442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25590	NC_021040	T	7	7	1216451	1216457	0 %	100 %	0 %	0 %	479202843
25591	NC_021040	CTC	2	6	1216497	1216502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202843
25592	NC_021040	CTCGGC	2	12	1216512	1216523	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479202843
25593	NC_021040	GAA	2	6	1216613	1216618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202843
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25598	NC_021040	TGTT	2	8	1216872	1216879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25599	NC_021040	GCACC	2	10	1216921	1216930	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25600	NC_021040	CA	3	6	1216987	1216992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25601	NC_021040	AT	3	6	1217004	1217009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25602	NC_021040	T	7	7	1217073	1217079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25603	NC_021040	GTC	2	6	1217161	1217166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25604	NC_021040	CGG	2	6	1217192	1217197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25605	NC_021040	GCC	2	6	1217212	1217217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25606	NC_021040	ACG	2	6	1217250	1217255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25607	NC_021040	T	7	7	1217258	1217264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25608	NC_021040	CGT	2	6	1217272	1217277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25609	NC_021040	CTA	2	6	1217330	1217335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202844
25610	NC_021040	ATT	2	6	1217352	1217357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202844
25611	NC_021040	GGAAT	2	10	1217363	1217372	40 %	20 %	40 %	0 %	479202844
25612	NC_021040	AAC	2	6	1217397	1217402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202844
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25614	NC_021040	C	6	6	1217475	1217480	0 %	0 %	0 %	100 %	479202844
25615	NC_021040	CATA	2	8	1217545	1217552	50 %	25 %	0 %	25 %	479202844
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25618	NC_021040	AAT	2	6	1217925	1217930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202844
25619	NC_021040	CAG	2	6	1218117	1218122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202844
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25621	NC_021040	TGG	2	6	1218158	1218163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202844
25622	NC_021040	T	7	7	1218170	1218176	0 %	100 %	0 %	0 %	479202844
25623	NC_021040	T	6	6	1218179	1218184	0 %	100 %	0 %	0 %	479202844
25624	NC_021040	CT	3	6	1218186	1218191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25733	NC_021040	TCAT	2	8	1224423	1224430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25750	NC_021040	TG	3	6	1225292	1225297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25982	NC_021040	ATG	2	6	1237757	1237762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202864
25983	NC_021040	CCT	2	6	1237823	1237828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202865
25984	NC_021040	CAG	2	6	1237843	1237848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202865
25985	NC_021040	GAT	2	6	1237873	1237878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202865
25986	NC_021040	GCC	3	9	1237879	1237887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202865
25987	NC_021040	GCT	2	6	1237896	1237901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202865
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25989	NC_021040	ACA	2	6	1237994	1237999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202865
25990	NC_021040	CCT	2	6	1238045	1238050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25991	NC_021040	A	6	6	1238076	1238081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25992	NC_021040	GCC	2	6	1238082	1238087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25993	NC_021040	GGC	2	6	1238094	1238099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25994	NC_021040	TCG	2	6	1238158	1238163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25995	NC_021040	TCA	2	6	1238167	1238172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25996	NC_021040	GTCCTC	2	12	1238184	1238195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25997	NC_021040	CA	3	6	1238237	1238242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25998	NC_021040	GCC	2	6	1238258	1238263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25999	NC_021040	GCG	2	6	1238265	1238270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26000	NC_021040	GGTCAA	2	12	1238282	1238293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

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