MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021040	CA	3	6	1092505	1092510	50 %	0 %	0 %	50 %	479202734
23003	NC_021040	AC	3	6	1092530	1092535	50 %	0 %	0 %	50 %	479202734
23004	NC_021040	A	6	6	1092583	1092588	100 %	0 %	0 %	0 %	479202734
23005	NC_021040	TGA	2	6	1092672	1092677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202734
23006	NC_021040	ATC	2	6	1092706	1092711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202734
23007	NC_021040	GCA	2	6	1092744	1092749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202734
23008	NC_021040	ATC	2	6	1092814	1092819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202734
23009	NC_021040	GAA	2	6	1092877	1092882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202734
23010	NC_021040	GGC	2	6	1092945	1092950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202734
23011	NC_021040	GCAT	2	8	1092971	1092978	25 %	25 %	25 %	25 %	479202734
23012	NC_021040	A	6	6	1092979	1092984	100 %	0 %	0 %	0 %	479202734
23013	NC_021040	ACGAT	2	10	1093001	1093010	40 %	20 %	20 %	20 %	479202734
23014	NC_021040	TAT	2	6	1093059	1093064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202734
23015	NC_021040	AGA	2	6	1093230	1093235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202734
23016	NC_021040	CAA	2	6	1093245	1093250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202734
23017	NC_021040	TCGGTG	2	12	1093355	1093366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479202734
23018	NC_021040	GACA	2	8	1093390	1093397	50 %	0 %	25 %	25 %	479202734
23019	NC_021040	ATC	2	6	1093417	1093422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202734
23020	NC_021040	AG	3	6	1093440	1093445	50 %	0 %	50 %	0 %	479202734
23021	NC_021040	AG	3	6	1093512	1093517	50 %	0 %	50 %	0 %	479202734
23022	NC_021040	GGA	2	6	1093524	1093529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202734
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23054	NC_021040	GATA	2	8	1095246	1095253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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23155	NC_021040	GA	3	6	1100712	1100717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23239	NC_021040	CGA	2	6	1104303	1104308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202743
23240	NC_021040	CTC	2	6	1104355	1104360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202743
23241	NC_021040	TG	4	8	1104384	1104391	0 %	50 %	50 %	0 %	479202743
23242	NC_021040	AGGA	2	8	1104397	1104404	50 %	0 %	50 %	0 %	479202743
23243	NC_021040	GGT	2	6	1104412	1104417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202743
23244	NC_021040	TCC	2	6	1104574	1104579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202743
23245	NC_021040	AGG	2	6	1104597	1104602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202743
23246	NC_021040	GT	3	6	1104607	1104612	0 %	50 %	50 %	0 %	479202743
23247	NC_021040	GTG	2	6	1104639	1104644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202743
23248	NC_021040	CGA	2	6	1104663	1104668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202743
23249	NC_021040	CT	3	6	1104674	1104679	0 %	50 %	0 %	50 %	479202743
23250	NC_021040	TGTGG	2	10	1104695	1104704	0 %	40 %	60 %	0 %	479202743
23251	NC_021040	GCGCA	2	10	1104778	1104787	20 %	0 %	40 %	40 %	479202743
23252	NC_021040	GCT	2	6	1104864	1104869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202743
23253	NC_021040	ATT	2	6	1104973	1104978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202743
23254	NC_021040	TAG	2	6	1105055	1105060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202743
23255	NC_021040	TATT	2	8	1105109	1105116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23256	NC_021040	ATG	2	6	1105130	1105135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23257	NC_021040	AT	3	6	1105137	1105142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23258	NC_021040	AAT	2	6	1105144	1105149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23259	NC_021040	A	6	6	1105208	1105213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23260	NC_021040	GT	3	6	1105299	1105304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23261	NC_021040	GA	3	6	1105351	1105356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23262	NC_021040	ATG	2	6	1105412	1105417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23263	NC_021040	GAGTG	2	10	1105421	1105430	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23264	NC_021040	GT	3	6	1105473	1105478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23265	NC_021040	AG	3	6	1105486	1105491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23266	NC_021040	CAGT	2	8	1105535	1105542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23267	NC_021040	TTC	2	6	1105581	1105586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23268	NC_021040	GCA	2	6	1105604	1105609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23269	NC_021040	CGG	2	6	1105663	1105668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23270	NC_021040	A	6	6	1105743	1105748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23271	NC_021040	GGA	2	6	1105820	1105825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23272	NC_021040	TCTG	2	8	1105828	1105835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23273	NC_021040	CTG	2	6	1105892	1105897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23276	NC_021040	TGG	2	6	1106060	1106065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202744
23277	NC_021040	CGGA	2	8	1106213	1106220	25 %	0 %	50 %	25 %	479202744
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23287	NC_021040	TTA	2	6	1106769	1106774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202745
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23294	NC_021040	AT	3	6	1107134	1107139	50 %	50 %	0 %	0 %	479202745
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23303	NC_021040	AAG	2	6	1107906	1107911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202745
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23305	NC_021040	AGGC	2	8	1108063	1108070	25 %	0 %	50 %	25 %	479202746
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23327	NC_021040	T	6	6	1109309	1109314	0 %	100 %	0 %	0 %	479202746
23328	NC_021040	CAT	2	6	1109329	1109334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202746
23329	NC_021040	CTT	2	6	1109344	1109349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23330	NC_021040	AAT	2	6	1109354	1109359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23331	NC_021040	TTC	2	6	1109392	1109397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23332	NC_021040	GTAT	2	8	1109410	1109417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23333	NC_021040	ATA	2	6	1109452	1109457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23334	NC_021040	GGA	2	6	1109511	1109516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23335	NC_021040	TGAG	2	8	1109525	1109532	25 %	25 %	50 %	0 %	479202747
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23339	NC_021040	TAT	2	6	1109716	1109721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202747
23340	NC_021040	TC	3	6	1109765	1109770	0 %	50 %	0 %	50 %	479202747
23341	NC_021040	A	6	6	1109776	1109781	100 %	0 %	0 %	0 %	479202747
23342	NC_021040	CTT	2	6	1109827	1109832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202747
23343	NC_021040	GAG	2	6	1109875	1109880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202747
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23345	NC_021040	CAT	2	6	1110008	1110013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202747
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23347	NC_021040	AG	4	8	1110047	1110054	50 %	0 %	50 %	0 %	479202747
23348	NC_021040	A	6	6	1110067	1110072	100 %	0 %	0 %	0 %	479202747
23349	NC_021040	AAAG	2	8	1110093	1110100	75 %	0 %	25 %	0 %	479202747
23350	NC_021040	GGA	2	6	1110129	1110134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202747
23351	NC_021040	CGGAC	2	10	1110143	1110152	20 %	0 %	40 %	40 %	479202747
23352	NC_021040	AAG	2	6	1110157	1110162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202747
23353	NC_021040	TCC	2	6	1110238	1110243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202747
23354	NC_021040	GAA	2	6	1110247	1110252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202747
23355	NC_021040	CTG	2	6	1110253	1110258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202747
23356	NC_021040	A	7	7	1110259	1110265	100 %	0 %	0 %	0 %	479202747
23357	NC_021040	TGA	2	6	1110302	1110307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202747
23358	NC_021040	AGA	2	6	1110312	1110317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202747
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23479	NC_021040	A	6	6	1117041	1117046	100 %	0 %	0 %	0 %	479202752
23480	NC_021040	AGC	2	6	1117096	1117101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202752
23481	NC_021040	ATG	2	6	1117149	1117154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202752
23482	NC_021040	GATAC	2	10	1117211	1117220	40 %	20 %	20 %	20 %	479202752
23483	NC_021040	ATG	2	6	1117233	1117238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202752
23484	NC_021040	GAT	2	6	1117265	1117270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202752
23485	NC_021040	GCAGG	2	10	1117296	1117305	20 %	0 %	60 %	20 %	479202752
23486	NC_021040	TGC	2	6	1117330	1117335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23487	NC_021040	TAAAA	2	10	1117346	1117355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23488	NC_021040	CAT	2	6	1117502	1117507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23489	NC_021040	CGG	2	6	1117576	1117581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23490	NC_021040	AGC	2	6	1117600	1117605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23491	NC_021040	TAT	2	6	1117629	1117634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23492	NC_021040	CTG	2	6	1117635	1117640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23493	NC_021040	GCCGT	2	10	1117664	1117673	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23494	NC_021040	GCG	2	6	1117683	1117688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23495	NC_021040	A	8	8	1117749	1117756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23496	NC_021040	A	6	6	1117781	1117786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23497	NC_021040	AAT	2	6	1117791	1117796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23498	NC_021040	AGA	2	6	1117808	1117813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23499	NC_021040	GCA	2	6	1117837	1117842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23500	NC_021040	TGG	2	6	1117913	1117918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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