MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19122	NC_021040	TTC	2	6	903864	903869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202572
19123	NC_021040	CT	3	6	903880	903885	0 %	50 %	0 %	50 %	479202572
19124	NC_021040	CCGGTT	2	12	903923	903934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202572
19125	NC_021040	TCT	2	6	903943	903948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202572
19126	NC_021040	TCA	2	6	904012	904017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202572
19127	NC_021040	CTT	2	6	904031	904036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202572
19128	NC_021040	CGGT	2	8	904174	904181	0 %	25 %	50 %	25 %	479202572
19129	NC_021040	GCAGA	2	10	904308	904317	40 %	0 %	40 %	20 %	479202572
19130	NC_021040	TAT	3	9	904349	904357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202572
19131	NC_021040	CGT	2	6	904376	904381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202572
19132	NC_021040	CATC	2	8	904454	904461	25 %	25 %	0 %	50 %	479202572
19133	NC_021040	ATC	2	6	904464	904469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202572
19134	NC_021040	T	6	6	904471	904476	0 %	100 %	0 %	0 %	479202572
19135	NC_021040	CTG	2	6	904506	904511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202572
19136	NC_021040	GCC	2	6	904515	904520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202572
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19138	NC_021040	T	7	7	904587	904593	0 %	100 %	0 %	0 %	479202572
19139	NC_021040	AAG	2	6	904652	904657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202572
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19141	NC_021040	TCTT	2	8	904717	904724	0 %	75 %	0 %	25 %	479202572
19142	NC_021040	T	6	6	904752	904757	0 %	100 %	0 %	0 %	479202572
19143	NC_021040	GTA	2	6	904935	904940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202573
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19145	NC_021040	ATA	2	6	905025	905030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202573
19146	NC_021040	T	6	6	905060	905065	0 %	100 %	0 %	0 %	479202573
19147	NC_021040	ATT	2	6	905088	905093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202573
19148	NC_021040	ACG	2	6	905192	905197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202573
19149	NC_021040	TG	3	6	905215	905220	0 %	50 %	50 %	0 %	479202573
19150	NC_021040	CAT	2	6	905250	905255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202573
19151	NC_021040	AT	4	8	905254	905261	50 %	50 %	0 %	0 %	479202573
19152	NC_021040	TGGC	2	8	905275	905282	0 %	25 %	50 %	25 %	479202573
19153	NC_021040	CCA	2	6	905318	905323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202573
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19161	NC_021040	T	8	8	905837	905844	0 %	100 %	0 %	0 %	479202574
19162	NC_021040	A	6	6	905870	905875	100 %	0 %	0 %	0 %	479202574
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19165	NC_021040	CAT	2	6	905945	905950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202574
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19168	NC_021040	AAT	2	6	905968	905973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202574
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19182	NC_021040	A	7	7	906823	906829	100 %	0 %	0 %	0 %	479202574
19183	NC_021040	T	6	6	906853	906858	0 %	100 %	0 %	0 %	479202574
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19187	NC_021040	A	7	7	907045	907051	100 %	0 %	0 %	0 %	479202574
19188	NC_021040	TGA	2	6	907201	907206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202575
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19216	NC_021040	AGATC	2	10	908526	908535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19217	NC_021040	ATC	2	6	908564	908569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19218	NC_021040	ATAGC	2	10	908582	908591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19219	NC_021040	GGTAT	2	10	908629	908638	20 %	40 %	40 %	0 %	479202576
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19232	NC_021040	GA	3	6	909343	909348	50 %	0 %	50 %	0 %	479202577
19233	NC_021040	GAA	2	6	909424	909429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202577
19234	NC_021040	ATT	2	6	909445	909450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19235	NC_021040	ATA	2	6	909451	909456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19236	NC_021040	GAA	2	6	909458	909463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19237	NC_021040	TGC	2	6	909503	909508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19238	NC_021040	AGA	2	6	909539	909544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19239	NC_021040	GCT	2	6	909609	909614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19240	NC_021040	GT	3	6	909635	909640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19241	NC_021040	TACAGA	2	12	909650	909661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19242	NC_021040	TAT	2	6	909675	909680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19243	NC_021040	GGC	2	6	909683	909688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19244	NC_021040	GAT	2	6	909740	909745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19245	NC_021040	ATG	2	6	909751	909756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19247	NC_021040	GGATAC	2	12	909809	909820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19248	NC_021040	A	7	7	909824	909830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19249	NC_021040	GAT	2	6	909861	909866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19250	NC_021040	TAA	2	6	909905	909910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19251	NC_021040	GAA	2	6	909927	909932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19252	NC_021040	TAT	2	6	909999	910004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19253	NC_021040	GAA	2	6	910104	910109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19254	NC_021040	CGG	2	6	910159	910164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19255	NC_021040	AATG	2	8	910175	910182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19256	NC_021040	N	426	426	910226	910651	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19262	NC_021040	AT	3	6	910820	910825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19265	NC_021040	TTC	2	6	911036	911041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19366	NC_021040	CGA	2	6	916550	916555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202582
19367	NC_021040	AGA	2	6	916556	916561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202582
19368	NC_021040	GCAG	2	8	916675	916682	25 %	0 %	50 %	25 %	479202582
19369	NC_021040	A	6	6	916740	916745	100 %	0 %	0 %	0 %	479202582
19370	NC_021040	GCAG	2	8	916815	916822	25 %	0 %	50 %	25 %	479202582
19371	NC_021040	GAT	2	6	916863	916868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202582
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19373	NC_021040	AG	3	6	916954	916959	50 %	0 %	50 %	0 %	479202582
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19378	NC_021040	GAT	2	6	917155	917160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202582
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19383	NC_021040	ATTAA	2	10	917317	917326	60 %	40 %	0 %	0 %	479202582
19384	NC_021040	ATC	2	6	917347	917352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202582
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19401	NC_021040	CGGG	2	8	918011	918018	0 %	0 %	75 %	25 %	479202583
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19408	NC_021040	CGTAT	2	10	918516	918525	20 %	40 %	20 %	20 %	479202583
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19488	NC_021040	ATG	2	6	921988	921993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202586
19489	NC_021040	TGCA	2	8	922063	922070	25 %	25 %	25 %	25 %	479202586
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19491	NC_021040	ACGAA	2	10	922197	922206	60 %	0 %	20 %	20 %	479202586
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