MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021040	CGA	2	6	852142	852147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202530
18002	NC_021040	CTT	2	6	852180	852185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202530
18003	NC_021040	GCGG	2	8	852248	852255	0 %	0 %	75 %	25 %	479202530
18004	NC_021040	TGAT	2	8	852295	852302	25 %	50 %	25 %	0 %	479202530
18005	NC_021040	GATCC	2	10	852526	852535	20 %	20 %	20 %	40 %	479202530
18006	NC_021040	TAT	2	6	852549	852554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202530
18007	NC_021040	AAG	2	6	852599	852604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202530
18008	NC_021040	ATC	2	6	852714	852719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202530
18009	NC_021040	CCG	2	6	852766	852771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202530
18010	NC_021040	ATC	3	9	852857	852865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202530
18011	NC_021040	AGC	2	6	852925	852930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202530
18012	NC_021040	CGGA	2	8	852940	852947	25 %	0 %	50 %	25 %	479202530
18013	NC_021040	CCGG	2	8	852952	852959	0 %	0 %	50 %	50 %	479202530
18014	NC_021040	ATGA	2	8	853039	853046	50 %	25 %	25 %	0 %	479202530
18015	NC_021040	AAT	2	6	853049	853054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_021040	AGG	2	6	853070	853075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_021040	GAA	2	6	853112	853117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202531
18018	NC_021040	CAG	2	6	853163	853168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202531
18019	NC_021040	ATG	2	6	853235	853240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202531
18020	NC_021040	ATA	2	6	853365	853370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202531
18021	NC_021040	TACGA	2	10	853406	853415	40 %	20 %	20 %	20 %	479202531
18022	NC_021040	AC	3	6	853430	853435	50 %	0 %	0 %	50 %	479202531
18023	NC_021040	GACA	2	8	853505	853512	50 %	0 %	25 %	25 %	479202531
18024	NC_021040	TGC	2	6	853560	853565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202531
18025	NC_021040	GGATAT	2	12	853576	853587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202531
18026	NC_021040	AGA	2	6	853591	853596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202531
18027	NC_021040	GT	3	6	853633	853638	0 %	50 %	50 %	0 %	479202531
18028	NC_021040	CAT	2	6	853757	853762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202531
18029	NC_021040	ATC	2	6	853782	853787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202531
18030	NC_021040	CCA	2	6	853851	853856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202531
18031	NC_021040	TGC	2	6	853885	853890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202531
18032	NC_021040	GGA	2	6	853915	853920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202531
18033	NC_021040	A	6	6	853925	853930	100 %	0 %	0 %	0 %	479202531
18034	NC_021040	TGC	2	6	854032	854037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202531
18035	NC_021040	GAT	2	6	854059	854064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202531
18036	NC_021040	TCA	2	6	854136	854141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202531
18037	NC_021040	TGT	2	6	854173	854178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202531
18038	NC_021040	GCAAAA	2	12	854180	854191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479202531
18039	NC_021040	A	7	7	854188	854194	100 %	0 %	0 %	0 %	479202531
18040	NC_021040	TGA	2	6	854205	854210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202531
18041	NC_021040	ACA	2	6	854300	854305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202531
18042	NC_021040	GCA	2	6	854306	854311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202531
18043	NC_021040	TGT	2	6	854320	854325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202531
18044	NC_021040	TG	3	6	854327	854332	0 %	50 %	50 %	0 %	479202531
18045	NC_021040	AGA	2	6	854359	854364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202531
18046	NC_021040	AGATT	2	10	854373	854382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_021040	AC	3	6	854383	854388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18048	NC_021040	ATT	2	6	854400	854405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_021040	GTAA	2	8	854442	854449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_021040	T	7	7	854482	854488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_021040	GGT	2	6	854539	854544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202532
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18054	NC_021040	T	6	6	854650	854655	0 %	100 %	0 %	0 %	479202532
18055	NC_021040	AGA	2	6	854669	854674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202532
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18057	NC_021040	AAG	2	6	854825	854830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202532
18058	NC_021040	TCA	2	6	854874	854879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202532
18059	NC_021040	T	6	6	854880	854885	0 %	100 %	0 %	0 %	479202532
18060	NC_021040	GCT	2	6	854913	854918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202532
18061	NC_021040	T	7	7	854958	854964	0 %	100 %	0 %	0 %	479202532
18062	NC_021040	TGT	2	6	855031	855036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202532
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18067	NC_021040	ATGA	2	8	855156	855163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_021040	T	6	6	855180	855185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_021040	TCT	2	6	855192	855197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_021040	AT	3	6	855203	855208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18072	NC_021040	TGT	2	6	855272	855277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_021040	A	6	6	855282	855287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18075	NC_021040	TGT	2	6	855370	855375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202533
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18082	NC_021040	TGC	2	6	855634	855639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202533
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18088	NC_021040	ACA	3	9	856173	856181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202533
18089	NC_021040	GAA	2	6	856192	856197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18092	NC_021040	TGC	2	6	856344	856349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202534
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18099	NC_021040	TACCGT	2	12	856711	856722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479202534
18100	NC_021040	GA	3	6	856741	856746	50 %	0 %	50 %	0 %	479202534
18101	NC_021040	TGA	2	6	856793	856798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202534
18102	NC_021040	AG	3	6	856876	856881	50 %	0 %	50 %	0 %	479202534
18103	NC_021040	T	6	6	856968	856973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18105	NC_021040	T	6	6	857058	857063	0 %	100 %	0 %	0 %	479202535
18106	NC_021040	TGA	2	6	857072	857077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202535
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18109	NC_021040	GATG	2	8	857111	857118	25 %	25 %	50 %	0 %	479202535
18110	NC_021040	TGAG	2	8	857173	857180	25 %	25 %	50 %	0 %	479202535
18111	NC_021040	GAAG	2	8	857207	857214	50 %	0 %	50 %	0 %	479202535
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18122	NC_021040	TCTT	2	8	857874	857881	0 %	75 %	0 %	25 %	479202535
18123	NC_021040	CGA	2	6	857941	857946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202535
18124	NC_021040	CTT	2	6	857949	857954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202535
18125	NC_021040	GAG	2	6	857972	857977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202535
18126	NC_021040	CGG	2	6	857992	857997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202535
18127	NC_021040	AG	3	6	858039	858044	50 %	0 %	50 %	0 %	479202535
18128	NC_021040	GCGT	2	8	858049	858056	0 %	25 %	50 %	25 %	479202535
18129	NC_021040	AGG	2	6	858092	858097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202535
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18135	NC_021040	TGC	2	6	858274	858279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202535
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18144	NC_021040	CTG	2	6	858861	858866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202536
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18153	NC_021040	TGA	2	6	859285	859290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202536
18154	NC_021040	T	6	6	859353	859358	0 %	100 %	0 %	0 %	479202536
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18161	NC_021040	GAG	2	6	859701	859706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202536
18162	NC_021040	CAGT	2	8	859729	859736	25 %	25 %	25 %	25 %	479202536
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18174	NC_021040	GTT	2	6	860281	860286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202537
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18182	NC_021040	ATT	2	6	860627	860632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18183	NC_021040	A	6	6	860644	860649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18184	NC_021040	CTC	2	6	860666	860671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18185	NC_021040	A	6	6	860683	860688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18186	NC_021040	A	7	7	860723	860729	100 %	0 %	0 %	0 %	479202538
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18214	NC_021040	TGCCG	2	10	862050	862059	0 %	20 %	40 %	40 %	479202540
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18217	NC_021040	GC	3	6	862276	862281	0 %	0 %	50 %	50 %	479202540
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18221	NC_021040	GTCCG	2	10	862482	862491	0 %	20 %	40 %	40 %	479202540
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18229	NC_021040	CTT	2	6	863000	863005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202540
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18231	NC_021040	T	6	6	863142	863147	0 %	100 %	0 %	0 %	479202540
18232	NC_021040	AT	3	6	863235	863240	50 %	50 %	0 %	0 %	479202540
18233	NC_021040	A	6	6	863246	863251	100 %	0 %	0 %	0 %	479202540
18234	NC_021040	ATT	2	6	863285	863290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202541
18235	NC_021040	TCATA	2	10	863297	863306	40 %	40 %	0 %	20 %	479202541
18236	NC_021040	T	6	6	863310	863315	0 %	100 %	0 %	0 %	479202541
18237	NC_021040	GC	3	6	863323	863328	0 %	0 %	50 %	50 %	479202541
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18240	NC_021040	GC	3	6	863503	863508	0 %	0 %	50 %	50 %	479202541
18241	NC_021040	CGG	2	6	863525	863530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202541
18242	NC_021040	GAA	2	6	863572	863577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202541
18243	NC_021040	CATC	2	8	863597	863604	25 %	25 %	0 %	50 %	479202541
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18246	NC_021040	GAT	2	6	863994	863999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202541
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18252	NC_021040	ATA	2	6	864287	864292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18254	NC_021040	ATGT	2	8	864333	864340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18282	NC_021040	GA	3	6	865864	865869	50 %	0 %	50 %	0 %	479202543
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18374	NC_021040	GAT	2	6	869761	869766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202545
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18495	NC_021040	GCT	2	6	875101	875106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202550
18496	NC_021040	GCG	2	6	875234	875239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202550
18497	NC_021040	TGT	2	6	875304	875309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202550
18498	NC_021040	TGA	2	6	875412	875417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202550
18499	NC_021040	TCG	2	6	875418	875423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202550
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