MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021040	CAT	2	6	523902	523907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202256
11002	NC_021040	GAT	2	6	523918	523923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202256
11003	NC_021040	CAGA	2	8	523944	523951	50 %	0 %	25 %	25 %	479202256
11004	NC_021040	AGA	2	6	523973	523978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202256
11005	NC_021040	TTGAAA	2	12	524174	524185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479202256
11006	NC_021040	ATT	3	9	524233	524241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202256
11007	NC_021040	TA	3	6	524327	524332	50 %	50 %	0 %	0 %	479202256
11008	NC_021040	ATT	2	6	524380	524385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202256
11009	NC_021040	AGC	2	6	524388	524393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202256
11010	NC_021040	T	6	6	524499	524504	0 %	100 %	0 %	0 %	479202256
11011	NC_021040	ACAG	2	8	524540	524547	50 %	0 %	25 %	25 %	479202256
11012	NC_021040	A	6	6	524599	524604	100 %	0 %	0 %	0 %	479202256
11013	NC_021040	TA	3	6	524614	524619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_021040	TAAA	2	8	524656	524663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_021040	GGAA	2	8	524686	524693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021040	GAG	2	6	524707	524712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021040	AT	3	6	524816	524821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_021040	ATT	2	6	524862	524867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_021040	TAT	2	6	524871	524876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_021040	ACA	2	6	524903	524908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_021040	AT	3	6	524915	524920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_021040	T	6	6	524923	524928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_021040	ATG	2	6	525034	525039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021040	T	6	6	525047	525052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021040	ATT	2	6	525053	525058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_021040	AACAAT	2	12	525059	525070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11027	NC_021040	A	6	6	525085	525090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_021040	TTA	2	6	525091	525096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_021040	TAA	2	6	525152	525157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021040	AGC	2	6	525173	525178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_021040	TAT	2	6	525193	525198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021040	TA	3	6	525286	525291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_021040	ATC	3	9	525292	525300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_021040	T	6	6	525304	525309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_021040	GAT	2	6	525395	525400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021040	TA	3	6	525402	525407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_021040	T	6	6	525486	525491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_021040	T	7	7	525503	525509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021040	TCA	2	6	525549	525554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_021040	ATA	2	6	525619	525624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021040	TAT	2	6	525661	525666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021040	AAT	2	6	525678	525683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_021040	A	8	8	525746	525753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021040	TAA	2	6	525754	525759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_021040	A	6	6	525768	525773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_021040	AG	3	6	525863	525868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021040	GTT	2	6	525900	525905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_021040	ATG	2	6	525910	525915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021040	TTA	2	6	525954	525959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_021040	GTA	2	6	525996	526001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_021040	AT	3	6	526073	526078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_021040	CATATA	2	12	526099	526110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11053	NC_021040	TAA	2	6	526178	526183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021040	TA	4	8	526184	526191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021040	TTA	2	6	526248	526253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021040	TAT	2	6	526345	526350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021040	A	6	6	526358	526363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021040	TTG	2	6	526423	526428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_021040	TAC	2	6	526470	526475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_021040	TA	3	6	526488	526493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021040	A	8	8	526560	526567	100 %	0 %	0 %	0 %	479202257
11062	NC_021040	ATT	2	6	526573	526578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202257
11063	NC_021040	GTTT	2	8	526587	526594	0 %	75 %	25 %	0 %	479202257
11064	NC_021040	TAT	2	6	526596	526601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202257
11065	NC_021040	TA	3	6	526625	526630	50 %	50 %	0 %	0 %	479202257
11066	NC_021040	AAATAA	2	12	526650	526661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479202257
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11068	NC_021040	AAT	2	6	526772	526777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021040	TTC	2	6	526794	526799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021040	ATT	2	6	526813	526818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_021040	AGCG	2	8	526828	526835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_021040	TAA	2	6	526844	526849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_021040	TATC	2	8	526860	526867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11074	NC_021040	CAG	2	6	526899	526904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202258
11075	NC_021040	GTG	2	6	526952	526957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202258
11076	NC_021040	GAAT	2	8	527043	527050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_021040	T	6	6	527109	527114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_021040	TCT	2	6	527128	527133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_021040	GTT	2	6	527177	527182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_021040	ATC	2	6	527199	527204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_021040	AAAG	2	8	527251	527258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_021040	A	6	6	527286	527291	100 %	0 %	0 %	0 %	479202259
11083	NC_021040	ATT	2	6	527388	527393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202259
11084	NC_021040	A	6	6	527408	527413	100 %	0 %	0 %	0 %	479202259
11085	NC_021040	CAGATA	2	12	527427	527438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479202259
11086	NC_021040	CCG	2	6	527561	527566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202259
11087	NC_021040	T	6	6	527570	527575	0 %	100 %	0 %	0 %	479202259
11088	NC_021040	TGA	2	6	527803	527808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202260
11089	NC_021040	TG	3	6	527890	527895	0 %	50 %	50 %	0 %	479202260
11090	NC_021040	GAA	2	6	527928	527933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202260
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11092	NC_021040	TA	3	6	528008	528013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_021040	GGAT	2	8	528102	528109	25 %	25 %	50 %	0 %	479202261
11094	NC_021040	T	6	6	528113	528118	0 %	100 %	0 %	0 %	479202261
11095	NC_021040	ATG	2	6	528155	528160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202261
11096	NC_021040	A	8	8	528192	528199	100 %	0 %	0 %	0 %	479202261
11097	NC_021040	AGAA	2	8	528231	528238	75 %	0 %	25 %	0 %	479202261
11098	NC_021040	AATGC	2	10	528251	528260	40 %	20 %	20 %	20 %	479202261
11099	NC_021040	AGA	2	6	528287	528292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202261
11100	NC_021040	TTC	2	6	528301	528306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202261
11101	NC_021040	CTG	2	6	528381	528386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202261
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11103	NC_021040	A	6	6	528440	528445	100 %	0 %	0 %	0 %	479202261
11104	NC_021040	GAA	2	6	528446	528451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202261
11105	NC_021040	TC	3	6	528454	528459	0 %	50 %	0 %	50 %	479202261
11106	NC_021040	GTC	2	6	528542	528547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202261
11107	NC_021040	AAG	2	6	528552	528557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202261
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11109	NC_021040	GAA	2	6	528602	528607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202261
11110	NC_021040	CCGG	2	8	528649	528656	0 %	0 %	50 %	50 %	479202261
11111	NC_021040	CAA	2	6	528792	528797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202261
11112	NC_021040	ATC	2	6	528815	528820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202261
11113	NC_021040	GAAG	2	8	528862	528869	50 %	0 %	50 %	0 %	479202261
11114	NC_021040	TGAT	2	8	528918	528925	25 %	50 %	25 %	0 %	479202261
11115	NC_021040	ATC	2	6	528943	528948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202261
11116	NC_021040	GA	3	6	529019	529024	50 %	0 %	50 %	0 %	479202261
11117	NC_021040	TGC	2	6	529168	529173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_021040	A	6	6	529186	529191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_021040	AGC	2	6	529206	529211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_021040	GAAA	2	8	529213	529220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_021040	AGT	2	6	529333	529338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202262
11122	NC_021040	TA	3	6	529413	529418	50 %	50 %	0 %	0 %	479202262
11123	NC_021040	GAT	2	6	529454	529459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202262
11124	NC_021040	ATA	3	9	529476	529484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202262
11125	NC_021040	CCG	2	6	529520	529525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202262
11126	NC_021040	GTG	2	6	529552	529557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202262
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11128	NC_021040	CTG	2	6	529599	529604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11254	NC_021040	AT	3	6	533987	533992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_021040	CAATC	2	10	534075	534084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11260	NC_021040	GTA	2	6	534162	534167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11261	NC_021040	TA	3	6	534193	534198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_021040	A	6	6	534316	534321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11263	NC_021040	ATG	2	6	534394	534399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202266
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11269	NC_021040	CAA	2	6	534814	534819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11270	NC_021040	ATGA	2	8	534824	534831	50 %	25 %	25 %	0 %	479202267
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11498	NC_021040	GAG	2	6	545233	545238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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