MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021040	TCAG	2	8	331810	331817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7002	NC_021040	TGC	2	6	331836	331841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_021040	TGGA	2	8	331849	331856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_021040	GA	3	6	331855	331860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_021040	A	7	7	331881	331887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021040	CAG	2	6	331905	331910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_021040	TCA	2	6	331919	331924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_021040	TGT	2	6	331932	331937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021040	GA	3	6	331984	331989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_021040	AAC	2	6	332045	332050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_021040	AGA	2	6	332056	332061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021040	TA	3	6	332088	332093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_021040	AATTTT	2	12	332122	332133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_021040	ATC	2	6	332196	332201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_021040	TAT	2	6	332205	332210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_021040	TGGG	2	8	332216	332223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_021040	AAG	2	6	332237	332242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021040	ATC	2	6	332360	332365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_021040	AAAGG	2	10	332381	332390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_021040	CTG	2	6	332444	332449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_021040	ACCG	2	8	332470	332477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_021040	TTA	2	6	332495	332500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021040	GTTATT	2	12	332564	332575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021040	GGTA	2	8	332584	332591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_021040	GCA	2	6	332654	332659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_021040	CTTT	2	8	332688	332695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7027	NC_021040	CA	3	6	332743	332748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_021040	CTTC	2	8	332782	332789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7029	NC_021040	AGAC	2	8	332832	332839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_021040	CTT	2	6	332840	332845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_021040	TAT	2	6	332882	332887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021040	TAT	2	6	332908	332913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_021040	GAG	2	6	332978	332983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021040	CAG	3	9	333017	333025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202110
7035	NC_021040	A	7	7	333034	333040	100 %	0 %	0 %	0 %	479202110
7036	NC_021040	GTG	2	6	333041	333046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202110
7037	NC_021040	GA	3	6	333167	333172	50 %	0 %	50 %	0 %	479202110
7038	NC_021040	TAA	2	6	333216	333221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202110
7039	NC_021040	ATT	2	6	333231	333236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202110
7040	NC_021040	CAT	2	6	333306	333311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202110
7041	NC_021040	GAT	2	6	333393	333398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202110
7042	NC_021040	ATC	2	6	333496	333501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202110
7043	NC_021040	T	6	6	333547	333552	0 %	100 %	0 %	0 %	479202110
7044	NC_021040	ATC	2	6	333649	333654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202110
7045	NC_021040	TA	3	6	333656	333661	50 %	50 %	0 %	0 %	479202110
7046	NC_021040	GCA	2	6	333808	333813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202110
7047	NC_021040	GT	3	6	333944	333949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_021040	GTTT	2	8	333989	333996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021040	CT	3	6	334000	334005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_021040	CTT	2	6	334127	334132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_021040	AGT	2	6	334144	334149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_021040	AT	3	6	334232	334237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021040	TCA	2	6	334336	334341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202111
7054	NC_021040	GAATG	2	10	334362	334371	40 %	20 %	40 %	0 %	479202111
7055	NC_021040	AGG	2	6	334442	334447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202111
7056	NC_021040	G	6	6	334446	334451	0 %	0 %	100 %	0 %	479202111
7057	NC_021040	TGA	2	6	334506	334511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202111
7058	NC_021040	T	6	6	334549	334554	0 %	100 %	0 %	0 %	479202111
7059	NC_021040	ATG	2	6	334703	334708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202111
7060	NC_021040	TCC	2	6	334828	334833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202111
7061	NC_021040	GCA	2	6	334855	334860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202111
7062	NC_021040	GGAG	2	8	334881	334888	25 %	0 %	75 %	0 %	479202111
7063	NC_021040	TAT	2	6	334984	334989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202111
7064	NC_021040	TGA	2	6	335046	335051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202111
7065	NC_021040	GCA	2	6	335110	335115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202111
7066	NC_021040	A	6	6	335188	335193	100 %	0 %	0 %	0 %	479202111
7067	NC_021040	TTA	2	6	335448	335453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202111
7068	NC_021040	TAT	2	6	335530	335535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202111
7069	NC_021040	CTG	2	6	335636	335641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202111
7070	NC_021040	AGG	2	6	335684	335689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202111
7071	NC_021040	GAG	2	6	335779	335784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202111
7072	NC_021040	GAT	2	6	335794	335799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202111
7073	NC_021040	CTG	2	6	335941	335946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202111
7074	NC_021040	AGA	2	6	335955	335960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202111
7075	NC_021040	GGT	2	6	336003	336008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202111
7076	NC_021040	ATA	2	6	336018	336023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202111
7077	NC_021040	GCAG	2	8	336065	336072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_021040	TGCC	2	8	336078	336085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_021040	TAG	2	6	336094	336099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202112
7080	NC_021040	CAG	2	6	336102	336107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202112
7081	NC_021040	AGC	2	6	336167	336172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202112
7082	NC_021040	CAT	2	6	336248	336253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202112
7083	NC_021040	GAT	2	6	336269	336274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202112
7084	NC_021040	CAT	2	6	336293	336298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202112
7085	NC_021040	CTT	2	6	336332	336337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202112
7086	NC_021040	CGC	2	6	336383	336388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202112
7087	NC_021040	ATC	2	6	336397	336402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202112
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7089	NC_021040	ATC	2	6	336447	336452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202112
7090	NC_021040	GCT	2	6	336485	336490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202112
7091	NC_021040	ATG	2	6	336571	336576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202112
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7093	NC_021040	AAATA	2	10	336651	336660	80 %	20 %	0 %	0 %	479202112
7094	NC_021040	T	7	7	336727	336733	0 %	100 %	0 %	0 %	479202112
7095	NC_021040	AT	3	6	336785	336790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021040	A	7	7	336791	336797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021040	A	6	6	336800	336805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_021040	A	6	6	336829	336834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021040	AAT	2	6	336953	336958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202113
7100	NC_021040	A	6	6	336990	336995	100 %	0 %	0 %	0 %	479202113
7101	NC_021040	GCC	2	6	336997	337002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202113
7102	NC_021040	GAAA	2	8	337004	337011	75 %	0 %	25 %	0 %	479202113
7103	NC_021040	GTT	2	6	337053	337058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202113
7104	NC_021040	TTC	2	6	337096	337101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202113
7105	NC_021040	G	6	6	337228	337233	0 %	0 %	100 %	0 %	479202113
7106	NC_021040	A	7	7	337282	337288	100 %	0 %	0 %	0 %	479202113
7107	NC_021040	GC	3	6	337332	337337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_021040	TCA	2	6	337350	337355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_021040	T	7	7	337387	337393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021040	CA	3	6	337417	337422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_021040	T	6	6	337456	337461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_021040	ATT	2	6	337470	337475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_021040	ATT	2	6	337501	337506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021040	A	7	7	337552	337558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021040	TTA	2	6	337566	337571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021040	AAC	2	6	337604	337609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_021040	A	6	6	337657	337662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021040	T	6	6	337698	337703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_021040	TATGA	2	10	337829	337838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_021040	GAT	2	6	337916	337921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021040	TAAA	2	8	338034	338041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_021040	GGC	2	6	338069	338074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_021040	AG	3	6	338182	338187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021040	ACA	2	6	338238	338243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_021040	GCA	2	6	338262	338267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_021040	GCA	2	6	338288	338293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_021040	GAAG	2	8	338317	338324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7129	NC_021040	TGA	2	6	338416	338421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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