MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021040	AC	3	6	2544304	2544309	50 %	0 %	0 %	50 %	479203934
53002	NC_021040	TGC	2	6	2544317	2544322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203934
53003	NC_021040	TGAT	2	8	2544339	2544346	25 %	50 %	25 %	0 %	479203934
53004	NC_021040	CTG	2	6	2544359	2544364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203934
53005	NC_021040	TG	3	6	2544372	2544377	0 %	50 %	50 %	0 %	479203934
53006	NC_021040	T	6	6	2544381	2544386	0 %	100 %	0 %	0 %	479203934
53007	NC_021040	GATCGT	2	12	2544416	2544427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479203934
53008	NC_021040	CTG	2	6	2544463	2544468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203934
53009	NC_021040	CAT	2	6	2544491	2544496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203934
53010	NC_021040	CAT	2	6	2544506	2544511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203934
53011	NC_021040	TGA	2	6	2544607	2544612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203934
53012	NC_021040	CCT	2	6	2544631	2544636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203934
53013	NC_021040	CTG	2	6	2544668	2544673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203934
53014	NC_021040	T	6	6	2544695	2544700	0 %	100 %	0 %	0 %	479203934
53015	NC_021040	CAT	2	6	2544779	2544784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203934
53016	NC_021040	TGA	2	6	2544817	2544822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203934
53017	NC_021040	CAT	2	6	2544865	2544870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203934
53018	NC_021040	TCT	2	6	2544973	2544978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203934
53019	NC_021040	CA	3	6	2545029	2545034	50 %	0 %	0 %	50 %	479203934
53020	NC_021040	GCC	2	6	2545182	2545187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203934
53021	NC_021040	AAT	2	6	2545205	2545210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203934
53022	NC_021040	TGC	2	6	2545320	2545325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203934
53023	NC_021040	GACA	2	8	2545356	2545363	50 %	0 %	25 %	25 %	479203935
53024	NC_021040	CTG	2	6	2545416	2545421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53025	NC_021040	TTC	2	6	2545446	2545451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203935
53026	NC_021040	CGA	2	6	2545466	2545471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53027	NC_021040	CAT	2	6	2545478	2545483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53028	NC_021040	ATG	2	6	2545537	2545542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203935
53029	NC_021040	TCA	2	6	2545621	2545626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53030	NC_021040	TGC	2	6	2545773	2545778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53031	NC_021040	TTC	2	6	2545881	2545886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203935
53032	NC_021040	CAT	2	6	2545952	2545957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53033	NC_021040	GAT	2	6	2546010	2546015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203935
53034	NC_021040	TCC	2	6	2546053	2546058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203935
53035	NC_021040	TTC	2	6	2546133	2546138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203935
53036	NC_021040	T	6	6	2546143	2546148	0 %	100 %	0 %	0 %	479203935
53037	NC_021040	TCT	2	6	2546152	2546157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203935
53038	NC_021040	CTG	2	6	2546195	2546200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53039	NC_021040	CTG	2	6	2546204	2546209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53040	NC_021040	ATC	3	9	2546260	2546268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53041	NC_021040	TGA	2	6	2546276	2546281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203935
53042	NC_021040	GC	3	6	2546327	2546332	0 %	0 %	50 %	50 %	479203935
53043	NC_021040	AGA	2	6	2546356	2546361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203935
53044	NC_021040	CAT	2	6	2546373	2546378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53045	NC_021040	CAT	2	6	2546385	2546390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53046	NC_021040	GCA	2	6	2546443	2546448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203935
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53048	NC_021040	TC	3	6	2546513	2546518	0 %	50 %	0 %	50 %	479203935
53049	NC_021040	AAT	2	6	2546625	2546630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203935
53050	NC_021040	ATCC	2	8	2546632	2546639	25 %	25 %	0 %	50 %	479203935
53051	NC_021040	GAT	2	6	2546658	2546663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203935
53052	NC_021040	ATC	2	6	2546713	2546718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
53053	NC_021040	CTG	2	6	2546739	2546744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
53054	NC_021040	ACC	2	6	2546815	2546820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203935
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53056	NC_021040	AAG	2	6	2546910	2546915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203935
53057	NC_021040	ATCG	2	8	2547051	2547058	25 %	25 %	25 %	25 %	479203935
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53059	NC_021040	CGT	2	6	2547173	2547178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203935
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53061	NC_021040	CT	3	6	2547292	2547297	0 %	50 %	0 %	50 %	479203935
53062	NC_021040	TCA	2	6	2547335	2547340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203935
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53068	NC_021040	AAT	2	6	2547549	2547554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203935
53069	NC_021040	CAC	2	6	2547586	2547591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203935
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53072	NC_021040	GCT	2	6	2547801	2547806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203936
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53077	NC_021040	TAAA	2	8	2548115	2548122	75 %	25 %	0 %	0 %	479203936
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53080	NC_021040	TTAT	2	8	2548179	2548186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53081	NC_021040	T	6	6	2548269	2548274	0 %	100 %	0 %	0 %	479203937
53082	NC_021040	GCA	2	6	2548290	2548295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203937
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53084	NC_021040	TGC	2	6	2548307	2548312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203937
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53087	NC_021040	CA	3	6	2548369	2548374	50 %	0 %	0 %	50 %	479203937
53088	NC_021040	CTG	2	6	2548400	2548405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203937
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53100	NC_021040	TCC	2	6	2548673	2548678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203937
53101	NC_021040	A	6	6	2548681	2548686	100 %	0 %	0 %	0 %	479203937
53102	NC_021040	GATC	2	8	2548692	2548699	25 %	25 %	25 %	25 %	479203937
53103	NC_021040	CA	3	6	2548705	2548710	50 %	0 %	0 %	50 %	479203937
53104	NC_021040	T	6	6	2548810	2548815	0 %	100 %	0 %	0 %	479203937
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53108	NC_021040	CTT	3	9	2548947	2548955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203937
53109	NC_021040	T	6	6	2548959	2548964	0 %	100 %	0 %	0 %	479203937
53110	NC_021040	ATC	2	6	2549052	2549057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53111	NC_021040	T	6	6	2549061	2549066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_021040	AACC	2	8	2549073	2549080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53113	NC_021040	CCT	2	6	2549082	2549087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53114	NC_021040	TCT	2	6	2549107	2549112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53115	NC_021040	ATT	2	6	2549221	2549226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53117	NC_021040	AGA	2	6	2549292	2549297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203939
53118	NC_021040	A	7	7	2549310	2549316	100 %	0 %	0 %	0 %	479203939
53119	NC_021040	ATC	2	6	2549374	2549379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203939
53120	NC_021040	CTGT	2	8	2549408	2549415	0 %	50 %	25 %	25 %	479203939
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53124	NC_021040	TAC	2	6	2549502	2549507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203939
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53144	NC_021040	T	6	6	2550330	2550335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53145	NC_021040	ATT	2	6	2550336	2550341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53154	NC_021040	CTT	2	6	2550928	2550933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203940
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53156	NC_021040	A	7	7	2551031	2551037	100 %	0 %	0 %	0 %	479203940
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53161	NC_021040	CTTT	2	8	2551287	2551294	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53162	NC_021040	T	6	6	2551307	2551312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53163	NC_021040	T	6	6	2551355	2551360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53164	NC_021040	ATC	2	6	2551364	2551369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53169	NC_021040	A	6	6	2551633	2551638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53172	NC_021040	A	8	8	2551715	2551722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53176	NC_021040	A	6	6	2551873	2551878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53199	NC_021040	ACC	2	6	2552560	2552565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53202	NC_021040	CCA	2	6	2552675	2552680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53203	NC_021040	AGCAA	2	10	2552714	2552723	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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53216	NC_021040	TCC	2	6	2553371	2553376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53222	NC_021040	ATCAGA	2	12	2553657	2553668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53223	NC_021040	GACA	2	8	2553673	2553680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53224	NC_021040	CCT	2	6	2553842	2553847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53225	NC_021040	ATC	2	6	2553853	2553858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53226	NC_021040	CTT	2	6	2553889	2553894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203943
53227	NC_021040	CAA	2	6	2553900	2553905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203943
53228	NC_021040	ATGT	2	8	2553907	2553914	25 %	50 %	25 %	0 %	479203943
53229	NC_021040	GCT	2	6	2553946	2553951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203943
53230	NC_021040	CTA	2	6	2554011	2554016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203943
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53233	NC_021040	TG	3	6	2554162	2554167	0 %	50 %	50 %	0 %	479203943
53234	NC_021040	TTC	2	6	2554171	2554176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203943
53235	NC_021040	CCTG	2	8	2554190	2554197	0 %	25 %	25 %	50 %	479203943
53236	NC_021040	GAAA	2	8	2554308	2554315	75 %	0 %	25 %	0 %	479203943
53237	NC_021040	CT	3	6	2554368	2554373	0 %	50 %	0 %	50 %	479203943
53238	NC_021040	ACC	2	6	2554385	2554390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203944
53239	NC_021040	TTTC	2	8	2554391	2554398	0 %	75 %	0 %	25 %	479203944
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53241	NC_021040	T	7	7	2554446	2554452	0 %	100 %	0 %	0 %	479203944
53242	NC_021040	AT	3	6	2554478	2554483	50 %	50 %	0 %	0 %	479203944
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53350	NC_021040	TCT	2	6	2559687	2559692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53362	NC_021040	TCC	2	6	2560484	2560489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53363	NC_021040	ATC	2	6	2560537	2560542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53364	NC_021040	AAT	2	6	2560793	2560798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53365	NC_021040	ATGACC	2	12	2560835	2560846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53369	NC_021040	TCCA	2	8	2560991	2560998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53370	NC_021040	GATT	2	8	2561049	2561056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53467	NC_021040	TGC	2	6	2566162	2566167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53468	NC_021040	ATGTC	2	10	2566242	2566251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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53470	NC_021040	CCGT	2	8	2566343	2566350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53471	NC_021040	GTAT	2	8	2566372	2566379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53483	NC_021040	CGT	2	6	2566878	2566883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203954
53484	NC_021040	ATGT	2	8	2566922	2566929	25 %	50 %	25 %	0 %	479203954
53485	NC_021040	TCT	2	6	2567081	2567086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203954
53486	NC_021040	CCTT	2	8	2567098	2567105	0 %	50 %	0 %	50 %	479203954
53487	NC_021040	CCA	2	6	2567150	2567155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203954
53488	NC_021040	AAG	3	9	2567157	2567165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203954
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53490	NC_021040	T	8	8	2567198	2567205	0 %	100 %	0 %	0 %	479203954
53491	NC_021040	CTG	2	6	2567223	2567228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203954
53492	NC_021040	CAC	2	6	2567260	2567265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203955
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53498	NC_021040	C	6	6	2567656	2567661	0 %	0 %	0 %	100 %	479203955
53499	NC_021040	A	8	8	2567668	2567675	100 %	0 %	0 %	0 %	479203955
53500	NC_021040	ATG	2	6	2567691	2567696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203955

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