MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_021040	GATCA	2	10	2519945	2519954	40 %	20 %	20 %	20 %	479203913
52502	NC_021040	ATACC	2	10	2519980	2519989	40 %	20 %	0 %	40 %	479203913
52503	NC_021040	T	7	7	2520027	2520033	0 %	100 %	0 %	0 %	479203913
52504	NC_021040	TTG	2	6	2520045	2520050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203913
52505	NC_021040	TCCT	2	8	2520059	2520066	0 %	50 %	0 %	50 %	479203913
52506	NC_021040	CATA	2	8	2520172	2520179	50 %	25 %	0 %	25 %	479203913
52507	NC_021040	GACT	2	8	2520235	2520242	25 %	25 %	25 %	25 %	479203913
52508	NC_021040	GTG	2	6	2520243	2520248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203913
52509	NC_021040	CTGCAT	2	12	2520250	2520261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479203913
52510	NC_021040	GCAG	2	8	2520357	2520364	25 %	0 %	50 %	25 %	479203913
52511	NC_021040	ATGG	2	8	2520392	2520399	25 %	25 %	50 %	0 %	479203913
52512	NC_021040	GAT	2	6	2520494	2520499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203913
52513	NC_021040	TTG	2	6	2520582	2520587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203913
52514	NC_021040	AAAAT	2	10	2520605	2520614	80 %	20 %	0 %	0 %	479203913
52515	NC_021040	AGTA	2	8	2520631	2520638	50 %	25 %	25 %	0 %	479203913
52516	NC_021040	CAT	2	6	2520643	2520648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203913
52517	NC_021040	GTT	2	6	2520651	2520656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203913
52518	NC_021040	TCC	2	6	2520679	2520684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203913
52519	NC_021040	A	6	6	2520711	2520716	100 %	0 %	0 %	0 %	479203913
52520	NC_021040	TTC	2	6	2520737	2520742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203913
52521	NC_021040	GAA	2	6	2520760	2520765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203913
52522	NC_021040	TTC	2	6	2520783	2520788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203913
52523	NC_021040	TCC	2	6	2520830	2520835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203913
52524	NC_021040	ATA	2	6	2520871	2520876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203913
52525	NC_021040	T	7	7	2520877	2520883	0 %	100 %	0 %	0 %	479203913
52526	NC_021040	TTC	2	6	2520916	2520921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52527	NC_021040	T	6	6	2520958	2520963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52528	NC_021040	ATCG	2	8	2521085	2521092	25 %	25 %	25 %	25 %	479203914
52529	NC_021040	CT	3	6	2521141	2521146	0 %	50 %	0 %	50 %	479203914
52530	NC_021040	TGT	2	6	2521160	2521165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203914
52531	NC_021040	TCG	2	6	2521183	2521188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203914
52532	NC_021040	GAT	2	6	2521301	2521306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203914
52533	NC_021040	ATCAT	2	10	2521428	2521437	40 %	40 %	0 %	20 %	479203914
52534	NC_021040	T	6	6	2521538	2521543	0 %	100 %	0 %	0 %	479203914
52535	NC_021040	AGC	2	6	2521611	2521616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203914
52536	NC_021040	TCA	3	9	2521692	2521700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203914
52537	NC_021040	ATA	2	6	2521707	2521712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203914
52538	NC_021040	TAA	2	6	2521718	2521723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203914
52539	NC_021040	ATC	2	6	2521742	2521747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203914
52540	NC_021040	CCT	2	6	2521782	2521787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52541	NC_021040	TAT	2	6	2521825	2521830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52542	NC_021040	ATT	2	6	2521836	2521841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52543	NC_021040	TGA	2	6	2521849	2521854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52544	NC_021040	ATT	2	6	2521872	2521877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52545	NC_021040	GTC	2	6	2521890	2521895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52546	NC_021040	ATT	2	6	2521923	2521928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203915
52547	NC_021040	AAT	2	6	2521933	2521938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203915
52548	NC_021040	ATCC	2	8	2521944	2521951	25 %	25 %	0 %	50 %	479203915
52549	NC_021040	GCT	2	6	2522100	2522105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52550	NC_021040	T	7	7	2522113	2522119	0 %	100 %	0 %	0 %	479203915
52551	NC_021040	TTC	2	6	2522149	2522154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203915
52552	NC_021040	TTC	2	6	2522225	2522230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203915
52553	NC_021040	ATCA	2	8	2522311	2522318	50 %	25 %	0 %	25 %	479203915
52554	NC_021040	GTT	2	6	2522448	2522453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203915
52555	NC_021040	T	6	6	2522515	2522520	0 %	100 %	0 %	0 %	479203915
52556	NC_021040	CTG	3	9	2522521	2522529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52557	NC_021040	ATA	2	6	2522626	2522631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203915
52558	NC_021040	CTGTT	2	10	2522636	2522645	0 %	60 %	20 %	20 %	479203915
52559	NC_021040	TGC	2	6	2522654	2522659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52560	NC_021040	CAG	2	6	2522710	2522715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52561	NC_021040	CTG	2	6	2522748	2522753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52562	NC_021040	ATC	2	6	2522761	2522766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203915
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52565	NC_021040	TG	3	6	2522970	2522975	0 %	50 %	50 %	0 %	479203915
52566	NC_021040	ATTCTC	2	12	2522998	2523009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479203915
52567	NC_021040	TGTC	2	8	2523012	2523019	0 %	50 %	25 %	25 %	479203915
52568	NC_021040	TGC	2	6	2523071	2523076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203915
52569	NC_021040	TTA	2	6	2523104	2523109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203915
52570	NC_021040	CAT	2	6	2523220	2523225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203915
52571	NC_021040	T	7	7	2523254	2523260	0 %	100 %	0 %	0 %	479203915
52572	NC_021040	GATA	2	8	2523267	2523274	50 %	25 %	25 %	0 %	479203915
52573	NC_021040	A	7	7	2523321	2523327	100 %	0 %	0 %	0 %	479203915
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52576	NC_021040	CCG	2	6	2523354	2523359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203915
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52582	NC_021040	CTTTC	2	10	2523893	2523902	0 %	60 %	0 %	40 %	479203916
52583	NC_021040	TCAC	2	8	2523972	2523979	25 %	25 %	0 %	50 %	479203916
52584	NC_021040	TGC	2	6	2523992	2523997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203916
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52587	NC_021040	AT	3	6	2524071	2524076	50 %	50 %	0 %	0 %	479203916
52588	NC_021040	AT	3	6	2524116	2524121	50 %	50 %	0 %	0 %	479203916
52589	NC_021040	TCC	3	9	2524154	2524162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203916
52590	NC_021040	CTG	2	6	2524174	2524179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203916
52591	NC_021040	TCT	2	6	2524188	2524193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203916
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52594	NC_021040	AT	3	6	2524550	2524555	50 %	50 %	0 %	0 %	479203916
52595	NC_021040	A	6	6	2524604	2524609	100 %	0 %	0 %	0 %	479203916
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52597	NC_021040	TC	5	10	2524667	2524676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52598	NC_021040	A	7	7	2524697	2524703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52599	NC_021040	TAT	2	6	2524733	2524738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52600	NC_021040	T	6	6	2524745	2524750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52601	NC_021040	TTAT	2	8	2524764	2524771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52602	NC_021040	CTGCC	2	10	2524777	2524786	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52603	NC_021040	AC	3	6	2524795	2524800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52604	NC_021040	T	7	7	2524806	2524812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52605	NC_021040	ATTTTT	2	12	2524816	2524827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479203917
52606	NC_021040	T	6	6	2524830	2524835	0 %	100 %	0 %	0 %	479203917
52607	NC_021040	TG	3	6	2525028	2525033	0 %	50 %	50 %	0 %	479203917
52608	NC_021040	GAT	2	6	2525039	2525044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203917
52609	NC_021040	GT	3	6	2525048	2525053	0 %	50 %	50 %	0 %	479203917
52610	NC_021040	TCA	2	6	2525121	2525126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203917
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52612	NC_021040	TCG	2	6	2525268	2525273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203917
52613	NC_021040	ACA	2	6	2525322	2525327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203917
52614	NC_021040	T	6	6	2525387	2525392	0 %	100 %	0 %	0 %	479203917
52615	NC_021040	T	6	6	2525429	2525434	0 %	100 %	0 %	0 %	479203917
52616	NC_021040	T	6	6	2525442	2525447	0 %	100 %	0 %	0 %	479203917
52617	NC_021040	AGC	2	6	2525496	2525501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203917
52618	NC_021040	TTCGC	2	10	2525511	2525520	0 %	40 %	20 %	40 %	479203917
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52620	NC_021040	ATC	2	6	2525627	2525632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203917
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52980	NC_021040	TCA	2	6	2543117	2543122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203933
52981	NC_021040	AT	3	6	2543134	2543139	50 %	50 %	0 %	0 %	479203933
52982	NC_021040	ATCA	2	8	2543212	2543219	50 %	25 %	0 %	25 %	479203933
52983	NC_021040	A	6	6	2543232	2543237	100 %	0 %	0 %	0 %	479203933
52984	NC_021040	GAT	2	6	2543264	2543269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203933
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