MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_021040	AGACA	2	10	2422218	2422227	60 %	0 %	20 %	20 %	479203826
50502	NC_021040	TC	3	6	2422257	2422262	0 %	50 %	0 %	50 %	479203826
50503	NC_021040	CA	3	6	2422291	2422296	50 %	0 %	0 %	50 %	479203826
50504	NC_021040	TGA	2	6	2422342	2422347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203826
50505	NC_021040	ATA	2	6	2422429	2422434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50506	NC_021040	GCA	2	6	2422498	2422503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203827
50507	NC_021040	A	6	6	2422503	2422508	100 %	0 %	0 %	0 %	479203827
50508	NC_021040	CTG	2	6	2422583	2422588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203827
50509	NC_021040	GCA	2	6	2422630	2422635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203827
50510	NC_021040	TTA	2	6	2422639	2422644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203827
50511	NC_021040	TGC	2	6	2422653	2422658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203827
50512	NC_021040	TGCA	2	8	2422704	2422711	25 %	25 %	25 %	25 %	479203827
50513	NC_021040	ACG	2	6	2422781	2422786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203827
50514	NC_021040	AT	3	6	2422848	2422853	50 %	50 %	0 %	0 %	479203827
50515	NC_021040	GCG	2	6	2422880	2422885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203827
50516	NC_021040	CAA	2	6	2422923	2422928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203827
50517	NC_021040	A	6	6	2422948	2422953	100 %	0 %	0 %	0 %	479203827
50518	NC_021040	TATC	2	8	2422973	2422980	25 %	50 %	0 %	25 %	479203827
50519	NC_021040	GCG	2	6	2423021	2423026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203827
50520	NC_021040	CTT	2	6	2423043	2423048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203827
50521	NC_021040	TCA	2	6	2423107	2423112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203828
50522	NC_021040	CAG	2	6	2423113	2423118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203828
50523	NC_021040	TAA	2	6	2423125	2423130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203828
50524	NC_021040	CATA	2	8	2423139	2423146	50 %	25 %	0 %	25 %	479203828
50525	NC_021040	ATC	2	6	2423188	2423193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203828
50526	NC_021040	AT	3	6	2423270	2423275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50527	NC_021040	ATA	2	6	2423281	2423286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50528	NC_021040	A	6	6	2423319	2423324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50529	NC_021040	TTTG	2	8	2423328	2423335	0 %	75 %	25 %	0 %	479203829
50530	NC_021040	TCC	2	6	2423353	2423358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203829
50531	NC_021040	GCT	2	6	2423371	2423376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203829
50532	NC_021040	CAT	2	6	2423387	2423392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203829
50533	NC_021040	CAT	2	6	2423426	2423431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203829
50534	NC_021040	TGT	2	6	2423517	2423522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203829
50535	NC_021040	ACC	2	6	2423571	2423576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203829
50536	NC_021040	TTTTC	2	10	2423588	2423597	0 %	80 %	0 %	20 %	479203829
50537	NC_021040	CCA	2	6	2423636	2423641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203829
50538	NC_021040	GAT	2	6	2423649	2423654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203829
50539	NC_021040	ACT	2	6	2423683	2423688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203829
50540	NC_021040	TGT	2	6	2423694	2423699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203829
50541	NC_021040	TGT	2	6	2423736	2423741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203829
50542	NC_021040	TGT	2	6	2423750	2423755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203829
50543	NC_021040	ATA	2	6	2423761	2423766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203829
50544	NC_021040	A	6	6	2423796	2423801	100 %	0 %	0 %	0 %	479203830
50545	NC_021040	CCTG	2	8	2424142	2424149	0 %	25 %	25 %	50 %	479203830
50546	NC_021040	TTA	2	6	2424190	2424195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203830
50547	NC_021040	TCTT	2	8	2424316	2424323	0 %	75 %	0 %	25 %	479203830
50548	NC_021040	CTG	2	6	2424335	2424340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203830
50549	NC_021040	TTC	2	6	2424450	2424455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203830
50550	NC_021040	TCC	2	6	2424463	2424468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203830
50551	NC_021040	AGC	2	6	2424562	2424567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203830
50552	NC_021040	TCT	2	6	2424598	2424603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203830
50553	NC_021040	CAG	2	6	2424657	2424662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203830
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50555	NC_021040	CAG	2	6	2424681	2424686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203830
50556	NC_021040	ATT	2	6	2424697	2424702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203830
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50558	NC_021040	TCA	2	6	2424833	2424838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203831
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50570	NC_021040	TAA	2	6	2425258	2425263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203832
50571	NC_021040	CAT	2	6	2425272	2425277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203832
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50574	NC_021040	AT	3	6	2425345	2425350	50 %	50 %	0 %	0 %	479203832
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50582	NC_021040	T	6	6	2425562	2425567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50583	NC_021040	ATA	2	6	2425568	2425573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50584	NC_021040	TAA	2	6	2425583	2425588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50585	NC_021040	TCAT	2	8	2425621	2425628	25 %	50 %	0 %	25 %	479203833
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50588	NC_021040	CTG	2	6	2425788	2425793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203833
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50601	NC_021040	CGG	2	6	2426407	2426412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479203833
50602	NC_021040	TGC	2	6	2426443	2426448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203833
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50605	NC_021040	TCT	2	6	2426877	2426882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203833
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50607	NC_021040	ATT	2	6	2426914	2426919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203833
50608	NC_021040	A	6	6	2426938	2426943	100 %	0 %	0 %	0 %	479203833
50609	NC_021040	CAGA	2	8	2426968	2426975	50 %	0 %	25 %	25 %	479203833
50610	NC_021040	T	6	6	2427020	2427025	0 %	100 %	0 %	0 %	479203833
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50613	NC_021040	TAG	2	6	2427051	2427056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203833
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50617	NC_021040	CAT	2	6	2427167	2427172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203834
50618	NC_021040	TCC	2	6	2427191	2427196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203834
50619	NC_021040	AGC	2	6	2427358	2427363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203834
50620	NC_021040	TTC	2	6	2427407	2427412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203834
50621	NC_021040	A	6	6	2427424	2427429	100 %	0 %	0 %	0 %	479203834
50622	NC_021040	CAA	2	6	2427442	2427447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203834
50623	NC_021040	GCC	2	6	2427494	2427499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203834
50624	NC_021040	GCA	2	6	2427621	2427626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203834
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50626	NC_021040	ACC	2	6	2427644	2427649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203834
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50628	NC_021040	TC	3	6	2427729	2427734	0 %	50 %	0 %	50 %	479203834
50629	NC_021040	GCC	2	6	2427762	2427767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203834
50630	NC_021040	TGCC	2	8	2427817	2427824	0 %	25 %	25 %	50 %	479203834
50631	NC_021040	A	6	6	2427827	2427832	100 %	0 %	0 %	0 %	479203834
50632	NC_021040	GCA	2	6	2427936	2427941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203834
50633	NC_021040	ATC	2	6	2427957	2427962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203834
50634	NC_021040	TAA	2	6	2428027	2428032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203834
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50639	NC_021040	A	7	7	2428287	2428293	100 %	0 %	0 %	0 %	479203834
50640	NC_021040	TCTG	2	8	2428294	2428301	0 %	50 %	25 %	25 %	479203834
50641	NC_021040	CTG	2	6	2428335	2428340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203834
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50644	NC_021040	T	6	6	2428514	2428519	0 %	100 %	0 %	0 %	479203835
50645	NC_021040	CGT	2	6	2428560	2428565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203835
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50647	NC_021040	TAT	2	6	2428652	2428657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203835
50648	NC_021040	TAAA	2	8	2428710	2428717	75 %	25 %	0 %	0 %	479203835
50649	NC_021040	AC	3	6	2428768	2428773	50 %	0 %	0 %	50 %	479203835
50650	NC_021040	TG	3	6	2428820	2428825	0 %	50 %	50 %	0 %	479203835
50651	NC_021040	TCA	2	6	2428990	2428995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203835
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50654	NC_021040	TCT	2	6	2429137	2429142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203835
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50672	NC_021040	TCT	2	6	2429845	2429850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203835
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50681	NC_021040	TAACAG	2	12	2430205	2430216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479203835
50682	NC_021040	TCA	3	9	2430329	2430337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203835
50683	NC_021040	GTAT	2	8	2430376	2430383	25 %	50 %	25 %	0 %	479203835
50684	NC_021040	AAT	2	6	2430435	2430440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203835
50685	NC_021040	ATA	2	6	2430462	2430467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203835
50686	NC_021040	GCA	2	6	2430470	2430475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203835
50687	NC_021040	AAT	2	6	2430514	2430519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203835
50688	NC_021040	TTC	2	6	2430582	2430587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203835
50689	NC_021040	ATT	2	6	2430597	2430602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203835
50690	NC_021040	GCC	2	6	2430627	2430632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203835
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50693	NC_021040	CTA	2	6	2430836	2430841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50694	NC_021040	CTGTT	2	10	2430860	2430869	0 %	60 %	20 %	20 %	479203836
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50698	NC_021040	TTTCTT	2	12	2431051	2431062	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479203836
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50701	NC_021040	CCG	2	6	2431275	2431280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203836
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50703	NC_021040	TCT	2	6	2431329	2431334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50704	NC_021040	AT	3	6	2431369	2431374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50705	NC_021040	TAT	2	6	2431379	2431384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50706	NC_021040	TAA	2	6	2431474	2431479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203837
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50722	NC_021040	AT	3	6	2432274	2432279	50 %	50 %	0 %	0 %	479203837
50723	NC_021040	CTG	2	6	2432303	2432308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203837
50724	NC_021040	ATC	2	6	2432318	2432323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203837
50725	NC_021040	T	6	6	2432344	2432349	0 %	100 %	0 %	0 %	479203837
50726	NC_021040	TG	3	6	2432376	2432381	0 %	50 %	50 %	0 %	479203837
50727	NC_021040	T	6	6	2432392	2432397	0 %	100 %	0 %	0 %	479203837
50728	NC_021040	CAC	2	6	2432411	2432416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50729	NC_021040	CGTC	2	8	2432468	2432475	0 %	25 %	25 %	50 %	479203838
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50731	NC_021040	GGA	2	6	2432517	2432522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479203838
50732	NC_021040	TCT	2	6	2432626	2432631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203838
50733	NC_021040	CAT	2	6	2432714	2432719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203838
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50735	NC_021040	GTC	2	6	2432749	2432754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203838
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50737	NC_021040	AGC	2	6	2432854	2432859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203838
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50843	NC_021040	TCA	2	6	2438346	2438351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50845	NC_021040	ATC	3	9	2438457	2438465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50848	NC_021040	AC	3	6	2438576	2438581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50849	NC_021040	ATCC	2	8	2438582	2438589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50850	NC_021040	GAA	3	9	2438673	2438681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50851	NC_021040	T	6	6	2438701	2438706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50852	NC_021040	ACT	2	6	2438722	2438727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50853	NC_021040	TAT	2	6	2438792	2438797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50854	NC_021040	A	7	7	2438830	2438836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50855	NC_021040	ATA	2	6	2438885	2438890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50857	NC_021040	ATTTTT	2	12	2438911	2438922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50979	NC_021040	CGAA	2	8	2444338	2444345	50 %	0 %	25 %	25 %	479203847
50980	NC_021040	T	6	6	2444387	2444392	0 %	100 %	0 %	0 %	479203847
50981	NC_021040	GAAT	2	8	2444500	2444507	50 %	25 %	25 %	0 %	479203847
50982	NC_021040	TCGT	2	8	2444780	2444787	0 %	50 %	25 %	25 %	479203847
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