MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50120	NC_021040	GCCA	2	8	2402973	2402980	25 %	0 %	25 %	50 %	479203813
50121	NC_021040	CCG	2	6	2402982	2402987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203813
50122	NC_021040	ATC	2	6	2403044	2403049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203813
50123	NC_021040	CGC	2	6	2403124	2403129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203813
50124	NC_021040	CATC	2	8	2403135	2403142	25 %	25 %	0 %	50 %	479203813
50125	NC_021040	CTT	2	6	2403197	2403202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203813
50126	NC_021040	T	7	7	2403268	2403274	0 %	100 %	0 %	0 %	479203813
50127	NC_021040	ATA	2	6	2403313	2403318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203813
50128	NC_021040	TCA	2	6	2403443	2403448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203813
50129	NC_021040	CAC	2	6	2403493	2403498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203813
50130	NC_021040	GAT	2	6	2403655	2403660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203813
50131	NC_021040	TAG	2	6	2403734	2403739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203813
50132	NC_021040	TAA	2	6	2403836	2403841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203813
50133	NC_021040	AAG	2	6	2403844	2403849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203813
50134	NC_021040	TCTTT	2	10	2403857	2403866	0 %	80 %	0 %	20 %	479203813
50135	NC_021040	CA	3	6	2403889	2403894	50 %	0 %	0 %	50 %	479203813
50136	NC_021040	CCA	2	6	2403933	2403938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203813
50137	NC_021040	CGC	2	6	2403970	2403975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203813
50138	NC_021040	GGT	2	6	2403993	2403998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203813
50139	NC_021040	AT	3	6	2404040	2404045	50 %	50 %	0 %	0 %	479203813
50140	NC_021040	CGT	2	6	2404105	2404110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203813
50141	NC_021040	ATC	2	6	2404111	2404116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203813
50142	NC_021040	TC	3	6	2404178	2404183	0 %	50 %	0 %	50 %	479203813
50143	NC_021040	TCT	2	6	2404200	2404205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203814
50144	NC_021040	CCG	2	6	2404242	2404247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203814
50145	NC_021040	CTT	2	6	2404249	2404254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203814
50146	NC_021040	CAA	2	6	2404261	2404266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203814
50147	NC_021040	ATC	2	6	2404358	2404363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203814
50148	NC_021040	AAT	2	6	2404372	2404377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203814
50149	NC_021040	GCT	2	6	2404462	2404467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203814
50150	NC_021040	CAT	2	6	2404571	2404576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203814
50151	NC_021040	ACAG	2	8	2404622	2404629	50 %	0 %	25 %	25 %	479203814
50152	NC_021040	GGAT	2	8	2404706	2404713	25 %	25 %	50 %	0 %	479203814
50153	NC_021040	TC	3	6	2404742	2404747	0 %	50 %	0 %	50 %	479203814
50154	NC_021040	ATC	2	6	2404763	2404768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203814
50155	NC_021040	CCACTG	2	12	2404784	2404795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479203814
50156	NC_021040	CGC	2	6	2404829	2404834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203814
50157	NC_021040	T	6	6	2404871	2404876	0 %	100 %	0 %	0 %	479203814
50158	NC_021040	GAT	2	6	2404880	2404885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203814
50159	NC_021040	TGA	2	6	2405073	2405078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203814
50160	NC_021040	TAA	2	6	2405172	2405177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203814
50161	NC_021040	TA	3	6	2405191	2405196	50 %	50 %	0 %	0 %	479203814
50162	NC_021040	TCG	2	6	2405212	2405217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203814
50163	NC_021040	TCC	2	6	2405250	2405255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203814
50164	NC_021040	GAT	2	6	2405339	2405344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203814
50165	NC_021040	AT	3	6	2405343	2405348	50 %	50 %	0 %	0 %	479203814
50166	NC_021040	GC	3	6	2405445	2405450	0 %	0 %	50 %	50 %	479203814
50167	NC_021040	GTA	2	6	2405480	2405485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203814
50168	NC_021040	ATA	2	6	2405669	2405674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203814
50169	NC_021040	AAT	2	6	2405707	2405712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203814
50170	NC_021040	CTGAT	2	10	2405750	2405759	20 %	40 %	20 %	20 %	479203814
50171	NC_021040	ATA	2	6	2405764	2405769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203814
50172	NC_021040	TCC	2	6	2405787	2405792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50173	NC_021040	TAA	2	6	2405849	2405854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203815
50174	NC_021040	AT	3	6	2405922	2405927	50 %	50 %	0 %	0 %	479203815
50175	NC_021040	T	6	6	2406007	2406012	0 %	100 %	0 %	0 %	479203815
50176	NC_021040	CG	3	6	2406035	2406040	0 %	0 %	50 %	50 %	479203815
50177	NC_021040	GATC	2	8	2406055	2406062	25 %	25 %	25 %	25 %	479203815
50178	NC_021040	TGC	2	6	2406098	2406103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203815
50179	NC_021040	TCA	2	6	2406141	2406146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203815
50180	NC_021040	TAA	2	6	2406172	2406177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203815
50181	NC_021040	TGC	2	6	2406203	2406208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203815
50182	NC_021040	TCA	2	6	2406433	2406438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203815
50183	NC_021040	ATTGT	2	10	2406476	2406485	20 %	60 %	20 %	0 %	479203815
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50185	NC_021040	TCC	2	6	2406530	2406535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50186	NC_021040	ATG	2	6	2406612	2406617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203816
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50189	NC_021040	CAC	2	6	2406658	2406663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203816
50190	NC_021040	ATG	2	6	2406690	2406695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203816
50191	NC_021040	CTT	2	6	2406699	2406704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203816
50192	NC_021040	TGTAA	2	10	2406737	2406746	40 %	40 %	20 %	0 %	479203816
50193	NC_021040	TGC	2	6	2406809	2406814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203816
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50199	NC_021040	GAT	2	6	2407130	2407135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203816
50200	NC_021040	TCC	2	6	2407227	2407232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203816
50201	NC_021040	GAT	2	6	2407298	2407303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203816
50202	NC_021040	GAT	2	6	2407319	2407324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203816
50203	NC_021040	T	7	7	2407360	2407366	0 %	100 %	0 %	0 %	479203816
50204	NC_021040	CTG	2	6	2407381	2407386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50205	NC_021040	TCCT	2	8	2407388	2407395	0 %	50 %	0 %	50 %	479203817
50206	NC_021040	CAGTAC	2	12	2407445	2407456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479203817
50207	NC_021040	CAAC	2	8	2407458	2407465	50 %	0 %	0 %	50 %	479203817
50208	NC_021040	CAC	2	6	2407516	2407521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203817
50209	NC_021040	AT	3	6	2407680	2407685	50 %	50 %	0 %	0 %	479203817
50210	NC_021040	CCAT	2	8	2407710	2407717	25 %	25 %	0 %	50 %	479203817
50211	NC_021040	TGC	2	6	2407718	2407723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203817
50212	NC_021040	TATT	2	8	2407741	2407748	25 %	75 %	0 %	0 %	479203817
50213	NC_021040	TTTC	2	8	2407789	2407796	0 %	75 %	0 %	25 %	479203817
50214	NC_021040	CCA	2	6	2407826	2407831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203817
50215	NC_021040	AAAT	2	8	2407848	2407855	75 %	25 %	0 %	0 %	479203817
50216	NC_021040	CTG	2	6	2407906	2407911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203817
50217	NC_021040	ATAA	2	8	2407973	2407980	75 %	25 %	0 %	0 %	479203817
50218	NC_021040	GCT	3	9	2408046	2408054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203817
50219	NC_021040	CAA	2	6	2408152	2408157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203817
50220	NC_021040	GAA	2	6	2408251	2408256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479203817
50221	NC_021040	TGC	2	6	2408291	2408296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203817
50222	NC_021040	GGT	2	6	2408299	2408304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203817
50223	NC_021040	TCT	2	6	2408305	2408310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203817
50224	NC_021040	TTC	2	6	2408365	2408370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203818
50225	NC_021040	TCAA	2	8	2408375	2408382	50 %	25 %	0 %	25 %	479203818
50226	NC_021040	TAT	2	6	2408475	2408480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203819
50227	NC_021040	CAT	2	6	2408548	2408553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203819
50228	NC_021040	AAC	2	6	2408573	2408578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203819
50229	NC_021040	GTT	2	6	2408604	2408609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203819
50230	NC_021040	CTCAT	2	10	2408628	2408637	20 %	40 %	0 %	40 %	479203819
50231	NC_021040	CAG	2	6	2408656	2408661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203819
50232	NC_021040	CTG	2	6	2408704	2408709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203819
50233	NC_021040	AGCA	2	8	2408750	2408757	50 %	0 %	25 %	25 %	479203819
50234	NC_021040	AAT	2	6	2408862	2408867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203819
50235	NC_021040	TCT	2	6	2408871	2408876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203819
50236	NC_021040	TGG	2	6	2409008	2409013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479203819
50237	NC_021040	CTA	2	6	2409058	2409063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203819
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50351	NC_021040	CAAT	2	8	2414308	2414315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50352	NC_021040	ATC	2	6	2414316	2414321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50358	NC_021040	CCT	2	6	2414622	2414627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50359	NC_021040	GCA	2	6	2414636	2414641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50360	NC_021040	CAA	2	6	2414650	2414655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50361	NC_021040	GCT	2	6	2414677	2414682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479203821
50362	NC_021040	ACC	2	6	2414702	2414707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479203821
50363	NC_021040	TACA	2	8	2414711	2414718	50 %	25 %	0 %	25 %	479203821
50364	NC_021040	TCT	2	6	2414781	2414786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203821
50365	NC_021040	GAT	2	6	2414819	2414824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203821
50366	NC_021040	CTGG	2	8	2414854	2414861	0 %	25 %	50 %	25 %	479203821
50367	NC_021040	GCA	2	6	2414985	2414990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203821
50368	NC_021040	TCA	2	6	2415025	2415030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203821
50369	NC_021040	TGA	2	6	2415043	2415048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203821
50370	NC_021040	T	6	6	2415062	2415067	0 %	100 %	0 %	0 %	479203821
50371	NC_021040	TGA	2	6	2415175	2415180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203821
50372	NC_021040	ATT	2	6	2415188	2415193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479203821
50373	NC_021040	CTT	3	9	2415217	2415225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203821
50374	NC_021040	CTC	2	6	2415254	2415259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479203821
50375	NC_021040	CATA	2	8	2415273	2415280	50 %	25 %	0 %	25 %	479203821
50376	NC_021040	T	6	6	2415485	2415490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50377	NC_021040	TGT	2	6	2415585	2415590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50378	NC_021040	ATT	2	6	2415595	2415600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50379	NC_021040	CTT	2	6	2415718	2415723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203822
50380	NC_021040	AAT	2	6	2415768	2415773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479203822
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50382	NC_021040	TTCTTT	2	12	2415837	2415848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479203822
50383	NC_021040	GCTG	2	8	2415944	2415951	0 %	25 %	50 %	25 %	479203822
50384	NC_021040	GCA	2	6	2415963	2415968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203822
50385	NC_021040	GCA	2	6	2416050	2416055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203822
50386	NC_021040	T	6	6	2416112	2416117	0 %	100 %	0 %	0 %	479203822
50387	NC_021040	TTC	2	6	2416211	2416216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203822
50388	NC_021040	GTT	2	6	2416281	2416286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479203822
50389	NC_021040	TACC	2	8	2416318	2416325	25 %	25 %	0 %	50 %	479203822
50390	NC_021040	GCC	2	6	2416361	2416366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479203822
50391	NC_021040	GAT	2	6	2416379	2416384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203822
50392	NC_021040	GCA	2	6	2416422	2416427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203822
50393	NC_021040	CATCT	2	10	2416466	2416475	20 %	40 %	0 %	40 %	479203822
50394	NC_021040	T	6	6	2416532	2416537	0 %	100 %	0 %	0 %	479203822
50395	NC_021040	TG	3	6	2416631	2416636	0 %	50 %	50 %	0 %	479203822
50396	NC_021040	ATC	2	6	2416643	2416648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479203822
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50399	NC_021040	CA	3	6	2416754	2416759	50 %	0 %	0 %	50 %	479203822
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50401	NC_021040	ATCAC	2	10	2416983	2416992	40 %	20 %	0 %	40 %	479203822
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50427	NC_021040	TCT	2	6	2418786	2418791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50428	NC_021040	T	10	10	2418830	2418839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50431	NC_021040	TAT	2	6	2418898	2418903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50432	NC_021040	T	6	6	2418951	2418956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50433	NC_021040	AT	3	6	2418965	2418970	50 %	50 %	0 %	0 %	479203824
50434	NC_021040	A	7	7	2418979	2418985	100 %	0 %	0 %	0 %	479203824
50435	NC_021040	A	6	6	2419055	2419060	100 %	0 %	0 %	0 %	479203824
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50446	NC_021040	A	7	7	2419573	2419579	100 %	0 %	0 %	0 %	479203824
50447	NC_021040	ACG	2	6	2419617	2419622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203824
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50458	NC_021040	GGA	2	6	2419982	2419987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50459	NC_021040	A	6	6	2419987	2419992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50460	NC_021040	GCA	2	6	2420064	2420069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203825
50461	NC_021040	TGTC	2	8	2420410	2420417	0 %	50 %	25 %	25 %	479203825
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50464	NC_021040	CGA	2	6	2420462	2420467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203825
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50469	NC_021040	ATGTA	2	10	2420719	2420728	40 %	40 %	20 %	0 %	479203825
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50471	NC_021040	TC	3	6	2420774	2420779	0 %	50 %	0 %	50 %	479203825
50472	NC_021040	ACA	3	9	2420899	2420907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203825
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50474	NC_021040	TCT	2	6	2420970	2420975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203825
50475	NC_021040	CAG	2	6	2421117	2421122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203825
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50477	NC_021040	GAT	2	6	2421170	2421175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479203825
50478	NC_021040	TC	3	6	2421197	2421202	0 %	50 %	0 %	50 %	479203825
50479	NC_021040	CTT	2	6	2421236	2421241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479203825
50480	NC_021040	AC	3	6	2421247	2421252	50 %	0 %	0 %	50 %	479203825
50481	NC_021040	CAG	2	6	2421319	2421324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203825
50482	NC_021040	ACA	2	6	2421364	2421369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479203825
50483	NC_021040	GCAG	2	8	2421426	2421433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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50486	NC_021040	GCA	2	6	2421533	2421538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479203826
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