MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 52867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021039	TTGC	2	8	627439	627446	0 %	50 %	25 %	25 %	479199786
13002	NC_021039	GCT	2	6	627512	627517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199786
13003	NC_021039	GGT	2	6	627519	627524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199786
13004	NC_021039	CCG	2	6	627583	627588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199786
13005	NC_021039	AGA	2	6	627602	627607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199786
13006	NC_021039	ATC	2	6	627657	627662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199786
13007	NC_021039	CTT	2	6	627684	627689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199786
13008	NC_021039	TCC	2	6	627703	627708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199786
13009	NC_021039	GGA	2	6	627723	627728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199786
13010	NC_021039	TCA	3	9	627767	627775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199786
13011	NC_021039	AG	3	6	627784	627789	50 %	0 %	50 %	0 %	479199786
13012	NC_021039	CGC	2	6	627800	627805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199786
13013	NC_021039	CTC	2	6	627810	627815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199786
13014	NC_021039	GGGGT	2	10	627952	627961	0 %	20 %	80 %	0 %	479199786
13015	NC_021039	GCG	2	6	627967	627972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199786
13016	NC_021039	GTT	2	6	628003	628008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479199786
13017	NC_021039	CTT	2	6	628072	628077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199787
13018	NC_021039	ACAG	2	8	628111	628118	50 %	0 %	25 %	25 %	479199787
13019	NC_021039	CCGT	2	8	628122	628129	0 %	25 %	25 %	50 %	479199787
13020	NC_021039	CCG	2	6	628195	628200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199787
13021	NC_021039	CCG	2	6	628315	628320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199787
13022	NC_021039	CCG	2	6	628386	628391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199787
13023	NC_021039	TGC	2	6	628415	628420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199787
13024	NC_021039	GCT	2	6	628432	628437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199787
13025	NC_021039	CTC	2	6	628457	628462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199787
13026	NC_021039	ATCCGG	2	12	628467	628478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479199787
13027	NC_021039	TCC	2	6	628491	628496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199787
13028	NC_021039	TCC	2	6	628527	628532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199787
13029	NC_021039	GCG	2	6	628542	628547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199787
13030	NC_021039	CCA	2	6	628555	628560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199787
13031	NC_021039	GTT	2	6	628603	628608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479199787
13032	NC_021039	TCCG	2	8	628634	628641	0 %	25 %	25 %	50 %	479199787
13033	NC_021039	CCT	2	6	628666	628671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199787
13034	NC_021039	CCG	2	6	628702	628707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199787
13035	NC_021039	CATC	2	8	628708	628715	25 %	25 %	0 %	50 %	479199787
13036	NC_021039	AGT	2	6	628733	628738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021039	A	7	7	628791	628797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_021039	TGC	2	6	628818	628823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_021039	ATGT	2	8	628940	628947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021039	CAGA	2	8	628989	628996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_021039	G	8	8	629030	629037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021039	TTG	2	6	629060	629065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021039	GCT	2	6	629085	629090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_021039	AGC	3	9	629177	629185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_021039	AGG	2	6	629210	629215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021039	CAAA	2	8	629331	629338	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13047	NC_021039	TCG	2	6	629360	629365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_021039	GA	3	6	629366	629371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_021039	GGA	2	6	629520	629525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_021039	CCA	2	6	629532	629537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_021039	AT	3	6	629559	629564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_021039	CGC	2	6	629637	629642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_021039	G	6	6	629651	629656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021039	AGC	2	6	629795	629800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_021039	GAG	2	6	629806	629811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021039	CAGA	2	8	629821	629828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_021039	ATG	2	6	629876	629881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021039	GGAGC	2	10	629964	629973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13059	NC_021039	GGT	2	6	629985	629990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021039	GGA	2	6	629997	630002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021039	GGA	2	6	630042	630047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021039	TGCGCA	2	12	630068	630079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_021039	GGA	2	6	630090	630095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021039	GGCA	2	8	630163	630170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13065	NC_021039	GCG	2	6	630189	630194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_021039	GAA	2	6	630198	630203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021039	CAT	2	6	630225	630230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_021039	CCA	2	6	630242	630247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13069	NC_021039	CTG	2	6	630265	630270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_021039	AGCGC	2	10	630290	630299	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13071	NC_021039	GGA	2	6	630309	630314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_021039	CAT	2	6	630429	630434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_021039	ACT	2	6	630479	630484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_021039	TGA	2	6	630494	630499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_021039	GCGGGA	2	12	630534	630545	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13076	NC_021039	GGA	2	6	630645	630650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_021039	GGA	2	6	630674	630679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021039	GAT	2	6	630697	630702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021039	TGC	2	6	630706	630711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_021039	CA	3	6	630790	630795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_021039	ATG	2	6	630823	630828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_021039	TTC	2	6	630952	630957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_021039	TGC	2	6	630971	630976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_021039	CAA	2	6	631047	631052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_021039	AGG	2	6	631190	631195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_021039	CATTGA	2	12	631206	631217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13087	NC_021039	CTC	2	6	631236	631241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13088	NC_021039	CTG	2	6	631249	631254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_021039	TG	3	6	631421	631426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_021039	AAG	2	6	631438	631443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_021039	GCTG	2	8	631451	631458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13092	NC_021039	GAT	2	6	631517	631522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_021039	CTG	2	6	631611	631616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_021039	AAAGA	2	10	631621	631630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021039	A	6	6	631658	631663	100 %	0 %	0 %	0 %	479199788
13096	NC_021039	GCT	2	6	631751	631756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199788
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13101	NC_021039	TGGG	2	8	631893	631900	0 %	25 %	75 %	0 %	479199788
13102	NC_021039	CTG	2	6	631905	631910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199788
13103	NC_021039	CTG	2	6	631920	631925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199788
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13106	NC_021039	TGC	2	6	632116	632121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199788
13107	NC_021039	AT	3	6	632211	632216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_021039	GGC	2	6	632232	632237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_021039	A	6	6	632354	632359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_021039	GAA	2	6	632373	632378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021039	A	6	6	632466	632471	100 %	0 %	0 %	0 %	479199789
13112	NC_021039	GTG	2	6	632477	632482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199789
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13115	NC_021039	GGCA	2	8	632611	632618	25 %	0 %	50 %	25 %	479199789
13116	NC_021039	TCA	2	6	632790	632795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199789
13117	NC_021039	ACGG	2	8	632810	632817	25 %	0 %	50 %	25 %	479199789
13118	NC_021039	GCAG	2	8	632818	632825	25 %	0 %	50 %	25 %	479199789
13119	NC_021039	CAG	2	6	632990	632995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199789
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13122	NC_021039	CAA	2	6	633136	633141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479199789
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13124	NC_021039	GCT	2	6	633150	633155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199789
13125	NC_021039	ACC	2	6	633200	633205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199789
13126	NC_021039	CTC	2	6	633243	633248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13127	NC_021039	AT	3	6	633321	633326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021039	TCA	2	6	633339	633344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_021039	AGG	2	6	633354	633359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021039	GCA	2	6	633387	633392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_021039	ATG	2	6	633398	633403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_021039	GCCT	2	8	633427	633434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13133	NC_021039	GCC	2	6	633479	633484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13134	NC_021039	GGAT	2	8	633485	633492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_021039	CGG	2	6	633495	633500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13136	NC_021039	GAGT	2	8	633531	633538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_021039	GGTCT	2	10	633604	633613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13138	NC_021039	TGA	3	9	633633	633641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_021039	CTAC	2	8	633717	633724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13140	NC_021039	TCC	2	6	633746	633751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13141	NC_021039	GGA	2	6	633769	633774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13142	NC_021039	GGA	2	6	633856	633861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13143	NC_021039	TCA	2	6	633876	633881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13144	NC_021039	CTGCC	2	10	633894	633903	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13145	NC_021039	CTG	2	6	633923	633928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13146	NC_021039	G	6	6	633953	633958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13147	NC_021039	CTG	2	6	633974	633979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13148	NC_021039	CTG	2	6	634094	634099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13149	NC_021039	CAT	2	6	634108	634113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13150	NC_021039	TTC	2	6	634124	634129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13151	NC_021039	CCTG	2	8	634224	634231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13152	NC_021039	TGG	2	6	634236	634241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_021039	GCT	2	6	634258	634263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13154	NC_021039	GGC	2	6	634325	634330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13155	NC_021039	TGCA	2	8	634342	634349	25 %	25 %	25 %	25 %	479199790
13156	NC_021039	TCCA	2	8	634400	634407	25 %	25 %	0 %	50 %	479199790
13157	NC_021039	GGCT	2	8	634439	634446	0 %	25 %	50 %	25 %	479199790
13158	NC_021039	TGG	2	6	634470	634475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199790
13159	NC_021039	TTC	2	6	634592	634597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199790
13160	NC_021039	TCC	2	6	634626	634631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199790
13161	NC_021039	CGG	2	6	634791	634796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199790
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13163	NC_021039	CTG	2	6	634826	634831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199790
13164	NC_021039	CT	3	6	634858	634863	0 %	50 %	0 %	50 %	479199790
13165	NC_021039	T	6	6	634901	634906	0 %	100 %	0 %	0 %	479199790
13166	NC_021039	GGAT	2	8	634994	635001	25 %	25 %	50 %	0 %	479199790
13167	NC_021039	CATGG	2	10	635057	635066	20 %	20 %	40 %	20 %	479199790
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13172	NC_021039	TCG	2	6	635328	635333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199791
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13199	NC_021039	CGG	2	6	636421	636426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199792
13200	NC_021039	CGG	2	6	636502	636507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199792
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13207	NC_021039	GAG	2	6	636866	636871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13219	NC_021039	GAA	2	6	637438	637443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199794
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13226	NC_021039	GGC	2	6	637681	637686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199794
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13230	NC_021039	CTG	2	6	637849	637854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199794
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13232	NC_021039	CTG	2	6	637958	637963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199794
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13234	NC_021039	ACG	2	6	638066	638071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199794
13235	NC_021039	TGAGGA	2	12	638073	638084	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479199794
13236	NC_021039	ACT	2	6	638128	638133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199794
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13238	NC_021039	CTG	2	6	638332	638337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199794
13239	NC_021039	CAT	2	6	638466	638471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199794
13240	NC_021039	CGT	2	6	638503	638508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199794
13241	NC_021039	CAT	2	6	638514	638519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199794
13242	NC_021039	ACC	3	9	638521	638529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199794
13243	NC_021039	GCG	2	6	638540	638545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199794
13244	NC_021039	AGC	2	6	638549	638554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199794
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13246	NC_021039	CGG	2	6	638586	638591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199794
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13248	NC_021039	ATC	2	6	638653	638658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199794
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13277	NC_021039	CTATA	2	10	639733	639742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13357	NC_021039	TG	3	6	643192	643197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_021039	AATAT	2	10	643254	643263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_021039	CAG	2	6	643265	643270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13365	NC_021039	ACA	2	6	643528	643533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479199798
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13489	NC_021039	AGG	2	6	649707	649712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199805
13490	NC_021039	AGC	2	6	649747	649752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199805
13491	NC_021039	AAG	2	6	649773	649778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199805
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13493	NC_021039	AGC	2	6	649881	649886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199806
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