MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_021022	TTGAC	2	10	2260691	2260700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48002	NC_021022	T	7	7	2260713	2260719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48003	NC_021022	ATA	2	6	2260720	2260725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48004	NC_021022	GTT	2	6	2260734	2260739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48005	NC_021022	T	7	7	2260888	2260894	0 %	100 %	0 %	0 %	479177948
48006	NC_021022	AGG	2	6	2260916	2260921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479177948
48007	NC_021022	GAA	2	6	2260934	2260939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177948
48008	NC_021022	A	6	6	2260938	2260943	100 %	0 %	0 %	0 %	479177949
48009	NC_021022	TGA	3	9	2260966	2260974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48010	NC_021022	TCA	2	6	2261025	2261030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177949
48011	NC_021022	GAT	2	6	2261031	2261036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48012	NC_021022	CAG	2	6	2261053	2261058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177949
48013	NC_021022	GAT	2	6	2261064	2261069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48014	NC_021022	G	7	7	2261112	2261118	0 %	0 %	100 %	0 %	479177949
48015	NC_021022	GAA	2	6	2261127	2261132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177949
48016	NC_021022	ATGAAA	2	12	2261179	2261190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479177949
48017	NC_021022	GAT	2	6	2261250	2261255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48018	NC_021022	A	6	6	2261325	2261330	100 %	0 %	0 %	0 %	479177949
48019	NC_021022	AATG	2	8	2261346	2261353	50 %	25 %	25 %	0 %	479177949
48020	NC_021022	ATG	2	6	2261392	2261397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48021	NC_021022	CAT	2	6	2261563	2261568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177949
48022	NC_021022	A	6	6	2261638	2261643	100 %	0 %	0 %	0 %	479177949
48023	NC_021022	GC	3	6	2261677	2261682	0 %	0 %	50 %	50 %	479177949
48024	NC_021022	AGC	2	6	2261748	2261753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177949
48025	NC_021022	ACG	2	6	2261836	2261841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177949
48026	NC_021022	AT	3	6	2262026	2262031	50 %	50 %	0 %	0 %	479177949
48027	NC_021022	GGT	2	6	2262036	2262041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177949
48028	NC_021022	AAT	2	6	2262078	2262083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177949
48029	NC_021022	ATC	2	6	2262107	2262112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177949
48030	NC_021022	ATG	2	6	2262139	2262144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48031	NC_021022	CAT	2	6	2262172	2262177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177949
48032	NC_021022	GAA	2	6	2262248	2262253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177949
48033	NC_021022	ACA	2	6	2262294	2262299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177949
48034	NC_021022	GCA	2	6	2262336	2262341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177949
48035	NC_021022	CTT	2	6	2262348	2262353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177949
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48038	NC_021022	AAGG	2	8	2262516	2262523	50 %	0 %	50 %	0 %	479177949
48039	NC_021022	ATT	2	6	2262532	2262537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479177949
48040	NC_021022	TGA	2	6	2262569	2262574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48041	NC_021022	GCAG	2	8	2262698	2262705	25 %	0 %	50 %	25 %	479177949
48042	NC_021022	ACTG	2	8	2262767	2262774	25 %	25 %	25 %	25 %	479177949
48043	NC_021022	CAGA	2	8	2262867	2262874	50 %	0 %	25 %	25 %	479177949
48044	NC_021022	ATG	2	6	2262883	2262888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48045	NC_021022	TGA	2	6	2262926	2262931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177949
48046	NC_021022	AGC	2	6	2262938	2262943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177949
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48048	NC_021022	AAG	2	6	2263033	2263038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177949
48049	NC_021022	TACA	2	8	2263157	2263164	50 %	25 %	0 %	25 %	479177949
48050	NC_021022	CAA	2	6	2263234	2263239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177949
48051	NC_021022	AAAG	2	8	2263304	2263311	75 %	0 %	25 %	0 %	479177949
48052	NC_021022	CAA	2	6	2263415	2263420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177949
48053	NC_021022	TTACAG	2	12	2263531	2263542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479177949
48054	NC_021022	CAA	2	6	2263616	2263621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177949
48055	NC_021022	A	6	6	2263620	2263625	100 %	0 %	0 %	0 %	479177949
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48059	NC_021022	A	6	6	2263734	2263739	100 %	0 %	0 %	0 %	479177949
48060	NC_021022	TA	3	6	2263795	2263800	50 %	50 %	0 %	0 %	479177949
48061	NC_021022	A	7	7	2263919	2263925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48062	NC_021022	ACA	2	6	2263938	2263943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48063	NC_021022	TGA	2	6	2263954	2263959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48064	NC_021022	GTA	2	6	2264070	2264075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48068	NC_021022	GACACC	2	12	2264162	2264173	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48069	NC_021022	AGA	2	6	2264180	2264185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48070	NC_021022	N	420	420	2264192	2264611	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48071	NC_021022	AGA	2	6	2264639	2264644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48072	NC_021022	GCA	2	6	2264709	2264714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48073	NC_021022	ATA	2	6	2264716	2264721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48074	NC_021022	AT	4	8	2264761	2264768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48075	NC_021022	ATG	2	6	2264929	2264934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48079	NC_021022	AGTAA	2	10	2265120	2265129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48080	NC_021022	ATA	2	6	2265193	2265198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48084	NC_021022	T	6	6	2265292	2265297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48087	NC_021022	TTA	2	6	2265448	2265453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48088	NC_021022	TGA	2	6	2265536	2265541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48089	NC_021022	AG	3	6	2265578	2265583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48090	NC_021022	GCA	2	6	2265593	2265598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48092	NC_021022	GAT	2	6	2265642	2265647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48093	NC_021022	ACA	2	6	2266047	2266052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48094	NC_021022	CTT	2	6	2266164	2266169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48095	NC_021022	CAG	2	6	2266235	2266240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48096	NC_021022	ATGCAG	2	12	2266264	2266275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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48098	NC_021022	A	7	7	2266368	2266374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48099	NC_021022	TTC	2	6	2266384	2266389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48100	NC_021022	TGA	2	6	2266394	2266399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48101	NC_021022	A	6	6	2266421	2266426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48102	NC_021022	AAC	2	6	2266450	2266455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48103	NC_021022	TG	3	6	2266508	2266513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48104	NC_021022	GACC	2	8	2266522	2266529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48105	NC_021022	GAA	2	6	2266548	2266553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48106	NC_021022	TGGA	2	8	2266825	2266832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48107	NC_021022	AAT	2	6	2266943	2266948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48108	NC_021022	CAG	2	6	2267039	2267044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48109	NC_021022	A	6	6	2267046	2267051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48110	NC_021022	TTCCGG	2	12	2267066	2267077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48112	NC_021022	GCA	2	6	2267111	2267116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48113	NC_021022	ATA	2	6	2267191	2267196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48114	NC_021022	ATG	2	6	2267197	2267202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48115	NC_021022	CGG	2	6	2267213	2267218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48116	NC_021022	GC	3	6	2267254	2267259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48117	NC_021022	A	6	6	2267291	2267296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48118	NC_021022	CA	3	6	2267341	2267346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48119	NC_021022	ATTT	2	8	2267354	2267361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48120	NC_021022	TGA	2	6	2267371	2267376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48242	NC_021022	GCGTG	2	10	2272836	2272845	0 %	20 %	60 %	20 %	479177954
48243	NC_021022	GAA	2	6	2273058	2273063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177954
48244	NC_021022	TTCTC	2	10	2273069	2273078	0 %	60 %	0 %	40 %	479177954
48245	NC_021022	GAT	2	6	2273079	2273084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177954
48246	NC_021022	TGC	2	6	2273129	2273134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177954
48247	NC_021022	TGC	2	6	2273145	2273150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177954
48248	NC_021022	GGC	2	6	2273172	2273177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177954
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48252	NC_021022	TTTC	2	8	2273262	2273269	0 %	75 %	0 %	25 %	479177954
48253	NC_021022	ATC	2	6	2273276	2273281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177954
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48258	NC_021022	GT	3	6	2273611	2273616	0 %	50 %	50 %	0 %	479177954
48259	NC_021022	GCA	2	6	2273664	2273669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177954
48260	NC_021022	GCC	2	6	2273726	2273731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479177954
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48262	NC_021022	A	6	6	2273786	2273791	100 %	0 %	0 %	0 %	479177954
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48267	NC_021022	A	6	6	2274139	2274144	100 %	0 %	0 %	0 %	479177955
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48294	NC_021022	T	6	6	2275717	2275722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48343	NC_021022	GAT	2	6	2277678	2277683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177957
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48347	NC_021022	GAT	2	6	2277786	2277791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177957
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48349	NC_021022	CGG	2	6	2277870	2277875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177957
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48354	NC_021022	AAG	2	6	2278062	2278067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177958
48355	NC_021022	A	6	6	2278152	2278157	100 %	0 %	0 %	0 %	479177958
48356	NC_021022	CAA	2	6	2278195	2278200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177958
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48474	NC_021022	TTC	2	6	2284142	2284147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177962
48475	NC_021022	GCA	2	6	2284245	2284250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177962
48476	NC_021022	GTG	2	6	2284253	2284258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177962
48477	NC_021022	TGC	2	6	2284270	2284275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177962
48478	NC_021022	CCAT	2	8	2284335	2284342	25 %	25 %	0 %	50 %	479177962
48479	NC_021022	CCT	2	6	2284399	2284404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479177962
48480	NC_021022	T	6	6	2284450	2284455	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962
48481	NC_021022	AGA	2	6	2284545	2284550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177962
48482	NC_021022	GAT	2	6	2284556	2284561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177962
48483	NC_021022	AGTGG	2	10	2284614	2284623	20 %	20 %	60 %	0 %	479177962
48484	NC_021022	GCT	2	6	2284681	2284686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177962
48485	NC_021022	AAT	2	6	2284725	2284730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177962
48486	NC_021022	T	6	6	2284784	2284789	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962
48487	NC_021022	T	6	6	2284796	2284801	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962
48488	NC_021022	ATC	2	6	2284832	2284837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177962
48489	NC_021022	T	6	6	2284853	2284858	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962
48490	NC_021022	T	6	6	2284874	2284879	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962
48491	NC_021022	GTTT	2	8	2284961	2284968	0 %	75 %	25 %	0 %	479177962
48492	NC_021022	TGT	2	6	2284969	2284974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177962
48493	NC_021022	CTTT	2	8	2285016	2285023	0 %	75 %	0 %	25 %	479177962
48494	NC_021022	GAT	2	6	2285114	2285119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177962
48495	NC_021022	TG	3	6	2285246	2285251	0 %	50 %	50 %	0 %	479177962
48496	NC_021022	CTT	2	6	2285290	2285295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177962
48497	NC_021022	TCA	2	6	2285424	2285429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177962
48498	NC_021022	CTG	2	6	2285465	2285470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177962
48499	NC_021022	ATC	2	6	2285504	2285509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177962
48500	NC_021022	T	6	6	2285546	2285551	0 %	100 %	0 %	0 %	479177962

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