MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40005	NC_021022	GCA	2	6	1884961	1884966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177629
40006	NC_021022	ATG	2	6	1885002	1885007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177629
40007	NC_021022	TCA	2	6	1885026	1885031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177629
40008	NC_021022	TCA	2	6	1885077	1885082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177629
40009	NC_021022	GAT	2	6	1885091	1885096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177629
40010	NC_021022	TGTA	2	8	1885102	1885109	25 %	50 %	25 %	0 %	479177629
40011	NC_021022	CAT	2	6	1885129	1885134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177629
40012	NC_021022	ATA	2	6	1885327	1885332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177629
40013	NC_021022	TAA	2	6	1885337	1885342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177629
40014	NC_021022	AAT	2	6	1885399	1885404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40015	NC_021022	GAG	2	6	1885531	1885536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40016	NC_021022	ATCA	2	8	1885585	1885592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40019	NC_021022	AT	3	6	1885617	1885622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40020	NC_021022	AGG	2	6	1885628	1885633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40021	NC_021022	CAT	2	6	1885740	1885745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177630
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40094	NC_021022	AT	3	6	1889308	1889313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40105	NC_021022	TTG	2	6	1889874	1889879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177633
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40116	NC_021022	CAGA	2	8	1890670	1890677	50 %	0 %	25 %	25 %	479177634
40117	NC_021022	AGA	3	9	1890705	1890713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177634
40118	NC_021022	TGT	2	6	1890762	1890767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177634
40119	NC_021022	CTT	2	6	1890877	1890882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177634
40120	NC_021022	TGA	2	6	1890927	1890932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177634
40121	NC_021022	AGGA	2	8	1891064	1891071	50 %	0 %	50 %	0 %	479177634
40122	NC_021022	GAA	2	6	1891177	1891182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177634
40123	NC_021022	AAG	2	6	1891188	1891193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177634
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40127	NC_021022	AGG	2	6	1891327	1891332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40132	NC_021022	GCA	2	6	1891509	1891514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177635
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40144	NC_021022	TTG	2	6	1891963	1891968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177635
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40146	NC_021022	TCA	2	6	1892129	1892134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177635
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40152	NC_021022	AAT	2	6	1892366	1892371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40154	NC_021022	GAGGG	2	10	1892393	1892402	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40155	NC_021022	T	6	6	1892478	1892483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40156	NC_021022	TGG	2	6	1892558	1892563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40157	NC_021022	TG	3	6	1892593	1892598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40158	NC_021022	AAT	2	6	1892615	1892620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40159	NC_021022	GGA	2	6	1892636	1892641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40160	NC_021022	GA	3	6	1892651	1892656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40161	NC_021022	GA	3	6	1892690	1892695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40162	NC_021022	GA	3	6	1892704	1892709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40163	NC_021022	N	437	437	1892719	1893155	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40164	NC_021022	GA	3	6	1893166	1893171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40165	NC_021022	GGAG	2	8	1893204	1893211	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40166	NC_021022	CGT	2	6	1893399	1893404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40167	NC_021022	TCTG	2	8	1893413	1893420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40168	NC_021022	GAA	2	6	1893462	1893467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40169	NC_021022	TCT	2	6	1893530	1893535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40171	NC_021022	T	6	6	1893604	1893609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40172	NC_021022	TAC	2	6	1893729	1893734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177636
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40221	NC_021022	A	6	6	1896346	1896351	100 %	0 %	0 %	0 %	479177637
40222	NC_021022	AGGA	2	8	1896356	1896363	50 %	0 %	50 %	0 %	479177637
40223	NC_021022	TGT	3	9	1896381	1896389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177637
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40229	NC_021022	GAAA	2	8	1896581	1896588	75 %	0 %	25 %	0 %	479177637
40230	NC_021022	GAA	2	6	1896592	1896597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177637
40231	NC_021022	TGA	2	6	1896605	1896610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177637
40232	NC_021022	CTT	2	6	1896628	1896633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177637
40233	NC_021022	GTT	2	6	1896661	1896666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177637
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40235	NC_021022	AG	3	6	1896843	1896848	50 %	0 %	50 %	0 %	479177637
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40354	NC_021022	TCA	2	6	1901645	1901650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177640
40355	NC_021022	GCA	2	6	1901697	1901702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177640
40356	NC_021022	ATC	2	6	1901704	1901709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177640
40357	NC_021022	ATC	2	6	1901725	1901730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177640
40358	NC_021022	ATC	2	6	1901746	1901751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177640
40359	NC_021022	AAAGA	2	10	1901752	1901761	80 %	0 %	20 %	0 %	479177640
40360	NC_021022	A	6	6	1901761	1901766	100 %	0 %	0 %	0 %	479177640
40361	NC_021022	GCT	2	6	1901767	1901772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177640
40362	NC_021022	ATC	2	6	1901869	1901874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40363	NC_021022	ATA	2	6	1901875	1901880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40364	NC_021022	A	6	6	1901880	1901885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40365	NC_021022	TA	3	6	1901887	1901892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40366	NC_021022	AGG	2	6	1901900	1901905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40367	NC_021022	A	6	6	1901924	1901929	100 %	0 %	0 %	0 %	479177641
40368	NC_021022	GTA	2	6	1901930	1901935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177641
40369	NC_021022	GCA	2	6	1901951	1901956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177641
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40372	NC_021022	GCT	2	6	1902110	1902115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177641
40373	NC_021022	GAA	2	6	1902116	1902121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177641
40374	NC_021022	TCT	2	6	1902245	1902250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177641
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40380	NC_021022	TGT	2	6	1902619	1902624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177641
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40387	NC_021022	GAC	2	6	1902995	1903000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177641
40388	NC_021022	AACG	2	8	1903044	1903051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40389	NC_021022	GAA	2	6	1903102	1903107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40390	NC_021022	TAA	2	6	1903163	1903168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40391	NC_021022	T	7	7	1903278	1903284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40392	NC_021022	T	7	7	1903311	1903317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40393	NC_021022	ATA	2	6	1903321	1903326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40394	NC_021022	TTA	2	6	1903329	1903334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40412	NC_021022	AGAA	2	8	1904085	1904092	75 %	0 %	25 %	0 %	479177642
40413	NC_021022	AGT	2	6	1904110	1904115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177642
40414	NC_021022	CTG	2	6	1904142	1904147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177642
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40417	NC_021022	GAAA	2	8	1904219	1904226	75 %	0 %	25 %	0 %	479177642
40418	NC_021022	TGAAC	2	10	1904254	1904263	40 %	20 %	20 %	20 %	479177642
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40423	NC_021022	ACT	2	6	1904478	1904483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177642
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40427	NC_021022	GGT	2	6	1904630	1904635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177642
40428	NC_021022	AAG	2	6	1904682	1904687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177642
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40430	NC_021022	CAAT	2	8	1904843	1904850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40431	NC_021022	AGG	2	6	1904851	1904856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40433	NC_021022	A	7	7	1904975	1904981	100 %	0 %	0 %	0 %	479177643
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40453	NC_021022	CA	3	6	1906036	1906041	50 %	0 %	0 %	50 %	479177643
40454	NC_021022	TGT	2	6	1906066	1906071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479177643
40455	NC_021022	TCCTT	2	10	1906101	1906110	0 %	60 %	0 %	40 %	479177643
40456	NC_021022	CATATT	2	12	1906306	1906317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40457	NC_021022	T	6	6	1906349	1906354	0 %	100 %	0 %	0 %	479177644
40458	NC_021022	TAAG	2	8	1906403	1906410	50 %	25 %	25 %	0 %	479177644
40459	NC_021022	GAC	2	6	1906440	1906445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177644
40460	NC_021022	TGTT	2	8	1906467	1906474	0 %	75 %	25 %	0 %	479177644
40461	NC_021022	CAT	2	6	1906542	1906547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177644
40462	NC_021022	AAG	2	6	1906555	1906560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177644
40463	NC_021022	TCCA	2	8	1906577	1906584	25 %	25 %	0 %	50 %	479177644
40464	NC_021022	ATC	2	6	1906612	1906617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177644
40465	NC_021022	GAA	2	6	1906635	1906640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177644
40466	NC_021022	GAT	2	6	1906651	1906656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177644
40467	NC_021022	AGAT	2	8	1906757	1906764	50 %	25 %	25 %	0 %	479177644
40468	NC_021022	TGCTT	2	10	1906800	1906809	0 %	60 %	20 %	20 %	479177644
40469	NC_021022	TCG	2	6	1906865	1906870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177644
40470	NC_021022	CTG	2	6	1906879	1906884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177644
40471	NC_021022	ATTGT	2	10	1906907	1906916	20 %	60 %	20 %	0 %	479177644
40472	NC_021022	AGTG	2	8	1906946	1906953	25 %	25 %	50 %	0 %	479177644
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40474	NC_021022	TTC	2	6	1906993	1906998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177644
40475	NC_021022	TGTA	2	8	1907031	1907038	25 %	50 %	25 %	0 %	479177644
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40478	NC_021022	GATG	2	8	1907118	1907125	25 %	25 %	50 %	0 %	479177644
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40481	NC_021022	CGGAC	2	10	1907248	1907257	20 %	0 %	40 %	40 %	479177644
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