MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35120	NC_021022	ATC	2	6	1658075	1658080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177429
35121	NC_021022	GCA	2	6	1658242	1658247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177429
35122	NC_021022	ACTGGC	2	12	1658267	1658278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479177429
35123	NC_021022	GAA	2	6	1658335	1658340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177429
35124	NC_021022	TAT	2	6	1658364	1658369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479177429
35125	NC_021022	TCTG	2	8	1658400	1658407	0 %	50 %	25 %	25 %	479177429
35126	NC_021022	ATA	2	6	1658420	1658425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177429
35127	NC_021022	AAT	2	6	1658443	1658448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177429
35128	NC_021022	AAT	2	6	1658500	1658505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177429
35129	NC_021022	ATG	2	6	1658540	1658545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177429
35130	NC_021022	ATT	2	6	1658575	1658580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479177429
35131	NC_021022	AG	3	6	1658586	1658591	50 %	0 %	50 %	0 %	479177429
35132	NC_021022	TGA	2	6	1658643	1658648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177429
35133	NC_021022	GACA	2	8	1658749	1658756	50 %	0 %	25 %	25 %	479177429
35134	NC_021022	AT	3	6	1658785	1658790	50 %	50 %	0 %	0 %	479177429
35135	NC_021022	A	6	6	1658926	1658931	100 %	0 %	0 %	0 %	479177429
35136	NC_021022	ATGT	2	8	1658985	1658992	25 %	50 %	25 %	0 %	479177429
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35138	NC_021022	GCA	2	6	1659009	1659014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177429
35139	NC_021022	GA	3	6	1659035	1659040	50 %	0 %	50 %	0 %	479177429
35140	NC_021022	AAT	2	6	1659150	1659155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177429
35141	NC_021022	CAGTA	2	10	1659174	1659183	40 %	20 %	20 %	20 %	479177429
35142	NC_021022	CAG	2	6	1659191	1659196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177429
35143	NC_021022	ATGT	2	8	1659233	1659240	25 %	50 %	25 %	0 %	479177429
35144	NC_021022	TAAGAA	2	12	1659256	1659267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479177429
35145	NC_021022	AGA	2	6	1659284	1659289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35146	NC_021022	T	6	6	1659321	1659326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35147	NC_021022	TGGA	2	8	1659339	1659346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35148	NC_021022	A	6	6	1659372	1659377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35149	NC_021022	ATT	2	6	1659422	1659427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35150	NC_021022	A	6	6	1659516	1659521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35151	NC_021022	AAT	2	6	1659526	1659531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35152	NC_021022	CAC	2	6	1659600	1659605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35153	NC_021022	CTG	2	6	1659625	1659630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35154	NC_021022	ATT	2	6	1659635	1659640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35155	NC_021022	GGC	2	6	1659656	1659661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35156	NC_021022	TTC	2	6	1659683	1659688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35157	NC_021022	ACAG	2	8	1659738	1659745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35158	NC_021022	A	7	7	1659767	1659773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35159	NC_021022	AAG	2	6	1659875	1659880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177430
35160	NC_021022	TGA	2	6	1659897	1659902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177430
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35162	NC_021022	GGC	2	6	1660010	1660015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177430
35163	NC_021022	T	7	7	1660033	1660039	0 %	100 %	0 %	0 %	479177430
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35166	NC_021022	GTGA	2	8	1660286	1660293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35167	NC_021022	AGA	2	6	1660453	1660458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177431
35168	NC_021022	GGCA	2	8	1660473	1660480	25 %	0 %	50 %	25 %	479177431
35169	NC_021022	GA	3	6	1660533	1660538	50 %	0 %	50 %	0 %	479177431
35170	NC_021022	GCA	2	6	1660565	1660570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177431
35171	NC_021022	CAA	2	6	1660578	1660583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479177431
35172	NC_021022	AGC	2	6	1660648	1660653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177431
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35175	NC_021022	ATTT	2	8	1661002	1661009	25 %	75 %	0 %	0 %	479177431
35176	NC_021022	TGC	2	6	1661041	1661046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177431
35177	NC_021022	AGA	2	6	1661047	1661052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177431
35178	NC_021022	GAT	2	6	1661128	1661133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35179	NC_021022	AGG	2	6	1661145	1661150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35180	NC_021022	CTA	2	6	1661325	1661330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177432
35181	NC_021022	CTT	2	6	1661333	1661338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177432
35182	NC_021022	TCT	3	9	1661386	1661394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177432
35183	NC_021022	GAT	2	6	1661433	1661438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177432
35184	NC_021022	GGC	2	6	1661482	1661487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35185	NC_021022	AGG	2	6	1661494	1661499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35186	NC_021022	TAG	2	6	1661524	1661529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177433
35187	NC_021022	CGA	2	6	1661554	1661559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177433
35188	NC_021022	TCA	2	6	1661587	1661592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177433
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35190	NC_021022	TGA	2	6	1661755	1661760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177433
35191	NC_021022	AAG	2	6	1661803	1661808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177433
35192	NC_021022	GAAA	2	8	1661831	1661838	75 %	0 %	25 %	0 %	479177433
35193	NC_021022	CAT	2	6	1662004	1662009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177433
35194	NC_021022	TGG	2	6	1662031	1662036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177434
35195	NC_021022	TGC	2	6	1662052	1662057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177434
35196	NC_021022	ATGA	2	8	1662092	1662099	50 %	25 %	25 %	0 %	479177434
35197	NC_021022	CAGA	2	8	1662103	1662110	50 %	0 %	25 %	25 %	479177434
35198	NC_021022	GGA	2	6	1662166	1662171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479177434
35199	NC_021022	GAAAA	2	10	1662248	1662257	80 %	0 %	20 %	0 %	479177434
35200	NC_021022	TGC	2	6	1662278	1662283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177434
35201	NC_021022	CGG	2	6	1662296	1662301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177434
35202	NC_021022	AAG	2	6	1662407	1662412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177434
35203	NC_021022	A	7	7	1662520	1662526	100 %	0 %	0 %	0 %	479177434
35204	NC_021022	TGAA	2	8	1662528	1662535	50 %	25 %	25 %	0 %	479177434
35205	NC_021022	GTG	2	6	1662539	1662544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177434
35206	NC_021022	TAA	2	6	1662545	1662550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177434
35207	NC_021022	ATGGA	2	10	1662600	1662609	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35208	NC_021022	GAA	2	6	1662628	1662633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177435
35209	NC_021022	CAG	2	6	1662682	1662687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35210	NC_021022	TGGT	2	8	1662710	1662717	0 %	50 %	50 %	0 %	479177435
35211	NC_021022	CTG	2	6	1662766	1662771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35212	NC_021022	GAA	2	6	1662811	1662816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177435
35213	NC_021022	AGT	2	6	1662930	1662935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177435
35214	NC_021022	ATC	2	6	1663159	1663164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177435
35215	NC_021022	GTA	2	6	1663279	1663284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177435
35216	NC_021022	GAT	2	6	1663393	1663398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177435
35217	NC_021022	TAAG	2	8	1663400	1663407	50 %	25 %	25 %	0 %	479177435
35218	NC_021022	TCT	2	6	1663434	1663439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177435
35219	NC_021022	CGT	2	6	1663444	1663449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35220	NC_021022	T	6	6	1663481	1663486	0 %	100 %	0 %	0 %	479177435
35221	NC_021022	CTG	2	6	1663501	1663506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35222	NC_021022	GCA	2	6	1663513	1663518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35223	NC_021022	GAC	2	6	1663525	1663530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35224	NC_021022	GGC	2	6	1663537	1663542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177435
35225	NC_021022	CAGG	2	8	1663576	1663583	25 %	0 %	50 %	25 %	479177435
35226	NC_021022	CGG	2	6	1663676	1663681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479177435
35227	NC_021022	TGG	2	6	1663710	1663715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479177435
35228	NC_021022	GATCT	2	10	1663808	1663817	20 %	40 %	20 %	20 %	479177435
35229	NC_021022	TGC	2	6	1664013	1664018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177435
35230	NC_021022	GAA	2	6	1664074	1664079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177435
35231	NC_021022	AAT	2	6	1664138	1664143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479177435
35232	NC_021022	AGG	2	6	1664150	1664155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35233	NC_021022	TCC	2	6	1664253	1664258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479177436
35234	NC_021022	CCGT	2	8	1664294	1664301	0 %	25 %	25 %	50 %	479177436
35235	NC_021022	TCC	2	6	1664358	1664363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479177436
35236	NC_021022	AG	3	6	1664373	1664378	50 %	0 %	50 %	0 %	479177436
35237	NC_021022	AGC	3	9	1664468	1664476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177436
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35354	NC_021022	TCT	2	6	1670226	1670231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177441
35355	NC_021022	T	7	7	1670236	1670242	0 %	100 %	0 %	0 %	479177441
35356	NC_021022	GCT	2	6	1670274	1670279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479177441
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35362	NC_021022	TAT	2	6	1670770	1670775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479177441
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35384	NC_021022	A	6	6	1671783	1671788	100 %	0 %	0 %	0 %	479177442
35385	NC_021022	TTC	2	6	1671814	1671819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177442
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35454	NC_021022	GAAG	2	8	1675362	1675369	50 %	0 %	50 %	0 %	479177445
35455	NC_021022	CAG	2	6	1675380	1675385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177445
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35458	NC_021022	GAAA	2	8	1675492	1675499	75 %	0 %	25 %	0 %	479177445
35459	NC_021022	GGCAA	2	10	1675521	1675530	40 %	0 %	40 %	20 %	479177445
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35463	NC_021022	ATG	2	6	1675830	1675835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177446
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35465	NC_021022	CT	3	6	1675931	1675936	0 %	50 %	0 %	50 %	479177446
35466	NC_021022	GAA	2	6	1676036	1676041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479177446
35467	NC_021022	A	6	6	1676058	1676063	100 %	0 %	0 %	0 %	479177446
35468	NC_021022	GCA	2	6	1676066	1676071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177446
35469	NC_021022	CTT	2	6	1676258	1676263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177446
35470	NC_021022	AG	3	6	1676267	1676272	50 %	0 %	50 %	0 %	479177446
35471	NC_021022	TGA	2	6	1676337	1676342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177446
35472	NC_021022	A	6	6	1676565	1676570	100 %	0 %	0 %	0 %	479177446
35473	NC_021022	ATC	2	6	1676615	1676620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177446
35474	NC_021022	ACC	2	6	1676660	1676665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479177446
35475	NC_021022	AT	3	6	1676743	1676748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35476	NC_021022	AC	3	6	1676789	1676794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35477	NC_021022	TGC	2	6	1676825	1676830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35478	NC_021022	GCA	2	6	1676874	1676879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35479	NC_021022	ACG	2	6	1676895	1676900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35480	NC_021022	AT	3	6	1676960	1676965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35481	NC_021022	CAG	3	9	1676992	1677000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35482	NC_021022	TC	3	6	1677019	1677024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35483	NC_021022	CTG	2	6	1677064	1677069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35484	NC_021022	GGACA	2	10	1677113	1677122	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35485	NC_021022	TGAC	2	8	1677126	1677133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35486	NC_021022	GCT	2	6	1677168	1677173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35487	NC_021022	GT	3	6	1677255	1677260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35488	NC_021022	CTGTC	2	10	1677269	1677278	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35489	NC_021022	GA	3	6	1677313	1677318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35490	NC_021022	CTT	2	6	1677394	1677399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479177447
35491	NC_021022	ATG	2	6	1677401	1677406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479177447
35492	NC_021022	CAT	2	6	1677417	1677422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177447
35493	NC_021022	CAT	2	6	1677462	1677467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177447
35494	NC_021022	ATC	2	6	1677496	1677501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479177447
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35496	NC_021022	CA	3	6	1677570	1677575	50 %	0 %	0 %	50 %	479177447
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35498	NC_021022	ACC	2	6	1677635	1677640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479177448
35499	NC_021022	GCA	2	6	1677653	1677658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479177448
35500	NC_021022	CA	3	6	1677749	1677754	50 %	0 %	0 %	50 %	479177448

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