MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021022	CTG	2	6	715043	715048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176647
15003	NC_021022	AAG	2	6	715062	715067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176647
15004	NC_021022	GTG	2	6	715109	715114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176647
15005	NC_021022	ATC	2	6	715176	715181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176647
15006	NC_021022	TGA	2	6	715192	715197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176647
15007	NC_021022	GAA	2	6	715216	715221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176647
15008	NC_021022	A	6	6	715220	715225	100 %	0 %	0 %	0 %	479176647
15009	NC_021022	AGGA	2	8	715296	715303	50 %	0 %	50 %	0 %	479176647
15010	NC_021022	T	6	6	715431	715436	0 %	100 %	0 %	0 %	479176647
15011	NC_021022	GT	3	6	715473	715478	0 %	50 %	50 %	0 %	479176647
15012	NC_021022	GAA	2	6	715487	715492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176647
15013	NC_021022	GGAA	2	8	715494	715501	50 %	0 %	50 %	0 %	479176647
15014	NC_021022	AGAAA	2	10	715519	715528	80 %	0 %	20 %	0 %	479176647
15015	NC_021022	AT	3	6	715570	715575	50 %	50 %	0 %	0 %	479176647
15016	NC_021022	AT	3	6	715647	715652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_021022	GTA	2	6	715705	715710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_021022	TCT	2	6	715720	715725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_021022	CGA	2	6	715769	715774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_021022	TCA	2	6	715788	715793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_021022	CGG	2	6	715800	715805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_021022	GAA	2	6	715888	715893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_021022	TGCC	2	8	716023	716030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15024	NC_021022	TGGAA	2	10	716130	716139	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_021022	N	195	195	716155	716349	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_021022	ATA	2	6	716362	716367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_021022	GAA	2	6	716396	716401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_021022	TAT	2	6	716406	716411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_021022	CAG	2	6	716493	716498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_021022	TAAA	2	8	716506	716513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_021022	ACA	2	6	716548	716553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_021022	AT	3	6	716567	716572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_021022	CAT	2	6	716588	716593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_021022	TCT	2	6	716604	716609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_021022	CA	3	6	716630	716635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15036	NC_021022	A	6	6	716652	716657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021022	CTG	2	6	716661	716666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15039	NC_021022	A	6	6	716818	716823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_021022	CTG	2	6	716827	716832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_021022	T	6	6	716848	716853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_021022	CGG	2	6	716926	716931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176648
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15055	NC_021022	ATA	2	6	717782	717787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176648
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15057	NC_021022	TAT	2	6	717859	717864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_021022	T	6	6	717884	717889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021022	GTG	2	6	718063	718068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176649
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15063	NC_021022	CGT	2	6	718336	718341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176649
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15108	NC_021022	GGCA	2	8	720126	720133	25 %	0 %	50 %	25 %	479176649
15109	NC_021022	AG	3	6	720317	720322	50 %	0 %	50 %	0 %	479176650
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15119	NC_021022	TGA	2	6	720754	720759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
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15122	NC_021022	GCG	2	6	720907	720912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176650
15123	NC_021022	GCG	2	6	720947	720952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176650
15124	NC_021022	GCTTCT	2	12	721008	721019	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479176650
15125	NC_021022	GAT	2	6	721025	721030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15126	NC_021022	AAG	2	6	721053	721058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176650
15127	NC_021022	CGAT	2	8	721107	721114	25 %	25 %	25 %	25 %	479176650
15128	NC_021022	CGA	2	6	721128	721133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176650
15129	NC_021022	AGA	2	6	721160	721165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176650
15130	NC_021022	TCT	2	6	721198	721203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176650
15131	NC_021022	GAT	2	6	721211	721216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15132	NC_021022	ATG	2	6	721236	721241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15133	NC_021022	TAT	2	6	721244	721249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176650
15134	NC_021022	A	6	6	721309	721314	100 %	0 %	0 %	0 %	479176650
15135	NC_021022	GAT	2	6	721343	721348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15136	NC_021022	GT	3	6	721449	721454	0 %	50 %	50 %	0 %	479176650
15137	NC_021022	CGG	2	6	721552	721557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176650
15138	NC_021022	ACA	2	6	721590	721595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176650
15139	NC_021022	TGA	2	6	721725	721730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15140	NC_021022	ATG	2	6	721887	721892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176650
15141	NC_021022	TAT	2	6	721938	721943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176651
15142	NC_021022	A	6	6	721978	721983	100 %	0 %	0 %	0 %	479176651
15143	NC_021022	CAG	2	6	722033	722038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176651
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15148	NC_021022	CAG	2	6	722315	722320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176651
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15150	NC_021022	CTT	2	6	722353	722358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176651
15151	NC_021022	CGG	2	6	722372	722377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176651
15152	NC_021022	GAAGAT	2	12	722398	722409	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479176651
15153	NC_021022	GAA	2	6	722468	722473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176651
15154	NC_021022	ACA	2	6	722483	722488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176651
15155	NC_021022	AAG	2	6	722502	722507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176651
15156	NC_021022	AG	3	6	722564	722569	50 %	0 %	50 %	0 %	479176651
15157	NC_021022	ATG	2	6	722581	722586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176651
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15159	NC_021022	CGC	2	6	722638	722643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176651
15160	NC_021022	CGA	2	6	722649	722654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176651
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15162	NC_021022	ATC	2	6	722701	722706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176651
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15164	NC_021022	ACA	2	6	722821	722826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176651
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15172	NC_021022	AAGAA	2	10	723173	723182	80 %	0 %	20 %	0 %	479176651
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15178	NC_021022	TCT	2	6	723379	723384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176651
15179	NC_021022	AAG	2	6	723409	723414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176651
15180	NC_021022	GAATAA	2	12	723421	723432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479176651
15181	NC_021022	TAC	2	6	723493	723498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15183	NC_021022	GGA	2	6	723596	723601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15184	NC_021022	T	7	7	723632	723638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15185	NC_021022	ATT	2	6	723648	723653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176652
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15188	NC_021022	CAC	2	6	723841	723846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176652
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15192	NC_021022	GAA	2	6	724034	724039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176652
15193	NC_021022	AAG	2	6	724180	724185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176652
15194	NC_021022	TCAT	2	8	724192	724199	25 %	50 %	0 %	25 %	479176652
15195	NC_021022	GCC	2	6	724261	724266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176652
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15198	NC_021022	GACA	2	8	724453	724460	50 %	0 %	25 %	25 %	479176652
15199	NC_021022	GTA	2	6	724461	724466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176652
15200	NC_021022	A	6	6	724485	724490	100 %	0 %	0 %	0 %	479176652
15201	NC_021022	T	6	6	724542	724547	0 %	100 %	0 %	0 %	479176652
15202	NC_021022	AAGA	2	8	724563	724570	75 %	0 %	25 %	0 %	479176652
15203	NC_021022	GCA	2	6	724576	724581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176652
15204	NC_021022	ACG	2	6	724588	724593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176652
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15206	NC_021022	ACAA	2	8	724654	724661	75 %	0 %	0 %	25 %	479176653
15207	NC_021022	TCTG	2	8	724715	724722	0 %	50 %	25 %	25 %	479176653
15208	NC_021022	GGA	2	6	724753	724758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176653
15209	NC_021022	CTT	2	6	724768	724773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176653
15210	NC_021022	TAT	2	6	724935	724940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176653
15211	NC_021022	TGG	2	6	724988	724993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176653
15212	NC_021022	TCC	2	6	725068	725073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176653
15213	NC_021022	CTT	2	6	725095	725100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176653
15214	NC_021022	CAGTT	2	10	725138	725147	20 %	40 %	20 %	20 %	479176653
15215	NC_021022	TGT	2	6	725184	725189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176653
15216	NC_021022	GTG	2	6	725308	725313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15217	NC_021022	T	7	7	725325	725331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15218	NC_021022	AT	3	6	725332	725337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15219	NC_021022	T	6	6	725418	725423	0 %	100 %	0 %	0 %	479176654
15220	NC_021022	GTT	2	6	725446	725451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176654
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15222	NC_021022	GCG	3	9	725537	725545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176654
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15224	NC_021022	TTC	2	6	725575	725580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176654
15225	NC_021022	CAG	2	6	725709	725714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176654
15226	NC_021022	GAAG	2	8	725759	725766	50 %	0 %	50 %	0 %	479176654
15227	NC_021022	AGC	2	6	725776	725781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176654
15228	NC_021022	TCA	2	6	725786	725791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176654
15229	NC_021022	TGCAAA	2	12	725833	725844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479176654
15230	NC_021022	GT	3	6	725895	725900	0 %	50 %	50 %	0 %	479176654
15231	NC_021022	ATC	2	6	725968	725973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176654
15232	NC_021022	AGGGC	2	10	725981	725990	20 %	0 %	60 %	20 %	479176654
15233	NC_021022	TCA	2	6	725999	726004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176654
15234	NC_021022	GAA	2	6	726005	726010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176654
15235	NC_021022	ATA	2	6	726046	726051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176654
15236	NC_021022	CAT	2	6	726141	726146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176654
15237	NC_021022	ACG	2	6	726370	726375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176654
15238	NC_021022	AAAATC	2	12	726388	726399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479176654
15239	NC_021022	GCA	2	6	726410	726415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176654
15240	NC_021022	ATCAC	2	10	726461	726470	40 %	20 %	0 %	40 %	479176654
15241	NC_021022	CAT	2	6	726552	726557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176654
15242	NC_021022	GTT	2	6	726565	726570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176654
15243	NC_021022	A	6	6	726647	726652	100 %	0 %	0 %	0 %	479176654
15244	NC_021022	T	6	6	726763	726768	0 %	100 %	0 %	0 %	479176654
15245	NC_021022	GTT	2	6	726776	726781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176654
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15351	NC_021022	A	8	8	731366	731373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15352	NC_021022	GAA	2	6	731383	731388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_021022	A	6	6	731393	731398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_021022	AAGTA	2	10	731400	731409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_021022	AGAA	2	8	731415	731422	75 %	0 %	25 %	0 %	479176658
15356	NC_021022	AAAG	2	8	731454	731461	75 %	0 %	25 %	0 %	479176658
15357	NC_021022	GAT	2	6	731532	731537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176658
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15368	NC_021022	AGTC	2	8	732096	732103	25 %	25 %	25 %	25 %	479176658
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15487	NC_021022	ACA	2	6	737951	737956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15488	NC_021022	CTG	2	6	737999	738004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_021022	A	6	6	738047	738052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15490	NC_021022	AAAT	2	8	738094	738101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15491	NC_021022	ACA	2	6	738110	738115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_021022	TCG	2	6	738171	738176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15493	NC_021022	AGC	2	6	738246	738251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15494	NC_021022	AGAA	2	8	738276	738283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_021022	CGA	2	6	738303	738308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15496	NC_021022	CG	3	6	738382	738387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15497	NC_021022	GAA	2	6	738406	738411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_021022	TAT	2	6	738432	738437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_021022	TA	3	6	738483	738488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_021022	TA	3	6	738507	738512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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