MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021022	TCG	2	6	527158	527163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_021022	CAAA	2	8	527212	527219	75 %	0 %	0 %	25 %	479176473
11003	NC_021022	GGC	2	6	527238	527243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176473
11004	NC_021022	GGT	2	6	527250	527255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176473
11005	NC_021022	GTG	2	6	527323	527328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176473
11006	NC_021022	TCG	2	6	527341	527346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176473
11007	NC_021022	CTC	2	6	527469	527474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176473
11008	NC_021022	ATGG	2	8	527499	527506	25 %	25 %	50 %	0 %	479176473
11009	NC_021022	TGT	2	6	527510	527515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176473
11010	NC_021022	GAT	2	6	527638	527643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176473
11011	NC_021022	TTTCGG	2	12	527645	527656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479176473
11012	NC_021022	AAG	3	9	527657	527665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176473
11013	NC_021022	CTG	2	6	527670	527675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176473
11014	NC_021022	TCA	2	6	527689	527694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176473
11015	NC_021022	AGC	2	6	527743	527748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176473
11016	NC_021022	TAA	2	6	527757	527762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176473
11017	NC_021022	T	7	7	527774	527780	0 %	100 %	0 %	0 %	479176473
11018	NC_021022	TTTC	2	8	527855	527862	0 %	75 %	0 %	25 %	479176474
11019	NC_021022	TCA	2	6	527894	527899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176474
11020	NC_021022	T	6	6	527912	527917	0 %	100 %	0 %	0 %	479176474
11021	NC_021022	GCA	2	6	527930	527935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176474
11022	NC_021022	TTC	2	6	527945	527950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176474
11023	NC_021022	GCA	2	6	527954	527959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176474
11024	NC_021022	TGC	2	6	527987	527992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176474
11025	NC_021022	GCAGCG	2	12	528112	528123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479176474
11026	NC_021022	C	6	6	528124	528129	0 %	0 %	0 %	100 %	479176474
11027	NC_021022	TCC	2	6	528144	528149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176474
11028	NC_021022	ATG	2	6	528178	528183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176474
11029	NC_021022	TTCGTT	2	12	528210	528221	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479176474
11030	NC_021022	CATTT	2	10	528237	528246	20 %	60 %	0 %	20 %	479176474
11031	NC_021022	TCAT	2	8	528256	528263	25 %	50 %	0 %	25 %	479176474
11032	NC_021022	TCC	2	6	528279	528284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_021022	ATT	2	6	528287	528292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_021022	ACG	2	6	528423	528428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176475
11035	NC_021022	TTCA	2	8	528530	528537	25 %	50 %	0 %	25 %	479176475
11036	NC_021022	AG	3	6	528589	528594	50 %	0 %	50 %	0 %	479176475
11037	NC_021022	AGCG	2	8	528605	528612	25 %	0 %	50 %	25 %	479176475
11038	NC_021022	CTT	2	6	528643	528648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176475
11039	NC_021022	TTC	2	6	528692	528697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176475
11040	NC_021022	GAT	2	6	528707	528712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176475
11041	NC_021022	GTA	2	6	528753	528758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176475
11042	NC_021022	AAGC	2	8	528844	528851	50 %	0 %	25 %	25 %	479176475
11043	NC_021022	TCA	2	6	528867	528872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176475
11044	NC_021022	TCA	4	12	528900	528911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176475
11045	NC_021022	ACC	2	6	529077	529082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176475
11046	NC_021022	CAG	2	6	529093	529098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176475
11047	NC_021022	CTG	2	6	529201	529206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176475
11048	NC_021022	CAT	2	6	529207	529212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176475
11049	NC_021022	TTC	2	6	529214	529219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176475
11050	NC_021022	GT	3	6	529270	529275	0 %	50 %	50 %	0 %	479176475
11051	NC_021022	CA	3	6	529427	529432	50 %	0 %	0 %	50 %	479176475
11052	NC_021022	T	6	6	529457	529462	0 %	100 %	0 %	0 %	479176475
11053	NC_021022	TATG	2	8	529504	529511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021022	AAC	2	6	529512	529517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_021022	TA	3	6	529526	529531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021022	TCG	2	6	529617	529622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176476
11057	NC_021022	CAT	2	6	529657	529662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176476
11058	NC_021022	AGA	2	6	529683	529688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176476
11059	NC_021022	A	7	7	529808	529814	100 %	0 %	0 %	0 %	479176476
11060	NC_021022	AAC	2	6	529832	529837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176476
11061	NC_021022	GAA	2	6	529855	529860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176476
11062	NC_021022	CTCC	2	8	529889	529896	0 %	25 %	0 %	75 %	479176476
11063	NC_021022	TTC	2	6	529968	529973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176476
11064	NC_021022	CAA	2	6	529986	529991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176476
11065	NC_021022	ATA	2	6	530009	530014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176476
11066	NC_021022	ATTGC	2	10	530048	530057	20 %	40 %	20 %	20 %	479176476
11067	NC_021022	AGAA	2	8	530075	530082	75 %	0 %	25 %	0 %	479176476
11068	NC_021022	GGA	2	6	530112	530117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176476
11069	NC_021022	AGC	2	6	530130	530135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176477
11070	NC_021022	TGA	2	6	530261	530266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176477
11071	NC_021022	AG	3	6	530295	530300	50 %	0 %	50 %	0 %	479176477
11072	NC_021022	AAAG	2	8	530307	530314	75 %	0 %	25 %	0 %	479176477
11073	NC_021022	CT	3	6	530323	530328	0 %	50 %	0 %	50 %	479176477
11074	NC_021022	T	6	6	530485	530490	0 %	100 %	0 %	0 %	479176477
11075	NC_021022	TTC	2	6	530517	530522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176477
11076	NC_021022	TGT	2	6	530539	530544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176477
11077	NC_021022	CAG	2	6	530547	530552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176477
11078	NC_021022	ATG	2	6	530575	530580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176477
11079	NC_021022	TGCT	2	8	530590	530597	0 %	50 %	25 %	25 %	479176477
11080	NC_021022	ATCCA	2	10	530619	530628	40 %	20 %	0 %	40 %	479176477
11081	NC_021022	CCA	2	6	530666	530671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176477
11082	NC_021022	GCCA	2	8	530692	530699	25 %	0 %	25 %	50 %	479176477
11083	NC_021022	CAG	2	6	530736	530741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176477
11084	NC_021022	ACA	2	6	530755	530760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176477
11085	NC_021022	A	7	7	530783	530789	100 %	0 %	0 %	0 %	479176477
11086	NC_021022	GA	3	6	530818	530823	50 %	0 %	50 %	0 %	479176477
11087	NC_021022	ATA	2	6	530857	530862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176477
11088	NC_021022	ATC	2	6	530875	530880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176477
11089	NC_021022	CAT	2	6	530945	530950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176477
11090	NC_021022	TCA	2	6	530957	530962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176477
11091	NC_021022	CTG	2	6	530968	530973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_021022	TAAA	2	8	530994	531001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_021022	TTCT	2	8	531033	531040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11094	NC_021022	TAC	2	6	531048	531053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_021022	T	6	6	531141	531146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_021022	TAA	2	6	531164	531169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021022	CGAG	2	8	531244	531251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11098	NC_021022	CGC	2	6	531259	531264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_021022	AGC	2	6	531273	531278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_021022	TGA	2	6	531287	531292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_021022	GCT	2	6	531298	531303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_021022	TGG	2	6	531334	531339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_021022	CCT	2	6	531389	531394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_021022	G	6	6	531403	531408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_021022	GCG	2	6	531415	531420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_021022	ACG	2	6	531431	531436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_021022	TAT	2	6	531474	531479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021022	CAG	2	6	531538	531543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_021022	CAGG	2	8	531566	531573	25 %	0 %	50 %	25 %	479176478
11110	NC_021022	CCAA	2	8	531625	531632	50 %	0 %	0 %	50 %	479176478
11111	NC_021022	AT	3	6	531815	531820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_021022	AAT	2	6	531858	531863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_021022	TTG	2	6	531870	531875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_021022	T	6	6	531880	531885	0 %	100 %	0 %	0 %	479176479
11115	NC_021022	CCA	2	6	531914	531919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176479
11116	NC_021022	CTG	2	6	531927	531932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176479
11117	NC_021022	ACA	2	6	532005	532010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176479
11118	NC_021022	TCAT	2	8	532020	532027	25 %	50 %	0 %	25 %	479176479
11119	NC_021022	TC	3	6	532066	532071	0 %	50 %	0 %	50 %	479176479
11120	NC_021022	CT	3	6	532241	532246	0 %	50 %	0 %	50 %	479176479
11121	NC_021022	CGAGCC	2	12	532261	532272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479176479
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11123	NC_021022	CA	3	6	532376	532381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11251	NC_021022	AATA	2	8	539130	539137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_021022	A	7	7	539175	539181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_021022	T	6	6	539223	539228	0 %	100 %	0 %	0 %	479176486
11254	NC_021022	GAT	2	6	539249	539254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176486
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11256	NC_021022	CGAG	2	8	539318	539325	25 %	0 %	50 %	25 %	479176486
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11260	NC_021022	TTGA	2	8	539490	539497	25 %	50 %	25 %	0 %	479176486
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11263	NC_021022	T	7	7	539567	539573	0 %	100 %	0 %	0 %	479176486
11264	NC_021022	CTTA	2	8	539605	539612	25 %	50 %	0 %	25 %	479176486
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11272	NC_021022	CAAG	2	8	540240	540247	50 %	0 %	25 %	25 %	479176486
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11280	NC_021022	ATT	2	6	540462	540467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11282	NC_021022	GGT	2	6	540526	540531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11284	NC_021022	GAA	2	6	540701	540706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11285	NC_021022	CTA	2	6	540718	540723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11289	NC_021022	AATGT	2	10	541078	541087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11361	NC_021022	GTC	2	6	543969	543974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11362	NC_021022	T	7	7	544014	544020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_021022	GTA	2	6	544022	544027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11364	NC_021022	TAT	2	6	544028	544033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11365	NC_021022	AAAT	2	8	544107	544114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11366	NC_021022	T	6	6	544125	544130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11367	NC_021022	TTA	2	6	544159	544164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11368	NC_021022	TA	3	6	544217	544222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11369	NC_021022	AAAC	2	8	544240	544247	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11370	NC_021022	GAT	2	6	544257	544262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176494
11371	NC_021022	CAAA	2	8	544305	544312	75 %	0 %	0 %	25 %	479176494
11372	NC_021022	GCT	2	6	544321	544326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176494
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11374	NC_021022	ACTTA	2	10	544419	544428	40 %	40 %	0 %	20 %	479176494
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11376	NC_021022	GAT	2	6	544569	544574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176495
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11405	NC_021022	GACC	2	8	545868	545875	25 %	0 %	25 %	50 %	479176497
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11439	NC_021022	CAAT	2	8	547101	547108	50 %	25 %	0 %	25 %	479176499
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11441	NC_021022	TTC	2	6	547228	547233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176499
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11451	NC_021022	GCAA	2	8	547454	547461	50 %	0 %	25 %	25 %	479176499
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11454	NC_021022	TGA	2	6	547621	547626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176499
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11456	NC_021022	GCT	2	6	547660	547665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176499
11457	NC_021022	ATACT	2	10	547801	547810	40 %	40 %	0 %	20 %	479176499
11458	NC_021022	A	6	6	547821	547826	100 %	0 %	0 %	0 %	479176499
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11477	NC_021022	A	6	6	548667	548672	100 %	0 %	0 %	0 %	479176499
11478	NC_021022	GGA	2	6	548769	548774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176500
11479	NC_021022	GAAC	2	8	548892	548899	50 %	0 %	25 %	25 %	479176500
11480	NC_021022	TGT	2	6	548984	548989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176500
11481	NC_021022	GAA	2	6	549025	549030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176500
11482	NC_021022	ATC	2	6	549031	549036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176500
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11484	NC_021022	CAA	2	6	549079	549084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_021022	AGG	2	6	549156	549161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11490	NC_021022	AGGG	2	8	549383	549390	25 %	0 %	75 %	0 %	479176501
11491	NC_021022	GAAA	2	8	549419	549426	75 %	0 %	25 %	0 %	479176502
11492	NC_021022	GCT	2	6	549501	549506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176502
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11494	NC_021022	GTCT	2	8	549589	549596	0 %	50 %	25 %	25 %	479176502
11495	NC_021022	GCC	2	6	549608	549613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176502
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11499	NC_021022	TGA	2	6	549859	549864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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