MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
79501	NC_021022	A	6	6	3754950	3754955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79502	NC_021022	CGA	2	6	3755063	3755068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79503	NC_021022	A	7	7	3755098	3755104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79504	NC_021022	GCAG	2	8	3755121	3755128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79505	NC_021022	TGAT	2	8	3755362	3755369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79506	NC_021022	CGCA	2	8	3755397	3755404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79507	NC_021022	TGC	2	6	3755429	3755434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79508	NC_021022	ATAA	2	8	3755551	3755558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79509	NC_021022	CAT	2	6	3755601	3755606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79510	NC_021022	CCG	2	6	3755647	3755652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79511	NC_021022	A	6	6	3755664	3755669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79512	NC_021022	GAT	2	6	3755685	3755690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79513	NC_021022	TGTC	2	8	3755723	3755730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79514	NC_021022	GAA	2	6	3755736	3755741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79515	NC_021022	AGC	2	6	3755746	3755751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79516	NC_021022	A	7	7	3755758	3755764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79517	NC_021022	TGA	2	6	3755795	3755800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79518	NC_021022	GCTT	2	8	3755832	3755839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79519	NC_021022	GCC	2	6	3755883	3755888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79520	NC_021022	GAG	2	6	3755895	3755900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79521	NC_021022	GCA	2	6	3755908	3755913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79522	NC_021022	TGTT	2	8	3755942	3755949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79523	NC_021022	TGA	2	6	3756029	3756034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79524	NC_021022	AAG	2	6	3756057	3756062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79525	NC_021022	TGA	2	6	3756102	3756107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79526	NC_021022	TCT	2	6	3756137	3756142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79527	NC_021022	AAAG	2	8	3756202	3756209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79528	NC_021022	AT	3	6	3756235	3756240	50 %	50 %	0 %	0 %	479179203
79529	NC_021022	GTT	2	6	3756262	3756267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479179203
79530	NC_021022	TG	3	6	3756279	3756284	0 %	50 %	50 %	0 %	479179203
79531	NC_021022	CTG	2	6	3756290	3756295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479179203
79532	NC_021022	CGGA	2	8	3756321	3756328	25 %	0 %	50 %	25 %	479179203
79533	NC_021022	TTA	2	6	3756334	3756339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479179203
79534	NC_021022	GAA	2	6	3756449	3756454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479179203
79535	NC_021022	TGC	2	6	3756463	3756468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479179203
79536	NC_021022	GCG	2	6	3756488	3756493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479179203
79537	NC_021022	CGG	2	6	3756508	3756513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479179203
79538	NC_021022	GGA	2	6	3756539	3756544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479179203
79539	NC_021022	AAAC	2	8	3756553	3756560	75 %	0 %	0 %	25 %	479179203
79540	NC_021022	TGC	2	6	3756589	3756594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479179203
79541	NC_021022	GAA	2	6	3756680	3756685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479179203
79542	NC_021022	GCA	2	6	3756782	3756787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479179203
79543	NC_021022	GGCTG	2	10	3756851	3756860	0 %	20 %	60 %	20 %	479179203
79544	NC_021022	AATG	2	8	3756866	3756873	50 %	25 %	25 %	0 %	479179203
79545	NC_021022	GAT	2	6	3756938	3756943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479179203
79546	NC_021022	GAT	2	6	3757031	3757036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479179203
79547	NC_021022	A	6	6	3757037	3757042	100 %	0 %	0 %	0 %	479179203
79548	NC_021022	TA	3	6	3757128	3757133	50 %	50 %	0 %	0 %	479179203
79549	NC_021022	TCA	2	6	3757315	3757320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479179203
79550	NC_021022	TGCAG	2	10	3757381	3757390	20 %	20 %	40 %	20 %	479179203
79551	NC_021022	TTA	2	6	3757405	3757410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479179203
79552	NC_021022	AAAG	2	8	3757442	3757449	75 %	0 %	25 %	0 %	479179203
79553	NC_021022	AAAT	2	8	3757466	3757473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79554	NC_021022	T	6	6	3757478	3757483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79555	NC_021022	A	6	6	3757485	3757490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.